Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDG5

Protein Details
Accession C5MDG5    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-38LINIYKKKGKFDNQRKKLLDNHydrophilic
216-239SSTSHKEDESNKRKKKDKIPFMMYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-231RKKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
KEGG ctp:CTRG_04266  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05205  COMPASS-Shg1  
Amino Acid Sequences MSQQSRSNKSEITDSKQLINIYKKKGKFDNQRKKLLDNFKQSQTYTNLLLKLKLLIEAKVKQDPSILMKNKGKMAALIQGEITTNDNNELLSIVDKDIQDKILDSYEFHNLIKTELIDIKQEISGDNDEELSNLKKQEQLKLERLKLESKLTNLKVIQQHHDSNPESRDGSYGKNNKINYNNNMKSNSMNSNHRINKPSRFNYRSENNSNNNASSSSTSHKEDESNKRKKKDKIPFMMY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.46
3 0.48
4 0.48
5 0.45
6 0.49
7 0.48
8 0.49
9 0.56
10 0.56
11 0.6
12 0.66
13 0.7
14 0.71
15 0.76
16 0.78
17 0.78
18 0.85
19 0.81
20 0.78
21 0.76
22 0.76
23 0.74
24 0.72
25 0.69
26 0.65
27 0.67
28 0.62
29 0.58
30 0.51
31 0.45
32 0.39
33 0.37
34 0.34
35 0.31
36 0.31
37 0.26
38 0.24
39 0.21
40 0.22
41 0.19
42 0.17
43 0.22
44 0.25
45 0.28
46 0.32
47 0.32
48 0.27
49 0.28
50 0.27
51 0.28
52 0.33
53 0.33
54 0.36
55 0.4
56 0.43
57 0.44
58 0.43
59 0.37
60 0.29
61 0.27
62 0.25
63 0.22
64 0.19
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.09
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.13
123 0.15
124 0.21
125 0.27
126 0.32
127 0.39
128 0.45
129 0.47
130 0.47
131 0.47
132 0.44
133 0.4
134 0.39
135 0.32
136 0.28
137 0.34
138 0.31
139 0.33
140 0.31
141 0.34
142 0.34
143 0.35
144 0.37
145 0.34
146 0.36
147 0.34
148 0.39
149 0.35
150 0.34
151 0.33
152 0.3
153 0.26
154 0.23
155 0.23
156 0.19
157 0.21
158 0.26
159 0.32
160 0.35
161 0.39
162 0.41
163 0.45
164 0.51
165 0.55
166 0.53
167 0.57
168 0.56
169 0.55
170 0.56
171 0.51
172 0.46
173 0.42
174 0.43
175 0.37
176 0.38
177 0.37
178 0.45
179 0.51
180 0.54
181 0.56
182 0.54
183 0.58
184 0.62
185 0.67
186 0.68
187 0.64
188 0.62
189 0.65
190 0.69
191 0.68
192 0.66
193 0.66
194 0.61
195 0.65
196 0.64
197 0.56
198 0.49
199 0.41
200 0.35
201 0.3
202 0.28
203 0.25
204 0.27
205 0.29
206 0.29
207 0.3
208 0.34
209 0.4
210 0.48
211 0.53
212 0.6
213 0.65
214 0.73
215 0.8
216 0.83
217 0.85
218 0.85
219 0.85