Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M663

Protein Details
Accession C5M663    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-249ESEKAKSKMKSKEKQDFYRFQIRQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
Gene Ontology GO:0032545  C:CURI complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0034456  C:UTP-C complex  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
GO:0006468  P:protein phosphorylation  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
GO:0000028  P:ribosomal small subunit assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ctp:CTRG_01344  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
CDD cd12293  dRRM_Rrp7p  
cd12950  RRP7_Rrp7p  
Amino Acid Sequences MGKTKEIKGFNILPLRLPNTKSTHYIYFKKHEVKNSDANNRSLFICNLPISTELATIKKFFQTVAIGSTIELFINSYLTDYPEDIWINLTKLTSDLDLSNIADDPASKLPKNCGVVTFVDKSSFQLAFNALKKLSSNGSETEWPIRQFSSNYYLNKFQQQILDPSALSEKVSQALIDFDKAEQKSIEELQEQKTLVDEDGFTLVVGPQRKTKAGILGKQKLAATVESEKAKSKMKSKEKQDFYRFQIRQRKKEEMNDLLNKFKMDQEKVRVMREKKRFRPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.47
3 0.44
4 0.42
5 0.42
6 0.4
7 0.43
8 0.44
9 0.44
10 0.48
11 0.5
12 0.56
13 0.56
14 0.57
15 0.62
16 0.66
17 0.66
18 0.66
19 0.64
20 0.63
21 0.65
22 0.67
23 0.69
24 0.64
25 0.63
26 0.56
27 0.51
28 0.47
29 0.4
30 0.32
31 0.24
32 0.24
33 0.21
34 0.2
35 0.2
36 0.19
37 0.18
38 0.17
39 0.17
40 0.14
41 0.16
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.14
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.17
52 0.17
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.12
57 0.1
58 0.08
59 0.06
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.12
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.08
92 0.12
93 0.14
94 0.14
95 0.15
96 0.18
97 0.24
98 0.27
99 0.25
100 0.21
101 0.21
102 0.23
103 0.26
104 0.26
105 0.2
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.12
112 0.11
113 0.13
114 0.16
115 0.17
116 0.18
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.16
121 0.15
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.17
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.15
136 0.18
137 0.21
138 0.22
139 0.25
140 0.28
141 0.28
142 0.32
143 0.31
144 0.26
145 0.24
146 0.24
147 0.24
148 0.23
149 0.22
150 0.18
151 0.17
152 0.17
153 0.13
154 0.12
155 0.1
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.13
170 0.13
171 0.15
172 0.16
173 0.18
174 0.15
175 0.17
176 0.2
177 0.23
178 0.22
179 0.19
180 0.19
181 0.18
182 0.15
183 0.13
184 0.1
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.1
192 0.13
193 0.13
194 0.17
195 0.2
196 0.21
197 0.24
198 0.25
199 0.31
200 0.36
201 0.41
202 0.46
203 0.51
204 0.52
205 0.52
206 0.5
207 0.42
208 0.37
209 0.3
210 0.25
211 0.21
212 0.25
213 0.24
214 0.25
215 0.27
216 0.28
217 0.34
218 0.35
219 0.39
220 0.45
221 0.53
222 0.61
223 0.68
224 0.76
225 0.79
226 0.85
227 0.85
228 0.83
229 0.79
230 0.81
231 0.73
232 0.72
233 0.73
234 0.72
235 0.73
236 0.73
237 0.76
238 0.72
239 0.79
240 0.79
241 0.76
242 0.76
243 0.76
244 0.71
245 0.67
246 0.61
247 0.53
248 0.44
249 0.41
250 0.39
251 0.37
252 0.42
253 0.45
254 0.53
255 0.56
256 0.63
257 0.67
258 0.66
259 0.7
260 0.73
261 0.76