Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M5F0

Protein Details
Accession C5M5F0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
539-565SDAWLKQQKNKQKRKLMQKKYPSAFKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
479-482KKRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 9.5, pero 6, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000775  C:chromosome, centromeric region  
GO:0000417  C:HIR complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0031491  F:nucleosome binding  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:1905268  P:negative regulation of chromatin organization  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0016480  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase III  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_01080  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MQIIKIPWFGHKTENKKVECYAVTINHDGTRLASGGLDGNIKIWDVPTINEFFNVSGNLPDKSLRRPLCTMSRHNGVVTSLKFSPDGRWLASGSDDKICLIWEKDNTQIPKSFGSEEQDLEHWTVRKRLVAHDNDIQDICWSPDGNLLVTVGLDRSIIIWNALTFERIKRYDIHQSMVKGVVFDPANKFFATASDDRTVRIFRYYKKLNEYNNYEFQMEHTVIDPFKKSPLTSYFRRMSWSPDGQHIAVPNATNGPVPSVAIINRGNWGCDISLIGHEAPVEVCAFSPRLFQIGEPASEDDEPKFQTVVATGGQDRTLAVWSTSNSRPIVVCQDIVDSAITDICWAPDGQTFYFSCLDGSITCVRFLDGELGKVVTEDLIDQQLNRYGADRDSTVLPESVEQLQLEEKAKNIRSIAIRRMMPLYNTKVEKTEALVTRTSIDINKLRNQQVTVTKSGKKRVAPMLISSSTAPAPPAPVEKKRKLKSSSKISQPNYTIPRLGLQTAVYGMKHKSEQIVPEDDDDNDNEEIGADTTVSNSVSDAWLKQQKNKQKRKLMQKKYPSAFKLISNLPEGLFNNHALQNIAINKIYKTHSKDISAELSWGAAVEVDEDLAFSVVFQSFSHQETIVTENIRTTIEIRNGKPWSESDRDFDDPTRVIVTNEGAQERVFSLFFPFRIQHVLPIVIDNVLQFYVFCSFNGSIQIVTPTGAYACPTFELGESVVTLKHDTKGTLVGLTSSGLLYGWNLTSMKVTMQGVSMATIINNYKVEGKSVLTPNVRALEINPKDGSPLVLLDTTNDIFGYSLDLGCWIKVIDSWYYSTPQDQQLDGVLQRMINKSRLAYEEDKISKRIYSYKFDCPTQLQDVMVARNKELLELV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.61
3 0.61
4 0.61
5 0.59
6 0.51
7 0.47
8 0.44
9 0.41
10 0.43
11 0.42
12 0.42
13 0.36
14 0.36
15 0.31
16 0.25
17 0.22
18 0.17
19 0.14
20 0.12
21 0.11
22 0.12
23 0.14
24 0.14
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.13
29 0.12
30 0.1
31 0.12
32 0.11
33 0.13
34 0.16
35 0.19
36 0.19
37 0.2
38 0.2
39 0.17
40 0.18
41 0.18
42 0.15
43 0.16
44 0.18
45 0.18
46 0.18
47 0.22
48 0.23
49 0.27
50 0.36
51 0.36
52 0.4
53 0.43
54 0.49
55 0.55
56 0.6
57 0.62
58 0.59
59 0.62
60 0.57
61 0.54
62 0.49
63 0.41
64 0.41
65 0.34
66 0.32
67 0.26
68 0.26
69 0.26
70 0.26
71 0.27
72 0.27
73 0.29
74 0.25
75 0.26
76 0.26
77 0.25
78 0.29
79 0.28
80 0.24
81 0.23
82 0.22
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.18
87 0.17
88 0.2
89 0.21
90 0.24
91 0.29
92 0.36
93 0.39
94 0.4
95 0.41
96 0.39
97 0.38
98 0.38
99 0.35
100 0.31
101 0.34
102 0.32
103 0.29
104 0.29
105 0.27
106 0.26
107 0.25
108 0.26
109 0.23
110 0.23
111 0.27
112 0.27
113 0.29
114 0.3
115 0.36
116 0.42
117 0.45
118 0.48
119 0.5
120 0.5
121 0.49
122 0.47
123 0.38
124 0.29
125 0.24
126 0.2
127 0.15
128 0.13
129 0.11
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.14
153 0.21
154 0.22
155 0.24
156 0.25
157 0.3
158 0.39
159 0.4
160 0.42
161 0.39
162 0.39
163 0.4
164 0.4
165 0.35
166 0.25
167 0.22
168 0.23
169 0.19
170 0.21
171 0.22
172 0.22
173 0.24
174 0.23
175 0.23
176 0.17
177 0.19
178 0.22
179 0.19
180 0.21
181 0.24
182 0.25
183 0.25
184 0.27
185 0.27
186 0.22
187 0.28
188 0.28
189 0.28
190 0.37
191 0.44
192 0.48
193 0.55
194 0.61
195 0.61
196 0.65
197 0.68
198 0.65
199 0.63
200 0.59
201 0.51
202 0.44
203 0.38
204 0.34
205 0.27
206 0.21
207 0.16
208 0.15
209 0.16
210 0.17
211 0.18
212 0.13
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.2
217 0.28
218 0.32
219 0.35
220 0.43
221 0.44
222 0.43
223 0.47
224 0.42
225 0.4
226 0.42
227 0.44
228 0.38
229 0.39
230 0.42
231 0.38
232 0.39
233 0.33
234 0.27
235 0.21
236 0.2
237 0.15
238 0.12
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.13
249 0.14
250 0.12
251 0.16
252 0.17
253 0.16
254 0.15
255 0.16
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.08
260 0.08
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.08
273 0.08
274 0.1
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.16
280 0.17
281 0.17
282 0.17
283 0.17
284 0.17
285 0.17
286 0.18
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.08
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.14
310 0.16
311 0.19
312 0.17
313 0.18
314 0.18
315 0.18
316 0.22
317 0.18
318 0.17
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.08
335 0.11
336 0.11
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.17
341 0.16
342 0.13
343 0.11
344 0.11
345 0.08
346 0.11
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.12
353 0.13
354 0.16
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.1
371 0.11
372 0.1
373 0.11
374 0.1
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.12
393 0.1
394 0.1
395 0.15
396 0.16
397 0.17
398 0.17
399 0.18
400 0.22
401 0.26
402 0.29
403 0.3
404 0.29
405 0.29
406 0.31
407 0.28
408 0.25
409 0.26
410 0.25
411 0.24
412 0.25
413 0.24
414 0.23
415 0.23
416 0.22
417 0.19
418 0.21
419 0.19
420 0.2
421 0.2
422 0.19
423 0.19
424 0.18
425 0.17
426 0.11
427 0.12
428 0.14
429 0.17
430 0.22
431 0.27
432 0.29
433 0.29
434 0.29
435 0.3
436 0.34
437 0.34
438 0.33
439 0.32
440 0.36
441 0.38
442 0.43
443 0.43
444 0.37
445 0.4
446 0.41
447 0.42
448 0.37
449 0.36
450 0.36
451 0.32
452 0.31
453 0.26
454 0.21
455 0.15
456 0.14
457 0.12
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.12
462 0.15
463 0.23
464 0.32
465 0.4
466 0.49
467 0.53
468 0.61
469 0.63
470 0.68
471 0.69
472 0.71
473 0.71
474 0.7
475 0.74
476 0.69
477 0.68
478 0.61
479 0.59
480 0.53
481 0.46
482 0.38
483 0.29
484 0.29
485 0.24
486 0.22
487 0.15
488 0.11
489 0.1
490 0.11
491 0.11
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.13
499 0.14
500 0.17
501 0.19
502 0.22
503 0.21
504 0.23
505 0.23
506 0.21
507 0.2
508 0.17
509 0.16
510 0.12
511 0.11
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.07
516 0.07
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.07
527 0.07
528 0.12
529 0.2
530 0.21
531 0.27
532 0.34
533 0.43
534 0.54
535 0.64
536 0.68
537 0.71
538 0.79
539 0.84
540 0.88
541 0.89
542 0.88
543 0.87
544 0.88
545 0.82
546 0.82
547 0.72
548 0.67
549 0.58
550 0.49
551 0.44
552 0.37
553 0.34
554 0.28
555 0.27
556 0.21
557 0.22
558 0.21
559 0.18
560 0.17
561 0.16
562 0.16
563 0.16
564 0.17
565 0.14
566 0.13
567 0.15
568 0.15
569 0.15
570 0.14
571 0.14
572 0.13
573 0.17
574 0.19
575 0.22
576 0.27
577 0.32
578 0.34
579 0.36
580 0.38
581 0.38
582 0.4
583 0.34
584 0.28
585 0.21
586 0.17
587 0.14
588 0.12
589 0.09
590 0.05
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.03
601 0.04
602 0.05
603 0.06
604 0.06
605 0.09
606 0.1
607 0.12
608 0.14
609 0.12
610 0.12
611 0.14
612 0.17
613 0.16
614 0.16
615 0.14
616 0.13
617 0.14
618 0.14
619 0.13
620 0.12
621 0.15
622 0.22
623 0.27
624 0.28
625 0.35
626 0.37
627 0.37
628 0.36
629 0.34
630 0.33
631 0.33
632 0.33
633 0.3
634 0.34
635 0.36
636 0.36
637 0.34
638 0.31
639 0.26
640 0.25
641 0.24
642 0.19
643 0.16
644 0.16
645 0.16
646 0.16
647 0.18
648 0.18
649 0.15
650 0.15
651 0.15
652 0.15
653 0.14
654 0.1
655 0.08
656 0.13
657 0.14
658 0.15
659 0.18
660 0.18
661 0.17
662 0.23
663 0.23
664 0.22
665 0.22
666 0.24
667 0.2
668 0.21
669 0.2
670 0.15
671 0.14
672 0.11
673 0.09
674 0.07
675 0.07
676 0.06
677 0.06
678 0.09
679 0.09
680 0.09
681 0.13
682 0.14
683 0.15
684 0.18
685 0.17
686 0.14
687 0.14
688 0.16
689 0.12
690 0.11
691 0.1
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.09
696 0.07
697 0.08
698 0.08
699 0.09
700 0.1
701 0.09
702 0.11
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.1
709 0.12
710 0.12
711 0.14
712 0.15
713 0.15
714 0.16
715 0.19
716 0.19
717 0.18
718 0.17
719 0.14
720 0.13
721 0.13
722 0.12
723 0.08
724 0.07
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.07
729 0.07
730 0.08
731 0.09
732 0.09
733 0.11
734 0.11
735 0.12
736 0.14
737 0.14
738 0.13
739 0.13
740 0.14
741 0.13
742 0.13
743 0.13
744 0.09
745 0.08
746 0.1
747 0.1
748 0.12
749 0.12
750 0.12
751 0.17
752 0.17
753 0.2
754 0.19
755 0.2
756 0.25
757 0.29
758 0.36
759 0.33
760 0.34
761 0.35
762 0.37
763 0.35
764 0.28
765 0.26
766 0.29
767 0.29
768 0.33
769 0.3
770 0.27
771 0.28
772 0.28
773 0.27
774 0.18
775 0.16
776 0.13
777 0.14
778 0.14
779 0.14
780 0.18
781 0.16
782 0.15
783 0.14
784 0.12
785 0.1
786 0.11
787 0.13
788 0.1
789 0.1
790 0.09
791 0.12
792 0.12
793 0.12
794 0.13
795 0.09
796 0.08
797 0.1
798 0.13
799 0.13
800 0.15
801 0.18
802 0.2
803 0.23
804 0.23
805 0.25
806 0.27
807 0.31
808 0.32
809 0.29
810 0.28
811 0.28
812 0.31
813 0.28
814 0.25
815 0.19
816 0.18
817 0.22
818 0.27
819 0.27
820 0.27
821 0.29
822 0.29
823 0.33
824 0.34
825 0.37
826 0.36
827 0.36
828 0.42
829 0.47
830 0.48
831 0.45
832 0.44
833 0.39
834 0.38
835 0.44
836 0.4
837 0.43
838 0.45
839 0.54
840 0.57
841 0.57
842 0.59
843 0.55
844 0.55
845 0.52
846 0.48
847 0.38
848 0.37
849 0.38
850 0.4
851 0.41
852 0.36
853 0.3
854 0.33
855 0.33