Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M4M9

Protein Details
Accession C5M4M9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
622-642TTPSNPQQQHHHQQHQQQPSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 3, golg 2, cyto_mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
KEGG ctp:CTRG_01019  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MTMNNRRPGMIGMNTFTNEILSSNSFPTVTTTTSSTTTTTATMTNSVPLHTFPSGSVLSLPDLSENGRDYLEDEISTILINSDPEECNENFSIYLKIILDNIYINKQPLYKDISKYSLKLIKSNLFTKNFKFCVGKIIAFLETFTVLTKFRLEEEEEEEQINEDDERAKYESECLKEFLCIVLLLLIKIKNTEHEKNSKNIDFNDGDVPKVKDDELSLIPVNELFETFREFKLMSILSSFISTQIIAINNQESKFVILKFSCDIIFEYFYQVEMLNNEELNELTKHDLIPTLIKYLLNNDDFHNYDLDGDEFEDESRLIAYEELKLLLLINEQFLMKSYYDKNLNNLVFDELLKNVENLNQITGLINLLIYHLNREESQIIKILILKFLYLVFVSSCTCKLIYLNDLKILIDIIIRELNNTDDDKKILTMTYLRVLYPILIFSQINENDNYKGYKNNQILQVLREIIINYETKLQDLSRNDSNDEDNSISKLAIKCMHVKWLKNPSQPNQQQHPQHHHQQQQQQGTFKTESPESDEQISIQSTNSKESLTGSFTRVASVRASSRSDYHKHTTTHNIVRKNSGKSKNSSNSFNNQRSLMIEENNGNVFLSKISKISLSDQSTTTPSNPQQQHHHQQHQQQPSLTTTTTLETTTSIHSDQISITSSVGTSDSNILDLPDEYLNSKPLPKIPLPTKAKRTFNLFNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.3
4 0.24
5 0.17
6 0.14
7 0.15
8 0.14
9 0.16
10 0.17
11 0.18
12 0.17
13 0.17
14 0.21
15 0.21
16 0.19
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.23
21 0.24
22 0.21
23 0.2
24 0.19
25 0.18
26 0.17
27 0.16
28 0.16
29 0.17
30 0.17
31 0.2
32 0.2
33 0.2
34 0.2
35 0.19
36 0.22
37 0.2
38 0.2
39 0.15
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.15
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.12
49 0.12
50 0.13
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.17
58 0.17
59 0.14
60 0.12
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.1
70 0.11
71 0.13
72 0.17
73 0.17
74 0.21
75 0.22
76 0.22
77 0.19
78 0.19
79 0.2
80 0.15
81 0.18
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.14
86 0.13
87 0.14
88 0.16
89 0.17
90 0.18
91 0.19
92 0.2
93 0.21
94 0.21
95 0.23
96 0.29
97 0.32
98 0.35
99 0.39
100 0.44
101 0.45
102 0.45
103 0.49
104 0.46
105 0.41
106 0.41
107 0.42
108 0.42
109 0.45
110 0.5
111 0.5
112 0.5
113 0.53
114 0.53
115 0.56
116 0.5
117 0.49
118 0.46
119 0.38
120 0.4
121 0.4
122 0.36
123 0.29
124 0.3
125 0.27
126 0.24
127 0.24
128 0.16
129 0.13
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.15
139 0.17
140 0.18
141 0.24
142 0.27
143 0.26
144 0.26
145 0.25
146 0.22
147 0.2
148 0.18
149 0.11
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.2
158 0.25
159 0.25
160 0.27
161 0.26
162 0.25
163 0.25
164 0.25
165 0.19
166 0.14
167 0.1
168 0.08
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.16
178 0.22
179 0.29
180 0.32
181 0.41
182 0.44
183 0.48
184 0.55
185 0.53
186 0.49
187 0.44
188 0.44
189 0.36
190 0.34
191 0.37
192 0.3
193 0.27
194 0.27
195 0.27
196 0.22
197 0.22
198 0.2
199 0.13
200 0.13
201 0.17
202 0.14
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.14
209 0.1
210 0.09
211 0.06
212 0.06
213 0.11
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.17
220 0.17
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.12
240 0.13
241 0.15
242 0.14
243 0.15
244 0.13
245 0.15
246 0.15
247 0.16
248 0.14
249 0.13
250 0.14
251 0.12
252 0.14
253 0.12
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.11
259 0.1
260 0.08
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.14
283 0.19
284 0.18
285 0.18
286 0.17
287 0.19
288 0.2
289 0.21
290 0.18
291 0.13
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.08
323 0.07
324 0.1
325 0.11
326 0.14
327 0.2
328 0.2
329 0.22
330 0.28
331 0.28
332 0.25
333 0.25
334 0.21
335 0.17
336 0.16
337 0.14
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.06
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.14
370 0.13
371 0.13
372 0.12
373 0.11
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.14
390 0.18
391 0.18
392 0.19
393 0.2
394 0.19
395 0.19
396 0.17
397 0.12
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.12
408 0.12
409 0.11
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.1
415 0.09
416 0.1
417 0.11
418 0.14
419 0.15
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.14
424 0.12
425 0.11
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.15
431 0.15
432 0.16
433 0.17
434 0.18
435 0.17
436 0.19
437 0.2
438 0.14
439 0.18
440 0.2
441 0.27
442 0.3
443 0.33
444 0.36
445 0.38
446 0.39
447 0.35
448 0.35
449 0.27
450 0.24
451 0.2
452 0.16
453 0.12
454 0.13
455 0.12
456 0.1
457 0.14
458 0.14
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.18
463 0.21
464 0.25
465 0.25
466 0.27
467 0.28
468 0.28
469 0.3
470 0.25
471 0.24
472 0.21
473 0.16
474 0.15
475 0.15
476 0.13
477 0.15
478 0.15
479 0.16
480 0.18
481 0.2
482 0.25
483 0.25
484 0.35
485 0.35
486 0.37
487 0.42
488 0.49
489 0.55
490 0.56
491 0.62
492 0.59
493 0.66
494 0.71
495 0.71
496 0.68
497 0.68
498 0.69
499 0.7
500 0.72
501 0.67
502 0.7
503 0.7
504 0.7
505 0.7
506 0.69
507 0.7
508 0.69
509 0.67
510 0.62
511 0.55
512 0.52
513 0.46
514 0.4
515 0.35
516 0.28
517 0.25
518 0.28
519 0.29
520 0.26
521 0.27
522 0.25
523 0.23
524 0.23
525 0.23
526 0.15
527 0.13
528 0.16
529 0.14
530 0.17
531 0.17
532 0.15
533 0.15
534 0.17
535 0.19
536 0.19
537 0.2
538 0.2
539 0.23
540 0.23
541 0.25
542 0.23
543 0.22
544 0.19
545 0.2
546 0.21
547 0.21
548 0.24
549 0.24
550 0.28
551 0.33
552 0.36
553 0.4
554 0.43
555 0.46
556 0.44
557 0.47
558 0.52
559 0.54
560 0.6
561 0.6
562 0.6
563 0.56
564 0.63
565 0.65
566 0.64
567 0.65
568 0.65
569 0.65
570 0.62
571 0.71
572 0.71
573 0.69
574 0.68
575 0.64
576 0.64
577 0.68
578 0.68
579 0.61
580 0.52
581 0.48
582 0.42
583 0.42
584 0.35
585 0.28
586 0.26
587 0.24
588 0.26
589 0.25
590 0.23
591 0.18
592 0.15
593 0.13
594 0.11
595 0.13
596 0.11
597 0.11
598 0.12
599 0.14
600 0.16
601 0.21
602 0.28
603 0.29
604 0.31
605 0.31
606 0.32
607 0.34
608 0.34
609 0.31
610 0.29
611 0.29
612 0.36
613 0.4
614 0.43
615 0.49
616 0.57
617 0.66
618 0.69
619 0.75
620 0.72
621 0.77
622 0.81
623 0.81
624 0.76
625 0.69
626 0.61
627 0.55
628 0.52
629 0.43
630 0.35
631 0.27
632 0.24
633 0.22
634 0.19
635 0.16
636 0.13
637 0.15
638 0.16
639 0.18
640 0.16
641 0.16
642 0.16
643 0.17
644 0.16
645 0.17
646 0.17
647 0.15
648 0.14
649 0.13
650 0.13
651 0.13
652 0.13
653 0.11
654 0.09
655 0.12
656 0.12
657 0.12
658 0.12
659 0.12
660 0.12
661 0.12
662 0.13
663 0.11
664 0.12
665 0.13
666 0.15
667 0.18
668 0.18
669 0.22
670 0.22
671 0.26
672 0.32
673 0.34
674 0.42
675 0.46
676 0.55
677 0.6
678 0.67
679 0.72
680 0.75
681 0.79
682 0.74
683 0.76