FuNGI

A0A5N6SHW3

Protein Details

Accession

A0A5N6SHW3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
361-384	TAERSQSRGRKRTRRSSARTGSSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
353-428	RKRRTVKATAERSQSRGRKRTRRSSARTGSSRPRSHSGRASSGRASSRPRSRRQSNSEYSRPRGRSTGSDRKRSAS

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019622 Rrn9_dom
Gene Ontology	GO:0003743 F:translation initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF10680 RRN9

Amino Acid Sequences

MSSSSGGRSPRFIPPQSAQPYTSIFGGSSSQDVADLQPYPEWQGDATFDSDDIDVAMEDIPIAEDDDSDDSTYKESDEDEPGPEDGGSQQRGPKSTVNAATGHSDIDSPPSSPAYRPNRFRGAESQWRKLTAEDRQNAEALETIRARDLAAHLYNAYALRVRARELARQAVEAGEPEDETKAFGPPKRWAAWPMSATEVPRGNEHIRRGEDEAWTLRMQPDARPSAELEESLIAIMLKDAKEKFQTRPWDHKLSSVHQWAMSQANTQNDTATDKEQKSDPDSIDEISLRPVVQADDEKSRIQLRPLTRNILTQFDDLLMALHNARNGGVGADDSSASEWQTDTESIASSISSRKRRTVKATAERSQSRGRKRTRRSSARTGSSRPRSHSGRASSGRASSRPRSRRQSNSEYSRPRGRSTGSDRKRSASRMRLGLRDWSEVLGIASMVGFPPAVVMRSSQRCATLFREDMEFRVLQEGTLQQVQDRGSSTWTYAEIEPEEAEASLPPPSPPRIKRSLSRTASVKKASSTRATSPATDHTDEVIKLKGKGQHRKQDIICPVRTCPRHINGFARTWNLNLHMRRMHPGYRPKSTDAKSKSSIVGPAGDTDG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.56
3	0.59
4	0.59
5	0.5
6	0.45
7	0.46
8	0.4
9	0.36
10	0.27
11	0.2
12	0.17
13	0.18
14	0.16
15	0.14
16	0.13
17	0.12
18	0.12
19	0.12
20	0.12
21	0.13
22	0.13
23	0.13
24	0.14
25	0.15
26	0.17
27	0.18
28	0.17
29	0.15
30	0.15
31	0.16
32	0.17
33	0.18
34	0.15
35	0.14
36	0.15
37	0.14
38	0.13
39	0.1
40	0.09
41	0.06
42	0.07
43	0.07
44	0.05
45	0.05
46	0.05
47	0.05
48	0.05
49	0.06
50	0.06
51	0.05
52	0.07
53	0.1
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.12
59	0.13
60	0.11
61	0.1
62	0.11
63	0.13
64	0.18
65	0.2
66	0.2
67	0.22
68	0.22
69	0.22
70	0.2
71	0.17
72	0.15
73	0.19
74	0.19
75	0.2
76	0.24
77	0.26
78	0.29
79	0.32
80	0.32
81	0.32
82	0.37
83	0.4
84	0.38
85	0.36
86	0.35
87	0.35
88	0.31
89	0.26
90	0.19
91	0.15
92	0.12
93	0.16
94	0.15
95	0.13
96	0.14
97	0.16
98	0.17
99	0.18
100	0.28
101	0.33
102	0.41
103	0.46
104	0.52
105	0.58
106	0.59
107	0.61
108	0.6
109	0.58
110	0.61
111	0.61
112	0.62
113	0.56
114	0.56
115	0.53
116	0.48
117	0.45
118	0.43
119	0.46
120	0.43
121	0.45
122	0.44
123	0.44
124	0.42
125	0.36
126	0.3
127	0.21
128	0.2
129	0.16
130	0.15
131	0.15
132	0.15
133	0.15
134	0.13
135	0.13
136	0.15
137	0.15
138	0.16
139	0.15
140	0.15
141	0.16
142	0.15
143	0.14
144	0.1
145	0.1
146	0.13
147	0.13
148	0.15
149	0.2
150	0.22
151	0.27
152	0.29
153	0.36
154	0.33
155	0.33
156	0.32
157	0.26
158	0.24
159	0.19
160	0.16
161	0.09
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.08
167	0.08
168	0.11
169	0.14
170	0.17
171	0.2
172	0.25
173	0.31
174	0.33
175	0.34
176	0.34
177	0.35
178	0.39
179	0.36
180	0.32
181	0.31
182	0.29
183	0.28
184	0.29
185	0.28
186	0.22
187	0.22
188	0.25
189	0.25
190	0.28
191	0.31
192	0.33
193	0.31
194	0.33
195	0.35
196	0.33
197	0.3
198	0.29
199	0.27
200	0.23
201	0.21
202	0.2
203	0.17
204	0.17
205	0.17
206	0.16
207	0.21
208	0.22
209	0.23
210	0.23
211	0.23
212	0.23
213	0.23
214	0.2
215	0.14
216	0.11
217	0.1
218	0.09
219	0.08
220	0.05
221	0.04
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.09
226	0.09
227	0.11
228	0.17
229	0.2
230	0.24
231	0.29
232	0.39
233	0.41
234	0.51
235	0.56
236	0.58
237	0.55
238	0.58
239	0.55
240	0.48
241	0.49
242	0.43
243	0.37
244	0.3
245	0.3
246	0.26
247	0.24
248	0.2
249	0.16
250	0.14
251	0.16
252	0.17
253	0.17
254	0.15
255	0.14
256	0.16
257	0.15
258	0.16
259	0.19
260	0.17
261	0.19
262	0.2
263	0.22
264	0.23
265	0.25
266	0.23
267	0.2
268	0.2
269	0.19
270	0.19
271	0.17
272	0.14
273	0.11
274	0.11
275	0.08
276	0.07
277	0.07
278	0.06
279	0.07
280	0.09
281	0.1
282	0.13
283	0.15
284	0.15
285	0.16
286	0.18
287	0.18
288	0.18
289	0.21
290	0.22
291	0.29
292	0.31
293	0.34
294	0.32
295	0.35
296	0.35
297	0.33
298	0.31
299	0.22
300	0.2
301	0.16
302	0.15
303	0.11
304	0.1
305	0.06
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.04
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.1
337	0.17
338	0.23
339	0.25
340	0.32
341	0.39
342	0.44
343	0.51
344	0.56
345	0.6
346	0.63
347	0.7
348	0.69
349	0.7
350	0.66
351	0.63
352	0.62
353	0.58
354	0.57
355	0.57
356	0.61
357	0.63
358	0.71
359	0.78
360	0.8
361	0.84
362	0.83
363	0.85
364	0.84
365	0.83
366	0.78
367	0.74
368	0.73
369	0.72
370	0.68
371	0.61
372	0.59
373	0.55
374	0.55
375	0.56
376	0.51
377	0.5
378	0.49
379	0.49
380	0.44
381	0.44
382	0.41
383	0.38
384	0.39
385	0.38
386	0.45
387	0.49
388	0.56
389	0.61
390	0.67
391	0.73
392	0.76
393	0.78
394	0.78
395	0.78
396	0.79
397	0.76
398	0.73
399	0.72
400	0.66
401	0.58
402	0.52
403	0.45
404	0.45
405	0.48
406	0.53
407	0.52
408	0.59
409	0.58
410	0.6
411	0.62
412	0.6
413	0.59
414	0.57
415	0.56
416	0.55
417	0.57
418	0.56
419	0.54
420	0.55
421	0.49
422	0.42
423	0.36
424	0.28
425	0.24
426	0.21
427	0.19
428	0.11
429	0.08
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.03
436	0.03
437	0.04
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.08
442	0.15
443	0.2
444	0.22
445	0.23
446	0.25
447	0.26
448	0.29
449	0.32
450	0.33
451	0.3
452	0.29
453	0.33
454	0.31
455	0.31
456	0.31
457	0.26
458	0.19
459	0.21
460	0.2
461	0.14
462	0.16
463	0.15
464	0.15
465	0.17
466	0.16
467	0.13
468	0.16
469	0.17
470	0.16
471	0.18
472	0.15
473	0.16
474	0.17
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.18
479	0.16
480	0.18
481	0.16
482	0.16
483	0.16
484	0.15
485	0.14
486	0.11
487	0.11
488	0.08
489	0.08
490	0.09
491	0.09
492	0.1
493	0.13
494	0.18
495	0.27
496	0.32
497	0.38
498	0.45
499	0.5
500	0.57
501	0.61
502	0.67
503	0.63
504	0.64
505	0.65
506	0.63
507	0.66
508	0.63
509	0.57
510	0.51
511	0.52
512	0.51
513	0.5
514	0.49
515	0.46
516	0.49
517	0.49
518	0.46
519	0.44
520	0.46
521	0.45
522	0.41
523	0.37
524	0.31
525	0.32
526	0.31
527	0.29
528	0.27
529	0.24
530	0.23
531	0.28
532	0.32
533	0.38
534	0.48
535	0.57
536	0.62
537	0.66
538	0.74
539	0.72
540	0.75
541	0.76
542	0.73
543	0.68
544	0.61
545	0.59
546	0.59
547	0.59
548	0.55
549	0.54
550	0.53
551	0.56
552	0.59
553	0.62
554	0.58
555	0.63
556	0.6
557	0.57
558	0.51
559	0.43
560	0.41
561	0.38
562	0.4
563	0.36
564	0.39
565	0.4
566	0.42
567	0.47
568	0.49
569	0.5
570	0.51
571	0.59
572	0.6
573	0.64
574	0.67
575	0.65
576	0.7
577	0.68
578	0.7
579	0.66
580	0.66
581	0.6
582	0.59
583	0.58
584	0.51
585	0.51
586	0.43
587	0.4
588	0.33

A0A5N6SHW3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer