Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SPC4

Protein Details
Accession A0A5N6SPC4    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
206-229YIKGSSDKAKREKARKEKNILEVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-55TKAIDKPAPRVGKRDAPKEAPSQPRAG
83-84KP
86-99DEREGGARRGGRPR
213-223KAKREKARKEK
236-265PRGSSGPRGRGGRGGRGARGGRGNGPRGER
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MTDVRSKNLYELLGNDPELDPSKPPAPPTKAIDKPAPRVGKRDAPKEAPSQPRAGQSSRRGNFSGNEAAFRDRNAGRNQNREKPTDEREGGARRGGRPRNDRQSRTGQTDTGKKVNQGWGGQSGEKELDDERAGEKIAQADENEPQTPAEEAEPADKAKSYNDYLVEKAAAGDFSAKAVRAANEGSKADSKWANAKEFKREEDDDYIKGSSDKAKREKARKEKNILEVDMRFVEAPRGSSGPRGRGGRGGRGARGGRGNGPRGERTERSAPVTVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.22
4 0.23
5 0.24
6 0.22
7 0.18
8 0.2
9 0.24
10 0.25
11 0.29
12 0.35
13 0.39
14 0.44
15 0.49
16 0.54
17 0.56
18 0.59
19 0.64
20 0.62
21 0.62
22 0.65
23 0.68
24 0.59
25 0.59
26 0.6
27 0.6
28 0.61
29 0.62
30 0.6
31 0.57
32 0.6
33 0.61
34 0.64
35 0.63
36 0.59
37 0.56
38 0.52
39 0.53
40 0.52
41 0.49
42 0.49
43 0.49
44 0.57
45 0.54
46 0.55
47 0.49
48 0.47
49 0.45
50 0.42
51 0.41
52 0.3
53 0.3
54 0.27
55 0.3
56 0.28
57 0.27
58 0.27
59 0.2
60 0.25
61 0.3
62 0.38
63 0.41
64 0.51
65 0.58
66 0.62
67 0.64
68 0.61
69 0.59
70 0.55
71 0.55
72 0.54
73 0.47
74 0.39
75 0.41
76 0.43
77 0.4
78 0.38
79 0.34
80 0.29
81 0.37
82 0.42
83 0.44
84 0.48
85 0.56
86 0.63
87 0.69
88 0.69
89 0.66
90 0.7
91 0.66
92 0.65
93 0.58
94 0.5
95 0.45
96 0.49
97 0.47
98 0.42
99 0.38
100 0.32
101 0.33
102 0.35
103 0.34
104 0.28
105 0.25
106 0.24
107 0.24
108 0.24
109 0.21
110 0.17
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.08
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.12
130 0.12
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.12
147 0.12
148 0.14
149 0.16
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.17
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.14
171 0.15
172 0.16
173 0.17
174 0.17
175 0.18
176 0.18
177 0.18
178 0.22
179 0.26
180 0.29
181 0.34
182 0.37
183 0.44
184 0.45
185 0.46
186 0.45
187 0.44
188 0.42
189 0.43
190 0.43
191 0.35
192 0.34
193 0.31
194 0.25
195 0.23
196 0.2
197 0.2
198 0.23
199 0.3
200 0.35
201 0.44
202 0.53
203 0.62
204 0.72
205 0.75
206 0.81
207 0.83
208 0.84
209 0.82
210 0.83
211 0.8
212 0.71
213 0.66
214 0.55
215 0.49
216 0.4
217 0.34
218 0.25
219 0.18
220 0.2
221 0.15
222 0.16
223 0.15
224 0.17
225 0.17
226 0.24
227 0.29
228 0.3
229 0.36
230 0.37
231 0.36
232 0.42
233 0.45
234 0.46
235 0.5
236 0.48
237 0.43
238 0.48
239 0.48
240 0.45
241 0.47
242 0.4
243 0.39
244 0.43
245 0.46
246 0.44
247 0.47
248 0.47
249 0.47
250 0.52
251 0.47
252 0.47
253 0.5
254 0.48
255 0.49
256 0.49
257 0.44
258 0.41
259 0.43
260 0.4
261 0.36
262 0.36
263 0.33
264 0.32
265 0.31