Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M482

Protein Details
Accession C5M482    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-64SRRTSEKIIPHHQNEKKRKTSIKPEKKKIQDDDADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-57EKKRKTSIKPEKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 9.833, mito 6.5, cyto_mito 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
IPR005576  Rpb7-like_N  
Gene Ontology GO:0005736  C:RNA polymerase I complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0001054  F:RNA polymerase I activity  
GO:0006363  P:termination of RNA polymerase I transcription  
GO:0006362  P:transcription elongation by RNA polymerase I  
GO:0006361  P:transcription initiation at RNA polymerase I promoter  
KEGG ctp:CTRG_00871  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
PF03876  SHS2_Rpb7-N  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MHNPISYSPNFAITLSRISKSRNISILGNSRRTSEKIIPHHQNEKKRKTSIKPEKKKIQDDDADIGSQFQQKKRSHHFLVTIMSVEVRKRPSETLSSASKRRATVQSTNPKDDSGLSQCYKTVTTSLYVSLAPVHLQNPINGIKQQHLDPLIMTYFAKAKGVVVAYSNIRFLEENDESSHSLAKIEGSSPFTFMWISVDFLCWCPQVGDVLEADVYMQTPSHIGLLINDTFNASIKKYNIPTSWTFKSNQVDEVSSDDKKTFGHWLDENETKIEGKLQFTVKAIYTTGRVVSVEGTLIKPGEERNAQPVYTERQEKKPSGKHMKFDDDEDDQQENVITTEIAEPDENEELPAYVKDSDDDEDEGEDGKVVNKSDSEEDIVESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.27
3 0.29
4 0.27
5 0.31
6 0.37
7 0.41
8 0.45
9 0.41
10 0.41
11 0.42
12 0.48
13 0.54
14 0.55
15 0.55
16 0.49
17 0.48
18 0.48
19 0.48
20 0.47
21 0.45
22 0.46
23 0.49
24 0.58
25 0.64
26 0.67
27 0.75
28 0.75
29 0.79
30 0.8
31 0.81
32 0.8
33 0.79
34 0.81
35 0.8
36 0.84
37 0.85
38 0.86
39 0.87
40 0.88
41 0.9
42 0.91
43 0.91
44 0.86
45 0.84
46 0.79
47 0.73
48 0.67
49 0.59
50 0.5
51 0.4
52 0.35
53 0.27
54 0.26
55 0.25
56 0.24
57 0.31
58 0.36
59 0.45
60 0.53
61 0.6
62 0.6
63 0.62
64 0.62
65 0.58
66 0.56
67 0.49
68 0.4
69 0.31
70 0.27
71 0.23
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.18
76 0.2
77 0.22
78 0.25
79 0.29
80 0.32
81 0.32
82 0.38
83 0.42
84 0.44
85 0.47
86 0.47
87 0.42
88 0.45
89 0.46
90 0.43
91 0.47
92 0.53
93 0.58
94 0.6
95 0.64
96 0.59
97 0.53
98 0.47
99 0.39
100 0.34
101 0.28
102 0.28
103 0.24
104 0.24
105 0.24
106 0.25
107 0.24
108 0.2
109 0.17
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.1
119 0.08
120 0.09
121 0.08
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.16
126 0.18
127 0.19
128 0.2
129 0.21
130 0.18
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.15
137 0.16
138 0.13
139 0.12
140 0.11
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.15
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.17
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.11
175 0.11
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.08
183 0.09
184 0.07
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.09
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.08
221 0.1
222 0.12
223 0.16
224 0.19
225 0.23
226 0.24
227 0.27
228 0.31
229 0.35
230 0.36
231 0.34
232 0.34
233 0.35
234 0.38
235 0.35
236 0.34
237 0.29
238 0.27
239 0.25
240 0.28
241 0.25
242 0.21
243 0.21
244 0.17
245 0.16
246 0.15
247 0.16
248 0.17
249 0.16
250 0.2
251 0.21
252 0.25
253 0.3
254 0.33
255 0.32
256 0.27
257 0.26
258 0.22
259 0.2
260 0.2
261 0.17
262 0.15
263 0.19
264 0.2
265 0.22
266 0.22
267 0.24
268 0.2
269 0.2
270 0.19
271 0.16
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.15
289 0.17
290 0.18
291 0.24
292 0.26
293 0.26
294 0.26
295 0.29
296 0.3
297 0.33
298 0.41
299 0.38
300 0.45
301 0.52
302 0.56
303 0.62
304 0.63
305 0.68
306 0.7
307 0.72
308 0.71
309 0.72
310 0.75
311 0.67
312 0.63
313 0.58
314 0.52
315 0.49
316 0.45
317 0.39
318 0.3
319 0.28
320 0.25
321 0.2
322 0.14
323 0.12
324 0.07
325 0.07
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.14
332 0.16
333 0.15
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.13
344 0.15
345 0.16
346 0.17
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.13
352 0.12
353 0.1
354 0.12
355 0.14
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.19
360 0.22
361 0.24
362 0.25
363 0.23