Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MG05

Protein Details
Accession C5MG05    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-50KPPATLPPITNPKRKRKRQKLFTKDIENLLHydrophilic
176-204NGKNKSDSSDKSQKKKRRKVTGNVMIEQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-40KSKPPATLPPITNPKRKRKRQK
186-194KSQKKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_04998  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSTNPSNKTESTSAESSKKSKPPATLPPITNPKRKRKRQKLFTKDIENLLYAMGDRPVSTDATVNALEDVLVEYITQVSYSMVNFAKSQNRTRVKLNDLAFTLRNDPAKLARFRYILEQSYKIERAKRMFDDNNDKYDADSKNDEDADDDEDDDNDEAKEGVENGGGTSDKLQKVNGKNKSDSSDKSQKKKRRKVTGNVMIEQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.44
3 0.42
4 0.47
5 0.49
6 0.5
7 0.51
8 0.53
9 0.55
10 0.62
11 0.66
12 0.66
13 0.62
14 0.64
15 0.7
16 0.7
17 0.71
18 0.69
19 0.72
20 0.75
21 0.83
22 0.85
23 0.86
24 0.91
25 0.93
26 0.95
27 0.95
28 0.94
29 0.92
30 0.89
31 0.81
32 0.74
33 0.64
34 0.53
35 0.43
36 0.32
37 0.23
38 0.15
39 0.12
40 0.09
41 0.07
42 0.06
43 0.07
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.09
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.05
67 0.05
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.12
73 0.19
74 0.22
75 0.26
76 0.33
77 0.38
78 0.39
79 0.44
80 0.46
81 0.43
82 0.47
83 0.44
84 0.37
85 0.32
86 0.32
87 0.28
88 0.24
89 0.22
90 0.17
91 0.17
92 0.14
93 0.14
94 0.16
95 0.2
96 0.22
97 0.22
98 0.24
99 0.24
100 0.24
101 0.29
102 0.3
103 0.27
104 0.28
105 0.28
106 0.25
107 0.29
108 0.31
109 0.28
110 0.28
111 0.29
112 0.3
113 0.32
114 0.34
115 0.37
116 0.37
117 0.42
118 0.48
119 0.46
120 0.46
121 0.43
122 0.4
123 0.33
124 0.36
125 0.31
126 0.24
127 0.24
128 0.22
129 0.23
130 0.24
131 0.23
132 0.18
133 0.18
134 0.17
135 0.15
136 0.14
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.11
156 0.17
157 0.19
158 0.2
159 0.22
160 0.29
161 0.38
162 0.47
163 0.53
164 0.53
165 0.55
166 0.59
167 0.61
168 0.6
169 0.55
170 0.55
171 0.57
172 0.59
173 0.65
174 0.71
175 0.76
176 0.8
177 0.87
178 0.88
179 0.89
180 0.9
181 0.9
182 0.92
183 0.92
184 0.89