Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SYC4

Protein Details
Accession A0A5N6SYC4    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
544-565SATEQMRRKRNQKKDESALRVMHydrophilic
621-648QTDANLQRGRDRKRKKKAVKRAPITVGQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
360-364RRKRI
609-618RRRSTRSKRA
627-642QRGRDRKRKKKAVKRA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001330  PFTB_repeat  
IPR045089  PGGT1B-like  
IPR026873  Ptb1  
IPR008930  Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004663  F:Rab geranylgeranyltransferase activity  
GO:0018344  P:protein geranylgeranylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00432  Prenyltrans  
CDD cd02894  GGTase-II  
Amino Acid Sequences MFPVSGAGQSDQYLCVQKHVEYIKNLDSRRDELEYWLTEHLRLNGVYWGLTALHLLGCPQALPREDTISFVLSCQRENGGFGAAPGHDAHMLYTVSAVQILVMLDAVDELEKRGLGGKQKVGSFIAGLQDKKTGSFMGDEWGELDTRFLYGAFNALSLLGLLDTVDVPKAVAYIQECENLDGGYGIHPGAESHSGQVFTCVGALAIAGRLDLINKDRLGGWLSERQVDNGGFNGRPEKLEDACYSWWVGASLAMIDKLHWINGDKLAAFILRCQDPENGGFGDRPGNMVDVFHTHFALAGLSLLGYDGVGEAHLSHYFKLQVRSHQEAQAVMVLDEYDRWYKANNLAKLLSDRLASKDARRKRIQGKAGSHDKRCPVKEDHGYKSPLVPVRSPHDSALPDYLDPRLVTSGVDMEHDISDRDTSVSADCVTAVVSPNLGLQAKAEASHLLHHTPGPQIITEATAYQWKQERVFGSDDEGASVLGCTPSRSKTLGDTAQIASQLLNRHLNYDPLVDDAESEVDKERVDEIARLKGVLWPGMDIFDSATEQMRRKRNQKKDESALRVMEKTSMGVEPTELIFSPTGILRKQRVISGNVEDGSPLKGETPIPRRRSTRSKRALSQTDANLQRGRDRKRKKKAVKRAPITVGQDLDHRDSHFTRATSTEAPICGGNQVNHGEGTDDFTLTFNGHEPRSRNGLKIFCDTPDKNIPDQHCGDGLPIGLVASSDALFLQQEVMITRTPNSVLSSNYISEFAERLCRFTTDKENIEPLLDVHGRIDPLVGWHSPVIKRHLASDTSYPPQFLFGDSQPIELNMLDGHDSHVGYSYNPLAASFPKLSAEENPIYTVDTSNVPSFQGATRVTSPEATISDIEEDDFERLYLDGSSC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.24
4 0.24
5 0.31
6 0.36
7 0.39
8 0.37
9 0.42
10 0.46
11 0.51
12 0.52
13 0.51
14 0.5
15 0.47
16 0.48
17 0.47
18 0.4
19 0.37
20 0.43
21 0.38
22 0.36
23 0.37
24 0.33
25 0.3
26 0.32
27 0.3
28 0.26
29 0.24
30 0.23
31 0.22
32 0.22
33 0.2
34 0.17
35 0.15
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.1
47 0.14
48 0.15
49 0.19
50 0.2
51 0.25
52 0.25
53 0.28
54 0.28
55 0.26
56 0.24
57 0.22
58 0.26
59 0.21
60 0.22
61 0.21
62 0.22
63 0.2
64 0.21
65 0.21
66 0.17
67 0.16
68 0.16
69 0.17
70 0.14
71 0.15
72 0.13
73 0.14
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.11
101 0.14
102 0.22
103 0.28
104 0.33
105 0.37
106 0.38
107 0.4
108 0.38
109 0.35
110 0.28
111 0.24
112 0.24
113 0.23
114 0.23
115 0.22
116 0.24
117 0.23
118 0.23
119 0.23
120 0.17
121 0.14
122 0.15
123 0.14
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.14
128 0.15
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.07
159 0.08
160 0.11
161 0.13
162 0.18
163 0.18
164 0.19
165 0.19
166 0.17
167 0.15
168 0.12
169 0.11
170 0.07
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.08
177 0.11
178 0.1
179 0.11
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.16
184 0.14
185 0.11
186 0.1
187 0.08
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.07
199 0.1
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.16
205 0.18
206 0.17
207 0.18
208 0.2
209 0.22
210 0.26
211 0.25
212 0.25
213 0.26
214 0.25
215 0.22
216 0.18
217 0.2
218 0.15
219 0.16
220 0.18
221 0.16
222 0.16
223 0.18
224 0.19
225 0.18
226 0.21
227 0.22
228 0.22
229 0.22
230 0.23
231 0.21
232 0.17
233 0.16
234 0.12
235 0.11
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.13
249 0.16
250 0.17
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.12
256 0.11
257 0.13
258 0.12
259 0.13
260 0.15
261 0.16
262 0.17
263 0.18
264 0.19
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.13
269 0.15
270 0.13
271 0.13
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.1
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.02
294 0.02
295 0.02
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.04
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.12
305 0.15
306 0.22
307 0.24
308 0.29
309 0.36
310 0.42
311 0.43
312 0.43
313 0.42
314 0.35
315 0.33
316 0.28
317 0.22
318 0.15
319 0.12
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.09
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.11
329 0.18
330 0.26
331 0.26
332 0.28
333 0.28
334 0.29
335 0.3
336 0.29
337 0.23
338 0.16
339 0.15
340 0.15
341 0.18
342 0.18
343 0.22
344 0.29
345 0.36
346 0.43
347 0.46
348 0.51
349 0.56
350 0.64
351 0.66
352 0.65
353 0.64
354 0.64
355 0.71
356 0.7
357 0.64
358 0.59
359 0.58
360 0.56
361 0.51
362 0.48
363 0.42
364 0.44
365 0.5
366 0.52
367 0.51
368 0.5
369 0.51
370 0.46
371 0.43
372 0.4
373 0.35
374 0.29
375 0.25
376 0.23
377 0.26
378 0.29
379 0.29
380 0.25
381 0.25
382 0.24
383 0.24
384 0.23
385 0.19
386 0.15
387 0.14
388 0.14
389 0.12
390 0.11
391 0.1
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.09
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.09
450 0.09
451 0.11
452 0.15
453 0.16
454 0.16
455 0.19
456 0.2
457 0.2
458 0.22
459 0.19
460 0.19
461 0.19
462 0.18
463 0.15
464 0.14
465 0.11
466 0.09
467 0.08
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.07
473 0.09
474 0.11
475 0.12
476 0.13
477 0.15
478 0.2
479 0.22
480 0.21
481 0.22
482 0.21
483 0.2
484 0.2
485 0.17
486 0.12
487 0.12
488 0.13
489 0.13
490 0.16
491 0.15
492 0.18
493 0.18
494 0.19
495 0.18
496 0.17
497 0.15
498 0.12
499 0.12
500 0.09
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.11
514 0.12
515 0.16
516 0.16
517 0.16
518 0.15
519 0.16
520 0.16
521 0.15
522 0.13
523 0.09
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.08
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.09
533 0.11
534 0.14
535 0.21
536 0.29
537 0.35
538 0.45
539 0.55
540 0.62
541 0.7
542 0.77
543 0.79
544 0.81
545 0.84
546 0.81
547 0.75
548 0.68
549 0.59
550 0.5
551 0.41
552 0.33
553 0.24
554 0.17
555 0.14
556 0.11
557 0.09
558 0.09
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.08
568 0.08
569 0.1
570 0.11
571 0.15
572 0.16
573 0.21
574 0.22
575 0.26
576 0.28
577 0.29
578 0.31
579 0.32
580 0.32
581 0.28
582 0.26
583 0.22
584 0.19
585 0.17
586 0.13
587 0.09
588 0.07
589 0.08
590 0.1
591 0.17
592 0.26
593 0.34
594 0.39
595 0.45
596 0.48
597 0.54
598 0.64
599 0.66
600 0.68
601 0.69
602 0.72
603 0.74
604 0.79
605 0.78
606 0.73
607 0.7
608 0.62
609 0.61
610 0.56
611 0.51
612 0.44
613 0.38
614 0.39
615 0.4
616 0.45
617 0.47
618 0.55
619 0.62
620 0.71
621 0.82
622 0.86
623 0.9
624 0.93
625 0.94
626 0.94
627 0.9
628 0.87
629 0.81
630 0.77
631 0.7
632 0.62
633 0.52
634 0.42
635 0.38
636 0.32
637 0.3
638 0.25
639 0.21
640 0.21
641 0.21
642 0.24
643 0.25
644 0.23
645 0.22
646 0.22
647 0.25
648 0.23
649 0.24
650 0.23
651 0.19
652 0.2
653 0.18
654 0.16
655 0.15
656 0.16
657 0.14
658 0.15
659 0.17
660 0.17
661 0.16
662 0.16
663 0.15
664 0.12
665 0.16
666 0.13
667 0.12
668 0.11
669 0.11
670 0.12
671 0.11
672 0.11
673 0.1
674 0.13
675 0.14
676 0.18
677 0.2
678 0.24
679 0.32
680 0.34
681 0.34
682 0.37
683 0.41
684 0.4
685 0.43
686 0.4
687 0.34
688 0.41
689 0.38
690 0.39
691 0.42
692 0.43
693 0.4
694 0.44
695 0.44
696 0.42
697 0.44
698 0.39
699 0.31
700 0.28
701 0.26
702 0.21
703 0.19
704 0.12
705 0.09
706 0.07
707 0.06
708 0.06
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.07
721 0.09
722 0.1
723 0.11
724 0.12
725 0.13
726 0.13
727 0.14
728 0.17
729 0.17
730 0.17
731 0.21
732 0.22
733 0.22
734 0.22
735 0.21
736 0.18
737 0.17
738 0.17
739 0.14
740 0.2
741 0.19
742 0.21
743 0.22
744 0.24
745 0.25
746 0.29
747 0.38
748 0.36
749 0.4
750 0.41
751 0.43
752 0.41
753 0.4
754 0.35
755 0.26
756 0.25
757 0.22
758 0.18
759 0.16
760 0.18
761 0.17
762 0.16
763 0.16
764 0.1
765 0.11
766 0.15
767 0.14
768 0.13
769 0.15
770 0.2
771 0.23
772 0.27
773 0.31
774 0.33
775 0.33
776 0.36
777 0.4
778 0.36
779 0.37
780 0.39
781 0.39
782 0.4
783 0.4
784 0.37
785 0.31
786 0.32
787 0.29
788 0.24
789 0.23
790 0.18
791 0.26
792 0.26
793 0.27
794 0.25
795 0.25
796 0.24
797 0.19
798 0.18
799 0.09
800 0.1
801 0.09
802 0.09
803 0.11
804 0.12
805 0.12
806 0.12
807 0.14
808 0.13
809 0.13
810 0.17
811 0.16
812 0.15
813 0.15
814 0.15
815 0.15
816 0.16
817 0.21
818 0.19
819 0.19
820 0.19
821 0.2
822 0.22
823 0.24
824 0.3
825 0.28
826 0.27
827 0.28
828 0.26
829 0.27
830 0.26
831 0.23
832 0.17
833 0.17
834 0.18
835 0.19
836 0.19
837 0.18
838 0.17
839 0.18
840 0.18
841 0.21
842 0.19
843 0.22
844 0.25
845 0.27
846 0.28
847 0.28
848 0.27
849 0.24
850 0.24
851 0.22
852 0.19
853 0.18
854 0.19
855 0.18
856 0.17
857 0.15
858 0.15
859 0.13
860 0.13
861 0.11
862 0.1
863 0.09
864 0.1