Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDE5

Protein Details
Accession C5MDE5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
598-618GEIWSQKSKSHKKDLNKAAAWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006597  Sel1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG ctp:CTRG_04246  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08238  Sel1  
Amino Acid Sequences MDEYIKSTLEVPTNIRHYPNSPLQSIERLHKRPITSPETNSNNLPVSPISQELINDANMDRESIYSFDSVSTSGRLLDRLGLEDDDDNYDDDSYSMLNKRESMASIQTTGRLLDRLELDGSRMQPQVQNKMLPQQRNVLPIQPVNSLGDIRGLKNQSSPQALQRRLTELQKENHRHNVKEKVGEEELTKDECIKNEGKPNLVASVQKPIQTTMNNIQPPQKPQSAPAHLKHVPMNLVFKNTNNSAETIKSDAASLKKVDTQKSQTPEGNGPSSLSNSPMLSPNNSSFPSATNSPAISAASSTTSLRTLQNQYQSEPNVPTLSSLEMKTRANRSNSVRPISQRVQYVTRTPSAPAIRKRSDESTERLGMRVRSDSTNSNFSTNSIESASSQGALTPPPSSSAQQQQQLLDLSNPEQRTNYALHLRSIGNHREASYQLQIAANIPFNYPKAMFLYAMALKYGQGVKQNDRHAIKWLTKCILLSSSSINSSNISIVIDKLNGLPLEDVVRLIMKNLRNTVDKDVHKNGQDPLSLYPIFSKLTKNQISKVVSVSRSKGDVVACSYFELGILLFNGSGSIEDGICCLEKAGSMGYIDAMVKLGEIWSQKSKSHKKDLNKAAAWLRLAELLGVKDIGNSWIYKDKYNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.38
3 0.37
4 0.36
5 0.41
6 0.47
7 0.45
8 0.41
9 0.42
10 0.42
11 0.46
12 0.47
13 0.48
14 0.49
15 0.48
16 0.53
17 0.55
18 0.55
19 0.56
20 0.61
21 0.6
22 0.57
23 0.58
24 0.62
25 0.62
26 0.62
27 0.56
28 0.51
29 0.44
30 0.38
31 0.34
32 0.25
33 0.21
34 0.21
35 0.21
36 0.17
37 0.16
38 0.16
39 0.17
40 0.18
41 0.15
42 0.15
43 0.13
44 0.15
45 0.14
46 0.15
47 0.13
48 0.12
49 0.13
50 0.12
51 0.14
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.13
61 0.13
62 0.14
63 0.14
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.19
68 0.17
69 0.17
70 0.17
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.13
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.08
81 0.11
82 0.14
83 0.16
84 0.17
85 0.18
86 0.2
87 0.22
88 0.23
89 0.23
90 0.25
91 0.24
92 0.26
93 0.26
94 0.26
95 0.24
96 0.23
97 0.2
98 0.16
99 0.14
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.17
104 0.16
105 0.17
106 0.2
107 0.21
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.22
112 0.27
113 0.33
114 0.34
115 0.36
116 0.33
117 0.41
118 0.46
119 0.47
120 0.44
121 0.44
122 0.44
123 0.45
124 0.45
125 0.4
126 0.38
127 0.36
128 0.36
129 0.29
130 0.27
131 0.23
132 0.23
133 0.19
134 0.15
135 0.18
136 0.17
137 0.17
138 0.22
139 0.22
140 0.22
141 0.26
142 0.29
143 0.28
144 0.32
145 0.32
146 0.35
147 0.42
148 0.45
149 0.44
150 0.43
151 0.45
152 0.43
153 0.46
154 0.45
155 0.43
156 0.47
157 0.54
158 0.57
159 0.56
160 0.62
161 0.62
162 0.57
163 0.58
164 0.6
165 0.55
166 0.57
167 0.53
168 0.49
169 0.45
170 0.43
171 0.37
172 0.3
173 0.28
174 0.22
175 0.22
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.2
180 0.19
181 0.21
182 0.27
183 0.29
184 0.29
185 0.3
186 0.3
187 0.28
188 0.27
189 0.25
190 0.18
191 0.24
192 0.24
193 0.25
194 0.24
195 0.24
196 0.26
197 0.25
198 0.29
199 0.26
200 0.32
201 0.31
202 0.32
203 0.37
204 0.37
205 0.41
206 0.42
207 0.41
208 0.34
209 0.38
210 0.46
211 0.47
212 0.5
213 0.47
214 0.5
215 0.47
216 0.49
217 0.46
218 0.38
219 0.32
220 0.27
221 0.3
222 0.23
223 0.25
224 0.23
225 0.22
226 0.24
227 0.23
228 0.24
229 0.2
230 0.2
231 0.17
232 0.18
233 0.18
234 0.16
235 0.16
236 0.13
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.18
244 0.21
245 0.24
246 0.27
247 0.32
248 0.35
249 0.39
250 0.42
251 0.39
252 0.38
253 0.38
254 0.36
255 0.31
256 0.25
257 0.22
258 0.19
259 0.19
260 0.16
261 0.14
262 0.12
263 0.11
264 0.12
265 0.14
266 0.15
267 0.14
268 0.16
269 0.16
270 0.18
271 0.19
272 0.19
273 0.15
274 0.16
275 0.18
276 0.16
277 0.17
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.12
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.13
294 0.16
295 0.19
296 0.26
297 0.27
298 0.27
299 0.29
300 0.3
301 0.28
302 0.25
303 0.22
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.13
313 0.14
314 0.17
315 0.22
316 0.25
317 0.27
318 0.32
319 0.36
320 0.43
321 0.47
322 0.47
323 0.44
324 0.41
325 0.45
326 0.43
327 0.4
328 0.34
329 0.31
330 0.32
331 0.31
332 0.33
333 0.29
334 0.27
335 0.24
336 0.22
337 0.25
338 0.27
339 0.31
340 0.34
341 0.39
342 0.4
343 0.42
344 0.44
345 0.43
346 0.42
347 0.4
348 0.37
349 0.35
350 0.36
351 0.35
352 0.32
353 0.3
354 0.27
355 0.25
356 0.23
357 0.19
358 0.16
359 0.19
360 0.23
361 0.23
362 0.28
363 0.27
364 0.26
365 0.24
366 0.23
367 0.25
368 0.2
369 0.18
370 0.13
371 0.13
372 0.12
373 0.14
374 0.13
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.09
384 0.11
385 0.12
386 0.15
387 0.23
388 0.27
389 0.31
390 0.32
391 0.3
392 0.31
393 0.3
394 0.27
395 0.2
396 0.16
397 0.14
398 0.16
399 0.17
400 0.15
401 0.15
402 0.15
403 0.16
404 0.17
405 0.19
406 0.22
407 0.22
408 0.22
409 0.25
410 0.25
411 0.26
412 0.3
413 0.3
414 0.26
415 0.26
416 0.26
417 0.25
418 0.26
419 0.27
420 0.23
421 0.2
422 0.18
423 0.17
424 0.17
425 0.16
426 0.16
427 0.15
428 0.13
429 0.13
430 0.13
431 0.13
432 0.15
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.14
437 0.14
438 0.13
439 0.17
440 0.17
441 0.17
442 0.16
443 0.13
444 0.12
445 0.14
446 0.15
447 0.12
448 0.17
449 0.21
450 0.27
451 0.33
452 0.38
453 0.43
454 0.44
455 0.43
456 0.43
457 0.45
458 0.47
459 0.46
460 0.46
461 0.41
462 0.39
463 0.39
464 0.33
465 0.3
466 0.24
467 0.2
468 0.19
469 0.18
470 0.19
471 0.2
472 0.19
473 0.17
474 0.16
475 0.15
476 0.12
477 0.11
478 0.09
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.09
484 0.12
485 0.11
486 0.11
487 0.11
488 0.1
489 0.12
490 0.12
491 0.11
492 0.09
493 0.1
494 0.09
495 0.11
496 0.16
497 0.17
498 0.22
499 0.26
500 0.29
501 0.31
502 0.34
503 0.41
504 0.44
505 0.44
506 0.47
507 0.5
508 0.51
509 0.5
510 0.5
511 0.47
512 0.42
513 0.4
514 0.34
515 0.3
516 0.3
517 0.28
518 0.25
519 0.23
520 0.2
521 0.2
522 0.2
523 0.23
524 0.22
525 0.32
526 0.4
527 0.41
528 0.43
529 0.5
530 0.51
531 0.48
532 0.49
533 0.46
534 0.42
535 0.43
536 0.43
537 0.37
538 0.36
539 0.35
540 0.33
541 0.27
542 0.26
543 0.26
544 0.25
545 0.23
546 0.22
547 0.22
548 0.18
549 0.17
550 0.14
551 0.09
552 0.07
553 0.07
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.07
562 0.06
563 0.07
564 0.07
565 0.08
566 0.09
567 0.08
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.09
572 0.1
573 0.1
574 0.09
575 0.1
576 0.1
577 0.11
578 0.11
579 0.1
580 0.09
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.09
586 0.11
587 0.15
588 0.22
589 0.25
590 0.29
591 0.4
592 0.5
593 0.56
594 0.65
595 0.69
596 0.71
597 0.79
598 0.86
599 0.86
600 0.78
601 0.75
602 0.7
603 0.67
604 0.58
605 0.48
606 0.39
607 0.3
608 0.28
609 0.22
610 0.19
611 0.15
612 0.15
613 0.15
614 0.13
615 0.12
616 0.12
617 0.13
618 0.13
619 0.13
620 0.15
621 0.23
622 0.25