Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M935

Protein Details
Accession C5M935    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-79SDSKSMTSRKTSRNHSQSNFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000253  FHA_dom  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0030695  F:GTPase regulator activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ctp:CTRG_02907  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50006  FHA_DOMAIN  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
cd09397  LIM1_UF1  
Amino Acid Sequences MSASTSSPQMMSFPKFIRKSEQSTRGLDGAFPPFKIEHRYKSVYERAGFDVNRGGNNNNSDSKSMTSRKTSRNHSQSNFGNPNESNTRLQDQSPSSSSYQNTPVLQKNRIPSLASGGANTRNNSPTASSHSSKSSSVNSNFTNSKSASSHSTFRNTDEFSPVFDQPLTSGSSTTTFFNNDNEAKVNSQNYNPPIISKNTTNMANDEPIQDQFDFSPTSNHSRNQKNLKLDLSNNDNISDTQSLPGITKVVSQQNTITNHSMHSVASNSSAQTHKQAEQPQVPSITINEEDDEQQQQQQQHENQKNASAEQGFQVLPPPVQNNGAPAPKFDPRKQRSIRGQTTNPPQQHHLQQQQQQQQGQGQPPRNPYSSVGQQSRNGSTSSLTHSAPHPHHHNNSRPSSPSLSAVGSNVPQLPMISLNSPTTAYRPSQRPQSPVLPTGYQSRQQPQSQPQILQSQPSYPSQPPQPPQSQSQPQQAVYNPFNHHQHRKQAPGGYYNQPQEQIVTPRSARQQATYSQIRDDKLSSALNDFKNDVEIHKQGGNKSPTHSNSSLEDELPSSASPSELGLYKNDSKEDYSNENTRFSYGTTMNSGMNENGKGFDPSAQFQNFTSQQVAKDANLNNEYAEFLATQNDEPVSGVQDNNVKNNKHLSTVSSILSKDSGNSDDDDIERELERQLQSLKMSGSSIDITKVTSNKSRNSFGYGNNGGIIPSFNVQDVDEVAEEDEEEYVKPLSISGSSSYVENKQSIVEDLNDDDFTRPLTTHSSTESKEDLQHEVSQPQLDSPSLHKKVQFESPQAEFFNEEDVTEETIKIENNDDEYEEAVKPLSPKTHSIEQELQNMNFQIPETDESPSVYIQDSFPQSTTETQPQQQEEDFIQDRSFTFPPESVYPVQDPILEVEQQQQLEQPQNQTPYPTKELSPELDLEENEQSKHVEPTIYASGTGPCRACHGTIDRHTKVKPLKPIFSKTGELSGQWHRQCFTCTSPQCSIQFSKNVQCYVFNDHPYCFEHYHILNNSVCKSCHVGIEGKCISNELDEKWHLQCLNCTKCGNGIRSDYFIINGNSIMCSSCKENNSGLTVADRIEKRRTRIYNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.43
3 0.46
4 0.52
5 0.53
6 0.58
7 0.62
8 0.67
9 0.63
10 0.64
11 0.65
12 0.59
13 0.52
14 0.45
15 0.39
16 0.38
17 0.34
18 0.3
19 0.28
20 0.27
21 0.29
22 0.36
23 0.39
24 0.38
25 0.44
26 0.5
27 0.51
28 0.58
29 0.64
30 0.63
31 0.59
32 0.55
33 0.51
34 0.53
35 0.49
36 0.43
37 0.41
38 0.35
39 0.36
40 0.35
41 0.32
42 0.3
43 0.35
44 0.38
45 0.36
46 0.36
47 0.34
48 0.34
49 0.35
50 0.38
51 0.4
52 0.41
53 0.45
54 0.51
55 0.59
56 0.65
57 0.71
58 0.73
59 0.77
60 0.82
61 0.76
62 0.76
63 0.73
64 0.75
65 0.73
66 0.63
67 0.59
68 0.49
69 0.52
70 0.48
71 0.46
72 0.39
73 0.36
74 0.4
75 0.36
76 0.37
77 0.38
78 0.36
79 0.38
80 0.37
81 0.37
82 0.34
83 0.37
84 0.37
85 0.34
86 0.36
87 0.35
88 0.35
89 0.37
90 0.44
91 0.46
92 0.5
93 0.5
94 0.51
95 0.52
96 0.52
97 0.48
98 0.4
99 0.41
100 0.42
101 0.37
102 0.32
103 0.29
104 0.34
105 0.36
106 0.36
107 0.33
108 0.29
109 0.29
110 0.29
111 0.29
112 0.25
113 0.29
114 0.35
115 0.33
116 0.34
117 0.37
118 0.39
119 0.37
120 0.38
121 0.36
122 0.38
123 0.39
124 0.42
125 0.4
126 0.43
127 0.44
128 0.42
129 0.4
130 0.32
131 0.32
132 0.28
133 0.29
134 0.3
135 0.31
136 0.36
137 0.35
138 0.42
139 0.39
140 0.41
141 0.45
142 0.41
143 0.39
144 0.4
145 0.35
146 0.32
147 0.35
148 0.32
149 0.27
150 0.24
151 0.22
152 0.16
153 0.18
154 0.16
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.16
164 0.17
165 0.22
166 0.22
167 0.22
168 0.24
169 0.24
170 0.24
171 0.27
172 0.29
173 0.25
174 0.27
175 0.32
176 0.31
177 0.35
178 0.33
179 0.32
180 0.31
181 0.33
182 0.34
183 0.3
184 0.32
185 0.31
186 0.33
187 0.32
188 0.31
189 0.29
190 0.28
191 0.26
192 0.24
193 0.22
194 0.2
195 0.21
196 0.19
197 0.17
198 0.14
199 0.16
200 0.15
201 0.14
202 0.18
203 0.18
204 0.25
205 0.28
206 0.33
207 0.39
208 0.45
209 0.54
210 0.59
211 0.63
212 0.62
213 0.64
214 0.64
215 0.61
216 0.56
217 0.54
218 0.51
219 0.48
220 0.42
221 0.38
222 0.33
223 0.28
224 0.28
225 0.24
226 0.17
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.11
233 0.09
234 0.11
235 0.15
236 0.21
237 0.22
238 0.23
239 0.25
240 0.31
241 0.34
242 0.36
243 0.33
244 0.27
245 0.26
246 0.26
247 0.24
248 0.17
249 0.16
250 0.13
251 0.11
252 0.13
253 0.14
254 0.13
255 0.15
256 0.17
257 0.16
258 0.2
259 0.23
260 0.23
261 0.28
262 0.34
263 0.38
264 0.43
265 0.44
266 0.42
267 0.4
268 0.38
269 0.32
270 0.27
271 0.23
272 0.18
273 0.16
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.17
279 0.14
280 0.16
281 0.19
282 0.21
283 0.22
284 0.28
285 0.33
286 0.41
287 0.46
288 0.48
289 0.45
290 0.47
291 0.46
292 0.39
293 0.37
294 0.27
295 0.21
296 0.19
297 0.2
298 0.15
299 0.14
300 0.16
301 0.13
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.13
306 0.15
307 0.15
308 0.16
309 0.19
310 0.24
311 0.22
312 0.23
313 0.25
314 0.29
315 0.35
316 0.37
317 0.44
318 0.44
319 0.54
320 0.58
321 0.63
322 0.68
323 0.73
324 0.75
325 0.72
326 0.73
327 0.7
328 0.75
329 0.73
330 0.66
331 0.58
332 0.52
333 0.49
334 0.52
335 0.52
336 0.51
337 0.5
338 0.54
339 0.6
340 0.64
341 0.64
342 0.58
343 0.52
344 0.48
345 0.45
346 0.44
347 0.43
348 0.41
349 0.41
350 0.45
351 0.48
352 0.45
353 0.42
354 0.38
355 0.37
356 0.39
357 0.41
358 0.4
359 0.39
360 0.41
361 0.43
362 0.43
363 0.38
364 0.31
365 0.24
366 0.21
367 0.19
368 0.2
369 0.19
370 0.17
371 0.17
372 0.19
373 0.25
374 0.26
375 0.3
376 0.31
377 0.35
378 0.42
379 0.48
380 0.54
381 0.56
382 0.59
383 0.57
384 0.53
385 0.5
386 0.47
387 0.41
388 0.34
389 0.28
390 0.23
391 0.21
392 0.18
393 0.16
394 0.13
395 0.13
396 0.11
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.13
411 0.13
412 0.18
413 0.23
414 0.25
415 0.34
416 0.38
417 0.39
418 0.42
419 0.47
420 0.44
421 0.42
422 0.42
423 0.33
424 0.31
425 0.34
426 0.32
427 0.29
428 0.28
429 0.3
430 0.33
431 0.35
432 0.39
433 0.4
434 0.47
435 0.46
436 0.44
437 0.42
438 0.42
439 0.4
440 0.37
441 0.31
442 0.24
443 0.23
444 0.23
445 0.24
446 0.19
447 0.22
448 0.25
449 0.3
450 0.3
451 0.35
452 0.39
453 0.38
454 0.42
455 0.46
456 0.48
457 0.47
458 0.52
459 0.48
460 0.43
461 0.43
462 0.41
463 0.39
464 0.33
465 0.34
466 0.28
467 0.28
468 0.33
469 0.35
470 0.4
471 0.39
472 0.47
473 0.46
474 0.5
475 0.5
476 0.5
477 0.47
478 0.44
479 0.44
480 0.39
481 0.39
482 0.36
483 0.33
484 0.29
485 0.27
486 0.23
487 0.21
488 0.2
489 0.16
490 0.17
491 0.17
492 0.19
493 0.22
494 0.26
495 0.24
496 0.22
497 0.24
498 0.24
499 0.3
500 0.31
501 0.29
502 0.28
503 0.3
504 0.28
505 0.27
506 0.25
507 0.19
508 0.17
509 0.17
510 0.14
511 0.14
512 0.19
513 0.18
514 0.18
515 0.18
516 0.15
517 0.16
518 0.16
519 0.14
520 0.13
521 0.13
522 0.14
523 0.16
524 0.18
525 0.17
526 0.24
527 0.26
528 0.24
529 0.25
530 0.3
531 0.29
532 0.34
533 0.33
534 0.28
535 0.26
536 0.3
537 0.29
538 0.23
539 0.21
540 0.15
541 0.14
542 0.13
543 0.11
544 0.07
545 0.06
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.11
554 0.14
555 0.15
556 0.16
557 0.16
558 0.16
559 0.17
560 0.2
561 0.2
562 0.21
563 0.27
564 0.27
565 0.28
566 0.27
567 0.26
568 0.23
569 0.18
570 0.19
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.15
575 0.14
576 0.14
577 0.15
578 0.11
579 0.12
580 0.11
581 0.09
582 0.09
583 0.09
584 0.09
585 0.08
586 0.12
587 0.12
588 0.13
589 0.17
590 0.17
591 0.17
592 0.17
593 0.22
594 0.19
595 0.19
596 0.2
597 0.17
598 0.17
599 0.19
600 0.2
601 0.15
602 0.19
603 0.19
604 0.21
605 0.21
606 0.2
607 0.17
608 0.17
609 0.16
610 0.11
611 0.1
612 0.06
613 0.05
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.09
626 0.14
627 0.15
628 0.21
629 0.26
630 0.24
631 0.25
632 0.3
633 0.3
634 0.27
635 0.27
636 0.23
637 0.22
638 0.24
639 0.24
640 0.2
641 0.2
642 0.17
643 0.18
644 0.15
645 0.12
646 0.11
647 0.11
648 0.1
649 0.11
650 0.12
651 0.12
652 0.12
653 0.13
654 0.12
655 0.12
656 0.11
657 0.11
658 0.1
659 0.13
660 0.13
661 0.12
662 0.13
663 0.14
664 0.14
665 0.16
666 0.15
667 0.12
668 0.12
669 0.11
670 0.11
671 0.1
672 0.1
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.11
677 0.13
678 0.14
679 0.2
680 0.23
681 0.28
682 0.33
683 0.36
684 0.35
685 0.4
686 0.4
687 0.36
688 0.4
689 0.35
690 0.31
691 0.28
692 0.26
693 0.19
694 0.17
695 0.15
696 0.07
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.07
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.05
712 0.04
713 0.04
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.06
720 0.06
721 0.08
722 0.08
723 0.1
724 0.1
725 0.11
726 0.13
727 0.15
728 0.17
729 0.16
730 0.15
731 0.13
732 0.14
733 0.14
734 0.14
735 0.12
736 0.11
737 0.12
738 0.13
739 0.12
740 0.12
741 0.12
742 0.1
743 0.11
744 0.1
745 0.09
746 0.09
747 0.13
748 0.15
749 0.16
750 0.2
751 0.23
752 0.23
753 0.26
754 0.27
755 0.24
756 0.26
757 0.26
758 0.25
759 0.23
760 0.26
761 0.24
762 0.24
763 0.23
764 0.21
765 0.19
766 0.17
767 0.15
768 0.12
769 0.12
770 0.16
771 0.25
772 0.28
773 0.3
774 0.32
775 0.34
776 0.37
777 0.44
778 0.44
779 0.38
780 0.39
781 0.4
782 0.4
783 0.38
784 0.35
785 0.27
786 0.22
787 0.22
788 0.17
789 0.14
790 0.12
791 0.13
792 0.15
793 0.14
794 0.14
795 0.11
796 0.12
797 0.12
798 0.11
799 0.13
800 0.11
801 0.13
802 0.14
803 0.14
804 0.13
805 0.14
806 0.15
807 0.13
808 0.12
809 0.1
810 0.11
811 0.11
812 0.13
813 0.17
814 0.17
815 0.21
816 0.27
817 0.35
818 0.35
819 0.41
820 0.46
821 0.45
822 0.52
823 0.52
824 0.46
825 0.4
826 0.38
827 0.32
828 0.24
829 0.2
830 0.12
831 0.11
832 0.13
833 0.12
834 0.13
835 0.14
836 0.14
837 0.15
838 0.15
839 0.14
840 0.12
841 0.12
842 0.1
843 0.15
844 0.17
845 0.17
846 0.18
847 0.18
848 0.19
849 0.21
850 0.25
851 0.28
852 0.29
853 0.31
854 0.36
855 0.37
856 0.38
857 0.35
858 0.33
859 0.26
860 0.29
861 0.27
862 0.22
863 0.21
864 0.19
865 0.19
866 0.22
867 0.21
868 0.16
869 0.17
870 0.17
871 0.2
872 0.22
873 0.26
874 0.23
875 0.25
876 0.25
877 0.25
878 0.24
879 0.21
880 0.2
881 0.18
882 0.19
883 0.16
884 0.15
885 0.18
886 0.21
887 0.2
888 0.2
889 0.19
890 0.2
891 0.26
892 0.28
893 0.28
894 0.29
895 0.33
896 0.34
897 0.36
898 0.38
899 0.38
900 0.41
901 0.38
902 0.35
903 0.35
904 0.38
905 0.37
906 0.35
907 0.29
908 0.26
909 0.27
910 0.25
911 0.24
912 0.25
913 0.23
914 0.21
915 0.2
916 0.19
917 0.18
918 0.2
919 0.19
920 0.15
921 0.14
922 0.19
923 0.23
924 0.22
925 0.21
926 0.2
927 0.23
928 0.24
929 0.28
930 0.23
931 0.18
932 0.23
933 0.24
934 0.24
935 0.25
936 0.29
937 0.35
938 0.43
939 0.52
940 0.51
941 0.55
942 0.55
943 0.57
944 0.6
945 0.58
946 0.59
947 0.57
948 0.63
949 0.65
950 0.72
951 0.7
952 0.66
953 0.63
954 0.54
955 0.52
956 0.44
957 0.37
958 0.35
959 0.37
960 0.41
961 0.4
962 0.41
963 0.35
964 0.36
965 0.39
966 0.39
967 0.36
968 0.38
969 0.4
970 0.45
971 0.48
972 0.52
973 0.51
974 0.52
975 0.5
976 0.45
977 0.48
978 0.46
979 0.5
980 0.5
981 0.5
982 0.46
983 0.45
984 0.42
985 0.44
986 0.45
987 0.43
988 0.4
989 0.38
990 0.4
991 0.4
992 0.42
993 0.34
994 0.3
995 0.29
996 0.28
997 0.36
998 0.36
999 0.38
1000 0.35
1001 0.37
1002 0.39
1003 0.37
1004 0.36
1005 0.3
1006 0.33
1007 0.3
1008 0.31
1009 0.3
1010 0.33
1011 0.32
1012 0.42
1013 0.42
1014 0.38
1015 0.36
1016 0.34
1017 0.31
1018 0.28
1019 0.29
1020 0.21
1021 0.25
1022 0.25
1023 0.29
1024 0.29
1025 0.34
1026 0.31
1027 0.3
1028 0.36
1029 0.39
1030 0.44
1031 0.46
1032 0.45
1033 0.41
1034 0.47
1035 0.52
1036 0.49
1037 0.44
1038 0.45
1039 0.43
1040 0.46
1041 0.47
1042 0.4
1043 0.34
1044 0.35
1045 0.3
1046 0.24
1047 0.21
1048 0.18
1049 0.16
1050 0.16
1051 0.16
1052 0.12
1053 0.13
1054 0.17
1055 0.23
1056 0.25
1057 0.28
1058 0.31
1059 0.34
1060 0.38
1061 0.36
1062 0.32
1063 0.28
1064 0.26
1065 0.24
1066 0.28
1067 0.27
1068 0.27
1069 0.36
1070 0.42
1071 0.45
1072 0.54