Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MFF1

Protein Details
Accession C5MFF1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-265QPVYGWEEPKKKKSKKKSPKKSDGTPITEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-256PKKKKSKKKSPKK
Subcellular Location(s) plas 15, nucl 5, E.R. 4, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004728  Sec62  
IPR011553  Sec62_asco  
Gene Ontology GO:0031207  C:Sec62/Sec63 complex  
GO:0071256  C:translocon complex  
GO:0008320  F:protein transmembrane transporter activity  
GO:0031204  P:post-translational protein targeting to membrane, translocation  
KEGG ctp:CTRG_04794  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03839  Sec62  
Amino Acid Sequences MSAPGATQQQQQNGQFQVPTSTQRSPLASNIANFLFQNPILKQRTGLLNNTSDIEFFRFKRFQRALLSDEYKEKQKNPKNGLIPINNIQDIQNVFVLLIQNQLILPVTKLHYAEIKQVKGWKPNKEKPTLKRAEKAAMDPNAYYGWLYQKPNPFILLYSVLAIAGIFAVILFPLWPNFMKRGVWYLSMGALGLIALFFLTAIVRLIIYIISLVAFPKPFWLFPNLFEDCGVIESFQPVYGWEEPKKKKSKKKSPKKSDGTPITEEKVGSNETKTTGSEVSNNSTAGKRKVTLEEVEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.38
3 0.34
4 0.32
5 0.27
6 0.3
7 0.3
8 0.3
9 0.32
10 0.35
11 0.37
12 0.35
13 0.36
14 0.38
15 0.35
16 0.32
17 0.33
18 0.3
19 0.28
20 0.25
21 0.23
22 0.18
23 0.16
24 0.2
25 0.17
26 0.25
27 0.28
28 0.28
29 0.28
30 0.3
31 0.39
32 0.37
33 0.41
34 0.37
35 0.35
36 0.36
37 0.37
38 0.32
39 0.23
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.19
44 0.26
45 0.29
46 0.3
47 0.4
48 0.41
49 0.43
50 0.47
51 0.5
52 0.46
53 0.49
54 0.52
55 0.44
56 0.47
57 0.44
58 0.42
59 0.41
60 0.43
61 0.45
62 0.49
63 0.57
64 0.58
65 0.64
66 0.63
67 0.67
68 0.69
69 0.62
70 0.59
71 0.55
72 0.51
73 0.43
74 0.38
75 0.31
76 0.26
77 0.23
78 0.19
79 0.14
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.08
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.11
98 0.15
99 0.15
100 0.23
101 0.26
102 0.26
103 0.26
104 0.32
105 0.35
106 0.41
107 0.46
108 0.47
109 0.52
110 0.59
111 0.65
112 0.68
113 0.72
114 0.69
115 0.74
116 0.73
117 0.67
118 0.64
119 0.6
120 0.57
121 0.5
122 0.47
123 0.43
124 0.36
125 0.33
126 0.27
127 0.26
128 0.19
129 0.18
130 0.14
131 0.08
132 0.1
133 0.13
134 0.15
135 0.18
136 0.23
137 0.25
138 0.26
139 0.26
140 0.22
141 0.19
142 0.19
143 0.17
144 0.12
145 0.11
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.05
151 0.03
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.03
161 0.04
162 0.05
163 0.07
164 0.09
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.16
169 0.17
170 0.18
171 0.17
172 0.16
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.08
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.03
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.14
207 0.2
208 0.2
209 0.22
210 0.3
211 0.26
212 0.26
213 0.25
214 0.23
215 0.18
216 0.18
217 0.16
218 0.09
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.12
226 0.16
227 0.21
228 0.25
229 0.35
230 0.41
231 0.51
232 0.61
233 0.66
234 0.73
235 0.79
236 0.85
237 0.86
238 0.91
239 0.93
240 0.94
241 0.96
242 0.94
243 0.92
244 0.92
245 0.9
246 0.85
247 0.79
248 0.72
249 0.64
250 0.57
251 0.48
252 0.38
253 0.31
254 0.27
255 0.23
256 0.21
257 0.19
258 0.2
259 0.21
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.21
264 0.24
265 0.26
266 0.29
267 0.3
268 0.3
269 0.29
270 0.31
271 0.35
272 0.34
273 0.36
274 0.32
275 0.35
276 0.4
277 0.43