Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SHV7

Protein Details
Accession A0A5N6SHV7    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-136ASPQKLASPRKPRSTRARESKEAHydrophilic
193-213ASTPKPTKTPRATRAKEPKGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-132PRLRRGRSASPSKKLASPQKLASPRKPRSTRARE
190-213KKSASTPKPTKTPRATRAKEPKGL
335-337RAK
342-346KLKRE
Subcellular Location(s) cyto 14, mito 6.5, mito_nucl 6.5, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037548  Bqt4  
IPR028606  Clp1  
IPR010655  Clp1_C  
IPR038238  Clp1_C_sf  
IPR032319  CLP1_P  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
Gene Ontology GO:0005849  C:mRNA cleavage factor complex  
GO:1990862  C:nuclear membrane complex Bqt3-Bqt4  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0070197  P:meiotic attachment of telomere to nuclear envelope  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06807  Clp1  
PF16575  CLP1_P  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
Amino Acid Sequences MFKIAFPWAKLEEERSEREYVKARKETSEDEIAGNVWISPILALELAKEYQMYDWVRALLDPTEIVQTPSSTKKHMQITPPPRFDLPPIEAPAQLTAAPRLRRGRSASPSKKLASPQKLASPRKPRSTRARESKEAQDVKEVKEASIVATSEANANLQSALDATAEAGSVNGTIQPSVERDEERVAPTPKKSASTPKPTKTPRATRAKEPKGLKELKEVEEVEEVVETKETKDTKEENVKVDVQTNADEAKDVQTTQTTVSVEVPISLLPDAPSAEDTEQMIAKAKEMVEEAAKLQSTDEEPVPSSSKAAKKRNIEEALSDDEEDEETKALRTKRAKVLEEKLKRERVRNRALVGVTAAFALANAMSLPGLDLTQPSADNQFAPAPPTQISLSKGSEWRFEVAFGTVIRVKNAGKTSVAKILTAYATKVERQPIVVNLDPTEGMLSVPGTLTATAFRTMMDVEEGWGSSPMSGPSAVPVKLPLVYFYPMQNPLEAEGSVYRPIVSRLALSVMGRMAEDEEARETGIIVDTPGALSQGKPGSLEMINHIVTEFSITTILVIGSERLYSLMMKNYDNKPTSSASAVASDERITVVKLSKSGGCVDRDAAFMKGVRESQIRTYFFGNPIPSTASAALSLSASSTTNVTLSPHAQQLDFNTLGIYNYTIASLEEDEDEYDPSQLGAGDSFLPGGGNDAEVNQTPQDEPARATPLPGIISSIESTTPAVASNVPLKKVSPPAPSTLANSLIAITNAPTTASAAEVRDASIMGFLYVAEVDSEKGKIRALAPVGGRVPPRAIVWGKKWPGEVVGLVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.43
3 0.45
4 0.42
5 0.45
6 0.5
7 0.49
8 0.53
9 0.56
10 0.55
11 0.56
12 0.6
13 0.6
14 0.56
15 0.56
16 0.48
17 0.41
18 0.38
19 0.33
20 0.28
21 0.23
22 0.17
23 0.09
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.05
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.17
39 0.18
40 0.18
41 0.19
42 0.2
43 0.2
44 0.2
45 0.21
46 0.15
47 0.15
48 0.13
49 0.12
50 0.15
51 0.15
52 0.16
53 0.15
54 0.15
55 0.19
56 0.26
57 0.27
58 0.28
59 0.33
60 0.38
61 0.46
62 0.51
63 0.55
64 0.59
65 0.67
66 0.73
67 0.72
68 0.69
69 0.62
70 0.58
71 0.53
72 0.49
73 0.44
74 0.41
75 0.41
76 0.39
77 0.37
78 0.36
79 0.34
80 0.27
81 0.23
82 0.18
83 0.19
84 0.24
85 0.25
86 0.31
87 0.38
88 0.4
89 0.45
90 0.5
91 0.54
92 0.57
93 0.67
94 0.69
95 0.69
96 0.73
97 0.69
98 0.67
99 0.66
100 0.66
101 0.64
102 0.6
103 0.57
104 0.6
105 0.67
106 0.7
107 0.71
108 0.72
109 0.71
110 0.76
111 0.78
112 0.77
113 0.78
114 0.82
115 0.82
116 0.83
117 0.83
118 0.8
119 0.79
120 0.79
121 0.78
122 0.72
123 0.62
124 0.61
125 0.55
126 0.51
127 0.52
128 0.44
129 0.33
130 0.31
131 0.3
132 0.22
133 0.22
134 0.19
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.09
164 0.12
165 0.14
166 0.14
167 0.16
168 0.2
169 0.22
170 0.24
171 0.29
172 0.3
173 0.32
174 0.33
175 0.36
176 0.35
177 0.35
178 0.36
179 0.4
180 0.45
181 0.52
182 0.6
183 0.6
184 0.68
185 0.71
186 0.77
187 0.76
188 0.77
189 0.76
190 0.77
191 0.76
192 0.76
193 0.82
194 0.8
195 0.78
196 0.73
197 0.7
198 0.69
199 0.71
200 0.61
201 0.6
202 0.57
203 0.52
204 0.52
205 0.45
206 0.38
207 0.33
208 0.31
209 0.22
210 0.17
211 0.15
212 0.1
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.19
220 0.21
221 0.28
222 0.38
223 0.4
224 0.38
225 0.42
226 0.43
227 0.39
228 0.39
229 0.32
230 0.23
231 0.21
232 0.19
233 0.15
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.14
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.12
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.13
290 0.16
291 0.14
292 0.15
293 0.18
294 0.24
295 0.31
296 0.39
297 0.44
298 0.48
299 0.53
300 0.61
301 0.6
302 0.54
303 0.46
304 0.42
305 0.4
306 0.33
307 0.28
308 0.19
309 0.15
310 0.15
311 0.13
312 0.1
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.1
317 0.11
318 0.17
319 0.22
320 0.28
321 0.36
322 0.43
323 0.46
324 0.49
325 0.56
326 0.61
327 0.63
328 0.64
329 0.63
330 0.64
331 0.63
332 0.65
333 0.65
334 0.64
335 0.65
336 0.63
337 0.58
338 0.54
339 0.51
340 0.43
341 0.35
342 0.26
343 0.17
344 0.12
345 0.1
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.02
352 0.02
353 0.02
354 0.02
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.15
378 0.16
379 0.16
380 0.17
381 0.2
382 0.19
383 0.21
384 0.2
385 0.19
386 0.16
387 0.15
388 0.14
389 0.11
390 0.12
391 0.09
392 0.1
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.15
399 0.16
400 0.15
401 0.14
402 0.16
403 0.18
404 0.22
405 0.22
406 0.18
407 0.17
408 0.17
409 0.17
410 0.15
411 0.13
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.13
416 0.14
417 0.13
418 0.14
419 0.15
420 0.16
421 0.2
422 0.2
423 0.18
424 0.16
425 0.16
426 0.15
427 0.14
428 0.11
429 0.07
430 0.05
431 0.05
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.05
456 0.06
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.07
462 0.1
463 0.11
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.11
471 0.12
472 0.13
473 0.14
474 0.16
475 0.17
476 0.17
477 0.17
478 0.15
479 0.14
480 0.15
481 0.13
482 0.11
483 0.09
484 0.1
485 0.11
486 0.11
487 0.1
488 0.09
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.08
493 0.08
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.08
501 0.08
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.13
528 0.14
529 0.14
530 0.13
531 0.15
532 0.15
533 0.14
534 0.14
535 0.11
536 0.1
537 0.11
538 0.09
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.06
553 0.07
554 0.08
555 0.13
556 0.15
557 0.16
558 0.23
559 0.26
560 0.33
561 0.34
562 0.33
563 0.31
564 0.31
565 0.31
566 0.27
567 0.25
568 0.18
569 0.19
570 0.19
571 0.16
572 0.15
573 0.13
574 0.12
575 0.11
576 0.1
577 0.08
578 0.09
579 0.12
580 0.12
581 0.13
582 0.15
583 0.16
584 0.17
585 0.21
586 0.23
587 0.22
588 0.22
589 0.23
590 0.22
591 0.22
592 0.22
593 0.18
594 0.16
595 0.15
596 0.15
597 0.16
598 0.15
599 0.17
600 0.18
601 0.19
602 0.26
603 0.32
604 0.33
605 0.32
606 0.35
607 0.36
608 0.35
609 0.38
610 0.32
611 0.24
612 0.24
613 0.25
614 0.22
615 0.21
616 0.19
617 0.16
618 0.14
619 0.13
620 0.13
621 0.1
622 0.09
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.08
631 0.09
632 0.11
633 0.12
634 0.15
635 0.18
636 0.18
637 0.18
638 0.19
639 0.21
640 0.25
641 0.23
642 0.2
643 0.17
644 0.16
645 0.16
646 0.15
647 0.13
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.1
659 0.11
660 0.12
661 0.11
662 0.11
663 0.1
664 0.09
665 0.08
666 0.08
667 0.07
668 0.06
669 0.07
670 0.07
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.06
675 0.06
676 0.08
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.08
681 0.1
682 0.1
683 0.12
684 0.1
685 0.12
686 0.11
687 0.15
688 0.17
689 0.17
690 0.18
691 0.21
692 0.26
693 0.25
694 0.26
695 0.24
696 0.23
697 0.23
698 0.21
699 0.19
700 0.14
701 0.16
702 0.16
703 0.15
704 0.12
705 0.12
706 0.12
707 0.11
708 0.1
709 0.09
710 0.09
711 0.09
712 0.11
713 0.19
714 0.22
715 0.23
716 0.24
717 0.25
718 0.29
719 0.36
720 0.41
721 0.4
722 0.4
723 0.44
724 0.47
725 0.48
726 0.47
727 0.43
728 0.39
729 0.31
730 0.28
731 0.24
732 0.2
733 0.18
734 0.14
735 0.12
736 0.1
737 0.09
738 0.09
739 0.08
740 0.09
741 0.09
742 0.1
743 0.11
744 0.11
745 0.13
746 0.13
747 0.14
748 0.13
749 0.13
750 0.11
751 0.1
752 0.09
753 0.08
754 0.07
755 0.06
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.06
760 0.06
761 0.07
762 0.09
763 0.11
764 0.12
765 0.13
766 0.15
767 0.17
768 0.18
769 0.24
770 0.25
771 0.3
772 0.29
773 0.35
774 0.35
775 0.36
776 0.37
777 0.32
778 0.31
779 0.27
780 0.27
781 0.28
782 0.31
783 0.34
784 0.39
785 0.47
786 0.5
787 0.52
788 0.52
789 0.46
790 0.44
791 0.39