Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6U6W9

Protein Details
Accession A0A5N6U6W9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-38MDEALKKPTKRRFRKADGIDLEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-30ALKKPTKRRFRK
260-275RKMRARQIAASKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MLDPAVRRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRKADGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAVNRRQGKPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTSLGKLPINKEALIASGIGKVIVFYTRSKRPEPGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAEFDPRKIMRTTQSAQATAAEARARELLPPRLANRARADITHTSYTVVPRPTMVQESKFARPLGASGEDRFRKMRARQIAASKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.6
3 0.57
4 0.5
5 0.47
6 0.48
7 0.45
8 0.42
9 0.45
10 0.51
11 0.6
12 0.69
13 0.75
14 0.76
15 0.79
16 0.87
17 0.86
18 0.86
19 0.81
20 0.77
21 0.69
22 0.59
23 0.5
24 0.39
25 0.31
26 0.21
27 0.14
28 0.08
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.12
37 0.17
38 0.2
39 0.25
40 0.27
41 0.3
42 0.33
43 0.35
44 0.38
45 0.37
46 0.35
47 0.34
48 0.34
49 0.32
50 0.32
51 0.34
52 0.36
53 0.41
54 0.51
55 0.54
56 0.54
57 0.56
58 0.54
59 0.58
60 0.56
61 0.47
62 0.37
63 0.28
64 0.28
65 0.25
66 0.24
67 0.18
68 0.15
69 0.18
70 0.18
71 0.17
72 0.15
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.15
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.07
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.11
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.08
136 0.13
137 0.19
138 0.23
139 0.25
140 0.27
141 0.31
142 0.4
143 0.44
144 0.49
145 0.5
146 0.49
147 0.5
148 0.5
149 0.47
150 0.39
151 0.33
152 0.25
153 0.24
154 0.22
155 0.2
156 0.18
157 0.17
158 0.18
159 0.18
160 0.18
161 0.14
162 0.15
163 0.18
164 0.24
165 0.31
166 0.31
167 0.32
168 0.34
169 0.36
170 0.35
171 0.34
172 0.29
173 0.22
174 0.26
175 0.27
176 0.33
177 0.32
178 0.3
179 0.32
180 0.32
181 0.33
182 0.28
183 0.27
184 0.23
185 0.29
186 0.31
187 0.36
188 0.38
189 0.36
190 0.35
191 0.33
192 0.29
193 0.22
194 0.22
195 0.15
196 0.12
197 0.12
198 0.14
199 0.13
200 0.15
201 0.19
202 0.23
203 0.27
204 0.31
205 0.31
206 0.39
207 0.41
208 0.44
209 0.43
210 0.44
211 0.41
212 0.37
213 0.42
214 0.37
215 0.41
216 0.38
217 0.33
218 0.28
219 0.29
220 0.31
221 0.31
222 0.27
223 0.22
224 0.2
225 0.23
226 0.25
227 0.3
228 0.31
229 0.28
230 0.33
231 0.38
232 0.41
233 0.43
234 0.4
235 0.34
236 0.3
237 0.28
238 0.27
239 0.28
240 0.25
241 0.24
242 0.34
243 0.35
244 0.38
245 0.39
246 0.37
247 0.39
248 0.43
249 0.5
250 0.5
251 0.55
252 0.6
253 0.67
254 0.73
255 0.71