Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SYF4

Protein Details
Accession A0A5N6SYF4    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-60SASRPRPSRRGGGRGRGNRNHRRPQTQTTERSQHydrophilic
81-104DPPADAPRSRRGPRRGRGGGRGGGBasic
177-204PTPSTTSAPTKKKPKAKNTPPPPPKVTTHydrophilic
988-1010SVSECVKLRERQRQKEREAQRLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-50RPRPSRRGGGRGRGNRNHRR
87-118PRSRRGPRRGRGGGRGGGAPSEGTSRRQRQRG
187-198KKKPKAKNTPPP
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MSGRVEVCNRLSITETMSDVPAPVAEGSASRPRPSRRGGGRGRGNRNHRRPQTQTTERSQDAQPSTQQPSQAQSTQNSPLDPPADAPRSRRGPRRGRGGGRGGGAPSEGTSRRQRQRGGDRGTTSTGRRFEGRLTKSEQAPEEEQADTAVDTNDPGLRADAPAFVPGTQPEHAPNEPTPSTTSAPTKKKPKAKNTPPPPPKVTTKSVAADIATRIHEDIAHNLYECPICTGELGRRSRVWNCGLCWTVFHLSCVKKWSKNEGAAAQDAARRQGEGDPTTPRAWRCPGCNLPQEVFPSSYTCWCEKEVDPRSLPGLPPHSCGQTCARQRKGCPHPCDATCHAGPCAPCTAMGPTQDCFCGRNSSTKRCQDTDYENGWSCGETCGDLLPCGEHTCPRPCHEGLCGDCEERIEARCYCGKVQTEMMCSSKDEEMDSQMLHDEDGEKSHVEDWTGCFSCGDQCNRPFDCGVHFCEKGCHPQDIHPAHCPRSPDVVLHCPCGKTPLTEIPGYTPRNSCEDPIPNCLEACGKILPCGHSCDKVCHTGSCGPCFRRVPVPCRCGRNSFMSICHQGTLVHPQCFRVCKAGLHCGRHACAERCCPGEQKAVERQALRRKLKSHLRPSDEDVEAEHICTRVCGRMLKCGRHTCPELCHKGPCNTCREAIFEEISCNCGRSILYPPLPCGTQPPPCSAPCERPKSCGHPQTPHNCHTDEEECPKCPYLTEKMCLCGKQMLKNVPCWLADARCGRICGATLKCGSHTCQKNCHRPGDCEDTLKPCQQPCGKTKTMCGHPCTEPCHAPYPCPEKTPCSSMITVTCGCGRLRQERRCNAAKAVASKGQLQQPQRLPAATPLTCDDECARLERNRSLASALGVDINPSTTVAQNLTATNLPYSSETLDMYIQLSSSAPLSTLQSYESTLHSLAANPTQRSVRFQPAKSSLRAFVHSLATDWGFASESFDPEPHRHVFVLKPTVWNPPLLGMGNGTAIGIGGMSVSECVKLRERQRQKEREAQRLAAAEAKAQREAVKAQANGANEGGWAQVAASRRSNASTRSTTPNPGTPARSGSMFAALAGDDGSTWGAPKKEKLVLRSGVGAGKQLRTPQAATEVVDSWEEEEEKQEQEERAREQVQELEQEQDDGQGDVQKGTSEIETTETGEAIATSSAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.21
4 0.22
5 0.2
6 0.17
7 0.16
8 0.13
9 0.12
10 0.1
11 0.09
12 0.08
13 0.09
14 0.13
15 0.22
16 0.25
17 0.27
18 0.34
19 0.4
20 0.47
21 0.53
22 0.58
23 0.58
24 0.66
25 0.72
26 0.75
27 0.8
28 0.83
29 0.87
30 0.86
31 0.87
32 0.88
33 0.89
34 0.89
35 0.88
36 0.87
37 0.84
38 0.85
39 0.85
40 0.84
41 0.82
42 0.8
43 0.79
44 0.71
45 0.67
46 0.59
47 0.57
48 0.51
49 0.48
50 0.45
51 0.43
52 0.48
53 0.46
54 0.48
55 0.41
56 0.42
57 0.44
58 0.43
59 0.41
60 0.37
61 0.4
62 0.44
63 0.44
64 0.4
65 0.35
66 0.35
67 0.32
68 0.3
69 0.28
70 0.28
71 0.32
72 0.34
73 0.37
74 0.42
75 0.49
76 0.56
77 0.63
78 0.65
79 0.69
80 0.75
81 0.82
82 0.82
83 0.81
84 0.82
85 0.8
86 0.74
87 0.66
88 0.6
89 0.5
90 0.4
91 0.33
92 0.24
93 0.17
94 0.18
95 0.17
96 0.2
97 0.29
98 0.38
99 0.47
100 0.53
101 0.59
102 0.63
103 0.73
104 0.77
105 0.76
106 0.75
107 0.7
108 0.67
109 0.66
110 0.6
111 0.53
112 0.49
113 0.44
114 0.39
115 0.37
116 0.35
117 0.38
118 0.44
119 0.44
120 0.43
121 0.46
122 0.49
123 0.51
124 0.55
125 0.49
126 0.45
127 0.44
128 0.41
129 0.36
130 0.31
131 0.27
132 0.22
133 0.2
134 0.14
135 0.12
136 0.1
137 0.08
138 0.07
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.14
148 0.12
149 0.14
150 0.14
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.17
155 0.16
156 0.16
157 0.18
158 0.22
159 0.23
160 0.26
161 0.26
162 0.29
163 0.29
164 0.29
165 0.28
166 0.27
167 0.29
168 0.29
169 0.35
170 0.37
171 0.45
172 0.52
173 0.6
174 0.64
175 0.72
176 0.78
177 0.81
178 0.84
179 0.87
180 0.89
181 0.89
182 0.92
183 0.91
184 0.89
185 0.84
186 0.78
187 0.76
188 0.71
189 0.66
190 0.6
191 0.57
192 0.51
193 0.47
194 0.43
195 0.35
196 0.3
197 0.26
198 0.24
199 0.19
200 0.17
201 0.15
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.16
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.14
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.14
218 0.18
219 0.25
220 0.28
221 0.29
222 0.31
223 0.35
224 0.38
225 0.42
226 0.43
227 0.39
228 0.38
229 0.42
230 0.41
231 0.36
232 0.34
233 0.33
234 0.31
235 0.27
236 0.27
237 0.27
238 0.26
239 0.29
240 0.35
241 0.36
242 0.37
243 0.4
244 0.48
245 0.49
246 0.53
247 0.56
248 0.53
249 0.51
250 0.46
251 0.43
252 0.35
253 0.3
254 0.25
255 0.23
256 0.18
257 0.15
258 0.15
259 0.17
260 0.2
261 0.21
262 0.23
263 0.24
264 0.28
265 0.3
266 0.32
267 0.29
268 0.29
269 0.33
270 0.34
271 0.34
272 0.4
273 0.45
274 0.49
275 0.54
276 0.54
277 0.49
278 0.48
279 0.48
280 0.41
281 0.35
282 0.29
283 0.25
284 0.22
285 0.25
286 0.24
287 0.23
288 0.22
289 0.22
290 0.26
291 0.25
292 0.35
293 0.37
294 0.4
295 0.39
296 0.39
297 0.4
298 0.37
299 0.36
300 0.31
301 0.32
302 0.26
303 0.29
304 0.3
305 0.31
306 0.29
307 0.31
308 0.31
309 0.32
310 0.4
311 0.46
312 0.52
313 0.53
314 0.56
315 0.64
316 0.69
317 0.7
318 0.67
319 0.64
320 0.63
321 0.6
322 0.63
323 0.57
324 0.52
325 0.44
326 0.39
327 0.33
328 0.29
329 0.27
330 0.22
331 0.21
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.17
336 0.17
337 0.2
338 0.2
339 0.18
340 0.18
341 0.2
342 0.19
343 0.16
344 0.15
345 0.19
346 0.18
347 0.28
348 0.33
349 0.4
350 0.49
351 0.56
352 0.59
353 0.55
354 0.57
355 0.52
356 0.53
357 0.51
358 0.46
359 0.42
360 0.38
361 0.36
362 0.33
363 0.28
364 0.22
365 0.16
366 0.12
367 0.08
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.15
379 0.22
380 0.25
381 0.27
382 0.32
383 0.31
384 0.32
385 0.33
386 0.35
387 0.29
388 0.31
389 0.29
390 0.24
391 0.24
392 0.22
393 0.2
394 0.15
395 0.15
396 0.14
397 0.13
398 0.15
399 0.19
400 0.2
401 0.2
402 0.24
403 0.24
404 0.23
405 0.28
406 0.28
407 0.28
408 0.28
409 0.28
410 0.24
411 0.23
412 0.23
413 0.19
414 0.16
415 0.14
416 0.12
417 0.13
418 0.14
419 0.13
420 0.11
421 0.11
422 0.1
423 0.09
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.08
431 0.09
432 0.1
433 0.09
434 0.1
435 0.1
436 0.16
437 0.17
438 0.16
439 0.15
440 0.15
441 0.19
442 0.23
443 0.25
444 0.24
445 0.26
446 0.33
447 0.33
448 0.34
449 0.3
450 0.26
451 0.27
452 0.25
453 0.26
454 0.25
455 0.25
456 0.23
457 0.26
458 0.27
459 0.3
460 0.29
461 0.27
462 0.23
463 0.27
464 0.37
465 0.37
466 0.38
467 0.38
468 0.39
469 0.39
470 0.4
471 0.37
472 0.3
473 0.32
474 0.3
475 0.25
476 0.26
477 0.32
478 0.32
479 0.33
480 0.32
481 0.26
482 0.25
483 0.27
484 0.23
485 0.15
486 0.17
487 0.21
488 0.22
489 0.22
490 0.23
491 0.23
492 0.29
493 0.29
494 0.28
495 0.23
496 0.22
497 0.26
498 0.27
499 0.24
500 0.23
501 0.28
502 0.28
503 0.32
504 0.33
505 0.28
506 0.27
507 0.26
508 0.22
509 0.15
510 0.15
511 0.12
512 0.1
513 0.12
514 0.13
515 0.15
516 0.15
517 0.2
518 0.19
519 0.22
520 0.23
521 0.25
522 0.26
523 0.29
524 0.29
525 0.24
526 0.25
527 0.27
528 0.28
529 0.29
530 0.31
531 0.27
532 0.32
533 0.32
534 0.31
535 0.33
536 0.35
537 0.38
538 0.42
539 0.47
540 0.47
541 0.52
542 0.52
543 0.48
544 0.47
545 0.46
546 0.41
547 0.36
548 0.34
549 0.32
550 0.33
551 0.29
552 0.26
553 0.2
554 0.16
555 0.16
556 0.23
557 0.23
558 0.22
559 0.22
560 0.23
561 0.25
562 0.27
563 0.27
564 0.21
565 0.18
566 0.18
567 0.2
568 0.28
569 0.31
570 0.32
571 0.34
572 0.31
573 0.31
574 0.31
575 0.32
576 0.26
577 0.24
578 0.25
579 0.26
580 0.26
581 0.27
582 0.26
583 0.25
584 0.28
585 0.26
586 0.27
587 0.31
588 0.33
589 0.34
590 0.34
591 0.36
592 0.39
593 0.48
594 0.47
595 0.44
596 0.43
597 0.48
598 0.57
599 0.61
600 0.63
601 0.62
602 0.63
603 0.62
604 0.64
605 0.61
606 0.52
607 0.42
608 0.32
609 0.27
610 0.22
611 0.19
612 0.15
613 0.09
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.07
618 0.09
619 0.13
620 0.14
621 0.23
622 0.29
623 0.33
624 0.39
625 0.45
626 0.46
627 0.46
628 0.49
629 0.41
630 0.43
631 0.46
632 0.45
633 0.4
634 0.42
635 0.41
636 0.44
637 0.47
638 0.45
639 0.42
640 0.38
641 0.38
642 0.34
643 0.34
644 0.29
645 0.26
646 0.23
647 0.18
648 0.17
649 0.16
650 0.17
651 0.14
652 0.12
653 0.1
654 0.09
655 0.09
656 0.09
657 0.15
658 0.19
659 0.23
660 0.23
661 0.25
662 0.25
663 0.25
664 0.23
665 0.23
666 0.21
667 0.24
668 0.24
669 0.28
670 0.3
671 0.3
672 0.36
673 0.33
674 0.38
675 0.4
676 0.47
677 0.44
678 0.45
679 0.49
680 0.52
681 0.58
682 0.57
683 0.53
684 0.51
685 0.57
686 0.63
687 0.64
688 0.61
689 0.55
690 0.47
691 0.43
692 0.41
693 0.36
694 0.29
695 0.31
696 0.29
697 0.28
698 0.29
699 0.29
700 0.24
701 0.22
702 0.23
703 0.24
704 0.26
705 0.29
706 0.28
707 0.32
708 0.34
709 0.34
710 0.31
711 0.29
712 0.27
713 0.29
714 0.34
715 0.38
716 0.37
717 0.4
718 0.41
719 0.37
720 0.35
721 0.3
722 0.27
723 0.2
724 0.24
725 0.23
726 0.24
727 0.24
728 0.24
729 0.22
730 0.2
731 0.21
732 0.21
733 0.2
734 0.2
735 0.2
736 0.2
737 0.22
738 0.23
739 0.24
740 0.28
741 0.35
742 0.34
743 0.43
744 0.51
745 0.59
746 0.63
747 0.69
748 0.64
749 0.59
750 0.62
751 0.61
752 0.54
753 0.48
754 0.45
755 0.42
756 0.41
757 0.41
758 0.37
759 0.29
760 0.34
761 0.35
762 0.4
763 0.39
764 0.44
765 0.46
766 0.44
767 0.5
768 0.51
769 0.55
770 0.55
771 0.53
772 0.49
773 0.48
774 0.51
775 0.49
776 0.45
777 0.38
778 0.35
779 0.4
780 0.36
781 0.33
782 0.37
783 0.4
784 0.38
785 0.4
786 0.38
787 0.35
788 0.38
789 0.4
790 0.36
791 0.33
792 0.31
793 0.29
794 0.29
795 0.28
796 0.25
797 0.22
798 0.2
799 0.18
800 0.17
801 0.19
802 0.22
803 0.28
804 0.37
805 0.46
806 0.54
807 0.6
808 0.67
809 0.69
810 0.68
811 0.6
812 0.57
813 0.51
814 0.45
815 0.42
816 0.39
817 0.34
818 0.34
819 0.35
820 0.35
821 0.37
822 0.36
823 0.39
824 0.4
825 0.44
826 0.42
827 0.38
828 0.33
829 0.34
830 0.38
831 0.3
832 0.27
833 0.24
834 0.28
835 0.28
836 0.28
837 0.24
838 0.19
839 0.2
840 0.21
841 0.23
842 0.21
843 0.25
844 0.26
845 0.3
846 0.28
847 0.28
848 0.27
849 0.24
850 0.21
851 0.18
852 0.16
853 0.13
854 0.11
855 0.11
856 0.1
857 0.09
858 0.08
859 0.08
860 0.08
861 0.07
862 0.08
863 0.09
864 0.1
865 0.11
866 0.11
867 0.13
868 0.13
869 0.13
870 0.13
871 0.12
872 0.11
873 0.11
874 0.12
875 0.11
876 0.11
877 0.11
878 0.12
879 0.12
880 0.11
881 0.11
882 0.09
883 0.08
884 0.07
885 0.07
886 0.06
887 0.07
888 0.06
889 0.06
890 0.07
891 0.09
892 0.1
893 0.1
894 0.11
895 0.11
896 0.13
897 0.14
898 0.14
899 0.14
900 0.14
901 0.14
902 0.13
903 0.14
904 0.14
905 0.2
906 0.24
907 0.22
908 0.24
909 0.27
910 0.28
911 0.33
912 0.36
913 0.4
914 0.43
915 0.44
916 0.51
917 0.56
918 0.59
919 0.56
920 0.55
921 0.5
922 0.46
923 0.46
924 0.4
925 0.34
926 0.33
927 0.29
928 0.26
929 0.23
930 0.2
931 0.18
932 0.15
933 0.13
934 0.1
935 0.1
936 0.13
937 0.12
938 0.13
939 0.14
940 0.15
941 0.18
942 0.19
943 0.24
944 0.22
945 0.23
946 0.22
947 0.24
948 0.27
949 0.32
950 0.38
951 0.35
952 0.37
953 0.37
954 0.45
955 0.43
956 0.4
957 0.32
958 0.26
959 0.27
960 0.23
961 0.22
962 0.14
963 0.14
964 0.13
965 0.12
966 0.1
967 0.07
968 0.06
969 0.05
970 0.04
971 0.03
972 0.02
973 0.02
974 0.03
975 0.04
976 0.04
977 0.06
978 0.07
979 0.1
980 0.16
981 0.23
982 0.31
983 0.42
984 0.52
985 0.62
986 0.72
987 0.79
988 0.81
989 0.84
990 0.84
991 0.84
992 0.79
993 0.71
994 0.64
995 0.57
996 0.51
997 0.46
998 0.38
999 0.32
1000 0.31
1001 0.3
1002 0.26
1003 0.25
1004 0.25
1005 0.23
1006 0.25
1007 0.27
1008 0.29
1009 0.27
1010 0.3
1011 0.32
1012 0.32
1013 0.31
1014 0.3
1015 0.23
1016 0.16
1017 0.16
1018 0.12
1019 0.08
1020 0.06
1021 0.05
1022 0.07
1023 0.1
1024 0.14
1025 0.17
1026 0.19
1027 0.2
1028 0.24
1029 0.27
1030 0.29
1031 0.33
1032 0.36
1033 0.38
1034 0.45
1035 0.47
1036 0.5
1037 0.51
1038 0.53
1039 0.51
1040 0.5
1041 0.49
1042 0.43
1043 0.44
1044 0.39
1045 0.36
1046 0.31
1047 0.27
1048 0.26
1049 0.22
1050 0.19
1051 0.15
1052 0.13
1053 0.12
1054 0.1
1055 0.09
1056 0.05
1057 0.05
1058 0.06
1059 0.05
1060 0.07
1061 0.1
1062 0.13
1063 0.16
1064 0.2
1065 0.25
1066 0.32
1067 0.37
1068 0.41
1069 0.46
1070 0.48
1071 0.47
1072 0.47
1073 0.43
1074 0.39
1075 0.35
1076 0.36
1077 0.31
1078 0.29
1079 0.29
1080 0.3
1081 0.31
1082 0.31
1083 0.32
1084 0.29
1085 0.32
1086 0.31
1087 0.3
1088 0.29
1089 0.26
1090 0.24
1091 0.23
1092 0.21
1093 0.16
1094 0.17
1095 0.16
1096 0.13
1097 0.15
1098 0.16
1099 0.17
1100 0.19
1101 0.22
1102 0.22
1103 0.28
1104 0.33
1105 0.34
1106 0.38
1107 0.4
1108 0.39
1109 0.37
1110 0.4
1111 0.37
1112 0.38
1113 0.35
1114 0.33
1115 0.3
1116 0.31
1117 0.28
1118 0.24
1119 0.22
1120 0.16
1121 0.16
1122 0.17
1123 0.17
1124 0.16
1125 0.17
1126 0.15
1127 0.14
1128 0.16
1129 0.15
1130 0.11
1131 0.11
1132 0.14
1133 0.15
1134 0.17
1135 0.17
1136 0.15
1137 0.14
1138 0.13
1139 0.12
1140 0.1