Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6B0

Protein Details
Accession C5M6B0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-99ETDQRGNGRGNRKKNKGQNHKRKLKQKKDTIKLCASLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-90NGRGNRKKNKGQNHKRKLKQKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR035587  DUS-like_FMN-bd  
IPR018517  tRNA_hU_synthase_CS  
Gene Ontology GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0050660  F:flavin adenine dinucleotide binding  
GO:0102265  F:tRNA-dihydrouridine47 synthase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG ctp:CTRG_01391  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01207  Dus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01136  UPF0034  
CDD cd02801  DUS_like_FMN  
Amino Acid Sequences MTLPEKRPVEDSAEVETKKQNTASYVKGVAAIKPEYLAPVSESATAIEYNDDEAEGGGRDAEETDQRGNGRGNRKKNKGQNHKRKLKQKKDTIKLCASLIDPEDESVVCSAGGAENCKFHHDVVSYLESKPEDIEGVCPVFEAIGYCPSGIKCRWLKSHYNKETSKLIKDLEKFEVAKKTNCEVNVIDKNNKFDMQKKKYDYTISAPVIKYLDSSVKNEKNENQEERKDNEADYVEAPFKIAEKKKLHLRNAKIVSPLTTVGNLPYRRLMKTLGADVTYSEMALSVPLIQGHNPEWALPKAHISEYPGFGVQIASSRHWPAAKAAEAIYRNTNHVSELNLNCGCPIDLLYKQGQGSALMDQPSKLLRILHGMSASSGDIPVTVKIRTGVREGKNTAKTLVRRVLQEGNTAAITLHGRSRQQRYSREADWDYIAEVGSVVKEWNENQKEDKDATDIQPVYFVGNGDVYSHEDWYNHVNTDGIDSVMVARGALIKPWIFEEVEAQQYLDKSSSERLDMLGKFAKYAVEHWGSDEYGVGMARRYMCEFLGFTHRYIPVGIMERLPPKLNERPPKWVGRNEMETMLASTDYKDWIKITEMFLGKASEDFQFIPKHKSNAYETN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.43
4 0.38
5 0.37
6 0.36
7 0.32
8 0.3
9 0.35
10 0.37
11 0.37
12 0.37
13 0.33
14 0.36
15 0.35
16 0.32
17 0.32
18 0.28
19 0.23
20 0.22
21 0.22
22 0.19
23 0.18
24 0.17
25 0.14
26 0.15
27 0.16
28 0.16
29 0.16
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.09
49 0.11
50 0.13
51 0.15
52 0.18
53 0.19
54 0.22
55 0.26
56 0.31
57 0.39
58 0.45
59 0.55
60 0.62
61 0.71
62 0.77
63 0.81
64 0.86
65 0.86
66 0.89
67 0.9
68 0.91
69 0.92
70 0.92
71 0.93
72 0.94
73 0.93
74 0.92
75 0.92
76 0.92
77 0.91
78 0.91
79 0.89
80 0.84
81 0.76
82 0.66
83 0.57
84 0.47
85 0.41
86 0.33
87 0.27
88 0.2
89 0.17
90 0.18
91 0.15
92 0.14
93 0.11
94 0.1
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.08
99 0.1
100 0.12
101 0.13
102 0.16
103 0.17
104 0.2
105 0.21
106 0.19
107 0.23
108 0.21
109 0.21
110 0.23
111 0.28
112 0.26
113 0.26
114 0.28
115 0.23
116 0.22
117 0.21
118 0.17
119 0.12
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.12
136 0.16
137 0.16
138 0.23
139 0.25
140 0.31
141 0.39
142 0.43
143 0.53
144 0.6
145 0.7
146 0.71
147 0.74
148 0.7
149 0.66
150 0.69
151 0.63
152 0.56
153 0.48
154 0.42
155 0.39
156 0.41
157 0.41
158 0.36
159 0.37
160 0.34
161 0.35
162 0.41
163 0.37
164 0.38
165 0.37
166 0.36
167 0.35
168 0.34
169 0.34
170 0.27
171 0.32
172 0.37
173 0.37
174 0.41
175 0.39
176 0.43
177 0.41
178 0.43
179 0.36
180 0.36
181 0.43
182 0.43
183 0.5
184 0.52
185 0.53
186 0.54
187 0.56
188 0.51
189 0.46
190 0.47
191 0.41
192 0.4
193 0.37
194 0.34
195 0.31
196 0.27
197 0.22
198 0.15
199 0.19
200 0.16
201 0.2
202 0.27
203 0.32
204 0.34
205 0.36
206 0.4
207 0.42
208 0.47
209 0.5
210 0.48
211 0.49
212 0.52
213 0.52
214 0.52
215 0.44
216 0.37
217 0.34
218 0.28
219 0.23
220 0.19
221 0.18
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.1
226 0.1
227 0.16
228 0.18
229 0.25
230 0.28
231 0.33
232 0.42
233 0.5
234 0.57
235 0.59
236 0.61
237 0.62
238 0.63
239 0.61
240 0.54
241 0.46
242 0.4
243 0.32
244 0.28
245 0.19
246 0.15
247 0.13
248 0.12
249 0.18
250 0.17
251 0.16
252 0.2
253 0.21
254 0.21
255 0.22
256 0.22
257 0.19
258 0.21
259 0.23
260 0.2
261 0.18
262 0.17
263 0.16
264 0.16
265 0.12
266 0.1
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.03
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.12
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.13
306 0.14
307 0.12
308 0.15
309 0.15
310 0.14
311 0.14
312 0.17
313 0.18
314 0.19
315 0.2
316 0.17
317 0.17
318 0.17
319 0.16
320 0.13
321 0.13
322 0.14
323 0.16
324 0.16
325 0.2
326 0.19
327 0.19
328 0.18
329 0.17
330 0.15
331 0.09
332 0.1
333 0.08
334 0.09
335 0.12
336 0.13
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.14
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.08
363 0.07
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.1
372 0.12
373 0.13
374 0.18
375 0.25
376 0.27
377 0.33
378 0.36
379 0.41
380 0.43
381 0.43
382 0.4
383 0.37
384 0.36
385 0.37
386 0.4
387 0.35
388 0.32
389 0.35
390 0.39
391 0.35
392 0.36
393 0.3
394 0.25
395 0.22
396 0.21
397 0.17
398 0.11
399 0.11
400 0.09
401 0.11
402 0.12
403 0.16
404 0.22
405 0.29
406 0.35
407 0.42
408 0.48
409 0.52
410 0.56
411 0.54
412 0.56
413 0.51
414 0.45
415 0.39
416 0.32
417 0.26
418 0.2
419 0.18
420 0.1
421 0.08
422 0.07
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.08
429 0.18
430 0.21
431 0.22
432 0.26
433 0.29
434 0.32
435 0.32
436 0.31
437 0.26
438 0.26
439 0.26
440 0.29
441 0.27
442 0.24
443 0.24
444 0.23
445 0.2
446 0.17
447 0.16
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.08
452 0.09
453 0.12
454 0.12
455 0.13
456 0.13
457 0.12
458 0.14
459 0.18
460 0.19
461 0.16
462 0.15
463 0.14
464 0.14
465 0.16
466 0.15
467 0.11
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.06
474 0.06
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.12
479 0.11
480 0.12
481 0.13
482 0.15
483 0.12
484 0.12
485 0.15
486 0.16
487 0.19
488 0.18
489 0.17
490 0.17
491 0.17
492 0.18
493 0.15
494 0.12
495 0.11
496 0.16
497 0.18
498 0.18
499 0.18
500 0.18
501 0.24
502 0.24
503 0.27
504 0.27
505 0.25
506 0.24
507 0.24
508 0.25
509 0.19
510 0.2
511 0.23
512 0.21
513 0.22
514 0.23
515 0.25
516 0.23
517 0.22
518 0.21
519 0.14
520 0.11
521 0.11
522 0.1
523 0.08
524 0.11
525 0.12
526 0.14
527 0.16
528 0.16
529 0.16
530 0.18
531 0.18
532 0.18
533 0.26
534 0.26
535 0.24
536 0.29
537 0.29
538 0.27
539 0.27
540 0.25
541 0.2
542 0.24
543 0.25
544 0.21
545 0.25
546 0.28
547 0.31
548 0.32
549 0.29
550 0.31
551 0.39
552 0.47
553 0.53
554 0.54
555 0.61
556 0.65
557 0.73
558 0.74
559 0.72
560 0.7
561 0.68
562 0.69
563 0.63
564 0.58
565 0.49
566 0.42
567 0.36
568 0.28
569 0.21
570 0.15
571 0.13
572 0.13
573 0.16
574 0.16
575 0.16
576 0.16
577 0.17
578 0.21
579 0.24
580 0.25
581 0.29
582 0.3
583 0.29
584 0.3
585 0.3
586 0.26
587 0.23
588 0.22
589 0.15
590 0.15
591 0.16
592 0.18
593 0.25
594 0.27
595 0.35
596 0.39
597 0.42
598 0.43
599 0.48