Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M7E2

Protein Details
Accession C5M7E2    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
323-343EKYYVPQHRKIRERKLYNFYAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 23, E.R. 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG ctp:CTRG_01774  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MDLGAMTNWTPTTTATSTTLRSVAATRASALVSSVSGAFETLLSKGSTIDNIDYVSASRIIRGGQASLTILSAEEVLATATAEDIKSQATQAIWNATENLLALEWEENVYDIHRLSRPANIIFLVVFAIMVLTTLLMWYKSRYWWFNVTWTCGTVLEFLGYLGRVLSFGDMTNFDYYILQLVCLTLSPVFLMAAIYNLFGQLVVIHGRHYSWLKPMYYSYIFITCDVISLVVQAVGGGLSAVAASEYDDVDPGTYTMIAGIAFQVFSMSVFLLFWFRFVWNMYFMDVNNEKIGNPLQKKTFANYLKLLINGKSANEYKQNELEKYYVPQHRKIRERKLYNFYALGITLAVIAVFIRCIYRVVELAQGFSGYLITHEVYIMTLDATMIAICCIIFVLFHPQIIMGTGNVIGLKSMANSPQEEAECRKDGNFDQEKNVGLPNKDQTGSTSDSEEETSTIQGDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.25
4 0.27
5 0.29
6 0.29
7 0.22
8 0.23
9 0.22
10 0.22
11 0.23
12 0.21
13 0.2
14 0.2
15 0.2
16 0.19
17 0.17
18 0.14
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.07
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.11
34 0.13
35 0.14
36 0.15
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.13
48 0.16
49 0.17
50 0.16
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.06
61 0.05
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.11
78 0.13
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.17
83 0.15
84 0.15
85 0.13
86 0.12
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.1
100 0.12
101 0.14
102 0.15
103 0.2
104 0.23
105 0.23
106 0.24
107 0.21
108 0.2
109 0.17
110 0.16
111 0.12
112 0.08
113 0.06
114 0.04
115 0.04
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.02
120 0.02
121 0.03
122 0.03
123 0.04
124 0.05
125 0.07
126 0.09
127 0.13
128 0.18
129 0.21
130 0.25
131 0.3
132 0.31
133 0.37
134 0.38
135 0.39
136 0.35
137 0.33
138 0.3
139 0.24
140 0.23
141 0.16
142 0.14
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.14
199 0.18
200 0.18
201 0.19
202 0.19
203 0.22
204 0.22
205 0.22
206 0.18
207 0.17
208 0.17
209 0.16
210 0.17
211 0.12
212 0.11
213 0.09
214 0.08
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.03
257 0.04
258 0.04
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.17
273 0.17
274 0.17
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.15
279 0.18
280 0.19
281 0.21
282 0.25
283 0.26
284 0.32
285 0.33
286 0.34
287 0.4
288 0.36
289 0.37
290 0.35
291 0.36
292 0.32
293 0.33
294 0.32
295 0.23
296 0.24
297 0.2
298 0.18
299 0.2
300 0.2
301 0.21
302 0.26
303 0.28
304 0.28
305 0.34
306 0.37
307 0.33
308 0.34
309 0.33
310 0.27
311 0.28
312 0.33
313 0.33
314 0.34
315 0.41
316 0.48
317 0.54
318 0.62
319 0.68
320 0.71
321 0.75
322 0.8
323 0.8
324 0.8
325 0.76
326 0.7
327 0.61
328 0.51
329 0.42
330 0.33
331 0.25
332 0.16
333 0.11
334 0.08
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.06
345 0.07
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.17
350 0.17
351 0.18
352 0.17
353 0.16
354 0.14
355 0.13
356 0.12
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.14
383 0.14
384 0.15
385 0.15
386 0.15
387 0.15
388 0.16
389 0.16
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.09
401 0.12
402 0.15
403 0.16
404 0.18
405 0.23
406 0.24
407 0.26
408 0.29
409 0.32
410 0.32
411 0.32
412 0.32
413 0.31
414 0.32
415 0.39
416 0.43
417 0.39
418 0.42
419 0.44
420 0.45
421 0.42
422 0.45
423 0.39
424 0.32
425 0.35
426 0.36
427 0.38
428 0.37
429 0.36
430 0.33
431 0.34
432 0.36
433 0.32
434 0.28
435 0.24
436 0.25
437 0.26
438 0.24
439 0.19
440 0.16
441 0.15