Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TJV4

Protein Details
Accession A0A5N6TJV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MSSPAKKRKKDAPTPGTRSIASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-9KRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 12.166, mito 10.5, cyto_nucl 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
Amino Acid Sequences MSSPAKKRKKDAPTPGTRSIASFFQGQAAKQAEPTPPAGEDTDHTLSDEALARKLQAEWNQQDAASALESGTTPGLAPTPKQDQPTAASSEPIEDDQEPQKKIRKTNTLSLQSTAGTEDTISLAVPFDESPLTFDSRKYADELKAQWAPGGGNASYALLTRAFVLANATSSRIKIVDTLVNFLRVLIEGDPSSVLPAVWLATNSISPPYDESELGLGGSSISKALKKVYGLNSQGLKSLYDRLGDAGDVAFEAKKRQSFTLMKPKPLTIKGVYQSLQKIATSKGSGSQENKQRVVEKLLQDTRGAEESRYIARTLVQNLRIGAVKTTMLIALARAFLYSKPDGTGFETRSVEELARLKKEELAEVYSNAEEIIKASYARHPDYNDLVPCLLEIGVTTELLVRCGLQLHIPLRPMLGSITRDLTEMLTKLQGRDFTCEYKYDGQRAQVHCDETGKVSIFSRHLEKMTEKYPDLVSLVPEIRGESVSSFILEGEVVAVDQETG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.8
4 0.7
5 0.61
6 0.53
7 0.44
8 0.35
9 0.29
10 0.22
11 0.25
12 0.26
13 0.24
14 0.28
15 0.29
16 0.27
17 0.27
18 0.3
19 0.27
20 0.28
21 0.3
22 0.25
23 0.23
24 0.25
25 0.24
26 0.21
27 0.19
28 0.24
29 0.24
30 0.22
31 0.22
32 0.2
33 0.19
34 0.2
35 0.25
36 0.18
37 0.18
38 0.18
39 0.18
40 0.19
41 0.21
42 0.24
43 0.26
44 0.35
45 0.36
46 0.41
47 0.41
48 0.4
49 0.38
50 0.32
51 0.26
52 0.17
53 0.13
54 0.08
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.15
66 0.22
67 0.26
68 0.29
69 0.3
70 0.31
71 0.34
72 0.37
73 0.37
74 0.31
75 0.28
76 0.25
77 0.26
78 0.24
79 0.21
80 0.18
81 0.13
82 0.17
83 0.23
84 0.29
85 0.29
86 0.32
87 0.39
88 0.42
89 0.49
90 0.54
91 0.57
92 0.57
93 0.65
94 0.71
95 0.72
96 0.68
97 0.63
98 0.55
99 0.45
100 0.39
101 0.31
102 0.21
103 0.12
104 0.1
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.09
118 0.1
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.17
123 0.18
124 0.19
125 0.2
126 0.23
127 0.23
128 0.28
129 0.3
130 0.32
131 0.32
132 0.32
133 0.29
134 0.25
135 0.22
136 0.18
137 0.19
138 0.12
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.12
163 0.14
164 0.14
165 0.17
166 0.17
167 0.18
168 0.18
169 0.16
170 0.14
171 0.1
172 0.11
173 0.07
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.08
180 0.06
181 0.06
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.08
203 0.06
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.09
213 0.1
214 0.16
215 0.21
216 0.27
217 0.29
218 0.32
219 0.33
220 0.32
221 0.33
222 0.27
223 0.22
224 0.16
225 0.18
226 0.15
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.06
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.06
240 0.08
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.19
245 0.24
246 0.31
247 0.41
248 0.42
249 0.45
250 0.45
251 0.46
252 0.43
253 0.4
254 0.37
255 0.27
256 0.3
257 0.28
258 0.3
259 0.29
260 0.27
261 0.27
262 0.24
263 0.23
264 0.17
265 0.16
266 0.14
267 0.15
268 0.13
269 0.13
270 0.16
271 0.18
272 0.21
273 0.23
274 0.29
275 0.34
276 0.38
277 0.39
278 0.36
279 0.36
280 0.34
281 0.37
282 0.36
283 0.31
284 0.34
285 0.35
286 0.35
287 0.33
288 0.32
289 0.28
290 0.25
291 0.23
292 0.15
293 0.13
294 0.14
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.12
299 0.13
300 0.16
301 0.2
302 0.24
303 0.23
304 0.24
305 0.24
306 0.25
307 0.24
308 0.22
309 0.17
310 0.13
311 0.11
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.14
330 0.19
331 0.24
332 0.21
333 0.25
334 0.25
335 0.25
336 0.25
337 0.25
338 0.2
339 0.18
340 0.22
341 0.21
342 0.23
343 0.24
344 0.24
345 0.26
346 0.27
347 0.26
348 0.23
349 0.24
350 0.22
351 0.21
352 0.22
353 0.19
354 0.18
355 0.15
356 0.13
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.09
363 0.13
364 0.18
365 0.21
366 0.24
367 0.24
368 0.27
369 0.32
370 0.36
371 0.33
372 0.3
373 0.27
374 0.24
375 0.22
376 0.19
377 0.14
378 0.08
379 0.06
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.11
385 0.11
386 0.12
387 0.12
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.09
393 0.15
394 0.16
395 0.19
396 0.2
397 0.2
398 0.19
399 0.19
400 0.18
401 0.14
402 0.17
403 0.15
404 0.16
405 0.19
406 0.19
407 0.19
408 0.19
409 0.19
410 0.17
411 0.16
412 0.15
413 0.17
414 0.18
415 0.2
416 0.22
417 0.26
418 0.25
419 0.3
420 0.33
421 0.32
422 0.33
423 0.33
424 0.35
425 0.39
426 0.42
427 0.42
428 0.42
429 0.45
430 0.51
431 0.52
432 0.55
433 0.5
434 0.48
435 0.43
436 0.42
437 0.36
438 0.3
439 0.32
440 0.26
441 0.23
442 0.22
443 0.25
444 0.25
445 0.28
446 0.3
447 0.3
448 0.3
449 0.33
450 0.35
451 0.37
452 0.4
453 0.42
454 0.38
455 0.37
456 0.37
457 0.35
458 0.32
459 0.28
460 0.23
461 0.23
462 0.23
463 0.21
464 0.2
465 0.19
466 0.18
467 0.18
468 0.17
469 0.12
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.11
475 0.1
476 0.09
477 0.08
478 0.07
479 0.06
480 0.05
481 0.05