Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MD46

Protein Details
Accession C5MD46    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-222SDAKGGISRQDKKNKSKKTKLKSKSTSSSSSSSKVTKPKKNTKKLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-222RQDKKNKSKKTKLKSKSTSSSSSSSKVTKPKKNTKKLK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011082  Exosome-assoc_fac/DNA_repair  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ctp:CTRG_04147  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences MSNENIANVKLFIQSLSNSITNYSTSLTPLQNKSLSDLLTSLETSSDSSTNSSIKDQLTILNNYAYVLISTLFAYLKSIGVETDNHPIMKELSRIKESMKRLKNIDLDESQQIKLEQEKQKQEEEKKKNYLNKVIGVKSNGLGNATGPAISKKNFTGVHTKFDDESIENSPDLSSESDAKGGISRQDKKNKSKKTKLKSKSTSSSSSSSKVTKPKKNTKKLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.18
7 0.18
8 0.17
9 0.17
10 0.17
11 0.13
12 0.14
13 0.18
14 0.21
15 0.26
16 0.28
17 0.32
18 0.33
19 0.33
20 0.34
21 0.33
22 0.3
23 0.24
24 0.22
25 0.18
26 0.16
27 0.16
28 0.12
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.11
36 0.12
37 0.13
38 0.14
39 0.15
40 0.16
41 0.16
42 0.17
43 0.16
44 0.19
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.19
49 0.19
50 0.17
51 0.17
52 0.13
53 0.08
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.16
76 0.16
77 0.18
78 0.17
79 0.2
80 0.21
81 0.22
82 0.24
83 0.29
84 0.34
85 0.39
86 0.4
87 0.41
88 0.41
89 0.46
90 0.48
91 0.43
92 0.41
93 0.33
94 0.3
95 0.3
96 0.3
97 0.24
98 0.2
99 0.19
100 0.15
101 0.16
102 0.22
103 0.24
104 0.29
105 0.35
106 0.36
107 0.41
108 0.47
109 0.53
110 0.56
111 0.57
112 0.59
113 0.6
114 0.64
115 0.65
116 0.64
117 0.63
118 0.56
119 0.54
120 0.52
121 0.47
122 0.44
123 0.39
124 0.35
125 0.27
126 0.25
127 0.19
128 0.14
129 0.12
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.13
139 0.12
140 0.18
141 0.2
142 0.22
143 0.3
144 0.3
145 0.36
146 0.36
147 0.37
148 0.31
149 0.3
150 0.3
151 0.21
152 0.22
153 0.19
154 0.19
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.14
159 0.14
160 0.12
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.18
170 0.24
171 0.31
172 0.4
173 0.5
174 0.58
175 0.67
176 0.76
177 0.81
178 0.83
179 0.86
180 0.88
181 0.89
182 0.92
183 0.91
184 0.92
185 0.9
186 0.89
187 0.88
188 0.84
189 0.79
190 0.73
191 0.69
192 0.62
193 0.56
194 0.51
195 0.46
196 0.45
197 0.49
198 0.54
199 0.58
200 0.65
201 0.73
202 0.79