Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MBS3

Protein Details
Accession C5MBS3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-29PKSSKESSDKTKHINRQRLLHydrophilic
263-285QAALERRIKKRNQVLKHDPLSNDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR026532  BRX1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000464  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 upstream of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000465  P:exonucleolytic trimming to generate mature 5'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG ctp:CTRG_03515  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MSAIYKALQPKSSKESSDKTKHINRQRLLVISSRGITYRHRHLIQDLLALLPHARKEPKFDSKKNLHQLNEVAELYNCNNIFFFECRKHQDLYLWISKPPNGPTLKFHIQNLHTLDELNFTGNCLKGSRPILSFDKNFLDNDHFKLLKEMFIQTFGVPPNARKSKPFIDHVMTFSIVDGKIWIRNYQINETLDVKENDNDDDVDVDQLNLVEIGPRLVLTLITVLEGSFGGPKIYENKQYVSPNFVRAQLKQQAADQAKSRSQAALERRIKKRNQVLKHDPLSNDALFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.57
4 0.64
5 0.64
6 0.65
7 0.7
8 0.75
9 0.79
10 0.81
11 0.73
12 0.71
13 0.7
14 0.66
15 0.58
16 0.54
17 0.48
18 0.4
19 0.39
20 0.32
21 0.28
22 0.26
23 0.29
24 0.3
25 0.35
26 0.41
27 0.41
28 0.42
29 0.44
30 0.49
31 0.44
32 0.41
33 0.33
34 0.24
35 0.22
36 0.21
37 0.19
38 0.14
39 0.13
40 0.14
41 0.19
42 0.19
43 0.27
44 0.35
45 0.45
46 0.53
47 0.58
48 0.63
49 0.67
50 0.77
51 0.79
52 0.77
53 0.68
54 0.63
55 0.6
56 0.54
57 0.49
58 0.4
59 0.31
60 0.24
61 0.23
62 0.2
63 0.22
64 0.17
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.15
69 0.15
70 0.19
71 0.19
72 0.24
73 0.3
74 0.33
75 0.34
76 0.32
77 0.34
78 0.34
79 0.36
80 0.39
81 0.34
82 0.32
83 0.32
84 0.34
85 0.33
86 0.3
87 0.31
88 0.26
89 0.26
90 0.28
91 0.35
92 0.39
93 0.37
94 0.36
95 0.36
96 0.35
97 0.38
98 0.37
99 0.3
100 0.25
101 0.23
102 0.22
103 0.17
104 0.16
105 0.12
106 0.09
107 0.08
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.12
114 0.15
115 0.17
116 0.17
117 0.2
118 0.24
119 0.27
120 0.27
121 0.25
122 0.25
123 0.23
124 0.22
125 0.2
126 0.21
127 0.18
128 0.2
129 0.21
130 0.19
131 0.18
132 0.21
133 0.2
134 0.17
135 0.16
136 0.16
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.11
141 0.13
142 0.11
143 0.13
144 0.12
145 0.13
146 0.2
147 0.25
148 0.25
149 0.25
150 0.3
151 0.35
152 0.4
153 0.42
154 0.38
155 0.38
156 0.39
157 0.39
158 0.35
159 0.27
160 0.22
161 0.19
162 0.16
163 0.11
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.17
172 0.2
173 0.22
174 0.27
175 0.25
176 0.26
177 0.28
178 0.27
179 0.28
180 0.26
181 0.24
182 0.2
183 0.2
184 0.19
185 0.17
186 0.16
187 0.12
188 0.12
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.08
220 0.13
221 0.17
222 0.24
223 0.25
224 0.28
225 0.34
226 0.41
227 0.41
228 0.44
229 0.42
230 0.4
231 0.4
232 0.44
233 0.41
234 0.36
235 0.44
236 0.43
237 0.44
238 0.4
239 0.41
240 0.43
241 0.44
242 0.46
243 0.42
244 0.4
245 0.4
246 0.41
247 0.4
248 0.32
249 0.3
250 0.33
251 0.36
252 0.41
253 0.47
254 0.54
255 0.61
256 0.69
257 0.72
258 0.75
259 0.78
260 0.78
261 0.78
262 0.79
263 0.81
264 0.83
265 0.84
266 0.81
267 0.71
268 0.65
269 0.61