Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M315

Protein Details
Accession C5M315    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
643-665AEVVRKLPTRVKKRRTVDFIEEEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR008847  Suf  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0071008  C:U2-type post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003688  F:DNA replication origin binding  
GO:0000354  P:cis assembly of pre-catalytic spliceosome  
GO:0006270  P:DNA replication initiation  
KEGG ctp:CTRG_00454  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05843  Suf  
Amino Acid Sequences MEDQDTRDQVTSKEILDVAFEKGKSTFTTPRQTIQDIEELNSYQQTKRREFEQHIHKNRLNLKQWIRYAKWEVENNHDFARARSIFERALDVNIEHIPFWVQYIELELAHKNINHARNLLDRAVKTLPRVNKLWFLYVLTEEMLKNYQMVRSVFEKWLEWHPDVSAWDAYISFEARYEEIDNVRSIFKRYLAEFPEGTTWCKWLDYEIENNEKDIPTIRAVFESAIDTLLVENPEDENIFDIVVRWSDWEASCNESDRALEIYKILLDGKIKISLNLRSRLQIAFNELKSKITRGTNTSGTSDQGKKQNQYLSAIKQNPNDYDSWWLYIKSLENNGAKSINEVRNSFISVTSNKPTDTFKSGDWRKYIMFWIWYAMWEEFVNGDINSSRRIWNDCLKIIPHSQFSFAKIWIGYAEFELRNNSEGGLTKLRKILGKAIGQTSTHGPKTKIFRYYIDFEKKLGEWDRVRLLYQKWLEAAISTDSPAEQILQSYLEFESSLEEYDRCDLILSVAIDLANSNETGGSLDKDTVFGLSVEFYRDEMKYDKIRELYRALLENEPTANNWISFALFESSIPSAKQLDEFLLGNSEEFEATVDEEQISKTRKLFTEAESYFKEKRDNESRLAVLEAWKEYEEINGTDDSLAEVVRKLPTRVKKRRTVDFIEEEYMEYVFPGDEEDQAPKGMSKFLANAKKWAATST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.22
4 0.23
5 0.22
6 0.24
7 0.23
8 0.22
9 0.22
10 0.24
11 0.23
12 0.28
13 0.32
14 0.35
15 0.45
16 0.47
17 0.53
18 0.56
19 0.56
20 0.52
21 0.47
22 0.46
23 0.37
24 0.37
25 0.33
26 0.28
27 0.27
28 0.28
29 0.27
30 0.24
31 0.28
32 0.34
33 0.37
34 0.4
35 0.45
36 0.5
37 0.55
38 0.61
39 0.67
40 0.7
41 0.73
42 0.79
43 0.75
44 0.74
45 0.75
46 0.75
47 0.71
48 0.7
49 0.69
50 0.68
51 0.74
52 0.75
53 0.69
54 0.67
55 0.67
56 0.65
57 0.64
58 0.62
59 0.58
60 0.58
61 0.59
62 0.54
63 0.49
64 0.45
65 0.38
66 0.32
67 0.38
68 0.3
69 0.29
70 0.28
71 0.3
72 0.28
73 0.29
74 0.32
75 0.23
76 0.24
77 0.22
78 0.2
79 0.19
80 0.19
81 0.19
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.13
87 0.1
88 0.08
89 0.08
90 0.11
91 0.12
92 0.11
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.16
97 0.17
98 0.17
99 0.23
100 0.27
101 0.28
102 0.29
103 0.3
104 0.34
105 0.37
106 0.38
107 0.36
108 0.31
109 0.33
110 0.37
111 0.36
112 0.33
113 0.36
114 0.39
115 0.38
116 0.41
117 0.4
118 0.43
119 0.43
120 0.43
121 0.37
122 0.33
123 0.29
124 0.27
125 0.25
126 0.17
127 0.17
128 0.13
129 0.14
130 0.13
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.16
136 0.17
137 0.19
138 0.21
139 0.25
140 0.26
141 0.26
142 0.26
143 0.24
144 0.31
145 0.33
146 0.31
147 0.28
148 0.26
149 0.26
150 0.26
151 0.26
152 0.18
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.18
171 0.17
172 0.18
173 0.18
174 0.19
175 0.21
176 0.23
177 0.28
178 0.29
179 0.32
180 0.29
181 0.28
182 0.31
183 0.29
184 0.29
185 0.23
186 0.21
187 0.17
188 0.18
189 0.16
190 0.12
191 0.16
192 0.16
193 0.22
194 0.26
195 0.31
196 0.31
197 0.32
198 0.32
199 0.27
200 0.24
201 0.2
202 0.17
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.15
208 0.15
209 0.13
210 0.12
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.13
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.14
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.15
258 0.14
259 0.16
260 0.19
261 0.24
262 0.29
263 0.32
264 0.32
265 0.28
266 0.3
267 0.29
268 0.28
269 0.22
270 0.23
271 0.23
272 0.23
273 0.26
274 0.24
275 0.26
276 0.24
277 0.25
278 0.23
279 0.21
280 0.23
281 0.23
282 0.27
283 0.29
284 0.3
285 0.31
286 0.27
287 0.25
288 0.27
289 0.25
290 0.25
291 0.29
292 0.3
293 0.3
294 0.33
295 0.36
296 0.33
297 0.35
298 0.35
299 0.32
300 0.36
301 0.4
302 0.4
303 0.39
304 0.4
305 0.36
306 0.34
307 0.3
308 0.23
309 0.23
310 0.2
311 0.19
312 0.17
313 0.16
314 0.14
315 0.15
316 0.16
317 0.12
318 0.13
319 0.17
320 0.18
321 0.18
322 0.19
323 0.18
324 0.17
325 0.17
326 0.22
327 0.2
328 0.21
329 0.21
330 0.22
331 0.22
332 0.23
333 0.21
334 0.15
335 0.13
336 0.12
337 0.15
338 0.16
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.18
344 0.2
345 0.18
346 0.17
347 0.26
348 0.3
349 0.33
350 0.33
351 0.32
352 0.28
353 0.28
354 0.29
355 0.21
356 0.18
357 0.14
358 0.15
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.11
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.06
370 0.07
371 0.06
372 0.07
373 0.09
374 0.1
375 0.11
376 0.12
377 0.15
378 0.18
379 0.25
380 0.28
381 0.27
382 0.28
383 0.27
384 0.29
385 0.29
386 0.28
387 0.24
388 0.21
389 0.24
390 0.23
391 0.25
392 0.24
393 0.2
394 0.2
395 0.16
396 0.16
397 0.12
398 0.12
399 0.09
400 0.08
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.12
408 0.11
409 0.09
410 0.1
411 0.13
412 0.19
413 0.19
414 0.2
415 0.22
416 0.24
417 0.24
418 0.25
419 0.28
420 0.27
421 0.29
422 0.3
423 0.3
424 0.3
425 0.29
426 0.29
427 0.27
428 0.25
429 0.24
430 0.24
431 0.23
432 0.26
433 0.33
434 0.37
435 0.39
436 0.36
437 0.37
438 0.39
439 0.43
440 0.47
441 0.48
442 0.43
443 0.38
444 0.39
445 0.36
446 0.36
447 0.33
448 0.31
449 0.24
450 0.27
451 0.32
452 0.3
453 0.31
454 0.3
455 0.29
456 0.3
457 0.3
458 0.28
459 0.23
460 0.23
461 0.22
462 0.18
463 0.18
464 0.12
465 0.11
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.12
489 0.12
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.08
494 0.12
495 0.11
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.08
521 0.09
522 0.09
523 0.1
524 0.12
525 0.12
526 0.14
527 0.15
528 0.2
529 0.25
530 0.27
531 0.31
532 0.34
533 0.36
534 0.37
535 0.38
536 0.36
537 0.34
538 0.35
539 0.33
540 0.31
541 0.3
542 0.28
543 0.26
544 0.23
545 0.2
546 0.19
547 0.18
548 0.14
549 0.14
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.12
554 0.1
555 0.1
556 0.1
557 0.12
558 0.12
559 0.13
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.13
564 0.15
565 0.13
566 0.13
567 0.15
568 0.15
569 0.14
570 0.15
571 0.14
572 0.13
573 0.13
574 0.12
575 0.09
576 0.09
577 0.09
578 0.07
579 0.08
580 0.09
581 0.09
582 0.08
583 0.09
584 0.1
585 0.15
586 0.18
587 0.19
588 0.21
589 0.27
590 0.28
591 0.33
592 0.36
593 0.35
594 0.41
595 0.4
596 0.43
597 0.41
598 0.45
599 0.42
600 0.41
601 0.44
602 0.36
603 0.44
604 0.49
605 0.5
606 0.5
607 0.53
608 0.51
609 0.46
610 0.45
611 0.37
612 0.31
613 0.29
614 0.25
615 0.21
616 0.2
617 0.19
618 0.17
619 0.19
620 0.18
621 0.15
622 0.16
623 0.14
624 0.15
625 0.14
626 0.14
627 0.12
628 0.1
629 0.09
630 0.08
631 0.08
632 0.1
633 0.15
634 0.18
635 0.2
636 0.28
637 0.38
638 0.49
639 0.59
640 0.67
641 0.72
642 0.77
643 0.85
644 0.85
645 0.83
646 0.81
647 0.78
648 0.73
649 0.67
650 0.59
651 0.5
652 0.42
653 0.33
654 0.24
655 0.16
656 0.11
657 0.07
658 0.07
659 0.09
660 0.09
661 0.11
662 0.13
663 0.16
664 0.17
665 0.17
666 0.18
667 0.18
668 0.18
669 0.19
670 0.19
671 0.19
672 0.23
673 0.32
674 0.41
675 0.41
676 0.46
677 0.47
678 0.5