Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MH39

Protein Details
Accession C5MH39    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-112SSVNSSKKSTPQKQSPLIRKSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, cyto 3.5, mito 3, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
KEGG ctp:CTRG_05393  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09402  MSC  
Amino Acid Sequences MEKSFRQVDPDMAKSLGITIQGFQPPVITTPLKEELARKRQPAQDASTPMKDNKKVITPRKSSSKVSTPKHSKDNVTPISSRKSVSSSAKKSSVNSSKKSTPQKQSPLIRKSALTPKPRLLSLGSQKYETDSDEDDEDEDNSEVNLSKTSEAETSYIASNKGSISFSKFLGSMILWIFVVGSGLFGLWYYEQKYSVGYCGQEIDQLTFSDSNNIYLESIGKFLDDNFKPNCISCPKYSRCHPNLKLSCMENFMESKPWYDFIVPGHKKCIPDTKKAEKLEIMIDVALDLLRSKNAAIQCGLGTDDEECGIKLEDLHDLLLSIKAPYITLEEFEELWEKSKRSPNLQSAEFTFDINDAETKEKETYKIFRSTSLSNISLKCQIHNSIVGGLTQYKSRIITIVLIALVIKFIQIKYKNYQLELAKIDIIYEEVLNKLKTQSKIGQESNNPETYSYIGSNQLRDSILSNENNLNQRLKLWKQVVDKVERNSNVSHRIIEHHGEIMKVWEWIGVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.22
4 0.17
5 0.14
6 0.13
7 0.17
8 0.2
9 0.21
10 0.19
11 0.19
12 0.18
13 0.19
14 0.23
15 0.19
16 0.17
17 0.23
18 0.28
19 0.29
20 0.3
21 0.35
22 0.41
23 0.5
24 0.56
25 0.54
26 0.57
27 0.61
28 0.66
29 0.65
30 0.62
31 0.6
32 0.6
33 0.62
34 0.6
35 0.57
36 0.55
37 0.57
38 0.54
39 0.49
40 0.47
41 0.51
42 0.55
43 0.62
44 0.67
45 0.65
46 0.69
47 0.75
48 0.76
49 0.72
50 0.7
51 0.7
52 0.7
53 0.7
54 0.73
55 0.73
56 0.74
57 0.77
58 0.75
59 0.7
60 0.69
61 0.73
62 0.68
63 0.63
64 0.6
65 0.55
66 0.56
67 0.52
68 0.45
69 0.37
70 0.34
71 0.35
72 0.42
73 0.48
74 0.47
75 0.52
76 0.57
77 0.57
78 0.56
79 0.59
80 0.6
81 0.57
82 0.56
83 0.57
84 0.58
85 0.64
86 0.73
87 0.72
88 0.71
89 0.73
90 0.77
91 0.8
92 0.82
93 0.84
94 0.8
95 0.75
96 0.68
97 0.59
98 0.56
99 0.57
100 0.55
101 0.53
102 0.51
103 0.52
104 0.53
105 0.53
106 0.48
107 0.41
108 0.42
109 0.44
110 0.48
111 0.43
112 0.41
113 0.41
114 0.41
115 0.39
116 0.31
117 0.24
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.14
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.15
152 0.17
153 0.17
154 0.18
155 0.17
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.06
166 0.07
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.11
203 0.13
204 0.08
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.15
211 0.14
212 0.18
213 0.18
214 0.2
215 0.2
216 0.2
217 0.24
218 0.2
219 0.23
220 0.23
221 0.32
222 0.34
223 0.4
224 0.45
225 0.52
226 0.53
227 0.6
228 0.6
229 0.62
230 0.61
231 0.6
232 0.57
233 0.48
234 0.43
235 0.36
236 0.32
237 0.22
238 0.19
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.13
244 0.14
245 0.13
246 0.12
247 0.13
248 0.11
249 0.22
250 0.23
251 0.23
252 0.26
253 0.28
254 0.28
255 0.29
256 0.37
257 0.31
258 0.38
259 0.45
260 0.51
261 0.56
262 0.56
263 0.56
264 0.46
265 0.44
266 0.36
267 0.28
268 0.2
269 0.12
270 0.1
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.04
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.1
322 0.13
323 0.15
324 0.15
325 0.19
326 0.27
327 0.3
328 0.35
329 0.43
330 0.48
331 0.51
332 0.52
333 0.49
334 0.43
335 0.45
336 0.39
337 0.31
338 0.23
339 0.17
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.08
344 0.11
345 0.11
346 0.13
347 0.15
348 0.16
349 0.18
350 0.21
351 0.26
352 0.28
353 0.36
354 0.34
355 0.36
356 0.39
357 0.38
358 0.39
359 0.39
360 0.36
361 0.32
362 0.33
363 0.31
364 0.34
365 0.32
366 0.29
367 0.27
368 0.27
369 0.25
370 0.26
371 0.25
372 0.2
373 0.2
374 0.19
375 0.16
376 0.16
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.12
381 0.13
382 0.13
383 0.13
384 0.12
385 0.14
386 0.13
387 0.14
388 0.12
389 0.11
390 0.11
391 0.09
392 0.08
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.14
398 0.19
399 0.24
400 0.28
401 0.37
402 0.4
403 0.4
404 0.46
405 0.4
406 0.42
407 0.4
408 0.37
409 0.29
410 0.26
411 0.25
412 0.18
413 0.17
414 0.12
415 0.09
416 0.08
417 0.09
418 0.12
419 0.12
420 0.13
421 0.17
422 0.23
423 0.25
424 0.31
425 0.36
426 0.42
427 0.5
428 0.53
429 0.56
430 0.56
431 0.61
432 0.61
433 0.57
434 0.49
435 0.41
436 0.38
437 0.32
438 0.29
439 0.23
440 0.19
441 0.23
442 0.25
443 0.27
444 0.26
445 0.27
446 0.24
447 0.24
448 0.24
449 0.22
450 0.27
451 0.26
452 0.28
453 0.29
454 0.34
455 0.39
456 0.39
457 0.37
458 0.3
459 0.33
460 0.38
461 0.38
462 0.42
463 0.42
464 0.47
465 0.51
466 0.59
467 0.62
468 0.63
469 0.66
470 0.63
471 0.66
472 0.61
473 0.57
474 0.54
475 0.53
476 0.51
477 0.47
478 0.44
479 0.36
480 0.39
481 0.41
482 0.4
483 0.36
484 0.33
485 0.32
486 0.3
487 0.28
488 0.27
489 0.23
490 0.19
491 0.17