Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6T409

Protein Details
Accession A0A5N6T409    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-79PIRMYRVNTHRRQYRPRRRHGRGQNSERNHTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-71RRQYRPRRRHGRG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MVRDHMERRRCHVCWERGHISMDCPVRQGLLHLANMAAELNDRIRRPVPIRMYRVNTHRRQYRPRRRHGRGQNSERNHTGRHELPPRPAHVNSELNYEDRGPYHRDVHNSRPARPPADNKENVRPAPPANPAHLHTSVAYDRHDLNMRLDSSIAAPGSSALATDTKLESESGNPIEHSENPTSDYLQTSGAEDVQATCSDTLATSSESDTPENLPSLSFNVPGDIVMTGESQAVMDDYCSELFTIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.7
3 0.68
4 0.62
5 0.66
6 0.57
7 0.49
8 0.47
9 0.42
10 0.34
11 0.3
12 0.27
13 0.23
14 0.22
15 0.22
16 0.22
17 0.21
18 0.21
19 0.2
20 0.19
21 0.18
22 0.19
23 0.17
24 0.1
25 0.06
26 0.07
27 0.1
28 0.14
29 0.15
30 0.18
31 0.19
32 0.25
33 0.28
34 0.36
35 0.42
36 0.47
37 0.53
38 0.58
39 0.63
40 0.63
41 0.69
42 0.7
43 0.67
44 0.67
45 0.69
46 0.69
47 0.74
48 0.8
49 0.82
50 0.83
51 0.86
52 0.89
53 0.87
54 0.9
55 0.9
56 0.9
57 0.89
58 0.89
59 0.87
60 0.82
61 0.8
62 0.73
63 0.65
64 0.55
65 0.46
66 0.41
67 0.35
68 0.37
69 0.41
70 0.39
71 0.44
72 0.47
73 0.48
74 0.47
75 0.44
76 0.4
77 0.37
78 0.39
79 0.32
80 0.33
81 0.31
82 0.26
83 0.26
84 0.23
85 0.18
86 0.14
87 0.16
88 0.14
89 0.16
90 0.2
91 0.22
92 0.28
93 0.32
94 0.38
95 0.45
96 0.44
97 0.45
98 0.48
99 0.48
100 0.45
101 0.44
102 0.44
103 0.43
104 0.49
105 0.51
106 0.46
107 0.52
108 0.53
109 0.5
110 0.45
111 0.38
112 0.3
113 0.29
114 0.31
115 0.25
116 0.23
117 0.25
118 0.25
119 0.28
120 0.27
121 0.24
122 0.18
123 0.2
124 0.18
125 0.17
126 0.16
127 0.13
128 0.13
129 0.15
130 0.17
131 0.15
132 0.16
133 0.19
134 0.19
135 0.18
136 0.17
137 0.15
138 0.13
139 0.14
140 0.12
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.15
163 0.17
164 0.2
165 0.18
166 0.17
167 0.19
168 0.2
169 0.19
170 0.18
171 0.18
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.11
193 0.14
194 0.15
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.17
199 0.17
200 0.16
201 0.13
202 0.12
203 0.15
204 0.16
205 0.15
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.08
225 0.09
226 0.09