FuNGI

C5M401

Protein Details

Accession

C5M401

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-25	HESISKRRKTSEPAKFRPGF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
252-267	KQRAHLKAARDKAKNK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003684 F:damaged DNA binding GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0019789 F:SUMO transferase activity GO:0051304 P:chromosome separation GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination GO:0071139 P:resolution of recombination intermediates
KEGG	ctp:CTRG_00790 -
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MTSEIHESISKRRKTSEPAKFRPGFIRNVKVWNFTTYSYTEFCLSPTLNMIIGPNGSGKSTLVASICIGLAGNITLIKRKNLKSMIKTGHESAAVEITLENHEGKSPIVVKREFTAKESAWTINGQRSTETKVRKLRSEFNIQLDNLCHFLPQERVAEFAGLSPEKLLMETERTLGDGHLLRKHEELIGHDNTCQTYINKIEELKTRLAQLQKEKTTLEEEAKKFEEYEKKAEEISNHTLLIPYAKFHDLKKQRAHLKAARDKAKNKLRSFQANFKPLEDEISSTESRIIKESEEYEEIKKAVRGYDVRIDQFKKTQKQCANEIAELIANAKYYRTKAEQKKRELEEVKQEIKRIIEKKSCFPEVDQEKLSELANQASAKRHEMREFEDKITEESSLKNEIGREITNLEHQKRTAERTLQSKDKLDVLVGAARQGTKYRLRDEAYEAHRRLRSNSKSQGRYFEAPVVSCNVTNVNYAAAIEKVIDNNSLFAFTVTSQADLDFLSRFSEENNSNTPIRLVNSIINPTATYNQQELRSFGFDGYLSDFITGPKEVLSMLYNTSKLHTIPVSSQPLSNEQVKRLTNTPPSGKIPFMKFVAGDTLYNIQRSRYGSQQSFYVTEKISRSNYFAVQGMSQEAKDSIKREIEMLNEQIDERKKVYESHRSAAERYSRERNELKQQMLAVKSEQQELVKISQQVNDLQTSITLKKERAEKLEEDANKDYSSKVHAYEQKIQQKYDIFGDASASISSALVEMAEKDNQARLKMISMINFKNRKSAAESLVRELRRMQEKLKDDYNRYKREYDEIKQSDAYVEIERQNQAYTDEERTRLAELAEEYVTNGTFTEATILSKIELLRAELSLLTGGDKSSIDALKKKLQDIKDAERYLPELESKKEQLDKQISDLQEKYESELSELVEKISVAFKKRFTKVASDGRVQLAKSDRFKDWKLQILVKFREESELKVLDHQSQSGGERAVSTIFFIMSLQGLTDAPFRIVDEINQGMDPKNEQMAHRYLVHTACQNNRSQYFLVTPKLLTGLYYHPDMVVHCIFTGPYITDDHKDKRDKNQLLLNFAV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.68
3	0.69
4	0.7
5	0.73
6	0.81
7	0.78
8	0.75
9	0.74
10	0.68
11	0.67
12	0.64
13	0.64
14	0.58
15	0.64
16	0.63
17	0.6
18	0.57
19	0.52
20	0.47
21	0.4
22	0.4
23	0.32
24	0.33
25	0.28
26	0.28
27	0.25
28	0.22
29	0.21
30	0.22
31	0.21
32	0.18
33	0.2
34	0.2
35	0.18
36	0.18
37	0.18
38	0.15
39	0.15
40	0.14
41	0.13
42	0.12
43	0.13
44	0.13
45	0.12
46	0.12
47	0.12
48	0.14
49	0.12
50	0.13
51	0.13
52	0.13
53	0.13
54	0.11
55	0.1
56	0.08
57	0.07
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.08
62	0.14
63	0.16
64	0.22
65	0.3
66	0.33
67	0.42
68	0.49
69	0.58
70	0.6
71	0.69
72	0.7
73	0.68
74	0.69
75	0.63
76	0.58
77	0.49
78	0.43
79	0.34
80	0.28
81	0.21
82	0.18
83	0.15
84	0.13
85	0.13
86	0.14
87	0.13
88	0.1
89	0.12
90	0.12
91	0.12
92	0.16
93	0.2
94	0.23
95	0.3
96	0.31
97	0.32
98	0.35
99	0.43
100	0.39
101	0.37
102	0.39
103	0.33
104	0.36
105	0.37
106	0.34
107	0.28
108	0.3
109	0.29
110	0.29
111	0.31
112	0.28
113	0.27
114	0.28
115	0.33
116	0.37
117	0.41
118	0.43
119	0.49
120	0.54
121	0.6
122	0.64
123	0.66
124	0.66
125	0.7
126	0.66
127	0.64
128	0.64
129	0.56
130	0.52
131	0.45
132	0.39
133	0.3
134	0.25
135	0.19
136	0.13
137	0.15
138	0.17
139	0.19
140	0.21
141	0.2
142	0.22
143	0.22
144	0.22
145	0.2
146	0.17
147	0.19
148	0.15
149	0.15
150	0.13
151	0.13
152	0.13
153	0.13
154	0.13
155	0.09
156	0.13
157	0.14
158	0.15
159	0.15
160	0.15
161	0.15
162	0.14
163	0.17
164	0.17
165	0.2
166	0.23
167	0.25
168	0.26
169	0.27
170	0.28
171	0.26
172	0.23
173	0.24
174	0.26
175	0.29
176	0.28
177	0.28
178	0.28
179	0.26
180	0.25
181	0.23
182	0.17
183	0.17
184	0.2
185	0.22
186	0.23
187	0.24
188	0.27
189	0.32
190	0.36
191	0.35
192	0.33
193	0.33
194	0.35
195	0.38
196	0.4
197	0.42
198	0.48
199	0.47
200	0.48
201	0.46
202	0.43
203	0.42
204	0.4
205	0.37
206	0.37
207	0.34
208	0.37
209	0.39
210	0.37
211	0.34
212	0.37
213	0.39
214	0.34
215	0.4
216	0.38
217	0.37
218	0.38
219	0.4
220	0.36
221	0.33
222	0.35
223	0.3
224	0.27
225	0.26
226	0.25
227	0.23
228	0.24
229	0.17
230	0.12
231	0.13
232	0.17
233	0.18
234	0.19
235	0.3
236	0.34
237	0.43
238	0.5
239	0.56
240	0.61
241	0.65
242	0.73
243	0.67
244	0.7
245	0.7
246	0.71
247	0.71
248	0.7
249	0.68
250	0.7
251	0.74
252	0.72
253	0.67
254	0.66
255	0.64
256	0.68
257	0.7
258	0.7
259	0.68
260	0.67
261	0.64
262	0.57
263	0.53
264	0.42
265	0.4
266	0.3
267	0.23
268	0.18
269	0.22
270	0.2
271	0.18
272	0.22
273	0.2
274	0.2
275	0.2
276	0.19
277	0.15
278	0.18
279	0.2
280	0.19
281	0.21
282	0.22
283	0.22
284	0.23
285	0.23
286	0.21
287	0.21
288	0.18
289	0.17
290	0.2
291	0.2
292	0.22
293	0.3
294	0.32
295	0.33
296	0.38
297	0.38
298	0.35
299	0.41
300	0.45
301	0.46
302	0.47
303	0.54
304	0.54
305	0.57
306	0.6
307	0.62
308	0.59
309	0.5
310	0.45
311	0.36
312	0.31
313	0.26
314	0.21
315	0.13
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.1
320	0.1
321	0.15
322	0.2
323	0.29
324	0.39
325	0.5
326	0.58
327	0.65
328	0.73
329	0.72
330	0.76
331	0.7
332	0.64
333	0.63
334	0.61
335	0.6
336	0.53
337	0.5
338	0.43
339	0.41
340	0.44
341	0.37
342	0.37
343	0.38
344	0.39
345	0.45
346	0.5
347	0.5
348	0.44
349	0.41
350	0.43
351	0.4
352	0.42
353	0.36
354	0.3
355	0.28
356	0.28
357	0.27
358	0.19
359	0.15
360	0.11
361	0.13
362	0.13
363	0.14
364	0.17
365	0.19
366	0.21
367	0.25
368	0.27
369	0.28
370	0.3
371	0.34
372	0.38
373	0.4
374	0.36
375	0.35
376	0.33
377	0.3
378	0.28
379	0.24
380	0.16
381	0.14
382	0.14
383	0.14
384	0.14
385	0.14
386	0.13
387	0.14
388	0.15
389	0.14
390	0.13
391	0.12
392	0.13
393	0.19
394	0.24
395	0.25
396	0.25
397	0.24
398	0.27
399	0.28
400	0.32
401	0.31
402	0.31
403	0.32
404	0.38
405	0.44
406	0.45
407	0.46
408	0.43
409	0.39
410	0.36
411	0.32
412	0.24
413	0.19
414	0.15
415	0.15
416	0.12
417	0.11
418	0.1
419	0.1
420	0.1
421	0.11
422	0.13
423	0.17
424	0.21
425	0.23
426	0.28
427	0.29
428	0.31
429	0.34
430	0.38
431	0.37
432	0.43
433	0.41
434	0.41
435	0.42
436	0.41
437	0.41
438	0.43
439	0.43
440	0.43
441	0.52
442	0.55
443	0.59
444	0.6
445	0.62
446	0.57
447	0.53
448	0.46
449	0.41
450	0.33
451	0.27
452	0.26
453	0.23
454	0.18
455	0.15
456	0.14
457	0.11
458	0.1
459	0.11
460	0.1
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.08
487	0.09
488	0.05
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.11
495	0.12
496	0.14
497	0.17
498	0.19
499	0.19
500	0.19
501	0.19
502	0.15
503	0.15
504	0.13
505	0.12
506	0.12
507	0.13
508	0.15
509	0.14
510	0.13
511	0.12
512	0.12
513	0.12
514	0.11
515	0.11
516	0.11
517	0.13
518	0.16
519	0.16
520	0.16
521	0.16
522	0.17
523	0.16
524	0.14
525	0.12
526	0.09
527	0.09
528	0.1
529	0.09
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.09
535	0.08
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.08
544	0.09
545	0.09
546	0.1
547	0.11
548	0.11
549	0.1
550	0.11
551	0.1
552	0.09
553	0.11
554	0.17
555	0.21
556	0.21
557	0.21
558	0.21
559	0.24
560	0.25
561	0.29
562	0.24
563	0.21
564	0.26
565	0.26
566	0.27
567	0.26
568	0.29
569	0.28
570	0.31
571	0.32
572	0.3
573	0.33
574	0.33
575	0.32
576	0.31
577	0.28
578	0.27
579	0.25
580	0.22
581	0.18
582	0.17
583	0.18
584	0.15
585	0.12
586	0.11
587	0.14
588	0.14
589	0.15
590	0.15
591	0.12
592	0.15
593	0.18
594	0.19
595	0.2
596	0.26
597	0.26
598	0.26
599	0.28
600	0.26
601	0.25
602	0.25
603	0.22
604	0.16
605	0.18
606	0.19
607	0.2
608	0.21
609	0.2
610	0.21
611	0.21
612	0.22
613	0.2
614	0.2
615	0.17
616	0.15
617	0.14
618	0.13
619	0.11
620	0.1
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.11
625	0.12
626	0.13
627	0.14
628	0.15
629	0.16
630	0.17
631	0.18
632	0.19
633	0.19
634	0.17
635	0.16
636	0.15
637	0.18
638	0.19
639	0.17
640	0.15
641	0.16
642	0.15
643	0.2
644	0.26
645	0.33
646	0.35
647	0.37
648	0.43
649	0.43
650	0.43
651	0.43
652	0.44
653	0.37
654	0.37
655	0.42
656	0.37
657	0.41
658	0.44
659	0.43
660	0.47
661	0.49
662	0.46
663	0.39
664	0.39
665	0.38
666	0.35
667	0.32
668	0.23
669	0.22
670	0.22
671	0.21
672	0.21
673	0.17
674	0.17
675	0.18
676	0.19
677	0.17
678	0.19
679	0.18
680	0.2
681	0.22
682	0.23
683	0.22
684	0.21
685	0.18
686	0.15
687	0.15
688	0.14
689	0.14
690	0.15
691	0.16
692	0.16
693	0.2
694	0.27
695	0.3
696	0.32
697	0.35
698	0.33
699	0.35
700	0.41
701	0.39
702	0.37
703	0.36
704	0.33
705	0.28
706	0.27
707	0.23
708	0.17
709	0.2
710	0.16
711	0.15
712	0.21
713	0.27
714	0.32
715	0.41
716	0.49
717	0.53
718	0.54
719	0.53
720	0.49
721	0.45
722	0.41
723	0.35
724	0.29
725	0.2
726	0.18
727	0.19
728	0.15
729	0.14
730	0.12
731	0.09
732	0.07
733	0.06
734	0.06
735	0.05
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.05
740	0.07
741	0.08
742	0.08
743	0.09
744	0.13
745	0.14
746	0.15
747	0.15
748	0.14
749	0.15
750	0.19
751	0.2
752	0.22
753	0.27
754	0.3
755	0.38
756	0.42
757	0.41
758	0.43
759	0.42
760	0.39
761	0.39
762	0.4
763	0.36
764	0.4
765	0.42
766	0.4
767	0.47
768	0.45
769	0.4
770	0.36
771	0.37
772	0.36
773	0.37
774	0.35
775	0.37
776	0.42
777	0.46
778	0.53
779	0.52
780	0.51
781	0.59
782	0.65
783	0.64
784	0.63
785	0.61
786	0.55
787	0.57
788	0.58
789	0.52
790	0.54
791	0.49
792	0.48
793	0.45
794	0.43
795	0.35
796	0.29
797	0.26
798	0.16
799	0.17
800	0.17
801	0.19
802	0.2
803	0.2
804	0.19
805	0.17
806	0.17
807	0.17
808	0.18
809	0.22
810	0.24
811	0.24
812	0.25
813	0.26
814	0.25
815	0.23
816	0.2
817	0.15
818	0.13
819	0.15
820	0.14
821	0.13
822	0.12
823	0.12
824	0.12
825	0.09
826	0.08
827	0.07
828	0.06
829	0.06
830	0.08
831	0.08
832	0.09
833	0.1
834	0.1
835	0.09
836	0.12
837	0.12
838	0.11
839	0.12
840	0.13
841	0.13
842	0.13
843	0.13
844	0.11
845	0.11
846	0.1
847	0.09
848	0.08
849	0.07
850	0.07
851	0.07
852	0.07
853	0.08
854	0.11
855	0.14
856	0.16
857	0.2
858	0.25
859	0.32
860	0.34
861	0.39
862	0.42
863	0.42
864	0.48
865	0.51
866	0.55
867	0.57
868	0.56
869	0.52
870	0.46
871	0.46
872	0.38
873	0.33
874	0.29
875	0.22
876	0.24
877	0.29
878	0.3
879	0.33
880	0.37
881	0.37
882	0.42
883	0.47
884	0.45
885	0.44
886	0.48
887	0.45
888	0.44
889	0.43
890	0.37
891	0.34
892	0.32
893	0.31
894	0.29
895	0.27
896	0.24
897	0.24
898	0.22
899	0.21
900	0.21
901	0.17
902	0.14
903	0.14
904	0.13
905	0.17
906	0.19
907	0.21
908	0.25
909	0.31
910	0.39
911	0.43
912	0.48
913	0.46
914	0.51
915	0.55
916	0.61
917	0.6
918	0.56
919	0.56
920	0.54
921	0.54
922	0.45
923	0.41
924	0.39
925	0.4
926	0.42
927	0.43
928	0.44
929	0.47
930	0.5
931	0.54
932	0.53
933	0.55
934	0.54
935	0.57
936	0.58
937	0.62
938	0.64
939	0.58
940	0.54
941	0.45
942	0.48
943	0.41
944	0.38
945	0.35
946	0.34
947	0.31
948	0.34
949	0.36
950	0.34
951	0.34
952	0.31
953	0.26
954	0.25
955	0.26
956	0.23
957	0.22
958	0.16
959	0.16
960	0.16
961	0.16
962	0.14
963	0.13
964	0.1
965	0.09
966	0.09
967	0.08
968	0.08
969	0.08
970	0.07
971	0.07
972	0.07
973	0.07
974	0.08
975	0.11
976	0.11
977	0.11
978	0.12
979	0.12
980	0.14
981	0.15
982	0.15
983	0.18
984	0.19
985	0.19
986	0.2
987	0.2
988	0.19
989	0.2
990	0.21
991	0.18
992	0.22
993	0.23
994	0.23
995	0.28
996	0.32
997	0.34
998	0.35
999	0.33
1000	0.32
1001	0.31
1002	0.34
1003	0.33
1004	0.35
1005	0.39
1006	0.4
1007	0.45
1008	0.48
1009	0.48
1010	0.49
1011	0.44
1012	0.41
1013	0.4
1014	0.41
1015	0.4
1016	0.34
1017	0.33
1018	0.3
1019	0.3
1020	0.27
1021	0.21
1022	0.19
1023	0.2
1024	0.2
1025	0.22
1026	0.21
1027	0.19
1028	0.21
1029	0.21
1030	0.24
1031	0.2
1032	0.18
1033	0.16
1034	0.16
1035	0.16
1036	0.16
1037	0.17
1038	0.12
1039	0.12
1040	0.15
1041	0.18
1042	0.22
1043	0.29
1044	0.36
1045	0.42
1046	0.51
1047	0.54
1048	0.61
1049	0.69
1050	0.7
1051	0.71
1052	0.73
1053	0.69

C5M401

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer