FuNGI

A0A5N6SJP6

Protein Details

Accession

A0A5N6SJP6

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-43	CLETYRPNHRLLKKKKKFSTSENQSDI	Hydrophilic
73-141	VPTAIPSPEKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKHESNQFTDETAAHDSGKKKKSKKSKDKTKIKQAGTEE	Hydrophilic
444-476	PEPDTPSKTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-32	KKKK
81-105	EKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKH
120-135	GKKKKSKKSKDKTKIK
451-476	KTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.833, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MEHYRMLSFMELRLGDCLETYRPNHRLLKKKKKFSTSENQSDINSRRYFTGAPIAPRSNTMAVDAMEIDSDQVPTAIPSPEKERKRKHKNKDVSSSSPSKKKRKHESNQFTDETAAHDSGKKKKSKKSKDKTKIKQAGTEETAIPDSPYVLTTATLYLPLSPISISPTHAKASLLAEHLSPLLLTYYAPLQGIVLAYSDASISSTPPSPSTSSDPADPNPKPLTLAKTAGEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPSNWKWVPPGEEGSVSGDQQKTTTASEDDESEPSASFDQEKEHFNPVSLANPVSDTLNEEVNAEDDESAAEGYFQSVSGHRVRGTVRFRVVDVDVIPGSERDRSFLSIEGTMLSPEEEARVLEDERNGVLTTSATPRRGLSQEPRVSMSGALAAPSVAAIPEPDTPSKTKEPKAEKEKKSKSSKSKKKEKKEK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.17
3	0.16
4	0.17
5	0.15
6	0.2
7	0.23
8	0.3
9	0.33
10	0.4
11	0.49
12	0.56
13	0.63
14	0.69
15	0.78
16	0.79
17	0.86
18	0.88
19	0.89
20	0.88
21	0.86
22	0.86
23	0.85
24	0.85
25	0.79
26	0.72
27	0.63
28	0.63
29	0.58
30	0.55
31	0.46
32	0.37
33	0.33
34	0.34
35	0.34
36	0.29
37	0.35
38	0.31
39	0.34
40	0.4
41	0.41
42	0.39
43	0.4
44	0.41
45	0.33
46	0.29
47	0.26
48	0.21
49	0.19
50	0.19
51	0.18
52	0.14
53	0.11
54	0.11
55	0.1
56	0.08
57	0.08
58	0.07
59	0.06
60	0.06
61	0.07
62	0.09
63	0.11
64	0.11
65	0.13
66	0.22
67	0.31
68	0.4
69	0.5
70	0.58
71	0.67
72	0.78
73	0.86
74	0.88
75	0.9
76	0.92
77	0.93
78	0.93
79	0.9
80	0.86
81	0.82
82	0.81
83	0.76
84	0.75
85	0.74
86	0.73
87	0.73
88	0.77
89	0.81
90	0.82
91	0.86
92	0.89
93	0.91
94	0.9
95	0.89
96	0.8
97	0.7
98	0.6
99	0.49
100	0.4
101	0.32
102	0.23
103	0.16
104	0.19
105	0.23
106	0.3
107	0.38
108	0.43
109	0.47
110	0.55
111	0.66
112	0.73
113	0.8
114	0.82
115	0.86
116	0.89
117	0.93
118	0.95
119	0.95
120	0.93
121	0.84
122	0.8
123	0.73
124	0.69
125	0.61
126	0.53
127	0.41
128	0.33
129	0.31
130	0.24
131	0.2
132	0.12
133	0.1
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.06
138	0.06
139	0.07
140	0.08
141	0.07
142	0.08
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.06
149	0.06
150	0.09
151	0.09
152	0.11
153	0.13
154	0.15
155	0.16
156	0.17
157	0.17
158	0.15
159	0.17
160	0.18
161	0.16
162	0.15
163	0.14
164	0.13
165	0.13
166	0.11
167	0.09
168	0.06
169	0.05
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.05
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.05
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.05
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.03
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.06
191	0.08
192	0.08
193	0.09
194	0.12
195	0.12
196	0.15
197	0.2
198	0.22
199	0.21
200	0.24
201	0.25
202	0.24
203	0.3
204	0.28
205	0.27
206	0.25
207	0.24
208	0.23
209	0.23
210	0.26
211	0.21
212	0.23
213	0.19
214	0.19
215	0.19
216	0.17
217	0.15
218	0.11
219	0.08
220	0.06
221	0.05
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.04
231	0.1
232	0.1
233	0.11
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.18
238	0.19
239	0.15
240	0.2
241	0.21
242	0.18
243	0.17
244	0.16
245	0.15
246	0.14
247	0.12
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.04
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.04
256	0.04
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.02
262	0.03
263	0.05
264	0.06
265	0.09
266	0.1
267	0.13
268	0.17
269	0.19
270	0.26
271	0.31
272	0.4
273	0.45
274	0.49
275	0.49
276	0.48
277	0.5
278	0.45
279	0.41
280	0.33
281	0.25
282	0.21
283	0.22
284	0.21
285	0.17
286	0.18
287	0.15
288	0.14
289	0.14
290	0.14
291	0.12
292	0.12
293	0.13
294	0.11
295	0.12
296	0.12
297	0.15
298	0.15
299	0.14
300	0.15
301	0.13
302	0.13
303	0.12
304	0.12
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.12
309	0.13
310	0.17
311	0.2
312	0.24
313	0.24
314	0.23
315	0.25
316	0.22
317	0.22
318	0.19
319	0.17
320	0.12
321	0.13
322	0.13
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.09
334	0.07
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.06
346	0.07
347	0.11
348	0.14
349	0.16
350	0.16
351	0.19
352	0.2
353	0.28
354	0.32
355	0.35
356	0.37
357	0.36
358	0.36
359	0.36
360	0.36
361	0.3
362	0.25
363	0.22
364	0.17
365	0.16
366	0.16
367	0.13
368	0.14
369	0.16
370	0.15
371	0.14
372	0.16
373	0.18
374	0.19
375	0.21
376	0.22
377	0.18
378	0.19
379	0.18
380	0.16
381	0.14
382	0.12
383	0.1
384	0.08
385	0.07
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.11
391	0.12
392	0.14
393	0.15
394	0.15
395	0.15
396	0.17
397	0.15
398	0.13
399	0.12
400	0.11
401	0.12
402	0.19
403	0.23
404	0.23
405	0.24
406	0.25
407	0.3
408	0.32
409	0.36
410	0.38
411	0.44
412	0.49
413	0.51
414	0.53
415	0.48
416	0.47
417	0.4
418	0.31
419	0.25
420	0.18
421	0.16
422	0.13
423	0.11
424	0.1
425	0.09
426	0.09
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.07
431	0.11
432	0.15
433	0.18
434	0.21
435	0.24
436	0.3
437	0.39
438	0.45
439	0.48
440	0.54
441	0.61
442	0.68
443	0.77
444	0.82
445	0.82
446	0.85
447	0.89
448	0.89
449	0.91
450	0.9
451	0.9
452	0.91
453	0.92
454	0.92
455	0.93
456	0.94

A0A5N6SJP6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer