FuNGI

A0A5N6T267

Protein Details

Accession

A0A5N6T267

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-51	GSNGPPPMRIRRPKAADPLVRPKKKPTAKPAIPTSGN	Hydrophilic
132-153	DENQFTRPVRLQRRDPRARSHE	Hydrophilic
520-541	GTDTSRKKGKSKNPSSQPTQPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-45	PMRIRRPKAADPLVRPKKKPTAKPA
412-434	EKKEKEARRVLGKKVRKALQKRE
492-509	PKHTDPLKKGTAAAPRKR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MATPTNDLNARTPTGSNGPPPMRIRRPKAADPLVRPKKKPTAKPAIPTSGNGPALKAASSRPATSNPPSMPHSERGKPSSSGADFSANGFSGPLLSETYTDYPLVTTKRALREGLKHHIARFASKKTVDPRDENQFTRPVRLQRRDPRARSHEMTSEKSQGMQKTTSESSHQIDEAEREELEARKAAREKERAENLAQIAPSAGSAPKRANVPKQKTQQVSKTDMTPEEMAKTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLEATGKMRMIPVEKWYRFNAKNQFKALTIEEAEKFMAKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPSGVEGLEAGEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEDAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKDYEQEELREKKEKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDDESSDDSEAERLKEEERKAEEEKNKKDITTSSKGNNTPSGRPKHTDPLKKGTAAAPRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKGKSKNPSSQPTQPSSRNIKFPISSPRSTRELTPLQLGKKRVRNVPLGGAGSGSDADGGAGSGAEMSESGKTKKLKLNPPAVSQGGTPQGSRAGSPTPLAGRSFSGSRASSPESFRGQTRVSTPVHAGNQSFPTPAEIHAAIPPSGILSSDLLKIFRPRIGESKENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGTLKES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.33
3	0.33
4	0.38
5	0.38
6	0.43
7	0.48
8	0.54
9	0.58
10	0.65
11	0.68
12	0.7
13	0.75
14	0.76
15	0.81
16	0.81
17	0.79
18	0.78
19	0.81
20	0.82
21	0.82
22	0.77
23	0.75
24	0.76
25	0.77
26	0.78
27	0.77
28	0.78
29	0.78
30	0.84
31	0.83
32	0.82
33	0.74
34	0.66
35	0.6
36	0.57
37	0.53
38	0.44
39	0.36
40	0.29
41	0.28
42	0.27
43	0.23
44	0.17
45	0.21
46	0.24
47	0.26
48	0.26
49	0.3
50	0.35
51	0.4
52	0.46
53	0.39
54	0.41
55	0.42
56	0.45
57	0.45
58	0.47
59	0.49
60	0.48
61	0.53
62	0.52
63	0.54
64	0.5
65	0.48
66	0.49
67	0.43
68	0.38
69	0.33
70	0.32
71	0.28
72	0.28
73	0.27
74	0.19
75	0.17
76	0.15
77	0.13
78	0.09
79	0.1
80	0.09
81	0.08
82	0.08
83	0.09
84	0.13
85	0.15
86	0.16
87	0.15
88	0.14
89	0.14
90	0.17
91	0.19
92	0.17
93	0.2
94	0.25
95	0.31
96	0.34
97	0.37
98	0.38
99	0.44
100	0.5
101	0.55
102	0.57
103	0.53
104	0.51
105	0.54
106	0.5
107	0.49
108	0.48
109	0.44
110	0.43
111	0.42
112	0.47
113	0.49
114	0.58
115	0.56
116	0.56
117	0.56
118	0.59
119	0.63
120	0.59
121	0.54
122	0.52
123	0.47
124	0.48
125	0.48
126	0.47
127	0.52
128	0.58
129	0.64
130	0.66
131	0.76
132	0.8
133	0.8
134	0.81
135	0.78
136	0.78
137	0.72
138	0.67
139	0.64
140	0.59
141	0.59
142	0.53
143	0.51
144	0.43
145	0.42
146	0.42
147	0.38
148	0.36
149	0.32
150	0.28
151	0.29
152	0.31
153	0.29
154	0.28
155	0.28
156	0.27
157	0.27
158	0.26
159	0.21
160	0.2
161	0.2
162	0.19
163	0.16
164	0.14
165	0.13
166	0.15
167	0.15
168	0.15
169	0.16
170	0.15
171	0.19
172	0.23
173	0.28
174	0.34
175	0.4
176	0.43
177	0.49
178	0.55
179	0.52
180	0.5
181	0.49
182	0.43
183	0.38
184	0.33
185	0.24
186	0.18
187	0.15
188	0.13
189	0.1
190	0.1
191	0.08
192	0.11
193	0.12
194	0.14
195	0.2
196	0.24
197	0.33
198	0.42
199	0.49
200	0.56
201	0.63
202	0.69
203	0.7
204	0.72
205	0.71
206	0.66
207	0.65
208	0.57
209	0.52
210	0.47
211	0.41
212	0.38
213	0.31
214	0.26
215	0.23
216	0.23
217	0.22
218	0.22
219	0.23
220	0.22
221	0.22
222	0.23
223	0.21
224	0.22
225	0.26
226	0.27
227	0.3
228	0.28
229	0.27
230	0.25
231	0.24
232	0.22
233	0.18
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.16
242	0.13
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.09
267	0.11
268	0.17
269	0.26
270	0.28
271	0.31
272	0.33
273	0.4
274	0.4
275	0.46
276	0.5
277	0.48
278	0.52
279	0.52
280	0.51
281	0.43
282	0.44
283	0.38
284	0.3
285	0.23
286	0.2
287	0.18
288	0.17
289	0.16
290	0.14
291	0.13
292	0.13
293	0.17
294	0.14
295	0.2
296	0.29
297	0.38
298	0.45
299	0.49
300	0.5
301	0.54
302	0.56
303	0.52
304	0.53
305	0.46
306	0.41
307	0.43
308	0.47
309	0.41
310	0.42
311	0.43
312	0.35
313	0.33
314	0.35
315	0.31
316	0.26
317	0.27
318	0.34
319	0.37
320	0.43
321	0.42
322	0.4
323	0.41
324	0.45
325	0.43
326	0.44
327	0.42
328	0.38
329	0.41
330	0.4
331	0.37
332	0.32
333	0.29
334	0.2
335	0.14
336	0.1
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.03
343	0.03
344	0.04
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.07
355	0.08
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.11
371	0.13
372	0.17
373	0.24
374	0.31
375	0.32
376	0.4
377	0.46
378	0.51
379	0.52
380	0.49
381	0.44
382	0.4
383	0.38
384	0.31
385	0.26
386	0.19
387	0.17
388	0.18
389	0.17
390	0.15
391	0.16
392	0.17
393	0.17
394	0.17
395	0.21
396	0.23
397	0.25
398	0.3
399	0.3
400	0.36
401	0.41
402	0.46
403	0.49
404	0.55
405	0.57
406	0.6
407	0.65
408	0.65
409	0.66
410	0.67
411	0.64
412	0.62
413	0.64
414	0.62
415	0.66
416	0.69
417	0.7
418	0.73
419	0.73
420	0.75
421	0.73
422	0.68
423	0.63
424	0.59
425	0.5
426	0.43
427	0.39
428	0.32
429	0.28
430	0.26
431	0.23
432	0.17
433	0.15
434	0.13
435	0.13
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.13
440	0.14
441	0.13
442	0.13
443	0.11
444	0.12
445	0.13
446	0.12
447	0.1
448	0.09
449	0.11
450	0.17
451	0.18
452	0.23
453	0.26
454	0.3
455	0.32
456	0.4
457	0.46
458	0.49
459	0.53
460	0.54
461	0.52
462	0.47
463	0.46
464	0.43
465	0.43
466	0.4
467	0.39
468	0.37
469	0.42
470	0.44
471	0.45
472	0.47
473	0.42
474	0.43
475	0.47
476	0.5
477	0.47
478	0.49
479	0.5
480	0.53
481	0.59
482	0.61
483	0.58
484	0.59
485	0.58
486	0.56
487	0.54
488	0.48
489	0.49
490	0.49
491	0.51
492	0.5
493	0.49
494	0.51
495	0.51
496	0.51
497	0.47
498	0.46
499	0.42
500	0.41
501	0.4
502	0.37
503	0.35
504	0.3
505	0.3
506	0.24
507	0.21
508	0.2
509	0.21
510	0.24
511	0.3
512	0.34
513	0.35
514	0.42
515	0.52
516	0.57
517	0.65
518	0.73
519	0.77
520	0.81
521	0.81
522	0.81
523	0.77
524	0.72
525	0.69
526	0.63
527	0.6
528	0.63
529	0.6
530	0.57
531	0.54
532	0.52
533	0.47
534	0.47
535	0.5
536	0.47
537	0.47
538	0.45
539	0.47
540	0.46
541	0.46
542	0.44
543	0.41
544	0.39
545	0.36
546	0.4
547	0.4
548	0.41
549	0.45
550	0.48
551	0.49
552	0.52
553	0.56
554	0.55
555	0.56
556	0.56
557	0.55
558	0.56
559	0.53
560	0.47
561	0.4
562	0.34
563	0.28
564	0.22
565	0.19
566	0.12
567	0.06
568	0.05
569	0.05
570	0.04
571	0.04
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.04
580	0.07
581	0.1
582	0.12
583	0.18
584	0.2
585	0.27
586	0.34
587	0.42
588	0.49
589	0.56
590	0.65
591	0.65
592	0.68
593	0.68
594	0.62
595	0.53
596	0.44
597	0.39
598	0.35
599	0.3
600	0.25
601	0.2
602	0.23
603	0.22
604	0.22
605	0.2
606	0.17
607	0.17
608	0.18
609	0.2
610	0.19
611	0.21
612	0.22
613	0.21
614	0.2
615	0.22
616	0.22
617	0.21
618	0.24
619	0.22
620	0.23
621	0.26
622	0.29
623	0.31
624	0.33
625	0.36
626	0.36
627	0.38
628	0.38
629	0.38
630	0.35
631	0.34
632	0.34
633	0.35
634	0.31
635	0.33
636	0.33
637	0.35
638	0.37
639	0.37
640	0.35
641	0.33
642	0.35
643	0.33
644	0.31
645	0.25
646	0.25
647	0.22
648	0.22
649	0.23
650	0.19
651	0.19
652	0.21
653	0.23
654	0.19
655	0.18
656	0.17
657	0.13
658	0.12
659	0.11
660	0.1
661	0.09
662	0.11
663	0.15
664	0.16
665	0.16
666	0.19
667	0.23
668	0.25
669	0.26
670	0.28
671	0.28
672	0.36
673	0.43
674	0.48
675	0.48
676	0.56
677	0.64
678	0.65
679	0.64
680	0.56
681	0.5
682	0.45
683	0.49
684	0.45
685	0.39
686	0.37
687	0.35
688	0.35
689	0.33
690	0.32
691	0.25
692	0.19
693	0.17
694	0.18
695	0.21
696	0.22
697	0.23
698	0.29
699	0.31
700	0.3
701	0.34

A0A5N6T267

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer