Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M3I6

Protein Details
Accession C5M3I6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-54NSNPEILLRKRKNADRKRLEKQEQIRERQILKKTLKKKRTKFIRPETLISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-48RKRKNADRKRLEKQEQIRERQILKKTLKKKRTKFIR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036919  L30_ferredoxin-like_sf  
IPR016082  Ribosomal_L30_ferredoxin-like  
IPR039699  Ribosomal_L7/L30  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000465  P:exonucleolytic trimming to generate mature 5'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ctp:CTRG_00625  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00327  Ribosomal_L30  
Amino Acid Sequences MAILNSNPEILLRKRKNADRKRLEKQEQIRERQILKKTLKKKRTKFIRPETLISNHKSNELERKRIKNLIKNQHNDVVEEKKVDDSEGNQEYKLLFVVRIPNQNTKGLKIPNKVLQILQVLRLTKINTGVFIKSSEKTKNILKLIEPYVLIGSPSLNSIRKLFQQRATIKITTKTDDDEKEEEKIIKLDDNSLVEEKFGDDLGLCCVEDLIFEIFNTSGNFIKITNWLQPFRLNAPINGWGPEAKLARMSNQEFKIEDYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.61
3 0.71
4 0.76
5 0.82
6 0.82
7 0.86
8 0.87
9 0.9
10 0.89
11 0.87
12 0.86
13 0.86
14 0.84
15 0.82
16 0.79
17 0.75
18 0.72
19 0.7
20 0.67
21 0.65
22 0.65
23 0.66
24 0.69
25 0.74
26 0.79
27 0.82
28 0.84
29 0.85
30 0.88
31 0.89
32 0.9
33 0.9
34 0.91
35 0.85
36 0.8
37 0.75
38 0.71
39 0.66
40 0.59
41 0.53
42 0.42
43 0.41
44 0.38
45 0.35
46 0.39
47 0.4
48 0.45
49 0.48
50 0.54
51 0.56
52 0.63
53 0.67
54 0.65
55 0.69
56 0.71
57 0.72
58 0.7
59 0.69
60 0.68
61 0.61
62 0.53
63 0.47
64 0.41
65 0.33
66 0.29
67 0.25
68 0.2
69 0.19
70 0.18
71 0.15
72 0.12
73 0.18
74 0.21
75 0.21
76 0.2
77 0.2
78 0.19
79 0.19
80 0.17
81 0.11
82 0.06
83 0.07
84 0.14
85 0.17
86 0.24
87 0.26
88 0.32
89 0.33
90 0.39
91 0.38
92 0.34
93 0.36
94 0.35
95 0.38
96 0.36
97 0.38
98 0.38
99 0.4
100 0.39
101 0.33
102 0.3
103 0.28
104 0.25
105 0.23
106 0.2
107 0.17
108 0.17
109 0.18
110 0.16
111 0.13
112 0.16
113 0.14
114 0.13
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.14
119 0.15
120 0.13
121 0.17
122 0.18
123 0.18
124 0.2
125 0.23
126 0.27
127 0.27
128 0.27
129 0.25
130 0.27
131 0.28
132 0.27
133 0.23
134 0.17
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.08
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.12
146 0.14
147 0.2
148 0.26
149 0.29
150 0.32
151 0.4
152 0.42
153 0.45
154 0.48
155 0.45
156 0.41
157 0.42
158 0.39
159 0.32
160 0.31
161 0.29
162 0.28
163 0.28
164 0.31
165 0.29
166 0.28
167 0.27
168 0.28
169 0.26
170 0.22
171 0.21
172 0.17
173 0.17
174 0.15
175 0.16
176 0.17
177 0.17
178 0.19
179 0.19
180 0.18
181 0.15
182 0.15
183 0.13
184 0.11
185 0.09
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.13
210 0.16
211 0.19
212 0.24
213 0.28
214 0.3
215 0.31
216 0.34
217 0.36
218 0.35
219 0.41
220 0.35
221 0.31
222 0.33
223 0.38
224 0.36
225 0.34
226 0.32
227 0.23
228 0.23
229 0.28
230 0.25
231 0.19
232 0.24
233 0.23
234 0.27
235 0.35
236 0.39
237 0.41
238 0.43
239 0.46
240 0.41