Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDA6

Protein Details
Accession C5MDA6    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
371-401IERKRHENSSKSKQEKKKELDRKKDINIKPEBasic
447-469SGSGKSTAIKQKSNKTKRKSKKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
370-394AIERKRHENSSKSKQEKKKELDRKK
456-469KQKSNKTKRKSKKV
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 8, mito 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036291  NAD(P)-bd_dom_sf  
IPR002347  SDR_fam  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG ctp:CTRG_04207  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00106  adh_short  
Amino Acid Sequences MPVNFLTSVVFDGPEVIPYWKQIKEYGPIVGPILLTLGGLKYYSHGATNTWDRDMHGKVFMITGGTSGIGAEIVYELGKRGAQLILLTRRTNDQWIAEYIEDLRDKTNNGLIYAEECDLNSLYSIRKFATKWLDNTPPRRLDGVICCAAECIPKGGLKQFTIDGIEKQMGINYLAHFHLLTLLGPSLRVQPPDRDVRVLIATCSSQNLGDVELEDLLWENKEYPKNQPWKIYGSSKLLLGLFAKEYQRQLMAYERKDQTPCNVRINMVNPGLVRTPSTRRFISMGSIWGLFLYLIMFPIWWLFLKSVTQGAQSFYFALFAPIFMKIEGGNIIQECKIMTKARKEYTDEELQVKIFKQTEELIKKIEMKSAIERKRHENSSKSKQEKKKELDRKKDINIKPETPEELEYKLNTLRNQIGIGIGNGNNGDPNEMPLFPDDEALKSVGNSGSGKSTAIKQKSNKTKRKSKKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.19
6 0.24
7 0.23
8 0.25
9 0.28
10 0.31
11 0.35
12 0.37
13 0.37
14 0.34
15 0.32
16 0.32
17 0.28
18 0.23
19 0.17
20 0.15
21 0.1
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.11
30 0.12
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.2
35 0.29
36 0.3
37 0.29
38 0.29
39 0.28
40 0.33
41 0.36
42 0.32
43 0.26
44 0.24
45 0.23
46 0.23
47 0.21
48 0.17
49 0.13
50 0.11
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.11
71 0.18
72 0.25
73 0.29
74 0.29
75 0.29
76 0.32
77 0.33
78 0.35
79 0.31
80 0.25
81 0.24
82 0.25
83 0.27
84 0.24
85 0.23
86 0.19
87 0.21
88 0.19
89 0.17
90 0.17
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.21
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.16
102 0.12
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.1
110 0.11
111 0.13
112 0.12
113 0.15
114 0.16
115 0.22
116 0.31
117 0.34
118 0.36
119 0.41
120 0.51
121 0.54
122 0.6
123 0.61
124 0.54
125 0.51
126 0.49
127 0.43
128 0.38
129 0.36
130 0.37
131 0.32
132 0.29
133 0.27
134 0.26
135 0.25
136 0.21
137 0.16
138 0.12
139 0.1
140 0.12
141 0.13
142 0.17
143 0.2
144 0.19
145 0.21
146 0.19
147 0.19
148 0.2
149 0.2
150 0.16
151 0.15
152 0.15
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.11
174 0.12
175 0.15
176 0.16
177 0.18
178 0.23
179 0.3
180 0.31
181 0.27
182 0.26
183 0.25
184 0.26
185 0.23
186 0.19
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.09
208 0.13
209 0.14
210 0.2
211 0.28
212 0.36
213 0.39
214 0.43
215 0.41
216 0.43
217 0.45
218 0.43
219 0.4
220 0.36
221 0.33
222 0.28
223 0.27
224 0.22
225 0.19
226 0.15
227 0.12
228 0.08
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.12
237 0.18
238 0.23
239 0.23
240 0.31
241 0.31
242 0.34
243 0.35
244 0.34
245 0.33
246 0.36
247 0.38
248 0.36
249 0.36
250 0.34
251 0.35
252 0.38
253 0.36
254 0.27
255 0.25
256 0.19
257 0.2
258 0.2
259 0.17
260 0.16
261 0.13
262 0.19
263 0.23
264 0.28
265 0.26
266 0.27
267 0.29
268 0.28
269 0.28
270 0.23
271 0.2
272 0.17
273 0.17
274 0.15
275 0.13
276 0.12
277 0.08
278 0.07
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.11
294 0.11
295 0.13
296 0.13
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.14
301 0.12
302 0.12
303 0.1
304 0.11
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.09
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.1
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.12
324 0.16
325 0.21
326 0.29
327 0.37
328 0.42
329 0.47
330 0.5
331 0.51
332 0.52
333 0.55
334 0.48
335 0.42
336 0.38
337 0.34
338 0.31
339 0.28
340 0.25
341 0.19
342 0.17
343 0.17
344 0.19
345 0.28
346 0.31
347 0.32
348 0.31
349 0.32
350 0.37
351 0.36
352 0.36
353 0.29
354 0.27
355 0.35
356 0.42
357 0.48
358 0.49
359 0.52
360 0.55
361 0.61
362 0.67
363 0.64
364 0.63
365 0.65
366 0.7
367 0.77
368 0.78
369 0.8
370 0.8
371 0.84
372 0.85
373 0.84
374 0.84
375 0.85
376 0.87
377 0.88
378 0.89
379 0.87
380 0.86
381 0.87
382 0.81
383 0.79
384 0.76
385 0.69
386 0.64
387 0.59
388 0.54
389 0.46
390 0.45
391 0.38
392 0.33
393 0.31
394 0.27
395 0.27
396 0.27
397 0.29
398 0.27
399 0.29
400 0.3
401 0.29
402 0.29
403 0.26
404 0.24
405 0.21
406 0.21
407 0.2
408 0.16
409 0.16
410 0.15
411 0.15
412 0.14
413 0.13
414 0.15
415 0.11
416 0.14
417 0.16
418 0.16
419 0.17
420 0.17
421 0.19
422 0.16
423 0.19
424 0.17
425 0.16
426 0.17
427 0.17
428 0.16
429 0.14
430 0.17
431 0.14
432 0.16
433 0.16
434 0.15
435 0.18
436 0.18
437 0.19
438 0.18
439 0.26
440 0.32
441 0.38
442 0.45
443 0.49
444 0.59
445 0.69
446 0.78
447 0.8
448 0.81
449 0.86