Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M9N6

Protein Details
Accession C5M9N6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24ILEERFKQKCKELKKRVLEVEESHydrophilic
84-103IKSKNGSKKGSKSKSKTTGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-97SKKGSKSK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.166, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG ctp:CTRG_02198  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MILEERFKQKCKELKKRVLEVEESNEIATIALSRTSASIRRLRLEYSILLERLEDRAKQIPDGIVSFEEMACPPTPTILDDSLIKSKNGSKKGSKSKSKTTGSGSGSGSGANASGSGGSGGGSGNGSGGSPSDVASTTMGKQKARDPDLPKRPTNAYLIFCELEKERIKSGDPNASDISRSMTEAWRNLSEEDRRPYFKLYEEDRIRYQREMTEYHQRKEGGEPELKKQKIEQKEQPEETEQQQEEPQEGEPQAEEQEEEEEAQPEEALVVDTAPTEPVEVPASSPAPIVSEQETVPPTEIEVDTEVTSEPEVEPETEASATPAAAVVAPTDTEAAINTETTEGSEAPQSESKDEPMN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.82
3 0.87
4 0.86
5 0.84
6 0.78
7 0.71
8 0.67
9 0.6
10 0.5
11 0.41
12 0.33
13 0.26
14 0.21
15 0.16
16 0.1
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.09
22 0.12
23 0.16
24 0.22
25 0.28
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.39
30 0.39
31 0.38
32 0.34
33 0.33
34 0.34
35 0.29
36 0.27
37 0.26
38 0.23
39 0.24
40 0.25
41 0.2
42 0.18
43 0.25
44 0.26
45 0.27
46 0.28
47 0.25
48 0.25
49 0.25
50 0.23
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.13
55 0.12
56 0.1
57 0.12
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.15
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.19
69 0.24
70 0.25
71 0.24
72 0.22
73 0.27
74 0.34
75 0.39
76 0.42
77 0.43
78 0.52
79 0.63
80 0.72
81 0.75
82 0.74
83 0.78
84 0.81
85 0.78
86 0.72
87 0.67
88 0.66
89 0.58
90 0.57
91 0.47
92 0.39
93 0.34
94 0.29
95 0.23
96 0.15
97 0.12
98 0.06
99 0.06
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.03
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.03
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.15
126 0.17
127 0.17
128 0.19
129 0.23
130 0.31
131 0.34
132 0.4
133 0.42
134 0.5
135 0.6
136 0.64
137 0.6
138 0.55
139 0.53
140 0.48
141 0.45
142 0.4
143 0.32
144 0.28
145 0.29
146 0.25
147 0.23
148 0.22
149 0.17
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.16
154 0.17
155 0.18
156 0.2
157 0.23
158 0.24
159 0.23
160 0.24
161 0.24
162 0.24
163 0.23
164 0.19
165 0.18
166 0.12
167 0.12
168 0.1
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.16
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.18
177 0.2
178 0.24
179 0.27
180 0.28
181 0.29
182 0.29
183 0.31
184 0.28
185 0.28
186 0.29
187 0.28
188 0.35
189 0.36
190 0.38
191 0.4
192 0.43
193 0.41
194 0.36
195 0.34
196 0.27
197 0.27
198 0.27
199 0.27
200 0.34
201 0.37
202 0.37
203 0.4
204 0.37
205 0.35
206 0.35
207 0.36
208 0.31
209 0.32
210 0.33
211 0.36
212 0.44
213 0.44
214 0.4
215 0.4
216 0.43
217 0.45
218 0.52
219 0.53
220 0.54
221 0.62
222 0.64
223 0.61
224 0.57
225 0.51
226 0.46
227 0.45
228 0.35
229 0.28
230 0.28
231 0.25
232 0.22
233 0.2
234 0.18
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.13
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.14
277 0.13
278 0.14
279 0.14
280 0.18
281 0.18
282 0.17
283 0.18
284 0.15
285 0.13
286 0.15
287 0.15
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.1
331 0.1
332 0.14
333 0.15
334 0.19
335 0.23
336 0.24
337 0.25
338 0.27