Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SKI2

Protein Details
Accession A0A5N6SKI2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-130KTTAAGGKTRRGKKDKRANVPSNQRSILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-119GGKTRRGKKDKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MPPNPRSGASTNDHAHHDRDTVITDEALDHQSAVGIHKGAREKSQLRQGPEAEEKPPSLREGLDEQSRTKSAEIGEKSSSRQGYQRLMSSRVKEKSSLCPSPKTTAAGGKTRRGKKDKRANVPSNQRSILSYMRPAEEAGETSEPLQTGCITAGKRPAPTEAVAENASDSKRAKLIKQEPVVSVKTEEELEDILDDIKEEQEEVPFNPEDYADAILIEDDEYPDELKHEDAAGYDVEEDSLPEHVYQEAGYLEEEGFISDEDRYRLAGIADEDHEALRESFDKSMHRVIRYLFNYAKYTPFKELKGGKSWIAPAMYQWLQRADSEVVYRLYQAIIPESTRTILGHDKLIGKHILALPKVSPSRRDRGVYLDLVTSPGEDGGLYTGSTKISFVVRIPAHQRAIQGGESGAHYTYIREKADRKPHFRVVAVFPRRVPELGIESADSVWLIRFLETVIMIVLDTFTPGSRPIFSVPQDRLDHMRSECGLRDTGFQPLNRALPTKQPIDSVRSKAQRKCPTCGDDKPSNWCLDYNPSTWVAIYLCSACFQWKRTHGTDRPASLYNRLPQPTSGPCSNPNCGATETTRKWYRDPNDKDRVLCDACHTYQTLNSGKIALKLAQASYGFEHMINPDYCTGAKSVTTGMKGAYQKPKIILDNASVVVNQILKTGTEYRQCVDPAIIMINNVVKNGSVQIAGTASSYGRRKRNSSAGLIPFASGYAISVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.43
3 0.39
4 0.35
5 0.28
6 0.26
7 0.25
8 0.22
9 0.21
10 0.19
11 0.17
12 0.16
13 0.18
14 0.18
15 0.15
16 0.13
17 0.11
18 0.13
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.19
25 0.26
26 0.27
27 0.31
28 0.38
29 0.4
30 0.46
31 0.55
32 0.56
33 0.56
34 0.6
35 0.57
36 0.56
37 0.6
38 0.56
39 0.48
40 0.45
41 0.42
42 0.38
43 0.37
44 0.32
45 0.25
46 0.23
47 0.24
48 0.26
49 0.3
50 0.34
51 0.34
52 0.34
53 0.38
54 0.39
55 0.36
56 0.31
57 0.28
58 0.24
59 0.3
60 0.32
61 0.31
62 0.35
63 0.35
64 0.38
65 0.42
66 0.4
67 0.33
68 0.35
69 0.37
70 0.39
71 0.42
72 0.46
73 0.44
74 0.49
75 0.53
76 0.54
77 0.57
78 0.54
79 0.53
80 0.5
81 0.49
82 0.53
83 0.56
84 0.59
85 0.55
86 0.57
87 0.58
88 0.59
89 0.59
90 0.51
91 0.45
92 0.43
93 0.44
94 0.46
95 0.46
96 0.5
97 0.56
98 0.61
99 0.68
100 0.7
101 0.74
102 0.76
103 0.82
104 0.84
105 0.85
106 0.88
107 0.86
108 0.87
109 0.89
110 0.85
111 0.81
112 0.72
113 0.62
114 0.52
115 0.48
116 0.43
117 0.35
118 0.33
119 0.29
120 0.29
121 0.29
122 0.27
123 0.25
124 0.21
125 0.19
126 0.17
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.16
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.09
135 0.08
136 0.09
137 0.12
138 0.11
139 0.14
140 0.21
141 0.23
142 0.25
143 0.26
144 0.28
145 0.27
146 0.27
147 0.28
148 0.22
149 0.22
150 0.2
151 0.19
152 0.17
153 0.17
154 0.16
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.18
159 0.2
160 0.22
161 0.3
162 0.39
163 0.45
164 0.5
165 0.52
166 0.5
167 0.53
168 0.52
169 0.43
170 0.36
171 0.27
172 0.22
173 0.19
174 0.16
175 0.12
176 0.11
177 0.1
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.1
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.11
269 0.13
270 0.15
271 0.22
272 0.25
273 0.25
274 0.25
275 0.26
276 0.33
277 0.33
278 0.35
279 0.29
280 0.29
281 0.3
282 0.29
283 0.34
284 0.28
285 0.29
286 0.29
287 0.3
288 0.28
289 0.32
290 0.37
291 0.35
292 0.38
293 0.38
294 0.33
295 0.32
296 0.32
297 0.28
298 0.23
299 0.19
300 0.13
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.15
308 0.18
309 0.14
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.13
314 0.12
315 0.13
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.14
333 0.16
334 0.16
335 0.18
336 0.16
337 0.13
338 0.15
339 0.16
340 0.17
341 0.15
342 0.15
343 0.13
344 0.17
345 0.2
346 0.18
347 0.23
348 0.24
349 0.29
350 0.32
351 0.33
352 0.3
353 0.33
354 0.35
355 0.3
356 0.27
357 0.22
358 0.18
359 0.18
360 0.16
361 0.11
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.03
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.14
380 0.14
381 0.17
382 0.2
383 0.23
384 0.24
385 0.25
386 0.26
387 0.2
388 0.22
389 0.19
390 0.16
391 0.12
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.11
400 0.14
401 0.15
402 0.17
403 0.21
404 0.28
405 0.39
406 0.46
407 0.49
408 0.52
409 0.57
410 0.58
411 0.55
412 0.51
413 0.47
414 0.5
415 0.47
416 0.42
417 0.37
418 0.35
419 0.35
420 0.31
421 0.25
422 0.17
423 0.16
424 0.16
425 0.16
426 0.14
427 0.13
428 0.13
429 0.12
430 0.1
431 0.06
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.06
439 0.05
440 0.06
441 0.05
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.09
455 0.11
456 0.15
457 0.18
458 0.24
459 0.24
460 0.31
461 0.31
462 0.32
463 0.33
464 0.31
465 0.33
466 0.27
467 0.28
468 0.22
469 0.22
470 0.23
471 0.21
472 0.2
473 0.16
474 0.19
475 0.17
476 0.23
477 0.24
478 0.22
479 0.23
480 0.25
481 0.26
482 0.24
483 0.25
484 0.2
485 0.25
486 0.29
487 0.29
488 0.28
489 0.3
490 0.31
491 0.35
492 0.4
493 0.38
494 0.42
495 0.47
496 0.53
497 0.56
498 0.64
499 0.67
500 0.66
501 0.66
502 0.66
503 0.63
504 0.63
505 0.63
506 0.61
507 0.59
508 0.57
509 0.59
510 0.54
511 0.5
512 0.43
513 0.37
514 0.31
515 0.31
516 0.32
517 0.26
518 0.25
519 0.25
520 0.24
521 0.23
522 0.23
523 0.15
524 0.11
525 0.11
526 0.1
527 0.09
528 0.1
529 0.1
530 0.14
531 0.16
532 0.18
533 0.24
534 0.3
535 0.37
536 0.41
537 0.51
538 0.52
539 0.58
540 0.62
541 0.58
542 0.55
543 0.53
544 0.5
545 0.44
546 0.45
547 0.42
548 0.42
549 0.4
550 0.37
551 0.34
552 0.37
553 0.39
554 0.39
555 0.36
556 0.32
557 0.38
558 0.42
559 0.44
560 0.42
561 0.37
562 0.34
563 0.32
564 0.32
565 0.29
566 0.34
567 0.35
568 0.39
569 0.45
570 0.44
571 0.46
572 0.53
573 0.56
574 0.58
575 0.64
576 0.65
577 0.68
578 0.7
579 0.68
580 0.61
581 0.6
582 0.51
583 0.42
584 0.37
585 0.33
586 0.3
587 0.31
588 0.3
589 0.24
590 0.24
591 0.29
592 0.28
593 0.23
594 0.23
595 0.23
596 0.24
597 0.26
598 0.26
599 0.22
600 0.21
601 0.21
602 0.21
603 0.22
604 0.21
605 0.2
606 0.19
607 0.19
608 0.17
609 0.15
610 0.16
611 0.13
612 0.19
613 0.18
614 0.18
615 0.17
616 0.17
617 0.18
618 0.18
619 0.17
620 0.13
621 0.13
622 0.12
623 0.16
624 0.18
625 0.19
626 0.19
627 0.19
628 0.24
629 0.27
630 0.34
631 0.4
632 0.4
633 0.42
634 0.45
635 0.5
636 0.47
637 0.47
638 0.42
639 0.36
640 0.36
641 0.34
642 0.31
643 0.25
644 0.22
645 0.19
646 0.18
647 0.15
648 0.11
649 0.11
650 0.11
651 0.15
652 0.2
653 0.24
654 0.29
655 0.31
656 0.32
657 0.36
658 0.36
659 0.34
660 0.3
661 0.26
662 0.2
663 0.22
664 0.2
665 0.15
666 0.17
667 0.2
668 0.19
669 0.18
670 0.17
671 0.13
672 0.14
673 0.15
674 0.15
675 0.1
676 0.1
677 0.11
678 0.12
679 0.12
680 0.11
681 0.1
682 0.1
683 0.16
684 0.23
685 0.29
686 0.37
687 0.43
688 0.48
689 0.55
690 0.65
691 0.65
692 0.66
693 0.68
694 0.66
695 0.64
696 0.59
697 0.51
698 0.41
699 0.34
700 0.27
701 0.17