FuNGI

C5MG54

Protein Details

Accession

C5MG54

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1100-1124	ELATKIKEIRKKYPERMKVHKLALE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 11.5, cyto_nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	ctp:CTRG_05047 -
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MKSFKLPRRLSYILRGHYSTRVSLTQPPTQFTTSIFDIANDIPKTLPRSSHVQLTKFYQSIKTQDLELASVLLSEISKNALKSIINKSRNISIEFYFDCLKIILENYLNSGTFKPINLLRQNVEEYQNILSRFDEVLPEQEDIEMSILKSIIHTYSVSKKSKSTSMFTIPIMEYFITVLNSFKIDVQKLYLSTEEEELRKYLVEICQIKNIKLVSVTTNMDKELKNFNVPIDSYLDKYGGIDYDGICNYISDNKFKWNNKEIKTRLFQFYETLPKEEAEKFMNEYLQFNKVKEISIESFTNRIVHASSKASKEFQRSFGFVHSESDLLSEWIALISDHTNKLLSIKIPVSDDEKTLQYFKPFLETVSVESIASYVVQSLLGTGDNNRLQVILQKMRYSYPSILSQQGGSSKKNSTIFKYITDDSYNKLTEVFINIIVENCKIFISEEEQEKFQNTMKLQNRTIPPEFKINDGSNKYPAFFIAKEYDSRIGYAVYTIDIHPYLESKLETFTTGTYFRYLPLLCPPKPWTNSQNGGYLNYQTRLIATTDTVHKKLLEKAGVRGQLDSAYNCLDQIGNTPWAINPQMLDVFNKVINYPNGFLEIPAIIPDSNLPSKERRELKNLRTSIEITNKVANAFGKNGDLLYHCYMLDFRGRVYTFSPLTHYGSDLTRSLFLFWKSQPLGENGFYWVKYQLASLFGIKNCEEFYEENKQNIIDSAMNPLDGSRWWMKADKPFCALSVCFEIKNILDFQESGNNIEDYLSRLPIHQDGSCNGLQHYAALAADENGGRAVNLIGVGDSKQDVYIEVMKVVRGKIEKDIKDAKLPEETIDLAKFYLKILCRKLVKRPVMTTVYGVTLAGASAQIKSTIKEILDEHRTNPEINTFDQETLARLSTFKLNHTMYLARKVLESIDELFGHAKQIETWLLQNTKRILTAYNVKLLDYVQEKDTKLYENIFKRSVSYTPMSWTAPSGFPVIQIYRQIKHKMSSGPMEELTIRNWNKLYPMDRYKHELAIAPNFIHSLDASHMFMTCEEANKQGITFSAIHDSYWTHPVHVDQLSRILREKFVELYSFDYLEYVKQEFIAQVKGSYQLVEFDPDSYPELATKIKEIRKKYPERMKVHKLALELREMTEQGEEHIMRKLYHEYKPEVYHTVSTKTYHYSNVLSPEVPKLRRNRVAMFVPVVILDVPPKGNLDITNVLNSKYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.59
3	0.53
4	0.53
5	0.51
6	0.43
7	0.38
8	0.35
9	0.33
10	0.39
11	0.42
12	0.44
13	0.44
14	0.45
15	0.45
16	0.44
17	0.41
18	0.35
19	0.35
20	0.29
21	0.29
22	0.26
23	0.21
24	0.23
25	0.24
26	0.29
27	0.24
28	0.22
29	0.2
30	0.24
31	0.29
32	0.29
33	0.3
34	0.26
35	0.34
36	0.36
37	0.45
38	0.47
39	0.46
40	0.47
41	0.5
42	0.53
43	0.47
44	0.47
45	0.43
46	0.42
47	0.44
48	0.44
49	0.39
50	0.34
51	0.34
52	0.33
53	0.28
54	0.24
55	0.18
56	0.13
57	0.12
58	0.11
59	0.08
60	0.07
61	0.06
62	0.06
63	0.09
64	0.12
65	0.12
66	0.13
67	0.16
68	0.18
69	0.24
70	0.34
71	0.41
72	0.44
73	0.47
74	0.49
75	0.54
76	0.56
77	0.53
78	0.46
79	0.38
80	0.39
81	0.36
82	0.36
83	0.31
84	0.27
85	0.24
86	0.2
87	0.19
88	0.14
89	0.14
90	0.15
91	0.15
92	0.16
93	0.18
94	0.2
95	0.2
96	0.2
97	0.2
98	0.2
99	0.19
100	0.19
101	0.2
102	0.22
103	0.31
104	0.35
105	0.38
106	0.37
107	0.4
108	0.44
109	0.43
110	0.42
111	0.34
112	0.31
113	0.3
114	0.31
115	0.27
116	0.24
117	0.21
118	0.2
119	0.2
120	0.19
121	0.18
122	0.15
123	0.19
124	0.2
125	0.21
126	0.18
127	0.17
128	0.16
129	0.14
130	0.15
131	0.11
132	0.08
133	0.09
134	0.09
135	0.09
136	0.09
137	0.1
138	0.1
139	0.1
140	0.11
141	0.14
142	0.24
143	0.33
144	0.37
145	0.37
146	0.4
147	0.43
148	0.5
149	0.5
150	0.46
151	0.44
152	0.47
153	0.48
154	0.45
155	0.45
156	0.38
157	0.34
158	0.3
159	0.23
160	0.16
161	0.14
162	0.14
163	0.1
164	0.1
165	0.11
166	0.09
167	0.1
168	0.11
169	0.13
170	0.16
171	0.17
172	0.18
173	0.2
174	0.22
175	0.22
176	0.24
177	0.22
178	0.2
179	0.2
180	0.22
181	0.22
182	0.2
183	0.21
184	0.2
185	0.19
186	0.17
187	0.16
188	0.17
189	0.16
190	0.24
191	0.27
192	0.28
193	0.37
194	0.38
195	0.38
196	0.38
197	0.35
198	0.28
199	0.25
200	0.25
201	0.19
202	0.22
203	0.24
204	0.23
205	0.24
206	0.24
207	0.26
208	0.24
209	0.24
210	0.28
211	0.28
212	0.29
213	0.29
214	0.28
215	0.29
216	0.29
217	0.28
218	0.24
219	0.22
220	0.21
221	0.21
222	0.2
223	0.16
224	0.16
225	0.15
226	0.11
227	0.1
228	0.1
229	0.09
230	0.13
231	0.13
232	0.13
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.18
237	0.19
238	0.19
239	0.21
240	0.28
241	0.37
242	0.42
243	0.49
244	0.52
245	0.59
246	0.62
247	0.71
248	0.68
249	0.68
250	0.7
251	0.67
252	0.64
253	0.57
254	0.51
255	0.43
256	0.42
257	0.43
258	0.39
259	0.36
260	0.3
261	0.28
262	0.31
263	0.3
264	0.28
265	0.21
266	0.2
267	0.2
268	0.21
269	0.24
270	0.21
271	0.22
272	0.21
273	0.26
274	0.26
275	0.24
276	0.27
277	0.25
278	0.25
279	0.23
280	0.27
281	0.22
282	0.24
283	0.26
284	0.23
285	0.24
286	0.23
287	0.24
288	0.18
289	0.16
290	0.13
291	0.14
292	0.15
293	0.19
294	0.23
295	0.26
296	0.28
297	0.31
298	0.34
299	0.4
300	0.41
301	0.41
302	0.41
303	0.39
304	0.38
305	0.38
306	0.38
307	0.3
308	0.29
309	0.23
310	0.19
311	0.17
312	0.16
313	0.13
314	0.1
315	0.09
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.04
321	0.05
322	0.07
323	0.1
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.11
328	0.13
329	0.14
330	0.12
331	0.14
332	0.15
333	0.16
334	0.17
335	0.18
336	0.21
337	0.2
338	0.2
339	0.18
340	0.19
341	0.18
342	0.2
343	0.2
344	0.18
345	0.19
346	0.17
347	0.2
348	0.18
349	0.18
350	0.18
351	0.18
352	0.18
353	0.2
354	0.2
355	0.15
356	0.15
357	0.14
358	0.1
359	0.1
360	0.07
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.12
371	0.12
372	0.13
373	0.13
374	0.12
375	0.12
376	0.16
377	0.22
378	0.22
379	0.23
380	0.25
381	0.26
382	0.27
383	0.29
384	0.29
385	0.24
386	0.21
387	0.24
388	0.25
389	0.27
390	0.26
391	0.24
392	0.21
393	0.26
394	0.25
395	0.22
396	0.22
397	0.22
398	0.27
399	0.32
400	0.33
401	0.31
402	0.36
403	0.36
404	0.36
405	0.39
406	0.35
407	0.32
408	0.33
409	0.29
410	0.24
411	0.27
412	0.24
413	0.19
414	0.18
415	0.16
416	0.13
417	0.15
418	0.14
419	0.1
420	0.1
421	0.1
422	0.11
423	0.11
424	0.11
425	0.08
426	0.08
427	0.07
428	0.06
429	0.07
430	0.07
431	0.11
432	0.14
433	0.19
434	0.2
435	0.21
436	0.21
437	0.22
438	0.22
439	0.2
440	0.21
441	0.16
442	0.25
443	0.3
444	0.36
445	0.36
446	0.41
447	0.42
448	0.44
449	0.47
450	0.41
451	0.36
452	0.38
453	0.38
454	0.33
455	0.35
456	0.31
457	0.34
458	0.34
459	0.34
460	0.31
461	0.3
462	0.29
463	0.24
464	0.23
465	0.19
466	0.16
467	0.17
468	0.16
469	0.17
470	0.17
471	0.19
472	0.22
473	0.18
474	0.19
475	0.16
476	0.12
477	0.11
478	0.1
479	0.09
480	0.06
481	0.07
482	0.06
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.08
490	0.08
491	0.07
492	0.08
493	0.08
494	0.09
495	0.09
496	0.08
497	0.1
498	0.1
499	0.11
500	0.11
501	0.11
502	0.11
503	0.14
504	0.13
505	0.12
506	0.2
507	0.26
508	0.24
509	0.28
510	0.32
511	0.36
512	0.38
513	0.42
514	0.38
515	0.38
516	0.43
517	0.42
518	0.42
519	0.36
520	0.36
521	0.32
522	0.3
523	0.24
524	0.2
525	0.18
526	0.13
527	0.12
528	0.11
529	0.11
530	0.09
531	0.08
532	0.09
533	0.16
534	0.19
535	0.19
536	0.19
537	0.19
538	0.2
539	0.24
540	0.26
541	0.24
542	0.23
543	0.25
544	0.3
545	0.33
546	0.31
547	0.27
548	0.23
549	0.2
550	0.19
551	0.16
552	0.12
553	0.1
554	0.1
555	0.09
556	0.09
557	0.07
558	0.06
559	0.09
560	0.1
561	0.1
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.12
566	0.12
567	0.1
568	0.07
569	0.07
570	0.09
571	0.09
572	0.1
573	0.09
574	0.1
575	0.1
576	0.1
577	0.09
578	0.11
579	0.11
580	0.12
581	0.12
582	0.11
583	0.13
584	0.13
585	0.12
586	0.1
587	0.09
588	0.08
589	0.07
590	0.07
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.07
595	0.08
596	0.09
597	0.11
598	0.13
599	0.16
600	0.23
601	0.29
602	0.29
603	0.38
604	0.45
605	0.5
606	0.57
607	0.56
608	0.5
609	0.45
610	0.44
611	0.4
612	0.38
613	0.33
614	0.25
615	0.26
616	0.25
617	0.23
618	0.22
619	0.18
620	0.12
621	0.11
622	0.11
623	0.09
624	0.09
625	0.09
626	0.08
627	0.09
628	0.11
629	0.11
630	0.12
631	0.11
632	0.11
633	0.11
634	0.11
635	0.13
636	0.1
637	0.09
638	0.13
639	0.13
640	0.14
641	0.15
642	0.18
643	0.16
644	0.17
645	0.19
646	0.17
647	0.18
648	0.18
649	0.17
650	0.15
651	0.14
652	0.15
653	0.13
654	0.12
655	0.11
656	0.11
657	0.12
658	0.13
659	0.14
660	0.15
661	0.15
662	0.21
663	0.2
664	0.21
665	0.21
666	0.2
667	0.23
668	0.2
669	0.2
670	0.17
671	0.18
672	0.17
673	0.16
674	0.14
675	0.11
676	0.1
677	0.1
678	0.08
679	0.09
680	0.1
681	0.11
682	0.13
683	0.13
684	0.15
685	0.15
686	0.14
687	0.13
688	0.13
689	0.13
690	0.11
691	0.15
692	0.23
693	0.24
694	0.24
695	0.24
696	0.24
697	0.22
698	0.21
699	0.19
700	0.1
701	0.09
702	0.13
703	0.12
704	0.12
705	0.12
706	0.11
707	0.1
708	0.08
709	0.13
710	0.11
711	0.12
712	0.13
713	0.16
714	0.19
715	0.26
716	0.29
717	0.28
718	0.29
719	0.28
720	0.27
721	0.27
722	0.24
723	0.19
724	0.22
725	0.2
726	0.17
727	0.16
728	0.17
729	0.15
730	0.16
731	0.14
732	0.09
733	0.09
734	0.09
735	0.1
736	0.14
737	0.14
738	0.14
739	0.15
740	0.14
741	0.14
742	0.14
743	0.13
744	0.11
745	0.12
746	0.12
747	0.1
748	0.11
749	0.13
750	0.14
751	0.16
752	0.14
753	0.15
754	0.14
755	0.19
756	0.2
757	0.19
758	0.16
759	0.15
760	0.14
761	0.12
762	0.12
763	0.08
764	0.06
765	0.06
766	0.06
767	0.05
768	0.06
769	0.06
770	0.06
771	0.05
772	0.05
773	0.05
774	0.05
775	0.05
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.05
784	0.05
785	0.05
786	0.05
787	0.06
788	0.08
789	0.11
790	0.11
791	0.12
792	0.12
793	0.13
794	0.15
795	0.14
796	0.16
797	0.13
798	0.14
799	0.21
800	0.3
801	0.3
802	0.35
803	0.42
804	0.4
805	0.45
806	0.45
807	0.39
808	0.34
809	0.34
810	0.28
811	0.23
812	0.22
813	0.18
814	0.17
815	0.15
816	0.11
817	0.11
818	0.1
819	0.09
820	0.13
821	0.14
822	0.2
823	0.23
824	0.3
825	0.36
826	0.4
827	0.49
828	0.54
829	0.59
830	0.58
831	0.57
832	0.57
833	0.54
834	0.52
835	0.44
836	0.35
837	0.28
838	0.23
839	0.19
840	0.12
841	0.08
842	0.07
843	0.06
844	0.05
845	0.04
846	0.05
847	0.05
848	0.08
849	0.08
850	0.09
851	0.1
852	0.12
853	0.12
854	0.14
855	0.16
856	0.2
857	0.28
858	0.28
859	0.29
860	0.32
861	0.33
862	0.31
863	0.3
864	0.28
865	0.22
866	0.22
867	0.25
868	0.21
869	0.2
870	0.21
871	0.2
872	0.17
873	0.17
874	0.16
875	0.12
876	0.1
877	0.12
878	0.16
879	0.17
880	0.18
881	0.23
882	0.22
883	0.23
884	0.26
885	0.29
886	0.26
887	0.33
888	0.32
889	0.26
890	0.25
891	0.25
892	0.23
893	0.19
894	0.19
895	0.13
896	0.15
897	0.14
898	0.15
899	0.15
900	0.14
901	0.14
902	0.13
903	0.1
904	0.08
905	0.1
906	0.12
907	0.12
908	0.14
909	0.17
910	0.22
911	0.23
912	0.27
913	0.28
914	0.27
915	0.27
916	0.26
917	0.22
918	0.23
919	0.31
920	0.29
921	0.34
922	0.32
923	0.31
924	0.31
925	0.29
926	0.29
927	0.23
928	0.22
929	0.18
930	0.22
931	0.23
932	0.24
933	0.26
934	0.24
935	0.23
936	0.25
937	0.31
938	0.32
939	0.37
940	0.37
941	0.36
942	0.35
943	0.36
944	0.33
945	0.3
946	0.27
947	0.23
948	0.25
949	0.28
950	0.27
951	0.24
952	0.24
953	0.22
954	0.2
955	0.2
956	0.19
957	0.16
958	0.16
959	0.19
960	0.19
961	0.18
962	0.25
963	0.27
964	0.28
965	0.35
966	0.4
967	0.39
968	0.4
969	0.44
970	0.42
971	0.44
972	0.46
973	0.43
974	0.41
975	0.39
976	0.37
977	0.33
978	0.29
979	0.26
980	0.28
981	0.25
982	0.24
983	0.24
984	0.23
985	0.26
986	0.31
987	0.32
988	0.32
989	0.41
990	0.43
991	0.46
992	0.52
993	0.52
994	0.48
995	0.46
996	0.41
997	0.36
998	0.38
999	0.38
1000	0.3
1001	0.28
1002	0.25
1003	0.24
1004	0.2
1005	0.16
1006	0.11
1007	0.1
1008	0.12
1009	0.13
1010	0.13
1011	0.13
1012	0.13
1013	0.13
1014	0.16
1015	0.14
1016	0.15
1017	0.15
1018	0.17
1019	0.18
1020	0.18
1021	0.18
1022	0.14
1023	0.14
1024	0.15
1025	0.14
1026	0.14
1027	0.19
1028	0.19
1029	0.19
1030	0.19
1031	0.21
1032	0.2
1033	0.25
1034	0.24
1035	0.18
1036	0.19
1037	0.2
1038	0.25
1039	0.27
1040	0.26
1041	0.21
1042	0.29
1043	0.31
1044	0.32
1045	0.35
1046	0.31
1047	0.3
1048	0.3
1049	0.31
1050	0.26
1051	0.25
1052	0.26
1053	0.22
1054	0.25
1055	0.25
1056	0.23
1057	0.21
1058	0.18
1059	0.16
1060	0.16
1061	0.17
1062	0.14
1063	0.12
1064	0.12
1065	0.13
1066	0.15
1067	0.16
1068	0.19
1069	0.17
1070	0.17
1071	0.18
1072	0.2
1073	0.19
1074	0.18
1075	0.16
1076	0.14
1077	0.15
1078	0.18
1079	0.17
1080	0.16
1081	0.17
1082	0.17
1083	0.2
1084	0.18
1085	0.17
1086	0.14
1087	0.16
1088	0.16
1089	0.16
1090	0.21
1091	0.26
1092	0.33
1093	0.39
1094	0.45
1095	0.54
1096	0.62
1097	0.71
1098	0.76
1099	0.78
1100	0.81
1101	0.83
1102	0.87
1103	0.86
1104	0.84
1105	0.81
1106	0.74
1107	0.67
1108	0.64
1109	0.58
1110	0.55
1111	0.46
1112	0.39
1113	0.36
1114	0.33
1115	0.29
1116	0.24
1117	0.21
1118	0.16
1119	0.21
1120	0.19
1121	0.18
1122	0.23
1123	0.25
1124	0.23
1125	0.26
1126	0.33
1127	0.33
1128	0.39
1129	0.44
1130	0.44
1131	0.49
1132	0.54
1133	0.55
1134	0.5
1135	0.46
1136	0.45
1137	0.42
1138	0.41
1139	0.37
1140	0.35
1141	0.34
1142	0.34
1143	0.33
1144	0.32
1145	0.32
1146	0.31
1147	0.32
1148	0.36
1149	0.36
1150	0.32
1151	0.32
1152	0.37
1153	0.42
1154	0.42
1155	0.44
1156	0.47
1157	0.55
1158	0.62
1159	0.67
1160	0.63
1161	0.63
1162	0.65
1163	0.63
1164	0.58
1165	0.48
1166	0.4
1167	0.34
1168	0.29
1169	0.22
1170	0.16
1171	0.13
1172	0.11
1173	0.11
1174	0.12
1175	0.14
1176	0.14
1177	0.16
1178	0.16
1179	0.21
1180	0.24
1181	0.26
1182	0.32
1183	0.32
1184	0.32
1185	0.32

C5MG54

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer