Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SHB2

Protein Details
Accession A0A5N6SHB2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-251QTRAQRTPRAKRTPRFTPKQKVLDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-241KRIAPAPAKRTVPAQTRAQRTPRAKRTPR
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MTSFTVTSPLGRSDKANMNHLPSVSSLMSPPESKPFDSFNPAFSPHHVSQDPSFSHDMKLPPISVDRKRTQSEMDLPSPPVTPYTGNKKRKSNTSEQIEGDAVVGSSRDPVLFPRQDSLAEVATDEPLFGPMLPTATEALVEQHINSHMARFENKLNKPTRDEYLLALSCVPIVSAQYNRNPGAWAKEERETLERQLVMMNRCRPHTMEAKLKRIAPAPAKRTVPAQTRAQRTPRAKRTPRFTPKQKVLDTFDLTPQSSNKQPRAIGTNRDDTDYKSIMDYSPPLETLGSNAKALKADWKGQMLDLSNDSDRHLLNAAELNLAATLRLSCATYLCSKRRIFEARVKALNVGKEFRKTDAQQACKIDVNKASKLWTAYDRVGWFRPEHFEQFLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.45
4 0.43
5 0.46
6 0.49
7 0.46
8 0.41
9 0.32
10 0.33
11 0.27
12 0.24
13 0.18
14 0.18
15 0.21
16 0.21
17 0.22
18 0.26
19 0.29
20 0.3
21 0.32
22 0.33
23 0.35
24 0.42
25 0.41
26 0.36
27 0.37
28 0.39
29 0.37
30 0.35
31 0.4
32 0.32
33 0.39
34 0.36
35 0.34
36 0.33
37 0.4
38 0.38
39 0.34
40 0.36
41 0.3
42 0.31
43 0.32
44 0.32
45 0.28
46 0.3
47 0.26
48 0.24
49 0.3
50 0.36
51 0.38
52 0.45
53 0.47
54 0.51
55 0.54
56 0.54
57 0.51
58 0.5
59 0.52
60 0.5
61 0.48
62 0.44
63 0.43
64 0.42
65 0.39
66 0.32
67 0.24
68 0.19
69 0.18
70 0.21
71 0.3
72 0.39
73 0.47
74 0.54
75 0.62
76 0.67
77 0.73
78 0.76
79 0.75
80 0.74
81 0.73
82 0.72
83 0.64
84 0.61
85 0.51
86 0.43
87 0.33
88 0.23
89 0.15
90 0.09
91 0.08
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.08
98 0.17
99 0.2
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.23
104 0.24
105 0.23
106 0.17
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.13
138 0.14
139 0.2
140 0.28
141 0.31
142 0.37
143 0.41
144 0.43
145 0.47
146 0.47
147 0.43
148 0.38
149 0.36
150 0.3
151 0.31
152 0.28
153 0.23
154 0.2
155 0.17
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.04
160 0.04
161 0.06
162 0.09
163 0.12
164 0.15
165 0.19
166 0.2
167 0.2
168 0.21
169 0.2
170 0.21
171 0.22
172 0.22
173 0.2
174 0.23
175 0.24
176 0.24
177 0.26
178 0.24
179 0.21
180 0.21
181 0.18
182 0.15
183 0.17
184 0.18
185 0.18
186 0.22
187 0.27
188 0.25
189 0.26
190 0.27
191 0.26
192 0.27
193 0.31
194 0.31
195 0.35
196 0.39
197 0.45
198 0.46
199 0.46
200 0.44
201 0.4
202 0.39
203 0.38
204 0.4
205 0.38
206 0.41
207 0.41
208 0.4
209 0.4
210 0.41
211 0.39
212 0.36
213 0.41
214 0.42
215 0.47
216 0.52
217 0.54
218 0.56
219 0.58
220 0.64
221 0.65
222 0.69
223 0.72
224 0.73
225 0.76
226 0.79
227 0.8
228 0.8
229 0.8
230 0.79
231 0.79
232 0.81
233 0.77
234 0.7
235 0.66
236 0.63
237 0.56
238 0.48
239 0.42
240 0.36
241 0.32
242 0.28
243 0.23
244 0.21
245 0.24
246 0.29
247 0.29
248 0.31
249 0.32
250 0.33
251 0.4
252 0.41
253 0.42
254 0.41
255 0.46
256 0.42
257 0.44
258 0.42
259 0.37
260 0.38
261 0.31
262 0.27
263 0.19
264 0.19
265 0.17
266 0.18
267 0.16
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.18
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.19
282 0.23
283 0.2
284 0.24
285 0.27
286 0.29
287 0.29
288 0.29
289 0.32
290 0.26
291 0.25
292 0.21
293 0.21
294 0.2
295 0.2
296 0.2
297 0.19
298 0.17
299 0.16
300 0.16
301 0.12
302 0.12
303 0.16
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.09
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.11
319 0.19
320 0.26
321 0.3
322 0.38
323 0.39
324 0.42
325 0.49
326 0.54
327 0.52
328 0.55
329 0.6
330 0.6
331 0.63
332 0.62
333 0.59
334 0.55
335 0.54
336 0.48
337 0.44
338 0.39
339 0.42
340 0.42
341 0.41
342 0.46
343 0.42
344 0.49
345 0.52
346 0.54
347 0.54
348 0.57
349 0.56
350 0.54
351 0.53
352 0.49
353 0.47
354 0.47
355 0.44
356 0.41
357 0.41
358 0.39
359 0.4
360 0.38
361 0.36
362 0.36
363 0.34
364 0.39
365 0.39
366 0.4
367 0.41
368 0.41
369 0.38
370 0.36
371 0.41
372 0.4
373 0.42