Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TYC5

Protein Details
Accession A0A5N6TYC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-67EASRALRKKLKYGNVHRQLRAHydrophilic
132-153VTALYRQLPKRKQPANQAKAKVHydrophilic
182-215SGSKHKHSSSKSLKKEKKEKRTRDRTFNLDREKPBasic
252-271INRFEKCKQLRRQVLRYIQHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-204KHKHSSSKSLKKEKKEKRTR
Subcellular Location(s) plas 22, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR045007  LSB5  
IPR011701  MFS  
IPR020846  MFS_dom  
IPR036259  MFS_trans_sf  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0022857  F:transmembrane transporter activity  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF07690  MFS_1  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50850  MFS  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd17502  MFS_Azr1_MDR_like  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MFHSSKPYSAVSVQIEVLTSEQYEVDDSSGIPDLIEAVIIQGSGPSEASRALRKKLKYGNVHRQLRALTILDFLIQNSGDRFLREFADESLLERLRISATDPVSDPKVKEKCKQLFGQWAVTYKNTPGMERVTALYRQLPKRKQPANQAKAKVLRESGTSEEPPMGHTVSISAGNGPATVLSGSKHKHSSSKSLKKEKKEKRTRDRTFNLDREKPEILQTLASSSVASTNLLNALKLVNRETHRVSEDAEVINRFEKCKQLRRQVLRYIQHVESEEFLGSLIHANEELVDALMAFEVLDKSVDYDSDSDQDVLESGWSPDRDDRDQQSFAGLVVNPVKPPRPARPMSLSIPSSSRQRMYNSDSDTDTDEDDDEDNPFGDRNAIRTPNTERFEPSWCSPCFMTNHPSFDYRHPLLMTFSSSANIQQTPLLEQRNVNATVGVDPEPGTKQLALTLGSVWVGVFLAALDSTIVATLTGPISSSFHCFSLLSWLATAYLIANAACQPVSGRLTDIFSRRAGLIFCNIFFAAGNLVCGFARSESVMVLGRIVAGIGGGGLTAIGTIVTSDLVPLRQRGVWQGFGNICFGAGGALGGVFGGLINDTLGWRWAFLLQVPFIVVSGILVCVKLKLPTKETGVAKLKRVDFLGLTTLVVALVLLLLGLNTGGSQLPWTHPLVITSLSLSAGFLGVFVYIEARIASEPVIPVWLLLDRTVLSVCLTNWFTNMSVYGLIFYLPLFLQVQGSSATAAGARLIPQAIGTSVGGMASGVLMRATGRYQIYSYVSMALLVVSSALVCTLTFTSPSWLPFVYFFLVGLAFGGILTITLVALISAVDHDHHAVVTSASYAFRSTGSTIGITIASAVFQNVLKMGLWSRFGDREHAEELISRIRDNLKELKNLPPGLKTGALAAFMESLRAVFLTLLGLTILGTLFTRTEEEPEASNRREE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.2
4 0.19
5 0.14
6 0.11
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.09
15 0.11
16 0.13
17 0.12
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.06
24 0.05
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.05
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.1
35 0.14
36 0.22
37 0.27
38 0.35
39 0.42
40 0.45
41 0.53
42 0.6
43 0.67
44 0.68
45 0.74
46 0.77
47 0.8
48 0.86
49 0.78
50 0.73
51 0.65
52 0.57
53 0.5
54 0.4
55 0.31
56 0.24
57 0.22
58 0.19
59 0.18
60 0.15
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.17
69 0.17
70 0.19
71 0.2
72 0.2
73 0.19
74 0.23
75 0.22
76 0.21
77 0.27
78 0.25
79 0.23
80 0.22
81 0.21
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.17
86 0.17
87 0.2
88 0.21
89 0.24
90 0.28
91 0.31
92 0.3
93 0.33
94 0.41
95 0.43
96 0.49
97 0.56
98 0.6
99 0.64
100 0.69
101 0.66
102 0.67
103 0.66
104 0.67
105 0.58
106 0.54
107 0.49
108 0.45
109 0.4
110 0.31
111 0.34
112 0.27
113 0.25
114 0.24
115 0.26
116 0.26
117 0.26
118 0.27
119 0.23
120 0.24
121 0.25
122 0.28
123 0.32
124 0.4
125 0.48
126 0.54
127 0.59
128 0.68
129 0.74
130 0.75
131 0.78
132 0.8
133 0.8
134 0.81
135 0.77
136 0.75
137 0.75
138 0.7
139 0.63
140 0.54
141 0.47
142 0.4
143 0.38
144 0.35
145 0.32
146 0.3
147 0.27
148 0.26
149 0.25
150 0.23
151 0.22
152 0.18
153 0.13
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.11
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.12
170 0.14
171 0.19
172 0.23
173 0.24
174 0.31
175 0.35
176 0.45
177 0.51
178 0.59
179 0.65
180 0.72
181 0.78
182 0.81
183 0.88
184 0.88
185 0.88
186 0.89
187 0.9
188 0.9
189 0.94
190 0.92
191 0.92
192 0.88
193 0.86
194 0.85
195 0.83
196 0.81
197 0.76
198 0.69
199 0.63
200 0.58
201 0.5
202 0.44
203 0.38
204 0.29
205 0.24
206 0.22
207 0.19
208 0.17
209 0.16
210 0.12
211 0.09
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.14
224 0.15
225 0.18
226 0.2
227 0.24
228 0.27
229 0.29
230 0.3
231 0.29
232 0.29
233 0.26
234 0.27
235 0.24
236 0.23
237 0.2
238 0.19
239 0.21
240 0.2
241 0.19
242 0.17
243 0.24
244 0.29
245 0.38
246 0.47
247 0.54
248 0.63
249 0.71
250 0.77
251 0.78
252 0.8
253 0.75
254 0.71
255 0.66
256 0.57
257 0.5
258 0.44
259 0.36
260 0.28
261 0.24
262 0.19
263 0.13
264 0.12
265 0.09
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.12
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.09
304 0.09
305 0.11
306 0.14
307 0.18
308 0.21
309 0.25
310 0.29
311 0.31
312 0.32
313 0.31
314 0.29
315 0.24
316 0.21
317 0.19
318 0.14
319 0.11
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.15
324 0.17
325 0.18
326 0.23
327 0.28
328 0.33
329 0.35
330 0.39
331 0.44
332 0.48
333 0.47
334 0.49
335 0.42
336 0.35
337 0.35
338 0.31
339 0.29
340 0.27
341 0.26
342 0.22
343 0.24
344 0.28
345 0.32
346 0.36
347 0.35
348 0.35
349 0.33
350 0.32
351 0.31
352 0.26
353 0.21
354 0.15
355 0.12
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.08
366 0.08
367 0.11
368 0.15
369 0.18
370 0.19
371 0.22
372 0.28
373 0.34
374 0.36
375 0.34
376 0.32
377 0.31
378 0.35
379 0.36
380 0.32
381 0.3
382 0.28
383 0.29
384 0.27
385 0.28
386 0.26
387 0.25
388 0.29
389 0.25
390 0.28
391 0.28
392 0.3
393 0.29
394 0.29
395 0.34
396 0.28
397 0.27
398 0.24
399 0.22
400 0.22
401 0.2
402 0.19
403 0.13
404 0.12
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.09
413 0.11
414 0.14
415 0.15
416 0.14
417 0.15
418 0.16
419 0.19
420 0.2
421 0.16
422 0.13
423 0.12
424 0.12
425 0.13
426 0.12
427 0.08
428 0.07
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.08
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.06
444 0.05
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.02
449 0.02
450 0.02
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.02
457 0.02
458 0.02
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.06
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.15
473 0.16
474 0.13
475 0.13
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.05
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.05
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.06
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.09
495 0.11
496 0.13
497 0.15
498 0.15
499 0.14
500 0.15
501 0.14
502 0.15
503 0.13
504 0.11
505 0.13
506 0.12
507 0.12
508 0.13
509 0.12
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.07
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.06
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.06
527 0.07
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.03
535 0.02
536 0.02
537 0.02
538 0.02
539 0.02
540 0.02
541 0.02
542 0.01
543 0.02
544 0.02
545 0.02
546 0.02
547 0.02
548 0.02
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.04
553 0.05
554 0.06
555 0.07
556 0.09
557 0.09
558 0.1
559 0.15
560 0.18
561 0.21
562 0.2
563 0.24
564 0.23
565 0.23
566 0.23
567 0.18
568 0.14
569 0.1
570 0.09
571 0.06
572 0.04
573 0.04
574 0.02
575 0.02
576 0.02
577 0.02
578 0.02
579 0.02
580 0.02
581 0.02
582 0.02
583 0.02
584 0.02
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.06
592 0.06
593 0.07
594 0.08
595 0.11
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.09
600 0.09
601 0.08
602 0.06
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.05
610 0.06
611 0.1
612 0.15
613 0.18
614 0.21
615 0.25
616 0.29
617 0.36
618 0.36
619 0.4
620 0.44
621 0.44
622 0.45
623 0.47
624 0.44
625 0.39
626 0.39
627 0.32
628 0.23
629 0.21
630 0.2
631 0.14
632 0.13
633 0.11
634 0.1
635 0.08
636 0.08
637 0.06
638 0.03
639 0.02
640 0.02
641 0.02
642 0.02
643 0.02
644 0.02
645 0.02
646 0.02
647 0.02
648 0.03
649 0.03
650 0.03
651 0.04
652 0.05
653 0.07
654 0.1
655 0.11
656 0.12
657 0.13
658 0.13
659 0.14
660 0.14
661 0.13
662 0.11
663 0.1
664 0.09
665 0.09
666 0.08
667 0.07
668 0.05
669 0.05
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.06
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.08
687 0.07
688 0.07
689 0.07
690 0.08
691 0.08
692 0.07
693 0.08
694 0.08
695 0.09
696 0.09
697 0.09
698 0.08
699 0.09
700 0.09
701 0.13
702 0.15
703 0.14
704 0.14
705 0.16
706 0.15
707 0.14
708 0.15
709 0.11
710 0.09
711 0.09
712 0.09
713 0.08
714 0.08
715 0.07
716 0.06
717 0.07
718 0.06
719 0.07
720 0.07
721 0.08
722 0.09
723 0.09
724 0.1
725 0.09
726 0.1
727 0.08
728 0.08
729 0.08
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.06
734 0.07
735 0.08
736 0.08
737 0.07
738 0.07
739 0.08
740 0.08
741 0.09
742 0.08
743 0.07
744 0.07
745 0.07
746 0.06
747 0.05
748 0.05
749 0.04
750 0.04
751 0.03
752 0.03
753 0.03
754 0.04
755 0.05
756 0.06
757 0.1
758 0.11
759 0.12
760 0.13
761 0.17
762 0.2
763 0.21
764 0.21
765 0.18
766 0.17
767 0.16
768 0.15
769 0.11
770 0.08
771 0.06
772 0.05
773 0.03
774 0.03
775 0.03
776 0.03
777 0.03
778 0.03
779 0.05
780 0.07
781 0.08
782 0.09
783 0.1
784 0.14
785 0.16
786 0.17
787 0.18
788 0.17
789 0.17
790 0.17
791 0.19
792 0.17
793 0.15
794 0.14
795 0.13
796 0.12
797 0.11
798 0.1
799 0.07
800 0.05
801 0.04
802 0.04
803 0.03
804 0.03
805 0.03
806 0.03
807 0.03
808 0.03
809 0.03
810 0.03
811 0.03
812 0.03
813 0.03
814 0.03
815 0.04
816 0.05
817 0.06
818 0.07
819 0.08
820 0.08
821 0.08
822 0.08
823 0.08
824 0.08
825 0.08
826 0.09
827 0.09
828 0.09
829 0.09
830 0.1
831 0.1
832 0.12
833 0.12
834 0.13
835 0.14
836 0.14
837 0.14
838 0.14
839 0.14
840 0.11
841 0.1
842 0.08
843 0.07
844 0.07
845 0.07
846 0.07
847 0.07
848 0.08
849 0.08
850 0.09
851 0.09
852 0.1
853 0.13
854 0.15
855 0.18
856 0.19
857 0.23
858 0.26
859 0.27
860 0.32
861 0.31
862 0.32
863 0.31
864 0.3
865 0.27
866 0.24
867 0.26
868 0.27
869 0.25
870 0.21
871 0.22
872 0.27
873 0.28
874 0.32
875 0.39
876 0.37
877 0.44
878 0.46
879 0.52
880 0.55
881 0.58
882 0.54
883 0.48
884 0.45
885 0.41
886 0.4
887 0.31
888 0.27
889 0.25
890 0.23
891 0.2
892 0.19
893 0.17
894 0.15
895 0.15
896 0.11
897 0.1
898 0.09
899 0.09
900 0.08
901 0.06
902 0.06
903 0.07
904 0.07
905 0.07
906 0.07
907 0.06
908 0.06
909 0.06
910 0.06
911 0.05
912 0.05
913 0.06
914 0.07
915 0.08
916 0.11
917 0.11
918 0.15
919 0.19
920 0.2
921 0.23
922 0.29
923 0.35