Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TMH6

Protein Details
Accession A0A5N6TMH6    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-213AKEQIKPPRKQPKHLKMRFRPVGSBasic
232-302QPTFKAPKELRKEKEERKRKHHQTDGEGTQPSGEPRKKSKHQSEGDDKAEKPKKSSKSKEEKKRKKADKAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-205KPPRKQPKHLK
237-257APKELRKEKEERKRKHHQTDG
259-302GTQPSGEPRKKSKHQSEGDDKAEKPKKSSKSKEEKKRKKADKAA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAPTKDQMSTSSDGDSRSNSPEVSKKQEAESSSDSSSDSDNESSASEEQSKQSKAKKVSFQAQPYKPPSGFKAAKKQTPPSSANLLNDLRGKQVFHITAPSSLPLSKVKEVSWGKVLQGQPVLKHEGVHYGIPVESIGQGDQGNKTLVLYDSKSQTYYTTANSNIQSYHIQELINLPERSEDNDPALEAAKEQIKPPRKQPKHLKMRFRPVGSEQGPAETIGSDSEESEEEQPTFKAPKELRKEKEERKRKHHQTDGEGTQPSGEPRKKSKHQSEGDDKAEKPKKSSKSKEEKKRKKADKAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.25
4 0.26
5 0.27
6 0.24
7 0.27
8 0.33
9 0.38
10 0.44
11 0.47
12 0.44
13 0.46
14 0.51
15 0.48
16 0.46
17 0.44
18 0.4
19 0.34
20 0.33
21 0.29
22 0.25
23 0.25
24 0.19
25 0.17
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.15
34 0.17
35 0.2
36 0.26
37 0.29
38 0.31
39 0.38
40 0.43
41 0.48
42 0.54
43 0.59
44 0.61
45 0.67
46 0.7
47 0.72
48 0.74
49 0.71
50 0.72
51 0.68
52 0.67
53 0.59
54 0.53
55 0.47
56 0.47
57 0.49
58 0.47
59 0.53
60 0.54
61 0.59
62 0.62
63 0.67
64 0.64
65 0.65
66 0.62
67 0.55
68 0.55
69 0.51
70 0.47
71 0.44
72 0.37
73 0.32
74 0.32
75 0.28
76 0.24
77 0.22
78 0.21
79 0.17
80 0.21
81 0.2
82 0.17
83 0.2
84 0.19
85 0.2
86 0.2
87 0.19
88 0.15
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.19
93 0.19
94 0.2
95 0.19
96 0.28
97 0.29
98 0.29
99 0.3
100 0.26
101 0.24
102 0.29
103 0.29
104 0.22
105 0.25
106 0.24
107 0.21
108 0.23
109 0.26
110 0.2
111 0.2
112 0.18
113 0.18
114 0.18
115 0.17
116 0.14
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.15
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.15
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.15
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.15
161 0.21
162 0.19
163 0.18
164 0.18
165 0.19
166 0.22
167 0.23
168 0.2
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.13
173 0.14
174 0.1
175 0.08
176 0.09
177 0.11
178 0.11
179 0.13
180 0.21
181 0.29
182 0.32
183 0.42
184 0.51
185 0.53
186 0.62
187 0.72
188 0.75
189 0.78
190 0.83
191 0.84
192 0.82
193 0.88
194 0.85
195 0.76
196 0.69
197 0.61
198 0.63
199 0.53
200 0.48
201 0.37
202 0.31
203 0.3
204 0.26
205 0.22
206 0.12
207 0.11
208 0.07
209 0.09
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.11
216 0.12
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.15
222 0.14
223 0.21
224 0.23
225 0.33
226 0.42
227 0.52
228 0.55
229 0.63
230 0.72
231 0.74
232 0.81
233 0.82
234 0.81
235 0.81
236 0.86
237 0.87
238 0.88
239 0.87
240 0.84
241 0.83
242 0.83
243 0.79
244 0.73
245 0.63
246 0.53
247 0.45
248 0.37
249 0.32
250 0.32
251 0.32
252 0.32
253 0.4
254 0.5
255 0.58
256 0.68
257 0.74
258 0.76
259 0.79
260 0.83
261 0.84
262 0.83
263 0.81
264 0.76
265 0.66
266 0.66
267 0.66
268 0.58
269 0.54
270 0.54
271 0.57
272 0.63
273 0.73
274 0.73
275 0.77
276 0.86
277 0.91
278 0.93
279 0.94
280 0.94
281 0.95
282 0.94