Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MBH9

Protein Details
Accession C5MBH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
412-444WNVHIQSRRHRKNEEGIKKRKHNEEMIRLKKLKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-443RRHRKNEEGIKKRKHNEEMIRLKKL
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 12, cyto_mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG ctp:CTRG_03421  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MLRRMTSKPIISIVGTTGVGKSQFSIDLAKAINGEIINADSMQIYKKLDQITNKHPLEERSGIPHYIMDYVSWDEDYHIHKFSQDAQKSIDDIHNRGKVPIVIGGTHYYLQTLLFNNKTLDDSNKTLKELTKEQLDILDGPVDVLFKTLEEVDPIVAKKFHPQDHRKLRRALEIYYTRGEKPSEIYHEQKLDELESSSLKYNTLFFWVYCDPDVLNERLDVRVDKMMAQGAIDEIKEMYDFYKDNKKDESSCTSGIWQVIGFKEFLPWLENNQVDEKQFKEGIERMKIRTRQYAKYQVKWIKKSLITELDKESAFDYVNGGKLYILNATDLNVWHQNVDDIGIQIAKEFLSNGANGVTLPQAPPELHEFFTKKSTNQSNRVLESQENWKHYTCEICKDKQGKPLVAVGDHSWNVHIQSRRHRKNEEGIKKRKHNEEMIRLKKLKEASSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.18
4 0.15
5 0.15
6 0.15
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.17
13 0.15
14 0.19
15 0.2
16 0.19
17 0.18
18 0.17
19 0.18
20 0.15
21 0.15
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.08
28 0.09
29 0.1
30 0.12
31 0.14
32 0.15
33 0.2
34 0.25
35 0.3
36 0.37
37 0.42
38 0.48
39 0.56
40 0.55
41 0.54
42 0.51
43 0.49
44 0.49
45 0.46
46 0.39
47 0.36
48 0.38
49 0.35
50 0.33
51 0.31
52 0.24
53 0.22
54 0.2
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.12
62 0.15
63 0.19
64 0.19
65 0.19
66 0.18
67 0.18
68 0.2
69 0.27
70 0.34
71 0.33
72 0.33
73 0.34
74 0.36
75 0.36
76 0.38
77 0.35
78 0.27
79 0.28
80 0.34
81 0.36
82 0.35
83 0.35
84 0.34
85 0.3
86 0.27
87 0.27
88 0.21
89 0.16
90 0.17
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.15
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.15
101 0.16
102 0.18
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.2
107 0.22
108 0.22
109 0.24
110 0.3
111 0.31
112 0.31
113 0.32
114 0.33
115 0.33
116 0.33
117 0.33
118 0.31
119 0.3
120 0.29
121 0.28
122 0.26
123 0.22
124 0.18
125 0.15
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.04
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.17
146 0.22
147 0.28
148 0.36
149 0.43
150 0.52
151 0.63
152 0.73
153 0.72
154 0.73
155 0.69
156 0.68
157 0.64
158 0.55
159 0.52
160 0.46
161 0.43
162 0.4
163 0.39
164 0.31
165 0.3
166 0.29
167 0.2
168 0.19
169 0.2
170 0.23
171 0.25
172 0.28
173 0.29
174 0.31
175 0.31
176 0.29
177 0.25
178 0.2
179 0.16
180 0.14
181 0.11
182 0.09
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.14
198 0.11
199 0.12
200 0.15
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.06
227 0.06
228 0.09
229 0.18
230 0.19
231 0.21
232 0.24
233 0.26
234 0.27
235 0.31
236 0.34
237 0.29
238 0.3
239 0.28
240 0.26
241 0.25
242 0.23
243 0.19
244 0.13
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.11
256 0.16
257 0.17
258 0.17
259 0.2
260 0.21
261 0.19
262 0.21
263 0.19
264 0.18
265 0.18
266 0.17
267 0.17
268 0.2
269 0.25
270 0.31
271 0.33
272 0.33
273 0.4
274 0.45
275 0.45
276 0.5
277 0.5
278 0.49
279 0.54
280 0.62
281 0.6
282 0.61
283 0.67
284 0.66
285 0.69
286 0.67
287 0.63
288 0.59
289 0.56
290 0.53
291 0.49
292 0.51
293 0.45
294 0.43
295 0.42
296 0.38
297 0.35
298 0.33
299 0.27
300 0.18
301 0.16
302 0.13
303 0.11
304 0.1
305 0.13
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.13
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.14
323 0.13
324 0.12
325 0.13
326 0.11
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.1
349 0.09
350 0.12
351 0.17
352 0.18
353 0.19
354 0.24
355 0.25
356 0.26
357 0.34
358 0.34
359 0.3
360 0.36
361 0.45
362 0.49
363 0.55
364 0.62
365 0.61
366 0.63
367 0.64
368 0.58
369 0.49
370 0.44
371 0.46
372 0.44
373 0.4
374 0.39
375 0.38
376 0.37
377 0.37
378 0.43
379 0.36
380 0.4
381 0.43
382 0.44
383 0.52
384 0.57
385 0.6
386 0.59
387 0.64
388 0.56
389 0.52
390 0.54
391 0.48
392 0.42
393 0.39
394 0.33
395 0.32
396 0.29
397 0.27
398 0.22
399 0.2
400 0.21
401 0.26
402 0.3
403 0.3
404 0.41
405 0.52
406 0.61
407 0.67
408 0.7
409 0.71
410 0.76
411 0.8
412 0.8
413 0.79
414 0.8
415 0.83
416 0.88
417 0.89
418 0.88
419 0.84
420 0.84
421 0.83
422 0.84
423 0.84
424 0.83
425 0.85
426 0.79
427 0.72
428 0.67
429 0.63