Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6T532

Protein Details
Accession A0A5N6T532    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
409-435YPPMLPRKLRVMRAKKQPKKREAGSSTHydrophilic
486-517DGSSRIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-108RKRKR
124-142KEEQKEEQKRRAEKAKRQK
337-340KKKK
415-433RKLRVMRAKKQPKKREAGS
490-526RIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAAGGKKRKTE
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 12.333, cyto 3.5, cyto_mito 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKSKLQSDSAPQTEKAETTLPFLAGSAAVDPTLASLFDTSSGPVKAPSLPTTSTVEKPAAGNDTSEDVSEPEDEDQVMQEVSEASSDADGEPAQATSEPPSRKRKRAAGEDLEESYMRRIAKEEQKEEQKRRAEKAKRQKAEGEEEDEATSTDKSDGEDEDDSSDKDGEIAIPKHETLTGDAQLSNIDKSNRTVFLSNVSNEAIKSKSAKKTLLKHFESFLSTLPESTGPHKVESIRFRSTAFASGGKIPKRAAFAKREVLDETTPSTNAYIVYSTVQAARKAPAVLNGTVVLDRHVRVDSVAHPAPVDNKRCVFVGNLNFVDQEGNADDEEKPKKKKAPADVEEGLWRTFNAHTSKPKDQTIRRGNVESVRVVRDSVTRVSKGFAYVQFYDQNCVEEALLLDGKQYPPMLPRKLRVMRAKKQPKKREAGSSTQGKSLREADKTLQGRAGKLFGRAGAAKVRADATKSISNNSLVFEGHRATDDGSSRIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAAGGKKRKTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.5
3 0.43
4 0.35
5 0.3
6 0.24
7 0.25
8 0.26
9 0.23
10 0.21
11 0.2
12 0.18
13 0.14
14 0.14
15 0.1
16 0.08
17 0.08
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.17
35 0.21
36 0.23
37 0.24
38 0.25
39 0.27
40 0.32
41 0.34
42 0.33
43 0.33
44 0.3
45 0.28
46 0.27
47 0.27
48 0.26
49 0.22
50 0.2
51 0.18
52 0.2
53 0.19
54 0.18
55 0.16
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.12
86 0.19
87 0.23
88 0.3
89 0.41
90 0.49
91 0.57
92 0.65
93 0.69
94 0.71
95 0.77
96 0.8
97 0.77
98 0.74
99 0.69
100 0.63
101 0.55
102 0.46
103 0.36
104 0.28
105 0.22
106 0.17
107 0.14
108 0.14
109 0.21
110 0.3
111 0.38
112 0.42
113 0.47
114 0.58
115 0.67
116 0.71
117 0.71
118 0.7
119 0.67
120 0.69
121 0.72
122 0.71
123 0.72
124 0.77
125 0.8
126 0.76
127 0.74
128 0.74
129 0.69
130 0.68
131 0.61
132 0.56
133 0.46
134 0.42
135 0.38
136 0.32
137 0.26
138 0.18
139 0.15
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.13
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.17
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.17
184 0.21
185 0.24
186 0.22
187 0.2
188 0.19
189 0.17
190 0.16
191 0.18
192 0.13
193 0.11
194 0.14
195 0.19
196 0.25
197 0.28
198 0.34
199 0.39
200 0.48
201 0.57
202 0.63
203 0.6
204 0.56
205 0.54
206 0.49
207 0.44
208 0.36
209 0.27
210 0.21
211 0.17
212 0.16
213 0.15
214 0.14
215 0.13
216 0.15
217 0.2
218 0.16
219 0.17
220 0.18
221 0.2
222 0.25
223 0.3
224 0.33
225 0.29
226 0.29
227 0.29
228 0.3
229 0.28
230 0.26
231 0.22
232 0.17
233 0.16
234 0.2
235 0.24
236 0.23
237 0.24
238 0.21
239 0.21
240 0.24
241 0.28
242 0.28
243 0.29
244 0.32
245 0.37
246 0.37
247 0.37
248 0.34
249 0.31
250 0.26
251 0.22
252 0.2
253 0.14
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.16
274 0.17
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.1
289 0.1
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.21
296 0.25
297 0.27
298 0.23
299 0.24
300 0.25
301 0.25
302 0.25
303 0.21
304 0.21
305 0.22
306 0.25
307 0.24
308 0.24
309 0.23
310 0.23
311 0.22
312 0.15
313 0.11
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.08
318 0.08
319 0.13
320 0.2
321 0.24
322 0.28
323 0.32
324 0.38
325 0.43
326 0.5
327 0.55
328 0.6
329 0.58
330 0.63
331 0.59
332 0.54
333 0.51
334 0.45
335 0.35
336 0.24
337 0.2
338 0.14
339 0.13
340 0.17
341 0.18
342 0.21
343 0.29
344 0.36
345 0.43
346 0.46
347 0.52
348 0.55
349 0.56
350 0.62
351 0.64
352 0.65
353 0.61
354 0.59
355 0.56
356 0.52
357 0.5
358 0.42
359 0.35
360 0.3
361 0.26
362 0.24
363 0.22
364 0.2
365 0.2
366 0.23
367 0.24
368 0.23
369 0.23
370 0.24
371 0.24
372 0.23
373 0.25
374 0.22
375 0.23
376 0.23
377 0.25
378 0.3
379 0.3
380 0.3
381 0.26
382 0.25
383 0.2
384 0.19
385 0.16
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.09
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.13
396 0.11
397 0.17
398 0.25
399 0.33
400 0.35
401 0.39
402 0.48
403 0.54
404 0.61
405 0.66
406 0.68
407 0.69
408 0.76
409 0.84
410 0.83
411 0.87
412 0.89
413 0.88
414 0.87
415 0.85
416 0.84
417 0.79
418 0.79
419 0.76
420 0.75
421 0.67
422 0.64
423 0.6
424 0.49
425 0.47
426 0.45
427 0.42
428 0.35
429 0.37
430 0.34
431 0.4
432 0.42
433 0.4
434 0.39
435 0.35
436 0.34
437 0.33
438 0.34
439 0.27
440 0.27
441 0.27
442 0.22
443 0.25
444 0.24
445 0.24
446 0.25
447 0.27
448 0.24
449 0.24
450 0.26
451 0.23
452 0.25
453 0.25
454 0.25
455 0.29
456 0.3
457 0.32
458 0.32
459 0.33
460 0.31
461 0.3
462 0.26
463 0.19
464 0.19
465 0.19
466 0.17
467 0.16
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.2
472 0.21
473 0.21
474 0.23
475 0.26
476 0.28
477 0.32
478 0.37
479 0.38
480 0.44
481 0.51
482 0.59
483 0.65
484 0.72
485 0.78
486 0.81
487 0.86
488 0.9
489 0.9
490 0.89
491 0.89
492 0.9
493 0.9
494 0.92
495 0.89
496 0.89
497 0.86
498 0.85
499 0.79
500 0.76
501 0.7
502 0.66
503 0.66
504 0.64
505 0.63
506 0.61