FuNGI

A0A5N6TC78

Protein Details

Accession

A0A5N6TC78

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-53	PSTGPPPRPLRNPRAGQTRQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1223-1240	KRPQQPGSRGGRRGGLGV

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR034397 Prp24_RRM1 IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR031766 RRM_occluded IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF16842 RRM_occluded
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12296 RRM1_Prp24 cd12299 RRM4_Prp24 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MDINSLLSPQESNSQSGRSSPAAAPTSVSNTSIPSTGPPPRPLRNPRAGQTRQGMTSSPLAQHVFAPPHVSEPSPPAISPTVGPSMGSGNGTPPAADLPPPRQPSTPGMDTLADLASMQHHQPQRSNAPLLRSTESYESQLSPSPMYPHVSSVAHNTPTPRSSFDIAMSDGPREAARRNYMETSLVPNAQRLATELFAQIQENPQSYDAHVNFVRLLHAGFVNHVYPPNNPEIHGDPRKYDLLKDMRTAREEMDKLFALGEDLWAEWIQDESMLAQTVDERIAVMEFCQRSVEEEYGSTKLWSIYGEWVLYLYNSAHGEGGQHQWTEEDRAIGREVFSWQSVLDVWQRGAEATRWRTPDSHLVWDRLLDLQMQDITRNPSQEKISHVRNLFDIRLQTPHATWDQTFQTFSGFVSTYYNANYETIMADTAGRYATACKEQYSAREEFEIRLRNATESGDPTQEWTIFTEYIEWEVSNNHRNRHANFELVNAVYQRAVLRFPTDANMWEDFVMFLIDESMHGNTNTTTISTLERATRHCPCSGTLWSQYLLSSEREGQSFSKIADIKHKATSTGLLDVAGMEEVLKVHTAWCSYLRRRAFMSDSTDEDLDVAEVGIRSAIESVQELGEKKYGRSYQGDPLFRLERIYIRYLSESGSWDSARETFKGLMGRRGNSYEFWLTYYEWELISWSKFVQGEATVDAARRTPNPSFATAVLKQAIKRTDLDWPEKIMQTYIAHCEDYEDSDELQLAILETRKAMRAVRARRERDARELAAQHAQQAASSEQATHPEKRKREEEEEANVNGLPAKKARGEQETSATEAEPAALRRDRENATVVVKNLPHQITEHKVRQFFRHCGMINSVKMFPGDGNSEVAVIEFNSRDEALVAQTRDQKSLDDSTIEVQIGTCSTLFVTNFPPEADESYIRDLFRECGEIIDVRFPSLKYNTHRRFCYVQFKTAEAAHSATKLDGTTVGKGLRLTAKISDPSRKQDRHGPIYEGREIHVSNVDFKANERDIQELFSKYGTVELVRLPRKVDGGSKGFGYVVFSTKEEATAAVAMDGQEYRSRTLHVKISAPQSTKRSATTIVSHVGKSQSPTAEVNGSKASADADTASRERAARSLGLMNIPDTVNDARIRALVEPYGKLIKVVLRPDHQGAIVEFADVNHAGRASLELEGQEIAPGRKLHVGTVPEMLKQSAENKDGRTQPSSKPKEKQGAFLQPTGPIKRPQQPGSRGGRRGGLGVKRAVPHGEHNGEKTMTTTMMTTDSAPSAEGGKPKKSNDDFRAMIQRGREK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.26
3	0.28
4	0.31
5	0.25
6	0.28
7	0.26
8	0.32
9	0.32
10	0.32
11	0.31
12	0.29
13	0.32
14	0.29
15	0.29
16	0.21
17	0.21
18	0.22
19	0.21
20	0.19
21	0.17
22	0.22
23	0.29
24	0.35
25	0.41
26	0.47
27	0.54
28	0.63
29	0.7
30	0.73
31	0.75
32	0.76
33	0.77
34	0.8
35	0.77
36	0.74
37	0.72
38	0.68
39	0.61
40	0.54
41	0.47
42	0.4
43	0.41
44	0.37
45	0.3
46	0.29
47	0.28
48	0.27
49	0.27
50	0.3
51	0.27
52	0.25
53	0.27
54	0.23
55	0.26
56	0.27
57	0.26
58	0.22
59	0.24
60	0.29
61	0.27
62	0.26
63	0.26
64	0.26
65	0.26
66	0.25
67	0.24
68	0.23
69	0.21
70	0.21
71	0.18
72	0.19
73	0.19
74	0.19
75	0.15
76	0.13
77	0.15
78	0.15
79	0.14
80	0.12
81	0.13
82	0.13
83	0.17
84	0.19
85	0.23
86	0.32
87	0.38
88	0.4
89	0.39
90	0.42
91	0.44
92	0.48
93	0.45
94	0.38
95	0.36
96	0.33
97	0.32
98	0.3
99	0.24
100	0.16
101	0.12
102	0.1
103	0.1
104	0.11
105	0.12
106	0.17
107	0.22
108	0.25
109	0.3
110	0.37
111	0.43
112	0.47
113	0.53
114	0.49
115	0.51
116	0.52
117	0.52
118	0.48
119	0.42
120	0.4
121	0.38
122	0.37
123	0.34
124	0.31
125	0.28
126	0.26
127	0.29
128	0.27
129	0.23
130	0.23
131	0.24
132	0.24
133	0.27
134	0.26
135	0.24
136	0.26
137	0.25
138	0.24
139	0.28
140	0.32
141	0.29
142	0.3
143	0.31
144	0.31
145	0.33
146	0.34
147	0.31
148	0.29
149	0.3
150	0.3
151	0.3
152	0.28
153	0.27
154	0.3
155	0.27
156	0.24
157	0.21
158	0.2
159	0.18
160	0.17
161	0.19
162	0.21
163	0.26
164	0.29
165	0.33
166	0.35
167	0.35
168	0.36
169	0.34
170	0.34
171	0.31
172	0.32
173	0.28
174	0.26
175	0.26
176	0.24
177	0.22
178	0.18
179	0.18
180	0.15
181	0.16
182	0.16
183	0.16
184	0.16
185	0.17
186	0.15
187	0.17
188	0.19
189	0.19
190	0.2
191	0.2
192	0.2
193	0.21
194	0.29
195	0.24
196	0.27
197	0.26
198	0.25
199	0.25
200	0.24
201	0.24
202	0.15
203	0.15
204	0.11
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.13
209	0.13
210	0.13
211	0.16
212	0.15
213	0.16
214	0.19
215	0.24
216	0.23
217	0.23
218	0.26
219	0.28
220	0.36
221	0.42
222	0.4
223	0.36
224	0.39
225	0.43
226	0.4
227	0.36
228	0.36
229	0.37
230	0.39
231	0.43
232	0.45
233	0.45
234	0.46
235	0.47
236	0.4
237	0.39
238	0.37
239	0.33
240	0.3
241	0.26
242	0.24
243	0.23
244	0.2
245	0.13
246	0.12
247	0.11
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.06
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.12
273	0.12
274	0.13
275	0.14
276	0.13
277	0.16
278	0.2
279	0.21
280	0.15
281	0.16
282	0.19
283	0.19
284	0.2
285	0.16
286	0.14
287	0.13
288	0.12
289	0.12
290	0.11
291	0.13
292	0.14
293	0.14
294	0.13
295	0.13
296	0.12
297	0.12
298	0.11
299	0.07
300	0.09
301	0.09
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.11
306	0.12
307	0.16
308	0.15
309	0.14
310	0.14
311	0.15
312	0.16
313	0.19
314	0.17
315	0.15
316	0.14
317	0.16
318	0.17
319	0.17
320	0.16
321	0.13
322	0.15
323	0.14
324	0.14
325	0.12
326	0.1
327	0.11
328	0.11
329	0.12
330	0.13
331	0.13
332	0.13
333	0.13
334	0.14
335	0.13
336	0.14
337	0.15
338	0.2
339	0.23
340	0.29
341	0.3
342	0.32
343	0.33
344	0.35
345	0.41
346	0.37
347	0.41
348	0.39
349	0.39
350	0.37
351	0.37
352	0.34
353	0.26
354	0.23
355	0.14
356	0.11
357	0.1
358	0.12
359	0.12
360	0.11
361	0.12
362	0.17
363	0.18
364	0.21
365	0.2
366	0.22
367	0.24
368	0.26
369	0.31
370	0.31
371	0.35
372	0.39
373	0.4
374	0.37
375	0.37
376	0.38
377	0.32
378	0.29
379	0.26
380	0.21
381	0.22
382	0.23
383	0.21
384	0.17
385	0.2
386	0.19
387	0.19
388	0.17
389	0.19
390	0.2
391	0.2
392	0.21
393	0.17
394	0.17
395	0.15
396	0.15
397	0.13
398	0.1
399	0.1
400	0.12
401	0.13
402	0.12
403	0.13
404	0.14
405	0.11
406	0.11
407	0.11
408	0.09
409	0.08
410	0.08
411	0.07
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.06
420	0.09
421	0.13
422	0.14
423	0.14
424	0.17
425	0.18
426	0.22
427	0.26
428	0.25
429	0.21
430	0.23
431	0.23
432	0.23
433	0.28
434	0.29
435	0.25
436	0.26
437	0.25
438	0.23
439	0.23
440	0.23
441	0.19
442	0.16
443	0.18
444	0.16
445	0.16
446	0.17
447	0.17
448	0.16
449	0.15
450	0.13
451	0.14
452	0.12
453	0.13
454	0.12
455	0.11
456	0.12
457	0.12
458	0.1
459	0.08
460	0.1
461	0.13
462	0.2
463	0.22
464	0.23
465	0.29
466	0.33
467	0.35
468	0.42
469	0.4
470	0.36
471	0.34
472	0.34
473	0.29
474	0.25
475	0.24
476	0.16
477	0.14
478	0.1
479	0.1
480	0.09
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.09
485	0.09
486	0.1
487	0.11
488	0.12
489	0.13
490	0.15
491	0.15
492	0.14
493	0.14
494	0.13
495	0.11
496	0.1
497	0.08
498	0.05
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.06
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.06
513	0.07
514	0.08
515	0.09
516	0.1
517	0.12
518	0.14
519	0.16
520	0.21
521	0.26
522	0.27
523	0.27
524	0.27
525	0.25
526	0.29
527	0.3
528	0.29
529	0.25
530	0.25
531	0.24
532	0.23
533	0.21
534	0.18
535	0.16
536	0.13
537	0.11
538	0.12
539	0.13
540	0.13
541	0.14
542	0.13
543	0.14
544	0.14
545	0.13
546	0.16
547	0.16
548	0.16
549	0.24
550	0.28
551	0.28
552	0.31
553	0.31
554	0.27
555	0.26
556	0.28
557	0.2
558	0.17
559	0.15
560	0.11
561	0.1
562	0.1
563	0.09
564	0.06
565	0.05
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.04
571	0.03
572	0.04
573	0.05
574	0.06
575	0.07
576	0.11
577	0.17
578	0.2
579	0.27
580	0.28
581	0.29
582	0.3
583	0.32
584	0.3
585	0.28
586	0.32
587	0.26
588	0.27
589	0.27
590	0.25
591	0.22
592	0.19
593	0.15
594	0.09
595	0.07
596	0.04
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.04
607	0.04
608	0.05
609	0.06
610	0.07
611	0.07
612	0.11
613	0.11
614	0.11
615	0.16
616	0.17
617	0.18
618	0.21
619	0.24
620	0.28
621	0.35
622	0.36
623	0.32
624	0.34
625	0.32
626	0.29
627	0.27
628	0.19
629	0.15
630	0.16
631	0.18
632	0.15
633	0.15
634	0.16
635	0.15
636	0.16
637	0.14
638	0.13
639	0.11
640	0.12
641	0.11
642	0.1
643	0.11
644	0.13
645	0.13
646	0.12
647	0.12
648	0.11
649	0.13
650	0.18
651	0.18
652	0.23
653	0.25
654	0.25
655	0.25
656	0.27
657	0.26
658	0.21
659	0.24
660	0.18
661	0.15
662	0.15
663	0.15
664	0.13
665	0.13
666	0.14
667	0.11
668	0.1
669	0.09
670	0.09
671	0.09
672	0.09
673	0.09
674	0.07
675	0.08
676	0.09
677	0.09
678	0.09
679	0.09
680	0.09
681	0.09
682	0.1
683	0.08
684	0.09
685	0.09
686	0.09
687	0.09
688	0.09
689	0.13
690	0.12
691	0.18
692	0.2
693	0.21
694	0.22
695	0.22
696	0.27
697	0.24
698	0.25
699	0.21
700	0.2
701	0.19
702	0.22
703	0.22
704	0.18
705	0.18
706	0.17
707	0.22
708	0.26
709	0.29
710	0.26
711	0.28
712	0.29
713	0.29
714	0.28
715	0.21
716	0.19
717	0.16
718	0.16
719	0.16
720	0.15
721	0.14
722	0.14
723	0.15
724	0.13
725	0.14
726	0.14
727	0.11
728	0.1
729	0.1
730	0.1
731	0.08
732	0.08
733	0.06
734	0.04
735	0.04
736	0.05
737	0.05
738	0.05
739	0.06
740	0.07
741	0.09
742	0.09
743	0.15
744	0.23
745	0.31
746	0.41
747	0.5
748	0.52
749	0.58
750	0.65
751	0.61
752	0.6
753	0.57
754	0.49
755	0.44
756	0.41
757	0.37
758	0.34
759	0.31
760	0.25
761	0.21
762	0.19
763	0.14
764	0.15
765	0.13
766	0.1
767	0.1
768	0.09
769	0.08
770	0.14
771	0.17
772	0.2
773	0.28
774	0.34
775	0.38
776	0.43
777	0.49
778	0.5
779	0.53
780	0.56
781	0.53
782	0.52
783	0.52
784	0.47
785	0.42
786	0.35
787	0.28
788	0.23
789	0.18
790	0.13
791	0.09
792	0.11
793	0.12
794	0.15
795	0.19
796	0.23
797	0.26
798	0.26
799	0.31
800	0.3
801	0.3
802	0.28
803	0.24
804	0.18
805	0.15
806	0.14
807	0.09
808	0.09
809	0.11
810	0.13
811	0.14
812	0.15
813	0.2
814	0.22
815	0.22
816	0.24
817	0.22
818	0.24
819	0.25
820	0.25
821	0.24
822	0.22
823	0.22
824	0.25
825	0.23
826	0.19
827	0.18
828	0.22
829	0.25
830	0.31
831	0.36
832	0.35
833	0.4
834	0.41
835	0.47
836	0.5
837	0.47
838	0.44
839	0.44
840	0.4
841	0.38
842	0.42
843	0.4
844	0.35
845	0.33
846	0.3
847	0.24
848	0.23
849	0.21
850	0.16
851	0.12
852	0.13
853	0.11
854	0.12
855	0.11
856	0.11
857	0.11
858	0.1
859	0.08
860	0.06
861	0.07
862	0.06
863	0.06
864	0.07
865	0.07
866	0.07
867	0.07
868	0.07
869	0.09
870	0.12
871	0.13
872	0.15
873	0.22
874	0.23
875	0.25
876	0.25
877	0.23
878	0.22
879	0.25
880	0.23
881	0.17
882	0.17
883	0.16
884	0.18
885	0.17
886	0.13
887	0.1
888	0.09
889	0.08
890	0.08
891	0.06
892	0.05
893	0.05
894	0.08
895	0.08
896	0.09
897	0.12
898	0.13
899	0.14
900	0.14
901	0.15
902	0.13
903	0.15
904	0.17
905	0.15
906	0.16
907	0.2
908	0.22
909	0.21
910	0.21
911	0.2
912	0.18
913	0.18
914	0.18
915	0.13
916	0.11
917	0.13
918	0.14
919	0.14
920	0.17
921	0.16
922	0.15
923	0.16
924	0.16
925	0.19
926	0.21
927	0.26
928	0.28
929	0.39
930	0.47
931	0.53
932	0.55
933	0.55
934	0.57
935	0.57
936	0.62
937	0.55
938	0.53
939	0.48
940	0.48
941	0.45
942	0.41
943	0.36
944	0.26
945	0.24
946	0.18
947	0.17
948	0.15
949	0.13
950	0.12
951	0.11
952	0.09
953	0.11
954	0.12
955	0.13
956	0.15
957	0.15
958	0.16
959	0.16
960	0.18
961	0.19
962	0.18
963	0.18
964	0.18
965	0.22
966	0.26
967	0.3
968	0.36
969	0.36
970	0.43
971	0.51
972	0.51
973	0.51
974	0.55
975	0.61
976	0.61
977	0.6
978	0.58
979	0.54
980	0.56
981	0.58
982	0.48
983	0.4
984	0.35
985	0.31
986	0.27
987	0.26
988	0.21
989	0.2
990	0.21
991	0.21
992	0.18
993	0.2
994	0.26
995	0.22
996	0.25
997	0.22
998	0.23
999	0.23
1000	0.25
1001	0.27
1002	0.21
1003	0.21
1004	0.18
1005	0.17
1006	0.14
1007	0.15
1008	0.13
1009	0.1
1010	0.1
1011	0.13
1012	0.21
1013	0.24
1014	0.25
1015	0.25
1016	0.26
1017	0.28
1018	0.28
1019	0.3
1020	0.29
1021	0.3
1022	0.3
1023	0.29
1024	0.28
1025	0.26
1026	0.24
1027	0.22
1028	0.16
1029	0.15
1030	0.15
1031	0.15
1032	0.16
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.14
1036	0.12
1037	0.11
1038	0.1
1039	0.1
1040	0.08
1041	0.08
1042	0.07
1043	0.08
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.11
1047	0.12
1048	0.15
1049	0.15
1050	0.18
1051	0.2
1052	0.25
1053	0.3
1054	0.3
1055	0.33
1056	0.36
1057	0.43
1058	0.47
1059	0.47
1060	0.48
1061	0.46
1062	0.48
1063	0.46
1064	0.42
1065	0.37
1066	0.34
1067	0.35
1068	0.33
1069	0.32
1070	0.33
1071	0.33
1072	0.32
1073	0.32
1074	0.31
1075	0.29
1076	0.27
1077	0.28
1078	0.23
1079	0.24
1080	0.25
1081	0.25
1082	0.28
1083	0.27
1084	0.27
1085	0.24
1086	0.23
1087	0.2
1088	0.18
1089	0.17
1090	0.11
1091	0.11
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.14
1095	0.14
1096	0.16
1097	0.16
1098	0.17
1099	0.17
1100	0.18
1101	0.19
1102	0.16
1103	0.18
1104	0.21
1105	0.21
1106	0.23
1107	0.23
1108	0.21
1109	0.21
1110	0.2
1111	0.17
1112	0.16
1113	0.15
1114	0.16
1115	0.16
1116	0.16
1117	0.15
1118	0.16
1119	0.17
1120	0.15
1121	0.17
1122	0.17
1123	0.19
1124	0.19
1125	0.22
1126	0.24
1127	0.23
1128	0.21
1129	0.21
1130	0.23
1131	0.26
1132	0.32
1133	0.35
1134	0.35
1135	0.4
1136	0.43
1137	0.43
1138	0.37
1139	0.34
1140	0.28
1141	0.26
1142	0.22
1143	0.18
1144	0.16
1145	0.13
1146	0.15
1147	0.13
1148	0.14
1149	0.1
1150	0.1
1151	0.09
1152	0.09
1153	0.11
1154	0.09
1155	0.1
1156	0.1
1157	0.09
1158	0.1
1159	0.11
1160	0.11
1161	0.11
1162	0.12
1163	0.12
1164	0.16
1165	0.16
1166	0.17
1167	0.22
1168	0.22
1169	0.23
1170	0.27
1171	0.28
1172	0.26
1173	0.33
1174	0.32
1175	0.29
1176	0.3
1177	0.28
1178	0.22
1179	0.22
1180	0.26
1181	0.25
1182	0.29
1183	0.3
1184	0.33
1185	0.4
1186	0.46
1187	0.48
1188	0.48
1189	0.46
1190	0.51
1191	0.58
1192	0.64
1193	0.66
1194	0.67
1195	0.72
1196	0.76
1197	0.74
1198	0.73
1199	0.72
1200	0.73
1201	0.69
1202	0.65
1203	0.57
1204	0.53
1205	0.57
1206	0.54
1207	0.48
1208	0.44
1209	0.47
1210	0.52
1211	0.59
1212	0.61
1213	0.64
1214	0.66
1215	0.71
1216	0.75
1217	0.78
1218	0.73
1219	0.67
1220	0.64
1221	0.55
1222	0.53
1223	0.51
1224	0.47
1225	0.43
1226	0.44
1227	0.46
1228	0.43
1229	0.44
1230	0.42
1231	0.37
1232	0.37
1233	0.41
1234	0.43
1235	0.41
1236	0.42
1237	0.44
1238	0.42
1239	0.39
1240	0.34
1241	0.27
1242	0.21
1243	0.19
1244	0.16
1245	0.13
1246	0.14
1247	0.15
1248	0.15
1249	0.15
1250	0.15
1251	0.15
1252	0.14
1253	0.14
1254	0.14
1255	0.17
1256	0.22
1257	0.25
1258	0.33
1259	0.38
1260	0.41
1261	0.51
1262	0.56
1263	0.64
1264	0.64
1265	0.68
1266	0.61
1267	0.62
1268	0.69
1269	0.61
1270	0.56

A0A5N6TC78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer