Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDE8

Protein Details
Accession C5MDE8    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-31GANKGKKKGGGSKGPSKPKVNBasic
184-211NTTNQNKFKKDQKPNKGKDKNQNFKGPKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-29KGGANKGKKKGGGSKGPSKPK
192-219KKDQKPNKGKDKNQNFKGPKSKFKNGNS
Subcellular Location(s) nucl 20, mito_nucl 12.999, cyto_nucl 12.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045107  SAC3/GANP/THP3  
IPR005062  SAC3/GANP/THP3_conserved  
KEGG ctp:CTRG_04249  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03399  SAC3_GANP  
Amino Acid Sequences MANSNSPNKGGANKGKKKGGGSKGPSKPKVNANLIPLGTRGAATTAPTMTPSNSNPLPSNNMDNIVSKVDFDPSWPPSLQEFHNRSMQRIGKLKPNKQPTGMNQLSQLIIQAKERGVLETNNWSAQLIPILDGGGMFQLDCMRSKKNGGSNGTTPADGSNLQGGALPSSTGPSPPIVPDRFQNNTTNQNKFKKDQKPNKGKDKNQNFKGPKSKFKNGNSNGKRPFVSNFDSEERKRMRLERFGELAKPTTISSFYETKTPNLQIVGTSTNLEKSYMRLTDEAKPENVRPEFILFQSLPLVLRKYRENNDYGYIRDQLKSIRQDLVVQHIKTDFTIIVYEENARISIENNDLSDYNQCAAQLKNLYSTKRRNDPTLKNKYFSHEIEMMLYRLIYLITTKNNSEVNKFYLAIITDFKHFVMTDSEKLIHEFIMALLEVQNHLLQGEFESFFQLSRFNELEETRTAFIFLKNSMLDEIRIRALYSMAYTFASMNLNVVVEKLKFDDGSPKASTHACYNYLCSLRLGDVIDKTKGEMMSAKVRPILKAHVAKFNKVDIKGQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.68
3 0.7
4 0.72
5 0.73
6 0.72
7 0.72
8 0.71
9 0.73
10 0.76
11 0.82
12 0.83
13 0.78
14 0.75
15 0.73
16 0.74
17 0.72
18 0.67
19 0.62
20 0.62
21 0.57
22 0.52
23 0.43
24 0.35
25 0.27
26 0.22
27 0.17
28 0.11
29 0.11
30 0.12
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.15
35 0.16
36 0.17
37 0.2
38 0.2
39 0.26
40 0.26
41 0.29
42 0.29
43 0.31
44 0.36
45 0.34
46 0.39
47 0.33
48 0.34
49 0.32
50 0.32
51 0.3
52 0.28
53 0.25
54 0.2
55 0.19
56 0.19
57 0.17
58 0.18
59 0.22
60 0.21
61 0.26
62 0.24
63 0.25
64 0.25
65 0.29
66 0.31
67 0.35
68 0.37
69 0.36
70 0.44
71 0.43
72 0.42
73 0.47
74 0.49
75 0.46
76 0.48
77 0.48
78 0.5
79 0.59
80 0.65
81 0.66
82 0.7
83 0.68
84 0.65
85 0.7
86 0.66
87 0.67
88 0.61
89 0.52
90 0.45
91 0.42
92 0.37
93 0.29
94 0.26
95 0.18
96 0.16
97 0.17
98 0.18
99 0.16
100 0.18
101 0.19
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.19
106 0.23
107 0.25
108 0.23
109 0.22
110 0.2
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.11
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.06
126 0.07
127 0.1
128 0.12
129 0.15
130 0.17
131 0.21
132 0.26
133 0.31
134 0.38
135 0.4
136 0.43
137 0.42
138 0.47
139 0.44
140 0.39
141 0.32
142 0.25
143 0.22
144 0.17
145 0.15
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.11
162 0.18
163 0.18
164 0.19
165 0.23
166 0.28
167 0.31
168 0.32
169 0.35
170 0.32
171 0.41
172 0.45
173 0.49
174 0.5
175 0.54
176 0.56
177 0.56
178 0.61
179 0.61
180 0.67
181 0.7
182 0.74
183 0.78
184 0.82
185 0.89
186 0.89
187 0.87
188 0.87
189 0.88
190 0.87
191 0.82
192 0.83
193 0.76
194 0.74
195 0.76
196 0.7
197 0.69
198 0.67
199 0.7
200 0.68
201 0.71
202 0.74
203 0.71
204 0.77
205 0.73
206 0.74
207 0.7
208 0.64
209 0.57
210 0.47
211 0.43
212 0.37
213 0.34
214 0.27
215 0.27
216 0.28
217 0.33
218 0.32
219 0.37
220 0.34
221 0.33
222 0.33
223 0.35
224 0.37
225 0.4
226 0.43
227 0.4
228 0.41
229 0.4
230 0.39
231 0.34
232 0.31
233 0.23
234 0.19
235 0.15
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.2
243 0.2
244 0.21
245 0.24
246 0.23
247 0.21
248 0.19
249 0.18
250 0.12
251 0.14
252 0.13
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.16
266 0.21
267 0.25
268 0.25
269 0.23
270 0.24
271 0.24
272 0.29
273 0.26
274 0.21
275 0.17
276 0.18
277 0.18
278 0.17
279 0.19
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.09
288 0.12
289 0.15
290 0.2
291 0.25
292 0.27
293 0.28
294 0.29
295 0.33
296 0.32
297 0.3
298 0.26
299 0.25
300 0.23
301 0.21
302 0.2
303 0.18
304 0.22
305 0.24
306 0.24
307 0.23
308 0.22
309 0.24
310 0.24
311 0.31
312 0.32
313 0.28
314 0.27
315 0.25
316 0.25
317 0.22
318 0.22
319 0.13
320 0.07
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.09
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.22
350 0.25
351 0.28
352 0.34
353 0.42
354 0.45
355 0.5
356 0.52
357 0.53
358 0.6
359 0.67
360 0.7
361 0.74
362 0.7
363 0.65
364 0.64
365 0.61
366 0.58
367 0.48
368 0.43
369 0.34
370 0.31
371 0.3
372 0.3
373 0.25
374 0.19
375 0.17
376 0.11
377 0.08
378 0.08
379 0.05
380 0.06
381 0.08
382 0.12
383 0.14
384 0.15
385 0.18
386 0.22
387 0.23
388 0.25
389 0.25
390 0.25
391 0.26
392 0.26
393 0.23
394 0.21
395 0.2
396 0.18
397 0.18
398 0.15
399 0.15
400 0.15
401 0.15
402 0.14
403 0.13
404 0.13
405 0.17
406 0.19
407 0.19
408 0.21
409 0.23
410 0.22
411 0.23
412 0.22
413 0.16
414 0.13
415 0.11
416 0.08
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.07
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.14
438 0.12
439 0.17
440 0.17
441 0.16
442 0.2
443 0.2
444 0.23
445 0.23
446 0.25
447 0.21
448 0.2
449 0.21
450 0.18
451 0.2
452 0.19
453 0.17
454 0.17
455 0.16
456 0.17
457 0.18
458 0.18
459 0.17
460 0.17
461 0.19
462 0.18
463 0.18
464 0.17
465 0.15
466 0.15
467 0.14
468 0.14
469 0.12
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.12
475 0.13
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.12
483 0.1
484 0.11
485 0.13
486 0.14
487 0.14
488 0.15
489 0.24
490 0.23
491 0.29
492 0.3
493 0.28
494 0.29
495 0.31
496 0.32
497 0.29
498 0.32
499 0.3
500 0.29
501 0.33
502 0.37
503 0.37
504 0.37
505 0.31
506 0.28
507 0.25
508 0.26
509 0.25
510 0.21
511 0.25
512 0.28
513 0.29
514 0.28
515 0.28
516 0.29
517 0.27
518 0.25
519 0.23
520 0.24
521 0.31
522 0.34
523 0.35
524 0.36
525 0.37
526 0.38
527 0.38
528 0.4
529 0.4
530 0.46
531 0.47
532 0.52
533 0.54
534 0.57
535 0.57
536 0.59
537 0.56
538 0.5