FuNGI

A0A5N6SHM1

Protein Details

Accession

A0A5N6SHM1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
865-884	QSGKHSPSQVRRRCVRCCEI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 9.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021665 Mediator_Med16 IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex
Pfam	View protein in Pfam PF11635 Med16

Amino Acid Sequences

MPMIMDGGINVDDLFGESASLELGLPATAPTSNSTKGLAQRLDEMRLLGCCQKIAWSKQGCIAYISQDTLRVNLRHLECRPSDGKWVLSDDTPLHPVAEAHGGQPLVHLCWNEIGSELAVVDSSGRVSIYNIAISLNSLAGQRQAAFDPIDDAAQIVGVMWLNIQRSVHAFNVAAMVQGRRAYSPFRRRPIGPFHPAGKAALLCVTRSGIIRLLYQNPDNKWAEISAELKNASYSDRLLTHAAIVATQNGILIATYSACQKIYFYRVQINWTPPQWDPSQLKQAPNQFPVPSFRFMHSKVEAPCIVPSACRSGEATNDGLPSSTNPLYCLTRLDIVLAAHDNSAGMTTNPWILAVFSIPPHATPDHSQQQSPCSIIVRWQLDSAPQVLHPKFDEVTSKKNNAQIKPKSVLRRLEDMYCDRYVTMIEQTEHGNVLAVTYDDSSVTFYDPKTMAVLNGTDDTNTLTSLAHAGFHYPPDSAGLHISFSPSGCNAVTLDGEGQAQLRVMEHSYGAENGLYDENKFSAAVASLTLAFCRGCGSEFNTDDILLILKRQASPDAQISFINEVYRALGVNCNYTQENDKLMSHQYLPKCLSVQAALGFIDKYKSRNFASNVPWTILQLRHASVLYALFLQYLKGGVQAEPPDADAIRILLGNTKWALDLLHYVLNDLLDLADDLESFLSDQEAFAQKLKTINSLPLIILLSSMSRAFLRFICRGLRGLQAGYATAPLTGDAGVYYAEIYQTLDTSPVRIDVYEKLLAGVDSTVRHVYHGAGFGDNERPGPEKELLVNGRIPPVLVAAVSTILRQTVPALKPEIDRMAIYMGDYSWLGLGSDRRAELYRRTRDVDIIKKIPFRSTASAGSDEAQSGKHSPSQVRRRCVRCCEIMCGAYPPRPQLSSRMMYKLGYVRYCICGGGWTLESDLHR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.06
3	0.06
4	0.06
5	0.06
6	0.06
7	0.06
8	0.05
9	0.05
10	0.05
11	0.05
12	0.05
13	0.05
14	0.06
15	0.07
16	0.08
17	0.11
18	0.15
19	0.18
20	0.19
21	0.21
22	0.25
23	0.3
24	0.37
25	0.37
26	0.34
27	0.4
28	0.43
29	0.44
30	0.4
31	0.35
32	0.29
33	0.27
34	0.28
35	0.24
36	0.22
37	0.19
38	0.18
39	0.25
40	0.31
41	0.34
42	0.41
43	0.42
44	0.43
45	0.49
46	0.52
47	0.45
48	0.4
49	0.37
50	0.32
51	0.29
52	0.29
53	0.23
54	0.24
55	0.24
56	0.24
57	0.29
58	0.25
59	0.25
60	0.31
61	0.35
62	0.38
63	0.41
64	0.46
65	0.4
66	0.46
67	0.47
68	0.41
69	0.45
70	0.4
71	0.4
72	0.35
73	0.38
74	0.33
75	0.31
76	0.32
77	0.26
78	0.26
79	0.26
80	0.23
81	0.19
82	0.17
83	0.17
84	0.16
85	0.19
86	0.17
87	0.15
88	0.18
89	0.17
90	0.17
91	0.19
92	0.18
93	0.14
94	0.15
95	0.15
96	0.13
97	0.17
98	0.17
99	0.15
100	0.15
101	0.14
102	0.11
103	0.11
104	0.1
105	0.07
106	0.06
107	0.06
108	0.06
109	0.05
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.06
114	0.07
115	0.11
116	0.12
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.12
121	0.13
122	0.12
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.09
128	0.1
129	0.1
130	0.11
131	0.12
132	0.13
133	0.14
134	0.13
135	0.14
136	0.14
137	0.13
138	0.11
139	0.1
140	0.08
141	0.07
142	0.07
143	0.04
144	0.05
145	0.04
146	0.04
147	0.05
148	0.07
149	0.08
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.13
154	0.16
155	0.17
156	0.17
157	0.16
158	0.15
159	0.18
160	0.16
161	0.15
162	0.13
163	0.12
164	0.12
165	0.14
166	0.14
167	0.12
168	0.14
169	0.2
170	0.29
171	0.4
172	0.47
173	0.52
174	0.56
175	0.58
176	0.63
177	0.67
178	0.66
179	0.62
180	0.58
181	0.55
182	0.54
183	0.52
184	0.46
185	0.37
186	0.28
187	0.21
188	0.21
189	0.18
190	0.14
191	0.14
192	0.15
193	0.14
194	0.14
195	0.15
196	0.14
197	0.15
198	0.18
199	0.2
200	0.24
201	0.27
202	0.3
203	0.34
204	0.32
205	0.38
206	0.36
207	0.33
208	0.29
209	0.26
210	0.23
211	0.21
212	0.22
213	0.18
214	0.19
215	0.18
216	0.17
217	0.17
218	0.16
219	0.15
220	0.13
221	0.12
222	0.11
223	0.12
224	0.14
225	0.15
226	0.15
227	0.14
228	0.15
229	0.14
230	0.12
231	0.11
232	0.1
233	0.09
234	0.08
235	0.08
236	0.05
237	0.05
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.05
243	0.06
244	0.07
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.12
249	0.17
250	0.2
251	0.21
252	0.28
253	0.29
254	0.34
255	0.38
256	0.4
257	0.39
258	0.37
259	0.38
260	0.31
261	0.33
262	0.29
263	0.32
264	0.31
265	0.32
266	0.41
267	0.42
268	0.44
269	0.45
270	0.53
271	0.52
272	0.51
273	0.49
274	0.39
275	0.37
276	0.4
277	0.39
278	0.34
279	0.3
280	0.29
281	0.3
282	0.32
283	0.36
284	0.31
285	0.33
286	0.3
287	0.34
288	0.33
289	0.29
290	0.27
291	0.23
292	0.22
293	0.17
294	0.16
295	0.16
296	0.15
297	0.15
298	0.16
299	0.14
300	0.17
301	0.19
302	0.19
303	0.15
304	0.15
305	0.14
306	0.13
307	0.12
308	0.11
309	0.13
310	0.13
311	0.12
312	0.13
313	0.15
314	0.17
315	0.17
316	0.18
317	0.14
318	0.15
319	0.15
320	0.14
321	0.13
322	0.12
323	0.13
324	0.12
325	0.1
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.05
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.05
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.1
348	0.1
349	0.11
350	0.13
351	0.2
352	0.27
353	0.28
354	0.29
355	0.28
356	0.31
357	0.3
358	0.28
359	0.22
360	0.15
361	0.14
362	0.17
363	0.22
364	0.21
365	0.2
366	0.2
367	0.19
368	0.19
369	0.2
370	0.17
371	0.12
372	0.11
373	0.17
374	0.16
375	0.17
376	0.16
377	0.17
378	0.16
379	0.17
380	0.22
381	0.19
382	0.27
383	0.3
384	0.33
385	0.34
386	0.39
387	0.44
388	0.42
389	0.5
390	0.47
391	0.48
392	0.5
393	0.53
394	0.55
395	0.55
396	0.56
397	0.5
398	0.49
399	0.45
400	0.42
401	0.41
402	0.37
403	0.34
404	0.28
405	0.25
406	0.19
407	0.17
408	0.15
409	0.12
410	0.12
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.11
415	0.12
416	0.11
417	0.1
418	0.08
419	0.06
420	0.06
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.05
429	0.05
430	0.06
431	0.07
432	0.06
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.11
437	0.1
438	0.1
439	0.09
440	0.1
441	0.07
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.08
447	0.07
448	0.07
449	0.06
450	0.05
451	0.05
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.05
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.09
460	0.07
461	0.07
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.09
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.09
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.06
474	0.07
475	0.06
476	0.07
477	0.06
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.06
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.05
500	0.06
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.06
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.07
524	0.11
525	0.16
526	0.17
527	0.19
528	0.19
529	0.18
530	0.18
531	0.16
532	0.14
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.07
537	0.08
538	0.09
539	0.1
540	0.1
541	0.13
542	0.18
543	0.17
544	0.17
545	0.17
546	0.18
547	0.17
548	0.17
549	0.15
550	0.1
551	0.09
552	0.08
553	0.08
554	0.07
555	0.06
556	0.09
557	0.09
558	0.12
559	0.12
560	0.14
561	0.14
562	0.15
563	0.18
564	0.16
565	0.18
566	0.16
567	0.17
568	0.16
569	0.18
570	0.18
571	0.17
572	0.22
573	0.21
574	0.24
575	0.26
576	0.25
577	0.24
578	0.23
579	0.22
580	0.17
581	0.17
582	0.13
583	0.12
584	0.11
585	0.11
586	0.1
587	0.09
588	0.11
589	0.1
590	0.12
591	0.13
592	0.17
593	0.18
594	0.25
595	0.28
596	0.33
597	0.37
598	0.43
599	0.42
600	0.39
601	0.37
602	0.32
603	0.32
604	0.26
605	0.23
606	0.18
607	0.17
608	0.17
609	0.17
610	0.16
611	0.13
612	0.13
613	0.1
614	0.08
615	0.08
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.05
622	0.07
623	0.08
624	0.08
625	0.11
626	0.13
627	0.13
628	0.13
629	0.13
630	0.13
631	0.12
632	0.11
633	0.08
634	0.07
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.09
639	0.09
640	0.11
641	0.11
642	0.11
643	0.11
644	0.11
645	0.11
646	0.08
647	0.1
648	0.1
649	0.12
650	0.12
651	0.12
652	0.12
653	0.12
654	0.11
655	0.09
656	0.06
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.04
667	0.05
668	0.05
669	0.05
670	0.08
671	0.11
672	0.12
673	0.14
674	0.15
675	0.16
676	0.2
677	0.21
678	0.21
679	0.19
680	0.22
681	0.22
682	0.23
683	0.21
684	0.2
685	0.19
686	0.15
687	0.14
688	0.1
689	0.08
690	0.08
691	0.08
692	0.07
693	0.07
694	0.08
695	0.09
696	0.12
697	0.17
698	0.18
699	0.2
700	0.23
701	0.24
702	0.26
703	0.26
704	0.28
705	0.24
706	0.23
707	0.22
708	0.19
709	0.18
710	0.16
711	0.15
712	0.1
713	0.08
714	0.08
715	0.06
716	0.06
717	0.06
718	0.05
719	0.04
720	0.05
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.04
725	0.05
726	0.05
727	0.06
728	0.06
729	0.06
730	0.06
731	0.09
732	0.09
733	0.1
734	0.1
735	0.11
736	0.11
737	0.11
738	0.13
739	0.14
740	0.19
741	0.19
742	0.19
743	0.18
744	0.18
745	0.17
746	0.15
747	0.13
748	0.1
749	0.09
750	0.11
751	0.13
752	0.12
753	0.13
754	0.13
755	0.14
756	0.16
757	0.19
758	0.18
759	0.16
760	0.17
761	0.18
762	0.22
763	0.21
764	0.19
765	0.16
766	0.18
767	0.18
768	0.22
769	0.22
770	0.2
771	0.21
772	0.29
773	0.29
774	0.29
775	0.31
776	0.27
777	0.28
778	0.26
779	0.24
780	0.17
781	0.16
782	0.14
783	0.1
784	0.09
785	0.07
786	0.09
787	0.09
788	0.09
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.08
793	0.1
794	0.17
795	0.19
796	0.22
797	0.25
798	0.27
799	0.29
800	0.34
801	0.34
802	0.27
803	0.26
804	0.23
805	0.22
806	0.19
807	0.18
808	0.14
809	0.1
810	0.1
811	0.1
812	0.09
813	0.07
814	0.07
815	0.07
816	0.08
817	0.11
818	0.13
819	0.17
820	0.17
821	0.19
822	0.21
823	0.24
824	0.32
825	0.4
826	0.46
827	0.48
828	0.52
829	0.52
830	0.56
831	0.62
832	0.61
833	0.6
834	0.57
835	0.57
836	0.59
837	0.58
838	0.55
839	0.51
840	0.47
841	0.44
842	0.43
843	0.43
844	0.42
845	0.43
846	0.4
847	0.37
848	0.32
849	0.27
850	0.22
851	0.18
852	0.16
853	0.15
854	0.17
855	0.19
856	0.23
857	0.3
858	0.4
859	0.5
860	0.57
861	0.64
862	0.72
863	0.75
864	0.8
865	0.81
866	0.79
867	0.78
868	0.73
869	0.7
870	0.67
871	0.61
872	0.54
873	0.51
874	0.47
875	0.43
876	0.42
877	0.4
878	0.38
879	0.38
880	0.38
881	0.4
882	0.44
883	0.46
884	0.48
885	0.49
886	0.47
887	0.44
888	0.48
889	0.47
890	0.45
891	0.4
892	0.38
893	0.35
894	0.37
895	0.38
896	0.33
897	0.26
898	0.22
899	0.21
900	0.22
901	0.2
902	0.17
903	0.17

A0A5N6SHM1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer