Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M4S4

Protein Details
Accession C5M4S4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
554-581SPKKSGSSKVSPSPKKRKKDALLPGQTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
554-572SPKKSGSSKVSPSPKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006974  P:DNA damage response  
KEGG ctp:CTRG_01064  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGIPELWELLKPGFSRRVSIDELVDEFIKNHQRTPRIAIDAYSFIFQADHSSITVEDKDTILIQNVMSKILALIGLNISVVVVFDGVLKPQKTKSKENSGMMYEQELERLSLIGSCSEHHPVVEKVKDQLRRNKINYVQAAGEGEAQCAYLQKLGIVDYCLSQDGDALVFGANKVLRNFSKYLEDIGRSPSKKSDAKLKQTYYVTPVDIKVIEKETGLSVERLIFLASLRGGDYSAGVRKIGITNAKNLALCGTSRALYHSREKSKIELKELKKNQTQENTLPPPDFANELIQCFVSDRLPRLHPWESRLEPEVRHQKFTAFLNLINYHIKENNRDIFGRKLTIDEGVEFDEYYTMLYLFPLINDRIPIFKPDTLGSGELKADQSINLSGSLIRLSSCDGKYYKQNVGISIRGLPNESKFFFIPSTYNWSIKYVLIKLLTHPSTSVKVTNFKEEAGVEKLMLKFDINEVCKQFPECTEARKSPGSSSPGRNYIWVPKSLVELHAPNLLEEFINQRHEQEYIKKHKCSPQKTTLDAFGLSPSKKPPVPFDLKSISPKKSGSSKVSPSPKKRKKDALLPGQTSLDFFMKKSDAPKKKNIITNNIPDLSRNEAHVAFKEDDNPFVDSPGEAHVEFNQDDDPFVVSEAHVQFKDNDNPFLEAPMNDATRRADAFFLSLPDIKTDDIFVKRRPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.33
3 0.35
4 0.4
5 0.4
6 0.42
7 0.38
8 0.32
9 0.33
10 0.31
11 0.28
12 0.23
13 0.19
14 0.23
15 0.3
16 0.27
17 0.32
18 0.37
19 0.41
20 0.45
21 0.52
22 0.54
23 0.5
24 0.51
25 0.46
26 0.43
27 0.41
28 0.39
29 0.32
30 0.24
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.15
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.13
39 0.14
40 0.16
41 0.18
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.15
47 0.15
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.15
55 0.14
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.07
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.05
72 0.06
73 0.08
74 0.14
75 0.15
76 0.18
77 0.25
78 0.33
79 0.38
80 0.47
81 0.55
82 0.6
83 0.68
84 0.7
85 0.69
86 0.65
87 0.61
88 0.52
89 0.45
90 0.35
91 0.27
92 0.23
93 0.18
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.14
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.19
108 0.2
109 0.27
110 0.3
111 0.29
112 0.31
113 0.38
114 0.46
115 0.5
116 0.57
117 0.59
118 0.65
119 0.67
120 0.7
121 0.7
122 0.71
123 0.66
124 0.59
125 0.5
126 0.41
127 0.38
128 0.3
129 0.28
130 0.19
131 0.17
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.08
159 0.09
160 0.11
161 0.12
162 0.16
163 0.17
164 0.22
165 0.23
166 0.23
167 0.27
168 0.26
169 0.29
170 0.28
171 0.28
172 0.25
173 0.3
174 0.36
175 0.31
176 0.32
177 0.31
178 0.35
179 0.37
180 0.38
181 0.43
182 0.44
183 0.53
184 0.61
185 0.59
186 0.59
187 0.58
188 0.58
189 0.51
190 0.44
191 0.35
192 0.28
193 0.26
194 0.21
195 0.2
196 0.19
197 0.16
198 0.17
199 0.16
200 0.14
201 0.14
202 0.13
203 0.14
204 0.14
205 0.12
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.15
229 0.2
230 0.18
231 0.22
232 0.25
233 0.26
234 0.25
235 0.24
236 0.22
237 0.15
238 0.14
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.14
244 0.15
245 0.18
246 0.26
247 0.32
248 0.36
249 0.39
250 0.41
251 0.43
252 0.48
253 0.48
254 0.49
255 0.5
256 0.49
257 0.55
258 0.6
259 0.61
260 0.59
261 0.59
262 0.57
263 0.54
264 0.54
265 0.47
266 0.5
267 0.47
268 0.44
269 0.4
270 0.34
271 0.28
272 0.24
273 0.22
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.15
287 0.17
288 0.18
289 0.23
290 0.28
291 0.27
292 0.3
293 0.34
294 0.32
295 0.33
296 0.35
297 0.31
298 0.26
299 0.32
300 0.39
301 0.33
302 0.34
303 0.32
304 0.3
305 0.31
306 0.32
307 0.29
308 0.2
309 0.19
310 0.21
311 0.21
312 0.22
313 0.21
314 0.2
315 0.15
316 0.18
317 0.18
318 0.17
319 0.21
320 0.23
321 0.23
322 0.23
323 0.24
324 0.25
325 0.25
326 0.24
327 0.19
328 0.17
329 0.15
330 0.16
331 0.14
332 0.1
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.13
356 0.13
357 0.14
358 0.15
359 0.14
360 0.16
361 0.15
362 0.16
363 0.14
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.11
368 0.1
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.07
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.07
383 0.12
384 0.12
385 0.15
386 0.16
387 0.18
388 0.25
389 0.29
390 0.31
391 0.31
392 0.32
393 0.32
394 0.34
395 0.33
396 0.27
397 0.26
398 0.24
399 0.19
400 0.19
401 0.17
402 0.16
403 0.19
404 0.19
405 0.17
406 0.16
407 0.17
408 0.16
409 0.17
410 0.15
411 0.13
412 0.21
413 0.21
414 0.23
415 0.22
416 0.23
417 0.24
418 0.24
419 0.25
420 0.17
421 0.18
422 0.19
423 0.18
424 0.19
425 0.25
426 0.24
427 0.21
428 0.21
429 0.2
430 0.2
431 0.22
432 0.23
433 0.18
434 0.25
435 0.26
436 0.32
437 0.3
438 0.28
439 0.28
440 0.24
441 0.25
442 0.21
443 0.2
444 0.14
445 0.16
446 0.17
447 0.16
448 0.16
449 0.12
450 0.1
451 0.12
452 0.19
453 0.17
454 0.21
455 0.23
456 0.23
457 0.24
458 0.25
459 0.23
460 0.18
461 0.21
462 0.19
463 0.22
464 0.28
465 0.29
466 0.32
467 0.34
468 0.34
469 0.32
470 0.37
471 0.37
472 0.37
473 0.41
474 0.43
475 0.44
476 0.43
477 0.42
478 0.38
479 0.42
480 0.39
481 0.35
482 0.31
483 0.27
484 0.3
485 0.29
486 0.28
487 0.22
488 0.2
489 0.19
490 0.22
491 0.21
492 0.17
493 0.17
494 0.15
495 0.12
496 0.11
497 0.14
498 0.13
499 0.17
500 0.17
501 0.17
502 0.18
503 0.2
504 0.22
505 0.26
506 0.34
507 0.41
508 0.48
509 0.51
510 0.55
511 0.62
512 0.69
513 0.69
514 0.68
515 0.68
516 0.68
517 0.69
518 0.67
519 0.63
520 0.55
521 0.47
522 0.38
523 0.31
524 0.29
525 0.24
526 0.23
527 0.22
528 0.25
529 0.27
530 0.28
531 0.3
532 0.35
533 0.43
534 0.43
535 0.47
536 0.47
537 0.48
538 0.55
539 0.55
540 0.49
541 0.45
542 0.44
543 0.42
544 0.45
545 0.49
546 0.48
547 0.5
548 0.53
549 0.58
550 0.68
551 0.73
552 0.75
553 0.79
554 0.81
555 0.82
556 0.84
557 0.86
558 0.84
559 0.85
560 0.84
561 0.84
562 0.85
563 0.78
564 0.71
565 0.62
566 0.54
567 0.44
568 0.36
569 0.28
570 0.19
571 0.16
572 0.18
573 0.18
574 0.2
575 0.28
576 0.36
577 0.43
578 0.49
579 0.59
580 0.63
581 0.7
582 0.75
583 0.73
584 0.72
585 0.71
586 0.73
587 0.71
588 0.65
589 0.57
590 0.52
591 0.47
592 0.45
593 0.37
594 0.3
595 0.26
596 0.25
597 0.28
598 0.29
599 0.32
600 0.27
601 0.27
602 0.32
603 0.29
604 0.3
605 0.3
606 0.3
607 0.25
608 0.23
609 0.23
610 0.16
611 0.16
612 0.16
613 0.17
614 0.13
615 0.14
616 0.15
617 0.19
618 0.19
619 0.19
620 0.18
621 0.16
622 0.16
623 0.16
624 0.15
625 0.11
626 0.12
627 0.11
628 0.09
629 0.16
630 0.18
631 0.22
632 0.2
633 0.22
634 0.24
635 0.3
636 0.39
637 0.36
638 0.38
639 0.35
640 0.39
641 0.37
642 0.37
643 0.33
644 0.23
645 0.23
646 0.25
647 0.25
648 0.22
649 0.24
650 0.23
651 0.25
652 0.26
653 0.24
654 0.2
655 0.19
656 0.22
657 0.21
658 0.21
659 0.21
660 0.23
661 0.22
662 0.23
663 0.23
664 0.21
665 0.2
666 0.2
667 0.22
668 0.27
669 0.31