FuNGI

C5M947

Protein Details

Accession

C5M947

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-35	EGNKVSLHPEQKKWKAPKGPKPVHHKNKNLIGLG	Hydrophilic
132-158	MFENKLTIPKRPKWNKNQSKIEIDRQE	Hydrophilic
628-660	ATPFHKKSAEKTSNKKHNKKNKKQDKKVRVTGY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-29	KKWKAPKGPKPVHHKNK
633-655	KKSAEKTSNKKHNKKNKKQDKKV

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR030378 G_CP_dom IPR043358 GNL1-like IPR006073 GTP-bd IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0022625 C:cytosolic large ribosomal subunit GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0000027 P:ribosomal large subunit assembly GO:0000054 P:ribosomal subunit export from nucleus
KEGG	ctp:CTRG_02919 -
Pfam	View protein in Pfam PF01926 MMR_HSR1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51721 G_CP
CDD	cd01857 HSR1_MMR1

Amino Acid Sequences

MEGNKVSLHPEQKKWKAPKGPKPVHHKNKNLIGLGRTIANQRAKENSIQYLPDGEMRFTTDKKEADWVKLRSVTQENALDEFLSTAELADTDFTADKNQQVKIIKVGNTSIINSNGLLTTDEMLAMRQKHMMFENKLTIPKRPKWNKNQSKIEIDRQENLAFLDWRRQLAQLTENNDLLLTPFERNLEVWKQLWRVVERCDLIVQIVDARNPLFFRSVDLEKYVNSLSEPENNKAKNNLLLVNKADMLTREQRVAWAEYFKLKKINYVFFSAAKANELLEKEKEEENNLEGSNNAKDEVEEVEINEAIRILKIEELEKLFMDSAPKFEVDPEFPDRKLQIGLVGYPNVGKSSTINALVGSKKVSVSSTPGKTKHFQTIHLSPDVLLCDCPGLVFPNFAYTNGELVCNGVLPIDQLREHIPPISLVCQRIPKFFLEAVYGIHIPIQKVEDGGNGEYPTARELLNAYARARGYMTQGFGAADEPRAARYILKDYVNGKLLYVNPPPKEVAENEWILPNLQESRIFNRDLYTLNHLPESRQHQIITAMQNKHIPVDEFNLEKDLSRLNFSQHIGGEKKNGDNDAQEGSNKQGNNTGAKTLFYGGKQAALESAGDDLDREFFAMNNITGKFATPFHKKSAEKTSNKKHNKKNKKQDKKVRVTGY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.8
3	0.81
4	0.85
5	0.86
6	0.87
7	0.88
8	0.87
9	0.88
10	0.9
11	0.9
12	0.9
13	0.89
14	0.87
15	0.86
16	0.85
17	0.79
18	0.72
19	0.63
20	0.56
21	0.48
22	0.41
23	0.33
24	0.29
25	0.31
26	0.34
27	0.34
28	0.34
29	0.39
30	0.4
31	0.44
32	0.45
33	0.43
34	0.4
35	0.39
36	0.37
37	0.33
38	0.31
39	0.31
40	0.28
41	0.23
42	0.2
43	0.24
44	0.26
45	0.25
46	0.28
47	0.28
48	0.28
49	0.29
50	0.37
51	0.36
52	0.41
53	0.49
54	0.47
55	0.48
56	0.52
57	0.51
58	0.48
59	0.5
60	0.43
61	0.41
62	0.43
63	0.38
64	0.34
65	0.34
66	0.27
67	0.22
68	0.2
69	0.14
70	0.09
71	0.08
72	0.06
73	0.06
74	0.05
75	0.05
76	0.06
77	0.06
78	0.07
79	0.08
80	0.08
81	0.11
82	0.12
83	0.17
84	0.21
85	0.22
86	0.26
87	0.29
88	0.3
89	0.34
90	0.39
91	0.36
92	0.34
93	0.35
94	0.34
95	0.32
96	0.32
97	0.29
98	0.24
99	0.22
100	0.2
101	0.19
102	0.15
103	0.14
104	0.13
105	0.1
106	0.1
107	0.09
108	0.1
109	0.09
110	0.09
111	0.13
112	0.13
113	0.13
114	0.16
115	0.17
116	0.19
117	0.24
118	0.31
119	0.31
120	0.34
121	0.4
122	0.39
123	0.45
124	0.44
125	0.47
126	0.48
127	0.52
128	0.59
129	0.63
130	0.7
131	0.74
132	0.85
133	0.87
134	0.89
135	0.92
136	0.87
137	0.86
138	0.82
139	0.8
140	0.77
141	0.69
142	0.62
143	0.55
144	0.49
145	0.39
146	0.34
147	0.27
148	0.2
149	0.18
150	0.22
151	0.21
152	0.22
153	0.22
154	0.23
155	0.22
156	0.23
157	0.29
158	0.26
159	0.29
160	0.31
161	0.3
162	0.29
163	0.27
164	0.24
165	0.17
166	0.14
167	0.11
168	0.09
169	0.09
170	0.1
171	0.11
172	0.11
173	0.16
174	0.17
175	0.19
176	0.2
177	0.23
178	0.24
179	0.27
180	0.31
181	0.3
182	0.29
183	0.3
184	0.35
185	0.31
186	0.3
187	0.28
188	0.23
189	0.2
190	0.18
191	0.14
192	0.11
193	0.11
194	0.1
195	0.11
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.11
201	0.1
202	0.12
203	0.16
204	0.18
205	0.18
206	0.2
207	0.2
208	0.18
209	0.2
210	0.18
211	0.13
212	0.11
213	0.12
214	0.11
215	0.18
216	0.21
217	0.23
218	0.29
219	0.3
220	0.31
221	0.31
222	0.31
223	0.27
224	0.27
225	0.29
226	0.24
227	0.26
228	0.26
229	0.25
230	0.24
231	0.21
232	0.19
233	0.14
234	0.16
235	0.18
236	0.18
237	0.18
238	0.17
239	0.18
240	0.2
241	0.22
242	0.18
243	0.16
244	0.16
245	0.21
246	0.22
247	0.22
248	0.25
249	0.23
250	0.27
251	0.29
252	0.35
253	0.3
254	0.33
255	0.34
256	0.29
257	0.32
258	0.28
259	0.23
260	0.18
261	0.16
262	0.11
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.12
267	0.13
268	0.15
269	0.17
270	0.17
271	0.16
272	0.16
273	0.15
274	0.17
275	0.15
276	0.13
277	0.11
278	0.12
279	0.11
280	0.1
281	0.09
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.08
293	0.07
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.04
298	0.05
299	0.06
300	0.07
301	0.08
302	0.09
303	0.1
304	0.1
305	0.1
306	0.09
307	0.09
308	0.11
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.09
314	0.1
315	0.11
316	0.1
317	0.13
318	0.18
319	0.19
320	0.19
321	0.2
322	0.2
323	0.19
324	0.18
325	0.15
326	0.12
327	0.1
328	0.12
329	0.11
330	0.11
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.08
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.08
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.12
344	0.13
345	0.13
346	0.11
347	0.1
348	0.09
349	0.1
350	0.1
351	0.08
352	0.13
353	0.19
354	0.23
355	0.28
356	0.31
357	0.34
358	0.36
359	0.38
360	0.42
361	0.37
362	0.36
363	0.37
364	0.4
365	0.4
366	0.38
367	0.35
368	0.26
369	0.25
370	0.23
371	0.16
372	0.11
373	0.08
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.07
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.12
383	0.12
384	0.13
385	0.15
386	0.13
387	0.14
388	0.14
389	0.14
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.06
394	0.06
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.06
400	0.07
401	0.08
402	0.1
403	0.11
404	0.12
405	0.13
406	0.12
407	0.11
408	0.13
409	0.16
410	0.17
411	0.17
412	0.19
413	0.26
414	0.27
415	0.28
416	0.29
417	0.25
418	0.26
419	0.26
420	0.24
421	0.19
422	0.18
423	0.16
424	0.17
425	0.16
426	0.12
427	0.13
428	0.13
429	0.11
430	0.12
431	0.12
432	0.1
433	0.1
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.13
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.12
443	0.11
444	0.09
445	0.09
446	0.07
447	0.08
448	0.12
449	0.16
450	0.18
451	0.18
452	0.21
453	0.21
454	0.21
455	0.21
456	0.18
457	0.18
458	0.18
459	0.19
460	0.16
461	0.16
462	0.16
463	0.15
464	0.15
465	0.11
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.09
470	0.1
471	0.11
472	0.11
473	0.13
474	0.18
475	0.21
476	0.22
477	0.25
478	0.26
479	0.3
480	0.33
481	0.3
482	0.25
483	0.24
484	0.24
485	0.26
486	0.32
487	0.34
488	0.31
489	0.33
490	0.34
491	0.31
492	0.32
493	0.28
494	0.26
495	0.25
496	0.26
497	0.24
498	0.25
499	0.24
500	0.22
501	0.2
502	0.17
503	0.13
504	0.13
505	0.16
506	0.16
507	0.23
508	0.26
509	0.27
510	0.25
511	0.25
512	0.26
513	0.25
514	0.26
515	0.27
516	0.27
517	0.27
518	0.3
519	0.29
520	0.28
521	0.32
522	0.37
523	0.33
524	0.33
525	0.32
526	0.3
527	0.33
528	0.37
529	0.39
530	0.39
531	0.36
532	0.36
533	0.39
534	0.38
535	0.36
536	0.33
537	0.26
538	0.21
539	0.24
540	0.25
541	0.23
542	0.24
543	0.24
544	0.22
545	0.21
546	0.19
547	0.19
548	0.17
549	0.2
550	0.2
551	0.21
552	0.27
553	0.28
554	0.31
555	0.27
556	0.32
557	0.31
558	0.31
559	0.34
560	0.32
561	0.35
562	0.34
563	0.34
564	0.29
565	0.28
566	0.29
567	0.26
568	0.24
569	0.22
570	0.2
571	0.22
572	0.25
573	0.23
574	0.22
575	0.24
576	0.26
577	0.3
578	0.31
579	0.32
580	0.29
581	0.29
582	0.3
583	0.27
584	0.27
585	0.22
586	0.25
587	0.2
588	0.23
589	0.22
590	0.21
591	0.19
592	0.16
593	0.16
594	0.12
595	0.12
596	0.08
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.09
601	0.08
602	0.08
603	0.08
604	0.08
605	0.11
606	0.13
607	0.14
608	0.17
609	0.17
610	0.18
611	0.18
612	0.19
613	0.19
614	0.2
615	0.27
616	0.31
617	0.35
618	0.4
619	0.49
620	0.49
621	0.55
622	0.62
623	0.65
624	0.65
625	0.72
626	0.77
627	0.79
628	0.88
629	0.91
630	0.9
631	0.91
632	0.93
633	0.94
634	0.94
635	0.95
636	0.95
637	0.97
638	0.97
639	0.97
640	0.96

C5M947

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer