Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6T3

Protein Details
Accession C5M6T3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
997-1037YECNHACKDKSKCRHLCCREGLPVKSIKRKHTETKDNSPVLHydrophilic
1100-1120IQEVSKKKYKKTTSKVFSIENHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR004179  Sec63-dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006268  P:DNA unwinding involved in DNA replication  
GO:0007129  P:homologous chromosome pairing at meiosis  
GO:0007131  P:reciprocal meiotic recombination  
KEGG ctp:CTRG_01564  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PF02889  Sec63  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MATTTTTTPFHTKAPFNVISPQSPQLQHPPPAQPVPSFSNHSRQPLVARTNLNQFRYSSKDNNNFQTSNLTTGKLSTEVLPYDHRCVFPFKEFNDMQSKSFHTVYNSSSNCVVSSPTGSGKTVLFELAILRELSNCPSEPDFKVLYLAPTKALCNEKLEDWNKKFAQLNVTVGILTGDSTFKEAENVRKSTIIISTPEKWDVITRKWKDYSKLFGLIKLLLVDEIHILKDLRGSTLEVVVTRMKRICIGLRILAISATVANAGDISKWIKLADESTLPAETLCFGEEYRAVKLFKIVYGYKPTSENDFQFDIHLNSKLIEVINTHSKGKPVLIFCPTRNSSQGTAKFLYNNMTGIASDVQLKLKDHDDATYATKGIAYHHAGLHYADRKQIENSFLNGGLKVLCSTSTLAVGINLPAYLVIIKGTKCWAENCFQEYSETDILQMVGRAGRPQFEREGVAVIMTSAKLKQKYERLVKGTEKVESSLHLNFAEHLAAEIAVGVIKNVEDALIWLQTTYLYVRFMSNPSYYVLQIPKSSDLKETLTDFCRKQADSLYQEKIIFMDDLYNYKISPYGYSMTMHYVSFETMTKMIQSGLNLSISEILDVITKSKEFSDLKLKQQEKRLYREINNSPILRYPSKSKELSHCDKVSCIIQFELGGLEFPTYNGAMKLHSSFLGDKFYVFKHIYRLMMALLEVCVEKKDAVSLRSVNYLLRCINGRCWEDSPNELRQLDGVGPASVKKFCNHNVLSLEDARSLTNTQLEYYLGLKTGGGSKIKKNIQSLPQLCLDFVFDDEELSDNRDEVVVTTTVTIDVTNAKLSSNWKNRLVYIHIITDTSDGELLDFRRIPVCKFKNSGPKSYQVMAKVKNLNMTIHCQASADCIASVKSNSSVSIHPHLSQDTANRFIHIIDDEPTTTMSTIDYVGHVTAISDDDDDDDDDIKKLFEADHKPTSNVLKLDIIDLENDLASEKNHDLELPATQSKVQESTTHQRKTLPNGNYECNHACKDKSKCRHLCCREGLPVKSIKRKHTETKDNSPVLDTIKDLNHADNKVEVVLNEVREVVKPKVLNTKPLRLKKTKAVFKRTLFDDSDPEEMDSIQEIIQEVSKKKYKKTTSKVFSIENVGDHRGESRQEEVNSEVAAILDKSIFDYTTCLGDANQENDSLYNHQEEVTVPVKESLADTKMYHQSEYKEENQLNHTYNKDMLQGILGLDLELDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.45
3 0.42
4 0.49
5 0.47
6 0.44
7 0.45
8 0.43
9 0.41
10 0.4
11 0.41
12 0.42
13 0.46
14 0.48
15 0.5
16 0.53
17 0.54
18 0.57
19 0.56
20 0.48
21 0.47
22 0.46
23 0.45
24 0.45
25 0.42
26 0.46
27 0.48
28 0.52
29 0.49
30 0.46
31 0.47
32 0.49
33 0.51
34 0.48
35 0.48
36 0.46
37 0.54
38 0.59
39 0.56
40 0.5
41 0.46
42 0.45
43 0.47
44 0.5
45 0.49
46 0.52
47 0.59
48 0.63
49 0.7
50 0.71
51 0.65
52 0.58
53 0.58
54 0.49
55 0.46
56 0.41
57 0.34
58 0.27
59 0.28
60 0.28
61 0.22
62 0.21
63 0.17
64 0.19
65 0.18
66 0.21
67 0.26
68 0.27
69 0.32
70 0.34
71 0.33
72 0.31
73 0.36
74 0.38
75 0.4
76 0.43
77 0.38
78 0.44
79 0.43
80 0.46
81 0.5
82 0.48
83 0.4
84 0.38
85 0.41
86 0.36
87 0.37
88 0.35
89 0.29
90 0.31
91 0.34
92 0.39
93 0.37
94 0.35
95 0.35
96 0.33
97 0.29
98 0.26
99 0.23
100 0.15
101 0.17
102 0.17
103 0.19
104 0.21
105 0.21
106 0.22
107 0.21
108 0.21
109 0.19
110 0.16
111 0.12
112 0.11
113 0.12
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.12
119 0.13
120 0.15
121 0.17
122 0.16
123 0.18
124 0.2
125 0.25
126 0.25
127 0.29
128 0.28
129 0.25
130 0.27
131 0.25
132 0.26
133 0.26
134 0.24
135 0.22
136 0.22
137 0.23
138 0.26
139 0.29
140 0.26
141 0.27
142 0.29
143 0.29
144 0.38
145 0.43
146 0.48
147 0.47
148 0.55
149 0.5
150 0.53
151 0.54
152 0.48
153 0.49
154 0.42
155 0.42
156 0.35
157 0.34
158 0.29
159 0.25
160 0.22
161 0.14
162 0.1
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.13
170 0.16
171 0.24
172 0.31
173 0.33
174 0.33
175 0.34
176 0.34
177 0.32
178 0.33
179 0.26
180 0.23
181 0.26
182 0.28
183 0.3
184 0.31
185 0.29
186 0.26
187 0.3
188 0.31
189 0.35
190 0.41
191 0.43
192 0.49
193 0.55
194 0.6
195 0.6
196 0.61
197 0.61
198 0.57
199 0.61
200 0.54
201 0.49
202 0.47
203 0.41
204 0.35
205 0.27
206 0.21
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.13
220 0.14
221 0.14
222 0.16
223 0.17
224 0.13
225 0.15
226 0.19
227 0.19
228 0.21
229 0.22
230 0.2
231 0.21
232 0.24
233 0.26
234 0.26
235 0.29
236 0.28
237 0.27
238 0.27
239 0.25
240 0.22
241 0.18
242 0.13
243 0.09
244 0.07
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.15
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.12
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.08
273 0.11
274 0.13
275 0.15
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.21
280 0.21
281 0.19
282 0.23
283 0.22
284 0.23
285 0.3
286 0.32
287 0.3
288 0.32
289 0.32
290 0.33
291 0.35
292 0.32
293 0.29
294 0.29
295 0.27
296 0.26
297 0.27
298 0.22
299 0.2
300 0.2
301 0.16
302 0.15
303 0.15
304 0.15
305 0.13
306 0.11
307 0.1
308 0.13
309 0.2
310 0.22
311 0.24
312 0.23
313 0.24
314 0.24
315 0.26
316 0.27
317 0.22
318 0.24
319 0.28
320 0.31
321 0.31
322 0.39
323 0.38
324 0.36
325 0.36
326 0.35
327 0.33
328 0.38
329 0.41
330 0.38
331 0.38
332 0.36
333 0.35
334 0.33
335 0.32
336 0.24
337 0.2
338 0.16
339 0.14
340 0.12
341 0.13
342 0.12
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.12
347 0.13
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.17
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.17
356 0.19
357 0.19
358 0.17
359 0.15
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.18
367 0.19
368 0.18
369 0.19
370 0.22
371 0.21
372 0.19
373 0.2
374 0.21
375 0.22
376 0.24
377 0.26
378 0.26
379 0.24
380 0.25
381 0.24
382 0.23
383 0.23
384 0.2
385 0.18
386 0.12
387 0.11
388 0.09
389 0.07
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.11
413 0.12
414 0.14
415 0.15
416 0.17
417 0.2
418 0.23
419 0.23
420 0.22
421 0.22
422 0.21
423 0.24
424 0.21
425 0.18
426 0.15
427 0.14
428 0.14
429 0.13
430 0.12
431 0.07
432 0.06
433 0.07
434 0.09
435 0.09
436 0.12
437 0.13
438 0.16
439 0.17
440 0.18
441 0.19
442 0.17
443 0.19
444 0.15
445 0.13
446 0.11
447 0.08
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.11
453 0.13
454 0.15
455 0.2
456 0.27
457 0.36
458 0.44
459 0.49
460 0.49
461 0.53
462 0.54
463 0.55
464 0.49
465 0.42
466 0.34
467 0.29
468 0.25
469 0.21
470 0.2
471 0.15
472 0.15
473 0.13
474 0.12
475 0.11
476 0.11
477 0.1
478 0.07
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.04
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.02
494 0.03
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.09
508 0.1
509 0.13
510 0.13
511 0.13
512 0.13
513 0.14
514 0.13
515 0.15
516 0.16
517 0.14
518 0.15
519 0.15
520 0.18
521 0.19
522 0.19
523 0.18
524 0.19
525 0.18
526 0.19
527 0.2
528 0.19
529 0.2
530 0.24
531 0.22
532 0.23
533 0.25
534 0.23
535 0.22
536 0.23
537 0.26
538 0.27
539 0.32
540 0.31
541 0.3
542 0.3
543 0.29
544 0.25
545 0.2
546 0.14
547 0.09
548 0.09
549 0.08
550 0.09
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.11
556 0.08
557 0.09
558 0.09
559 0.1
560 0.11
561 0.12
562 0.12
563 0.13
564 0.14
565 0.13
566 0.12
567 0.1
568 0.09
569 0.1
570 0.09
571 0.08
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.08
580 0.08
581 0.09
582 0.08
583 0.08
584 0.09
585 0.08
586 0.08
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.11
597 0.11
598 0.14
599 0.23
600 0.27
601 0.33
602 0.41
603 0.44
604 0.43
605 0.51
606 0.56
607 0.51
608 0.53
609 0.55
610 0.51
611 0.52
612 0.57
613 0.52
614 0.51
615 0.5
616 0.44
617 0.38
618 0.35
619 0.35
620 0.28
621 0.25
622 0.25
623 0.26
624 0.31
625 0.33
626 0.32
627 0.36
628 0.43
629 0.48
630 0.49
631 0.45
632 0.4
633 0.38
634 0.37
635 0.32
636 0.24
637 0.19
638 0.12
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.09
643 0.06
644 0.05
645 0.04
646 0.05
647 0.04
648 0.04
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.06
654 0.06
655 0.07
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.11
662 0.14
663 0.13
664 0.12
665 0.13
666 0.13
667 0.16
668 0.16
669 0.16
670 0.17
671 0.2
672 0.21
673 0.19
674 0.2
675 0.15
676 0.14
677 0.13
678 0.09
679 0.06
680 0.06
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.08
688 0.1
689 0.11
690 0.14
691 0.15
692 0.16
693 0.18
694 0.19
695 0.17
696 0.15
697 0.17
698 0.14
699 0.14
700 0.15
701 0.14
702 0.18
703 0.23
704 0.24
705 0.24
706 0.25
707 0.27
708 0.27
709 0.3
710 0.3
711 0.27
712 0.29
713 0.26
714 0.24
715 0.21
716 0.2
717 0.17
718 0.14
719 0.11
720 0.07
721 0.08
722 0.09
723 0.1
724 0.11
725 0.12
726 0.12
727 0.16
728 0.2
729 0.28
730 0.28
731 0.31
732 0.31
733 0.31
734 0.32
735 0.29
736 0.26
737 0.19
738 0.19
739 0.14
740 0.13
741 0.12
742 0.1
743 0.11
744 0.11
745 0.1
746 0.1
747 0.1
748 0.1
749 0.11
750 0.1
751 0.08
752 0.08
753 0.07
754 0.07
755 0.11
756 0.13
757 0.16
758 0.18
759 0.2
760 0.29
761 0.33
762 0.36
763 0.36
764 0.4
765 0.42
766 0.5
767 0.49
768 0.44
769 0.44
770 0.4
771 0.36
772 0.3
773 0.25
774 0.15
775 0.13
776 0.12
777 0.07
778 0.07
779 0.08
780 0.08
781 0.08
782 0.09
783 0.09
784 0.07
785 0.08
786 0.08
787 0.07
788 0.07
789 0.09
790 0.07
791 0.07
792 0.08
793 0.08
794 0.08
795 0.08
796 0.07
797 0.05
798 0.06
799 0.07
800 0.08
801 0.08
802 0.08
803 0.1
804 0.14
805 0.24
806 0.31
807 0.36
808 0.4
809 0.41
810 0.42
811 0.44
812 0.44
813 0.39
814 0.33
815 0.3
816 0.25
817 0.24
818 0.23
819 0.2
820 0.16
821 0.11
822 0.09
823 0.07
824 0.06
825 0.08
826 0.09
827 0.11
828 0.11
829 0.11
830 0.15
831 0.16
832 0.19
833 0.27
834 0.31
835 0.34
836 0.37
837 0.43
838 0.5
839 0.53
840 0.59
841 0.52
842 0.53
843 0.51
844 0.52
845 0.48
846 0.44
847 0.47
848 0.42
849 0.46
850 0.45
851 0.42
852 0.43
853 0.41
854 0.37
855 0.32
856 0.34
857 0.3
858 0.25
859 0.24
860 0.2
861 0.18
862 0.19
863 0.18
864 0.13
865 0.11
866 0.1
867 0.11
868 0.12
869 0.12
870 0.1
871 0.11
872 0.11
873 0.11
874 0.13
875 0.15
876 0.18
877 0.23
878 0.24
879 0.23
880 0.24
881 0.24
882 0.24
883 0.23
884 0.25
885 0.23
886 0.27
887 0.26
888 0.25
889 0.25
890 0.23
891 0.23
892 0.18
893 0.16
894 0.11
895 0.13
896 0.13
897 0.13
898 0.13
899 0.12
900 0.11
901 0.1
902 0.08
903 0.07
904 0.08
905 0.08
906 0.07
907 0.08
908 0.07
909 0.07
910 0.07
911 0.06
912 0.06
913 0.07
914 0.07
915 0.06
916 0.06
917 0.07
918 0.08
919 0.08
920 0.08
921 0.09
922 0.09
923 0.09
924 0.1
925 0.09
926 0.08
927 0.08
928 0.09
929 0.15
930 0.21
931 0.27
932 0.35
933 0.37
934 0.38
935 0.41
936 0.43
937 0.41
938 0.35
939 0.3
940 0.24
941 0.23
942 0.24
943 0.22
944 0.18
945 0.14
946 0.13
947 0.12
948 0.09
949 0.08
950 0.08
951 0.07
952 0.06
953 0.09
954 0.1
955 0.1
956 0.1
957 0.11
958 0.11
959 0.12
960 0.14
961 0.16
962 0.16
963 0.16
964 0.17
965 0.18
966 0.19
967 0.2
968 0.18
969 0.17
970 0.24
971 0.34
972 0.43
973 0.45
974 0.44
975 0.49
976 0.52
977 0.58
978 0.59
979 0.53
980 0.52
981 0.53
982 0.58
983 0.52
984 0.54
985 0.48
986 0.43
987 0.42
988 0.35
989 0.34
990 0.37
991 0.45
992 0.5
993 0.56
994 0.63
995 0.69
996 0.75
997 0.84
998 0.83
999 0.83
1000 0.79
1001 0.77
1002 0.76
1003 0.74
1004 0.67
1005 0.62
1006 0.62
1007 0.6
1008 0.62
1009 0.61
1010 0.59
1011 0.6
1012 0.66
1013 0.7
1014 0.73
1015 0.77
1016 0.76
1017 0.81
1018 0.82
1019 0.76
1020 0.69
1021 0.6
1022 0.52
1023 0.43
1024 0.36
1025 0.27
1026 0.21
1027 0.2
1028 0.22
1029 0.21
1030 0.24
1031 0.27
1032 0.27
1033 0.27
1034 0.24
1035 0.24
1036 0.22
1037 0.22
1038 0.17
1039 0.16
1040 0.19
1041 0.18
1042 0.17
1043 0.17
1044 0.16
1045 0.18
1046 0.23
1047 0.19
1048 0.21
1049 0.22
1050 0.25
1051 0.35
1052 0.37
1053 0.45
1054 0.47
1055 0.55
1056 0.6
1057 0.68
1058 0.74
1059 0.7
1060 0.75
1061 0.74
1062 0.78
1063 0.78
1064 0.78
1065 0.78
1066 0.78
1067 0.77
1068 0.78
1069 0.72
1070 0.68
1071 0.61
1072 0.54
1073 0.5
1074 0.44
1075 0.41
1076 0.35
1077 0.31
1078 0.25
1079 0.22
1080 0.2
1081 0.15
1082 0.13
1083 0.09
1084 0.09
1085 0.09
1086 0.09
1087 0.13
1088 0.17
1089 0.19
1090 0.26
1091 0.32
1092 0.36
1093 0.42
1094 0.52
1095 0.59
1096 0.65
1097 0.74
1098 0.77
1099 0.78
1100 0.83
1101 0.81
1102 0.75
1103 0.67
1104 0.63
1105 0.54
1106 0.46
1107 0.42
1108 0.35
1109 0.3
1110 0.27
1111 0.25
1112 0.21
1113 0.22
1114 0.21
1115 0.22
1116 0.26
1117 0.27
1118 0.29
1119 0.3
1120 0.29
1121 0.26
1122 0.24
1123 0.2
1124 0.13
1125 0.13
1126 0.11
1127 0.09
1128 0.07
1129 0.07
1130 0.09
1131 0.1
1132 0.1
1133 0.09
1134 0.12
1135 0.12
1136 0.14
1137 0.15
1138 0.13
1139 0.12
1140 0.18
1141 0.22
1142 0.23
1143 0.23
1144 0.21
1145 0.21
1146 0.21
1147 0.24
1148 0.2
1149 0.18
1150 0.18
1151 0.17
1152 0.17
1153 0.18
1154 0.18
1155 0.21
1156 0.22
1157 0.21
1158 0.19
1159 0.2
1160 0.2
1161 0.2
1162 0.21
1163 0.2
1164 0.18
1165 0.2
1166 0.21
1167 0.26
1168 0.34
1169 0.35
1170 0.35
1171 0.34
1172 0.36
1173 0.41
1174 0.47
1175 0.45
1176 0.46
1177 0.47
1178 0.49
1179 0.5
1180 0.52
1181 0.48
1182 0.47
1183 0.44
1184 0.38
1185 0.38
1186 0.36
1187 0.34
1188 0.28
1189 0.25
1190 0.21
1191 0.2
1192 0.17
1193 0.15
1194 0.13
1195 0.1