Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SH58

Protein Details
Accession A0A5N6SH58    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
267-314LEDFYRFQSREKRKERQNELLKKFDEDKKKLEEMKKRKGKIRVSSIVFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-110KKRK
158-165AKKAGKKK
278-308KRKERQNELLKKFDEDKKKLEEMKKRKGKIR
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 9.5, mito 7, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
CDD cd12293  dRRM_Rrp7p  
cd12950  RRP7_Rrp7p  
Amino Acid Sequences MGKDLEIAGYTILPLRLPPAESKRAKPATHYLYLRPHEPRIPDADTPRSLFVVNVPLDTTELHLRHLFGTQLAAGRVERVHFETVPTKKKGGMATAHSMVANVSKSKKRKRVTADELQNQLENVTLPSMWDRELQKSGAHAVVVFVDKPSMEASVKAAKKAGKKKDGELVWGEGIEDRLPQLGLQRYLNHEQARYPPRAELLRTVNDFMTMFETVAEARRKEQALRAQEPDEDGFITVTSGPKLTSVAHEDEARELIEKQKQKSQGLEDFYRFQSREKRKERQNELLKKFDEDKKKLEEMKKRKGKIRVSSIVFPISLFLLLTKGFPLLMTY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.12
3 0.13
4 0.15
5 0.23
6 0.28
7 0.38
8 0.43
9 0.48
10 0.55
11 0.61
12 0.59
13 0.58
14 0.6
15 0.57
16 0.61
17 0.59
18 0.55
19 0.57
20 0.59
21 0.6
22 0.55
23 0.52
24 0.48
25 0.48
26 0.45
27 0.42
28 0.44
29 0.43
30 0.44
31 0.46
32 0.45
33 0.44
34 0.41
35 0.36
36 0.31
37 0.26
38 0.22
39 0.23
40 0.2
41 0.19
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.17
46 0.18
47 0.17
48 0.16
49 0.19
50 0.19
51 0.2
52 0.2
53 0.21
54 0.18
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.11
62 0.12
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.14
67 0.16
68 0.15
69 0.19
70 0.25
71 0.31
72 0.38
73 0.38
74 0.36
75 0.35
76 0.39
77 0.38
78 0.36
79 0.34
80 0.32
81 0.35
82 0.35
83 0.34
84 0.3
85 0.27
86 0.22
87 0.19
88 0.15
89 0.12
90 0.16
91 0.22
92 0.3
93 0.4
94 0.49
95 0.52
96 0.6
97 0.66
98 0.72
99 0.74
100 0.76
101 0.76
102 0.73
103 0.72
104 0.64
105 0.55
106 0.44
107 0.35
108 0.25
109 0.16
110 0.1
111 0.07
112 0.05
113 0.05
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.12
118 0.13
119 0.16
120 0.18
121 0.19
122 0.18
123 0.18
124 0.19
125 0.16
126 0.14
127 0.1
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.09
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.19
145 0.21
146 0.29
147 0.37
148 0.43
149 0.44
150 0.45
151 0.47
152 0.52
153 0.49
154 0.44
155 0.37
156 0.31
157 0.23
158 0.21
159 0.18
160 0.11
161 0.11
162 0.08
163 0.06
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.08
169 0.11
170 0.13
171 0.14
172 0.16
173 0.2
174 0.23
175 0.28
176 0.25
177 0.23
178 0.23
179 0.3
180 0.33
181 0.31
182 0.29
183 0.25
184 0.27
185 0.29
186 0.28
187 0.25
188 0.25
189 0.28
190 0.28
191 0.29
192 0.25
193 0.24
194 0.23
195 0.18
196 0.15
197 0.11
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.13
203 0.15
204 0.13
205 0.14
206 0.19
207 0.2
208 0.21
209 0.27
210 0.3
211 0.35
212 0.39
213 0.41
214 0.38
215 0.38
216 0.38
217 0.33
218 0.26
219 0.18
220 0.14
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.11
233 0.15
234 0.17
235 0.19
236 0.2
237 0.2
238 0.21
239 0.21
240 0.18
241 0.15
242 0.12
243 0.16
244 0.22
245 0.27
246 0.29
247 0.35
248 0.41
249 0.43
250 0.47
251 0.49
252 0.49
253 0.51
254 0.52
255 0.49
256 0.47
257 0.46
258 0.47
259 0.4
260 0.38
261 0.41
262 0.47
263 0.54
264 0.59
265 0.67
266 0.7
267 0.81
268 0.85
269 0.85
270 0.86
271 0.86
272 0.84
273 0.82
274 0.74
275 0.68
276 0.66
277 0.63
278 0.63
279 0.57
280 0.56
281 0.55
282 0.61
283 0.65
284 0.67
285 0.7
286 0.69
287 0.76
288 0.8
289 0.8
290 0.81
291 0.82
292 0.83
293 0.82
294 0.82
295 0.81
296 0.77
297 0.76
298 0.71
299 0.64
300 0.54
301 0.44
302 0.34
303 0.26
304 0.19
305 0.13
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.09