Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SMF7

Protein Details
Accession A0A5N6SMF7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-313YSEHDRRDSRKHFRERSPQIDRRNKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-216RRRRFDGRELRRRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MEVAGIQQPPASNGNHAMDASMDIDMDLDLGPLPEAEMIETDPAGGTVQDGAVDPQSSEAQYEKVHVRGVDELTTDNIKQFATEHFTLEAPSRVEWIDDTSANIIYSSPEIGLQALSAFTQASEEEDTSELPALRLRSAKLLSSHPDSVLQVRSAVKTDRKKPRAHEASRFYLMHPEHDPRERLRREFDDRRRQGGGDDGDYRRRRFDGRELRRRRDRDGDELISANMYDDSGAASTDYPETGRGRDERGRRRDRDRELFPSDEGRPSGRLQNRSASPGRDTLMESGYSEHDRRDSRKHFRERSPQIDRRNKGKELFPSSKPSGADADANSRELFPNKPATSYLKKELFPSKHSNHRRSDAIDAADETADLFSKRISVPLVDGSRDQRRNKNVELFPDSEESEVNIRGAAGPDQGFSIRGAANGLSIKGRGASVRELFPSKYKSNAGKELFSDKIEGRGGPRRRAEDMFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.25
4 0.22
5 0.2
6 0.19
7 0.18
8 0.12
9 0.09
10 0.07
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.06
19 0.05
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.08
29 0.07
30 0.08
31 0.07
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.08
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.22
53 0.21
54 0.22
55 0.24
56 0.26
57 0.23
58 0.21
59 0.2
60 0.19
61 0.22
62 0.2
63 0.16
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.19
70 0.2
71 0.2
72 0.21
73 0.21
74 0.22
75 0.22
76 0.22
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.14
81 0.15
82 0.14
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.15
90 0.14
91 0.11
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.1
118 0.09
119 0.11
120 0.11
121 0.13
122 0.14
123 0.15
124 0.18
125 0.19
126 0.22
127 0.22
128 0.25
129 0.28
130 0.31
131 0.32
132 0.27
133 0.28
134 0.26
135 0.26
136 0.24
137 0.2
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.18
142 0.21
143 0.26
144 0.32
145 0.42
146 0.5
147 0.56
148 0.6
149 0.63
150 0.7
151 0.73
152 0.71
153 0.71
154 0.66
155 0.66
156 0.65
157 0.61
158 0.5
159 0.46
160 0.4
161 0.34
162 0.3
163 0.28
164 0.26
165 0.3
166 0.32
167 0.29
168 0.39
169 0.4
170 0.39
171 0.42
172 0.44
173 0.49
174 0.57
175 0.64
176 0.65
177 0.64
178 0.66
179 0.61
180 0.55
181 0.46
182 0.42
183 0.34
184 0.26
185 0.28
186 0.25
187 0.32
188 0.35
189 0.35
190 0.3
191 0.3
192 0.29
193 0.28
194 0.36
195 0.39
196 0.47
197 0.57
198 0.64
199 0.71
200 0.77
201 0.77
202 0.71
203 0.7
204 0.63
205 0.59
206 0.58
207 0.51
208 0.43
209 0.4
210 0.35
211 0.25
212 0.21
213 0.14
214 0.07
215 0.05
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.1
231 0.11
232 0.15
233 0.21
234 0.3
235 0.37
236 0.47
237 0.55
238 0.58
239 0.66
240 0.7
241 0.73
242 0.73
243 0.69
244 0.66
245 0.62
246 0.58
247 0.5
248 0.45
249 0.38
250 0.31
251 0.27
252 0.2
253 0.18
254 0.18
255 0.24
256 0.26
257 0.29
258 0.29
259 0.35
260 0.35
261 0.39
262 0.4
263 0.34
264 0.31
265 0.29
266 0.27
267 0.22
268 0.22
269 0.18
270 0.17
271 0.15
272 0.13
273 0.12
274 0.13
275 0.15
276 0.14
277 0.13
278 0.16
279 0.19
280 0.23
281 0.31
282 0.38
283 0.46
284 0.55
285 0.65
286 0.69
287 0.74
288 0.82
289 0.81
290 0.82
291 0.82
292 0.79
293 0.8
294 0.81
295 0.77
296 0.75
297 0.73
298 0.67
299 0.6
300 0.58
301 0.56
302 0.55
303 0.57
304 0.51
305 0.52
306 0.5
307 0.5
308 0.45
309 0.38
310 0.31
311 0.27
312 0.26
313 0.2
314 0.24
315 0.22
316 0.23
317 0.21
318 0.19
319 0.2
320 0.19
321 0.19
322 0.16
323 0.24
324 0.23
325 0.24
326 0.26
327 0.32
328 0.37
329 0.4
330 0.45
331 0.41
332 0.42
333 0.46
334 0.52
335 0.5
336 0.49
337 0.53
338 0.51
339 0.56
340 0.65
341 0.68
342 0.66
343 0.67
344 0.64
345 0.59
346 0.58
347 0.52
348 0.44
349 0.38
350 0.32
351 0.27
352 0.23
353 0.19
354 0.14
355 0.1
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.05
360 0.08
361 0.09
362 0.1
363 0.11
364 0.12
365 0.14
366 0.21
367 0.23
368 0.22
369 0.25
370 0.29
371 0.37
372 0.44
373 0.48
374 0.49
375 0.55
376 0.6
377 0.64
378 0.68
379 0.62
380 0.63
381 0.63
382 0.57
383 0.52
384 0.48
385 0.42
386 0.32
387 0.28
388 0.22
389 0.18
390 0.17
391 0.14
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.12
399 0.12
400 0.14
401 0.14
402 0.14
403 0.13
404 0.14
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.11
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.14
417 0.13
418 0.15
419 0.21
420 0.23
421 0.26
422 0.3
423 0.32
424 0.33
425 0.38
426 0.42
427 0.37
428 0.39
429 0.43
430 0.48
431 0.52
432 0.6
433 0.57
434 0.54
435 0.55
436 0.56
437 0.51
438 0.44
439 0.4
440 0.31
441 0.32
442 0.31
443 0.29
444 0.28
445 0.36
446 0.42
447 0.47
448 0.53
449 0.53
450 0.57