Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDX5

Protein Details
Accession C5MDX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
627-649NDGGRLRKRGGKSKPSIEKSKDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
631-642RLRKRGGKSKPS
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005680  C:anaphase-promoting complex  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005721  C:pericentric heterochromatin  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0031145  P:anaphase-promoting complex-dependent catabolic process  
GO:0051306  P:mitotic sister chromatid separation  
GO:0032297  P:negative regulation of DNA-templated DNA replication initiation  
GO:1901970  P:positive regulation of mitotic sister chromatid separation  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
KEGG ctp:CTRG_03877  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12895  ANAPC3  
PF13424  TPR_12  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MVQNQKTPTEHNSTLYISPMMNKKNDLLYVTPPNPTTSTNKLLETPGSNKSTSSFFNFDKTSQHNAPHHHNHDYSLDDPLTPVDKLRLWRHDAIMQHQYKTAEFIGDKILELTSDPNDAFWLAQVYFNQGNYLRCKNLISNNADYNNSISCRYLAGYSLIKLEMWDEALDLIGETNPFKNSNNHNNNNNNNNNSTRIYQDDGGIKLEASMCYLRGLIYANQNNFERAKECYKEACVVDVKCYEAFNELIDNNLMTPTEEWDFVMTQLNYRDNLDNNDELIKLLYTTKLSKYLNTNKFEESEHILKEEYDLRDNCDLMLSRADYLYIQCNFDECLNICEKILNKDQYNFDVIPNYLSCLYELGGKNKLFLKAHQLAELHPTNPMTWLAIGTYYLSINKVVEARKFFSKATLLNPNFGQAWIGFAHTFAAEGEHEQAISAYAYAARLFPGTHLPNLFLGMQHLQMNNLNLSEEYLLASYHICNSDPLLLNELGVINFHKNQFDKAEIYLQEALTAAKNLNSDSKTWISIHANLGHVYRRANQPYKALECFNQVLKISNKNDANILSAIGLIHLRLGNIFKSIDILHDALAISPLDPVASDLLKRALEANKENQEIFKTTEKLIQLDLPNDGGRLRKRGGKSKPSIEKSKDDINKDANKLLGTPLLSKTRNLEPVNIEESKNEYDDVTLLAQDLQQGEESSDDDDDDDGMDIVSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.32
4 0.24
5 0.27
6 0.31
7 0.33
8 0.33
9 0.34
10 0.35
11 0.38
12 0.4
13 0.37
14 0.33
15 0.35
16 0.42
17 0.42
18 0.42
19 0.38
20 0.39
21 0.37
22 0.38
23 0.37
24 0.35
25 0.4
26 0.39
27 0.4
28 0.39
29 0.4
30 0.4
31 0.39
32 0.36
33 0.37
34 0.37
35 0.36
36 0.33
37 0.33
38 0.32
39 0.3
40 0.32
41 0.3
42 0.28
43 0.34
44 0.36
45 0.35
46 0.38
47 0.4
48 0.41
49 0.4
50 0.47
51 0.47
52 0.5
53 0.59
54 0.62
55 0.62
56 0.61
57 0.58
58 0.52
59 0.5
60 0.48
61 0.39
62 0.34
63 0.29
64 0.22
65 0.22
66 0.21
67 0.21
68 0.17
69 0.17
70 0.15
71 0.18
72 0.24
73 0.32
74 0.37
75 0.42
76 0.46
77 0.48
78 0.5
79 0.5
80 0.5
81 0.52
82 0.48
83 0.43
84 0.42
85 0.39
86 0.35
87 0.35
88 0.29
89 0.23
90 0.2
91 0.19
92 0.21
93 0.2
94 0.2
95 0.17
96 0.17
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.1
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.11
109 0.09
110 0.12
111 0.12
112 0.17
113 0.18
114 0.18
115 0.21
116 0.2
117 0.24
118 0.27
119 0.32
120 0.28
121 0.27
122 0.3
123 0.32
124 0.37
125 0.41
126 0.41
127 0.42
128 0.46
129 0.47
130 0.46
131 0.41
132 0.35
133 0.3
134 0.26
135 0.21
136 0.16
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.12
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.14
148 0.14
149 0.13
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.12
166 0.19
167 0.27
168 0.37
169 0.47
170 0.52
171 0.59
172 0.66
173 0.72
174 0.74
175 0.72
176 0.64
177 0.57
178 0.52
179 0.48
180 0.42
181 0.36
182 0.29
183 0.26
184 0.26
185 0.23
186 0.25
187 0.24
188 0.23
189 0.23
190 0.21
191 0.18
192 0.15
193 0.16
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.11
204 0.2
205 0.24
206 0.25
207 0.28
208 0.28
209 0.3
210 0.28
211 0.27
212 0.2
213 0.19
214 0.24
215 0.23
216 0.25
217 0.26
218 0.28
219 0.31
220 0.3
221 0.29
222 0.28
223 0.26
224 0.27
225 0.25
226 0.24
227 0.2
228 0.2
229 0.17
230 0.14
231 0.13
232 0.1
233 0.12
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.15
251 0.12
252 0.13
253 0.16
254 0.17
255 0.17
256 0.18
257 0.2
258 0.16
259 0.19
260 0.2
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.16
265 0.14
266 0.13
267 0.1
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.1
273 0.11
274 0.17
275 0.18
276 0.2
277 0.28
278 0.38
279 0.44
280 0.46
281 0.47
282 0.42
283 0.43
284 0.41
285 0.34
286 0.29
287 0.25
288 0.21
289 0.19
290 0.18
291 0.17
292 0.18
293 0.2
294 0.16
295 0.18
296 0.18
297 0.21
298 0.22
299 0.22
300 0.2
301 0.17
302 0.16
303 0.12
304 0.13
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.09
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.14
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.13
326 0.15
327 0.21
328 0.22
329 0.22
330 0.26
331 0.27
332 0.27
333 0.29
334 0.26
335 0.2
336 0.18
337 0.17
338 0.14
339 0.13
340 0.12
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.12
347 0.13
348 0.14
349 0.19
350 0.19
351 0.21
352 0.23
353 0.26
354 0.21
355 0.2
356 0.26
357 0.27
358 0.28
359 0.29
360 0.27
361 0.24
362 0.29
363 0.3
364 0.21
365 0.16
366 0.16
367 0.13
368 0.14
369 0.13
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.1
385 0.11
386 0.14
387 0.17
388 0.19
389 0.22
390 0.24
391 0.23
392 0.22
393 0.23
394 0.22
395 0.24
396 0.31
397 0.29
398 0.29
399 0.29
400 0.28
401 0.25
402 0.23
403 0.19
404 0.09
405 0.1
406 0.08
407 0.09
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.05
414 0.06
415 0.05
416 0.06
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.13
435 0.14
436 0.16
437 0.16
438 0.17
439 0.17
440 0.18
441 0.17
442 0.11
443 0.11
444 0.1
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.13
450 0.15
451 0.13
452 0.12
453 0.11
454 0.09
455 0.1
456 0.09
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.06
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.1
469 0.15
470 0.17
471 0.17
472 0.19
473 0.18
474 0.17
475 0.18
476 0.17
477 0.11
478 0.09
479 0.1
480 0.08
481 0.11
482 0.12
483 0.15
484 0.15
485 0.18
486 0.2
487 0.22
488 0.21
489 0.2
490 0.25
491 0.22
492 0.25
493 0.25
494 0.22
495 0.19
496 0.18
497 0.17
498 0.12
499 0.12
500 0.09
501 0.08
502 0.09
503 0.1
504 0.15
505 0.15
506 0.16
507 0.2
508 0.22
509 0.22
510 0.22
511 0.26
512 0.24
513 0.27
514 0.3
515 0.28
516 0.28
517 0.27
518 0.28
519 0.26
520 0.24
521 0.22
522 0.23
523 0.28
524 0.35
525 0.39
526 0.4
527 0.44
528 0.49
529 0.52
530 0.5
531 0.45
532 0.38
533 0.38
534 0.38
535 0.33
536 0.3
537 0.25
538 0.27
539 0.29
540 0.35
541 0.32
542 0.38
543 0.38
544 0.35
545 0.37
546 0.32
547 0.32
548 0.24
549 0.22
550 0.14
551 0.13
552 0.12
553 0.1
554 0.09
555 0.06
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.08
560 0.1
561 0.1
562 0.12
563 0.12
564 0.1
565 0.12
566 0.12
567 0.12
568 0.14
569 0.14
570 0.12
571 0.13
572 0.13
573 0.11
574 0.12
575 0.11
576 0.08
577 0.07
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.07
583 0.08
584 0.08
585 0.1
586 0.13
587 0.14
588 0.14
589 0.18
590 0.2
591 0.25
592 0.3
593 0.37
594 0.4
595 0.43
596 0.43
597 0.4
598 0.39
599 0.35
600 0.34
601 0.33
602 0.28
603 0.28
604 0.32
605 0.32
606 0.3
607 0.29
608 0.31
609 0.28
610 0.27
611 0.27
612 0.24
613 0.23
614 0.22
615 0.21
616 0.22
617 0.23
618 0.27
619 0.28
620 0.34
621 0.4
622 0.5
623 0.59
624 0.64
625 0.69
626 0.73
627 0.81
628 0.81
629 0.84
630 0.8
631 0.77
632 0.71
633 0.73
634 0.69
635 0.63
636 0.62
637 0.61
638 0.63
639 0.59
640 0.57
641 0.49
642 0.42
643 0.39
644 0.34
645 0.29
646 0.23
647 0.23
648 0.25
649 0.31
650 0.32
651 0.32
652 0.35
653 0.39
654 0.46
655 0.44
656 0.44
657 0.4
658 0.45
659 0.5
660 0.48
661 0.41
662 0.33
663 0.36
664 0.33
665 0.3
666 0.25
667 0.19
668 0.17
669 0.17
670 0.18
671 0.14
672 0.11
673 0.11
674 0.11
675 0.11
676 0.13
677 0.13
678 0.11
679 0.12
680 0.12
681 0.12
682 0.12
683 0.13
684 0.12
685 0.12
686 0.11
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.09
691 0.09
692 0.07