Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MIR3

Protein Details
Accession C5MIR3    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-31RTVNQDQTEMKRKKKKIQQMRYSICNFVHydrophilic
326-353PPAKIQKTGKGYKTPKKSSKVKEGDENYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-18RKKK
332-343KTGKGYKTPKKS
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR014816  tRNA_MeTrfase_Gcd14  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0016429  F:tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
KEGG ctp:CTRG_05956  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08704  GCD14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51620  SAM_TRM61  
Amino Acid Sequences MQNRTVNQDQTEMKRKKKKIQQMRYSICNFVFTTFNHYLVVFIPYNMSFFEYKDTIEEGDLVLAYVTRALIKPIFVKKGEIFNTRYGHFEHDKMIGLKYGEQMPGAKGYGFIHLLYPTPELWTLSLPHRTQIVYTPDSSYIIQRLNVAPGSRIIEAGTGSASFTHSFARTVTSSGKVFTYEFHEPRYLEAKKELEEHNLTNTTITHRDVCHGGFNIENETINGDVVFLDLPSPWDAIPHLESVISTTKRVGICCFSPCIEQVDRTVKKLEELGWTNIEMVEVSSRRWGVRKEMVRTVEDAVMRIRDIQGVRKTGIEIMKRGSSEEPPAKIQKTGKGYKTPKKSSKVKEGDENYEWLNVTKSESEIKSHTSYLTFAYKVPKKEETE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.74
3 0.78
4 0.82
5 0.84
6 0.85
7 0.88
8 0.89
9 0.9
10 0.9
11 0.88
12 0.82
13 0.76
14 0.65
15 0.58
16 0.48
17 0.38
18 0.34
19 0.25
20 0.3
21 0.27
22 0.27
23 0.24
24 0.23
25 0.22
26 0.2
27 0.25
28 0.16
29 0.14
30 0.16
31 0.15
32 0.16
33 0.16
34 0.17
35 0.12
36 0.13
37 0.18
38 0.16
39 0.16
40 0.17
41 0.18
42 0.16
43 0.16
44 0.16
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.08
49 0.07
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.09
57 0.1
58 0.12
59 0.19
60 0.25
61 0.3
62 0.29
63 0.34
64 0.34
65 0.42
66 0.45
67 0.44
68 0.42
69 0.43
70 0.45
71 0.42
72 0.4
73 0.33
74 0.34
75 0.32
76 0.3
77 0.25
78 0.24
79 0.27
80 0.26
81 0.26
82 0.22
83 0.19
84 0.2
85 0.19
86 0.2
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.16
91 0.17
92 0.16
93 0.13
94 0.11
95 0.12
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.22
113 0.21
114 0.22
115 0.23
116 0.22
117 0.21
118 0.25
119 0.27
120 0.23
121 0.24
122 0.24
123 0.23
124 0.25
125 0.24
126 0.19
127 0.16
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.15
135 0.13
136 0.14
137 0.16
138 0.14
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.16
167 0.19
168 0.19
169 0.21
170 0.23
171 0.22
172 0.24
173 0.3
174 0.25
175 0.2
176 0.23
177 0.22
178 0.21
179 0.25
180 0.24
181 0.21
182 0.23
183 0.22
184 0.21
185 0.21
186 0.2
187 0.17
188 0.16
189 0.14
190 0.13
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.14
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.14
199 0.14
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.1
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.14
234 0.18
235 0.19
236 0.2
237 0.2
238 0.17
239 0.19
240 0.21
241 0.22
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.22
246 0.2
247 0.19
248 0.22
249 0.3
250 0.3
251 0.31
252 0.33
253 0.28
254 0.28
255 0.29
256 0.27
257 0.24
258 0.27
259 0.28
260 0.26
261 0.26
262 0.25
263 0.23
264 0.21
265 0.13
266 0.1
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.13
271 0.14
272 0.15
273 0.19
274 0.21
275 0.24
276 0.33
277 0.4
278 0.42
279 0.49
280 0.51
281 0.49
282 0.49
283 0.44
284 0.39
285 0.31
286 0.27
287 0.21
288 0.18
289 0.17
290 0.16
291 0.14
292 0.15
293 0.16
294 0.23
295 0.27
296 0.3
297 0.3
298 0.3
299 0.3
300 0.31
301 0.36
302 0.31
303 0.28
304 0.28
305 0.31
306 0.3
307 0.32
308 0.3
309 0.26
310 0.32
311 0.36
312 0.35
313 0.37
314 0.43
315 0.42
316 0.45
317 0.46
318 0.45
319 0.48
320 0.53
321 0.54
322 0.59
323 0.67
324 0.71
325 0.77
326 0.8
327 0.8
328 0.81
329 0.85
330 0.84
331 0.85
332 0.85
333 0.81
334 0.8
335 0.77
336 0.76
337 0.68
338 0.62
339 0.52
340 0.44
341 0.39
342 0.29
343 0.25
344 0.18
345 0.18
346 0.17
347 0.18
348 0.23
349 0.24
350 0.27
351 0.28
352 0.33
353 0.33
354 0.33
355 0.33
356 0.27
357 0.27
358 0.27
359 0.29
360 0.25
361 0.24
362 0.33
363 0.37
364 0.41
365 0.46