Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SHZ8

Protein Details
Accession A0A5N6SHZ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
710-747VAGRRAQKPETQKRRKQQLEKKRRQKEREERRNKEPVMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
713-744RRAQKPETQKRRKQQLEKKRRQKEREERRNKE
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 9.5, cyto_mito 6.5, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR019451  Rtp1_C1  
IPR019414  Rtp1_C2  
IPR039600  TANGO6/Rtp1  
Pfam View protein in Pfam  
PF10363  RTP1_C1  
PF10304  RTP1_C2  
Amino Acid Sequences MSVLSDILCDKRSSIQPVIRGRILSDIISAASDLASNAEHLSEDKKLHYRDVLVKVVEETPSPVLLSTLSSFLQSDTAPWFKSIVSSQISRVPLRQDGVLQTILFLASQLAPSLGQESQDQTSNGPHFTVQAIMQSSRLLSSVPQGMDPVHYFSIIGPQLLALIDGDDPDLSKTAAYVVGNGILCKRAYGAPGTIGHSIFLEPLFKTLTAGLDNSSKKWMLSSSNTGDDLPDRVLMPEPFLLLAVDRLRSLVLQPPNPSLVKRVVYPILVPLWGLACFTSEQQNISLHEKIMEVLQTYFAISVGEQPLKKLVDNLLWDGGSTWTYSVVPTYGVSLVKRETAESNQLNIVRLLDILQSRAKLFVGLLGADPSSEERTGDIFLYVSESWLVQSPVNERSFNKSQLGPENETESMKRKLVSAKLAETLLDNFKDILSRRPLRVLELIKQIIDGELNRSGTRRKRAGDLGTSKVSLSSLANIVPTETNTEQGNTEESDSTESLPAVFSLLSTVLASPEFSASQDTLPVLENLKSQLDKLIPYLPPSLAKPGTTSSMLLEIHLTSPAEQSQRRPYSEVSDFETHRRALTNLNSDLPPVQAEGFSLLSDLVKKSSPVLDIPSTLTLLLSIITDPSETAANDEFIYLNAIKLIGTLASRHPRTVVKTLVDRYTDRNETASLDQRLKIGESLLRTVQDLGEALTGETAKILGEGMIAVAGRRAQKPETQKRRKQQLEKKRRQKEREERRNKEPVMPPGWKVSSPTPVAKIQEDEEDDSESESPERAAHSANVIAAWAAGASSDDEPDDLRARASALSILATAIQTNLAGFGSSVASSAVDLALATLTLEQEPESAILRRASVVLLLDILKALDTIRETRGSQSLGFGFSLTDDSTGGMSWRDENVSSRGPSTIGNIPHMLQTLTFVESRETDTIVRGHIRVLIESLEAWVEKSLLWGIGAHGREGDNEPRLELGDRIAGLQIDPLSGRNESGQPRIEEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.42
3 0.49
4 0.57
5 0.62
6 0.58
7 0.53
8 0.47
9 0.44
10 0.4
11 0.33
12 0.25
13 0.2
14 0.17
15 0.16
16 0.15
17 0.1
18 0.08
19 0.08
20 0.06
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.09
28 0.12
29 0.15
30 0.17
31 0.22
32 0.29
33 0.31
34 0.35
35 0.37
36 0.41
37 0.45
38 0.5
39 0.51
40 0.44
41 0.43
42 0.41
43 0.4
44 0.34
45 0.26
46 0.22
47 0.17
48 0.17
49 0.16
50 0.14
51 0.12
52 0.12
53 0.14
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.15
61 0.12
62 0.13
63 0.16
64 0.19
65 0.19
66 0.2
67 0.2
68 0.18
69 0.22
70 0.22
71 0.22
72 0.23
73 0.24
74 0.26
75 0.32
76 0.36
77 0.34
78 0.35
79 0.34
80 0.34
81 0.34
82 0.33
83 0.29
84 0.28
85 0.31
86 0.3
87 0.24
88 0.2
89 0.19
90 0.17
91 0.14
92 0.11
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.15
105 0.16
106 0.19
107 0.2
108 0.18
109 0.24
110 0.25
111 0.24
112 0.22
113 0.2
114 0.18
115 0.18
116 0.19
117 0.13
118 0.15
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.1
127 0.08
128 0.12
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.17
133 0.18
134 0.21
135 0.21
136 0.21
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.22
142 0.19
143 0.18
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.14
174 0.12
175 0.13
176 0.16
177 0.16
178 0.18
179 0.21
180 0.24
181 0.24
182 0.23
183 0.21
184 0.19
185 0.18
186 0.14
187 0.12
188 0.11
189 0.08
190 0.1
191 0.11
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.18
200 0.19
201 0.2
202 0.22
203 0.21
204 0.2
205 0.2
206 0.21
207 0.2
208 0.24
209 0.31
210 0.31
211 0.34
212 0.35
213 0.34
214 0.32
215 0.28
216 0.24
217 0.17
218 0.14
219 0.11
220 0.11
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.08
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.12
238 0.16
239 0.2
240 0.23
241 0.25
242 0.27
243 0.31
244 0.32
245 0.31
246 0.27
247 0.27
248 0.25
249 0.24
250 0.26
251 0.24
252 0.24
253 0.23
254 0.23
255 0.18
256 0.17
257 0.15
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.14
267 0.13
268 0.14
269 0.16
270 0.18
271 0.2
272 0.24
273 0.24
274 0.18
275 0.19
276 0.18
277 0.16
278 0.15
279 0.13
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.07
288 0.05
289 0.09
290 0.11
291 0.14
292 0.14
293 0.15
294 0.18
295 0.19
296 0.19
297 0.18
298 0.17
299 0.18
300 0.2
301 0.22
302 0.19
303 0.18
304 0.18
305 0.17
306 0.15
307 0.11
308 0.09
309 0.07
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.15
327 0.16
328 0.24
329 0.24
330 0.24
331 0.25
332 0.26
333 0.25
334 0.23
335 0.21
336 0.13
337 0.11
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.12
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.08
366 0.06
367 0.06
368 0.1
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.09
375 0.1
376 0.07
377 0.09
378 0.11
379 0.17
380 0.19
381 0.21
382 0.2
383 0.27
384 0.3
385 0.32
386 0.31
387 0.28
388 0.29
389 0.35
390 0.39
391 0.34
392 0.31
393 0.31
394 0.3
395 0.28
396 0.27
397 0.23
398 0.21
399 0.19
400 0.19
401 0.17
402 0.21
403 0.24
404 0.29
405 0.28
406 0.27
407 0.28
408 0.27
409 0.25
410 0.21
411 0.19
412 0.15
413 0.13
414 0.11
415 0.09
416 0.09
417 0.12
418 0.12
419 0.15
420 0.21
421 0.24
422 0.25
423 0.29
424 0.29
425 0.3
426 0.35
427 0.33
428 0.29
429 0.32
430 0.32
431 0.27
432 0.27
433 0.24
434 0.18
435 0.16
436 0.11
437 0.08
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.17
443 0.22
444 0.29
445 0.31
446 0.3
447 0.33
448 0.38
449 0.42
450 0.44
451 0.44
452 0.41
453 0.37
454 0.36
455 0.32
456 0.26
457 0.22
458 0.15
459 0.11
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.1
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.12
476 0.08
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.09
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.09
515 0.1
516 0.1
517 0.09
518 0.11
519 0.11
520 0.11
521 0.12
522 0.16
523 0.15
524 0.17
525 0.18
526 0.16
527 0.16
528 0.17
529 0.2
530 0.16
531 0.16
532 0.15
533 0.14
534 0.16
535 0.16
536 0.15
537 0.11
538 0.14
539 0.13
540 0.12
541 0.11
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.06
547 0.07
548 0.09
549 0.12
550 0.13
551 0.16
552 0.25
553 0.29
554 0.3
555 0.32
556 0.31
557 0.33
558 0.36
559 0.35
560 0.3
561 0.3
562 0.3
563 0.3
564 0.32
565 0.26
566 0.22
567 0.21
568 0.17
569 0.18
570 0.22
571 0.26
572 0.24
573 0.26
574 0.25
575 0.25
576 0.24
577 0.2
578 0.15
579 0.09
580 0.08
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.08
595 0.1
596 0.11
597 0.11
598 0.15
599 0.15
600 0.16
601 0.17
602 0.16
603 0.15
604 0.13
605 0.12
606 0.08
607 0.07
608 0.06
609 0.05
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.05
616 0.06
617 0.05
618 0.07
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.09
623 0.08
624 0.07
625 0.1
626 0.08
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.04
634 0.05
635 0.06
636 0.11
637 0.19
638 0.2
639 0.2
640 0.23
641 0.25
642 0.29
643 0.33
644 0.32
645 0.28
646 0.33
647 0.36
648 0.38
649 0.37
650 0.34
651 0.33
652 0.36
653 0.35
654 0.3
655 0.28
656 0.24
657 0.25
658 0.27
659 0.29
660 0.26
661 0.26
662 0.26
663 0.26
664 0.26
665 0.24
666 0.2
667 0.15
668 0.14
669 0.13
670 0.15
671 0.15
672 0.15
673 0.15
674 0.15
675 0.13
676 0.12
677 0.1
678 0.08
679 0.07
680 0.07
681 0.06
682 0.07
683 0.07
684 0.06
685 0.06
686 0.05
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.03
691 0.03
692 0.03
693 0.03
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.07
699 0.1
700 0.11
701 0.14
702 0.16
703 0.22
704 0.33
705 0.44
706 0.53
707 0.61
708 0.68
709 0.76
710 0.85
711 0.89
712 0.89
713 0.89
714 0.89
715 0.9
716 0.92
717 0.93
718 0.92
719 0.92
720 0.9
721 0.9
722 0.9
723 0.9
724 0.9
725 0.91
726 0.87
727 0.85
728 0.87
729 0.78
730 0.75
731 0.71
732 0.67
733 0.63
734 0.59
735 0.52
736 0.49
737 0.49
738 0.41
739 0.37
740 0.33
741 0.32
742 0.33
743 0.34
744 0.31
745 0.33
746 0.35
747 0.33
748 0.32
749 0.27
750 0.28
751 0.27
752 0.26
753 0.23
754 0.23
755 0.21
756 0.2
757 0.19
758 0.15
759 0.13
760 0.1
761 0.1
762 0.08
763 0.1
764 0.09
765 0.11
766 0.11
767 0.12
768 0.13
769 0.13
770 0.12
771 0.11
772 0.1
773 0.08
774 0.07
775 0.04
776 0.03
777 0.03
778 0.03
779 0.05
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.07
784 0.08
785 0.1
786 0.12
787 0.11
788 0.11
789 0.11
790 0.12
791 0.12
792 0.12
793 0.11
794 0.09
795 0.09
796 0.09
797 0.09
798 0.08
799 0.08
800 0.07
801 0.06
802 0.06
803 0.05
804 0.05
805 0.06
806 0.05
807 0.05
808 0.05
809 0.06
810 0.06
811 0.06
812 0.07
813 0.06
814 0.06
815 0.06
816 0.07
817 0.05
818 0.04
819 0.04
820 0.04
821 0.04
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.05
826 0.05
827 0.06
828 0.05
829 0.06
830 0.07
831 0.07
832 0.09
833 0.1
834 0.13
835 0.14
836 0.14
837 0.15
838 0.15
839 0.14
840 0.13
841 0.12
842 0.1
843 0.1
844 0.1
845 0.1
846 0.09
847 0.09
848 0.07
849 0.07
850 0.06
851 0.07
852 0.09
853 0.12
854 0.15
855 0.18
856 0.19
857 0.22
858 0.27
859 0.27
860 0.25
861 0.26
862 0.25
863 0.23
864 0.22
865 0.19
866 0.15
867 0.13
868 0.15
869 0.11
870 0.1
871 0.08
872 0.09
873 0.09
874 0.09
875 0.09
876 0.08
877 0.09
878 0.1
879 0.12
880 0.13
881 0.14
882 0.17
883 0.22
884 0.26
885 0.27
886 0.26
887 0.25
888 0.24
889 0.24
890 0.25
891 0.26
892 0.23
893 0.25
894 0.26
895 0.26
896 0.27
897 0.27
898 0.23
899 0.16
900 0.17
901 0.15
902 0.16
903 0.16
904 0.15
905 0.16
906 0.16
907 0.21
908 0.19
909 0.19
910 0.17
911 0.2
912 0.21
913 0.22
914 0.24
915 0.2
916 0.2
917 0.22
918 0.23
919 0.21
920 0.21
921 0.18
922 0.15
923 0.15
924 0.15
925 0.12
926 0.11
927 0.11
928 0.1
929 0.09
930 0.08
931 0.1
932 0.11
933 0.09
934 0.1
935 0.1
936 0.11
937 0.17
938 0.18
939 0.16
940 0.17
941 0.17
942 0.19
943 0.23
944 0.27
945 0.27
946 0.27
947 0.27
948 0.26
949 0.27
950 0.26
951 0.22
952 0.18
953 0.17
954 0.17
955 0.17
956 0.17
957 0.16
958 0.14
959 0.16
960 0.14
961 0.12
962 0.12
963 0.13
964 0.14
965 0.15
966 0.16
967 0.16
968 0.23
969 0.26
970 0.32
971 0.36