Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M8T6

Protein Details
Accession C5M8T6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-59VVFDVRQKEGKKKQVLKKKVDPNKKEVRKTTSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-53KEGKKKQVLKKKVDPNKKEV
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 3.5, cyto_nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR019368  Ribosomal_S23/S29_mit  
IPR017082  Ribosomal_S23_mit_fun  
Gene Ontology GO:0005763  C:mitochondrial small ribosomal subunit  
GO:0032543  P:mitochondrial translation  
KEGG ctp:CTRG_02808  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10236  DAP3  
Amino Acid Sequences MLRASNIVRARIVPTVSFTRTFTTTPVVFDVRQKEGKKKQVLKKKVDPNKKEVRKTTSLTHLPFRDAVRNLGLNKNAPVSKIEVLKLGNLQTGSMTSYPKKIESKLNIIGGFKRFQHHEMFDKPVSMITSNTTRLDSEFLEKLNGESKNNRIYIDGVKGSGKSTLVNQAITLAYEKLNNDVIVLHLDSGELIGNGSSDYIKNNKLKLYQQPMLTKRWIWKIMKTNEEIFKKLKLTKDTKFIKDKQEVVLKAGENTLFEYLKQNHEFGRINPHLAFQYFIEQLVDHSKEIPVLLSIDNFNAFADYPLTKYKHPDFTPIHINEFELGDFILKASSGELNFTKGGVLLAKSNDFALNRKTTHVGVYPNEEYDPYLKLPLFDFEIAYRLASNGGISPFKMNPLTKDETRSLMKFWKEQGVLIIRQDFHKKLYDDDVIGSIPELNQDEQFEKMVQLSYVNNQGNPYGMIKQSMLSY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.3
3 0.32
4 0.33
5 0.31
6 0.31
7 0.32
8 0.32
9 0.28
10 0.29
11 0.27
12 0.27
13 0.3
14 0.29
15 0.28
16 0.33
17 0.37
18 0.37
19 0.44
20 0.45
21 0.51
22 0.58
23 0.66
24 0.7
25 0.75
26 0.78
27 0.81
28 0.87
29 0.87
30 0.87
31 0.88
32 0.88
33 0.89
34 0.86
35 0.85
36 0.86
37 0.86
38 0.85
39 0.82
40 0.8
41 0.77
42 0.74
43 0.71
44 0.7
45 0.68
46 0.63
47 0.63
48 0.56
49 0.51
50 0.51
51 0.47
52 0.45
53 0.38
54 0.38
55 0.34
56 0.37
57 0.37
58 0.38
59 0.38
60 0.33
61 0.33
62 0.36
63 0.32
64 0.28
65 0.27
66 0.26
67 0.27
68 0.28
69 0.27
70 0.25
71 0.25
72 0.26
73 0.27
74 0.24
75 0.22
76 0.18
77 0.17
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.16
83 0.15
84 0.19
85 0.21
86 0.26
87 0.29
88 0.3
89 0.38
90 0.4
91 0.47
92 0.48
93 0.51
94 0.48
95 0.46
96 0.47
97 0.41
98 0.37
99 0.31
100 0.29
101 0.26
102 0.27
103 0.31
104 0.31
105 0.34
106 0.36
107 0.41
108 0.38
109 0.36
110 0.33
111 0.29
112 0.26
113 0.21
114 0.17
115 0.14
116 0.17
117 0.19
118 0.2
119 0.19
120 0.18
121 0.18
122 0.2
123 0.18
124 0.18
125 0.17
126 0.16
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.21
134 0.25
135 0.3
136 0.31
137 0.31
138 0.26
139 0.27
140 0.28
141 0.29
142 0.25
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.19
147 0.18
148 0.15
149 0.1
150 0.11
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.09
160 0.08
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.06
186 0.09
187 0.14
188 0.17
189 0.19
190 0.22
191 0.25
192 0.29
193 0.36
194 0.41
195 0.4
196 0.42
197 0.48
198 0.48
199 0.49
200 0.46
201 0.4
202 0.37
203 0.39
204 0.41
205 0.34
206 0.38
207 0.44
208 0.48
209 0.5
210 0.48
211 0.47
212 0.47
213 0.47
214 0.43
215 0.35
216 0.32
217 0.3
218 0.31
219 0.31
220 0.31
221 0.35
222 0.36
223 0.44
224 0.48
225 0.51
226 0.55
227 0.55
228 0.56
229 0.55
230 0.53
231 0.48
232 0.49
233 0.43
234 0.38
235 0.36
236 0.28
237 0.24
238 0.23
239 0.18
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.09
244 0.09
245 0.13
246 0.14
247 0.19
248 0.2
249 0.2
250 0.19
251 0.24
252 0.25
253 0.21
254 0.29
255 0.25
256 0.26
257 0.25
258 0.26
259 0.22
260 0.21
261 0.21
262 0.11
263 0.14
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.14
270 0.15
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.09
292 0.14
293 0.16
294 0.17
295 0.22
296 0.27
297 0.34
298 0.34
299 0.42
300 0.4
301 0.43
302 0.51
303 0.47
304 0.45
305 0.37
306 0.36
307 0.28
308 0.25
309 0.2
310 0.11
311 0.1
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.07
320 0.07
321 0.1
322 0.1
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.1
328 0.11
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.13
336 0.15
337 0.14
338 0.17
339 0.2
340 0.23
341 0.23
342 0.25
343 0.27
344 0.26
345 0.28
346 0.29
347 0.28
348 0.25
349 0.31
350 0.3
351 0.29
352 0.28
353 0.25
354 0.22
355 0.19
356 0.19
357 0.14
358 0.16
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.17
363 0.19
364 0.17
365 0.17
366 0.14
367 0.16
368 0.15
369 0.14
370 0.13
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.16
380 0.16
381 0.19
382 0.23
383 0.22
384 0.23
385 0.3
386 0.36
387 0.35
388 0.41
389 0.4
390 0.4
391 0.44
392 0.42
393 0.39
394 0.39
395 0.4
396 0.39
397 0.41
398 0.44
399 0.39
400 0.39
401 0.42
402 0.41
403 0.39
404 0.38
405 0.39
406 0.32
407 0.35
408 0.41
409 0.35
410 0.32
411 0.37
412 0.34
413 0.33
414 0.39
415 0.39
416 0.34
417 0.34
418 0.32
419 0.25
420 0.24
421 0.21
422 0.15
423 0.11
424 0.12
425 0.13
426 0.13
427 0.14
428 0.17
429 0.18
430 0.19
431 0.2
432 0.18
433 0.17
434 0.17
435 0.17
436 0.14
437 0.15
438 0.16
439 0.19
440 0.27
441 0.28
442 0.28
443 0.27
444 0.27
445 0.27
446 0.27
447 0.25
448 0.21
449 0.2
450 0.21
451 0.21