Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SIR0

Protein Details
Accession A0A5N6SIR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
185-225HSHHHHSHHGHHHHHRHKHRHGHRHHRHHRSHSRHSSHSGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-217HHHHHRHKHRHGHRHHRHHRSHS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 16, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008816  Gly_zipper_2TM_dom  
Gene Ontology GO:0019867  C:outer membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF05433  Rick_17kDa_Anti  
Amino Acid Sequences MSDPYAQHPHYTPPGPGPEANFYAPADSLYQNPPYDYESQHPYSQQFPPNQSAQYGSQYDLAQTPRSYPAQMSGPQQDYLNPASAGGFEQDRDRRGSNADYYNASTNEQDQHYSQSSHPHGADNTSDNEGTERNLAGALAGGAGGYYLGHQSNHGLLGAVGGAILGNFVGDKMEGKPEEDEHRHHSHHHHSHHGHHHHHRHKHRHGHRHHRHHRSHSRHSSHSGSY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.4
4 0.38
5 0.36
6 0.37
7 0.36
8 0.32
9 0.26
10 0.24
11 0.22
12 0.19
13 0.16
14 0.14
15 0.15
16 0.17
17 0.21
18 0.2
19 0.21
20 0.21
21 0.22
22 0.24
23 0.24
24 0.25
25 0.27
26 0.3
27 0.32
28 0.33
29 0.32
30 0.33
31 0.37
32 0.39
33 0.37
34 0.38
35 0.4
36 0.41
37 0.4
38 0.36
39 0.33
40 0.29
41 0.29
42 0.26
43 0.23
44 0.23
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.21
49 0.19
50 0.17
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.2
55 0.17
56 0.19
57 0.21
58 0.23
59 0.25
60 0.27
61 0.28
62 0.28
63 0.27
64 0.25
65 0.23
66 0.22
67 0.2
68 0.14
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.09
74 0.07
75 0.06
76 0.11
77 0.13
78 0.14
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.2
83 0.22
84 0.22
85 0.23
86 0.23
87 0.22
88 0.22
89 0.24
90 0.22
91 0.2
92 0.16
93 0.14
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.12
98 0.14
99 0.15
100 0.17
101 0.16
102 0.2
103 0.21
104 0.22
105 0.22
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.14
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.09
119 0.08
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.03
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.06
160 0.12
161 0.12
162 0.14
163 0.16
164 0.19
165 0.27
166 0.29
167 0.32
168 0.33
169 0.39
170 0.39
171 0.4
172 0.44
173 0.47
174 0.52
175 0.53
176 0.57
177 0.55
178 0.62
179 0.69
180 0.71
181 0.69
182 0.7
183 0.76
184 0.76
185 0.82
186 0.84
187 0.85
188 0.87
189 0.89
190 0.89
191 0.89
192 0.9
193 0.91
194 0.92
195 0.93
196 0.93
197 0.93
198 0.92
199 0.93
200 0.93
201 0.91
202 0.91
203 0.91
204 0.88
205 0.83
206 0.8