Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6T4D0

Protein Details
Accession A0A5N6T4D0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
308-334QHEREVRRERKAERERVKDERRKKIGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
313-339VRRERKAERERVKDERRKKIGELRSKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025066  CCDC174-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF13300  DUF4078  
Amino Acid Sequences MSNPNSLYGIPRSKSTPQSQSNAPSSSTLAFTTALSSLINKDADSSTRGRPRPSKTNKSDIFARPNKGAQKRAAADLRDDDTHQTHQRSQDIGGVDTATLHRSKRRMEEKARMYEDLKKGLYLAAGSDSEEETQDEYLARLRRREKEGLVDFDQKWADAQRGKGSGSDGEEEEEEEDADENASVISYEDELGRARRGTRAEATRAARLKEEESERGDAKERWRPSRPDNLIYGAAVQAEAFNPDAGLAAQMSYLAKRRDRSPTPPEETHYDADAEVRNRGTGFYAFSKDENVRRQQMEDLMNVRNETQHEREVRRERKAERERVKDERRKKIGELRSKRQAEIFLAKLGDVGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.56
4 0.55
5 0.59
6 0.62
7 0.65
8 0.64
9 0.58
10 0.51
11 0.43
12 0.38
13 0.34
14 0.29
15 0.22
16 0.17
17 0.16
18 0.15
19 0.15
20 0.13
21 0.12
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.15
26 0.15
27 0.13
28 0.15
29 0.16
30 0.18
31 0.21
32 0.22
33 0.27
34 0.36
35 0.39
36 0.44
37 0.51
38 0.57
39 0.64
40 0.71
41 0.74
42 0.72
43 0.8
44 0.76
45 0.73
46 0.74
47 0.7
48 0.7
49 0.66
50 0.63
51 0.56
52 0.57
53 0.61
54 0.59
55 0.58
56 0.52
57 0.54
58 0.52
59 0.56
60 0.55
61 0.47
62 0.44
63 0.42
64 0.4
65 0.33
66 0.31
67 0.27
68 0.24
69 0.29
70 0.31
71 0.3
72 0.31
73 0.34
74 0.37
75 0.35
76 0.33
77 0.32
78 0.28
79 0.25
80 0.22
81 0.18
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.15
89 0.19
90 0.23
91 0.32
92 0.41
93 0.48
94 0.55
95 0.63
96 0.67
97 0.73
98 0.72
99 0.64
100 0.57
101 0.56
102 0.51
103 0.46
104 0.38
105 0.29
106 0.26
107 0.24
108 0.22
109 0.14
110 0.11
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.11
125 0.16
126 0.17
127 0.22
128 0.27
129 0.33
130 0.39
131 0.43
132 0.4
133 0.45
134 0.48
135 0.48
136 0.46
137 0.46
138 0.4
139 0.38
140 0.36
141 0.27
142 0.23
143 0.18
144 0.17
145 0.13
146 0.15
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.16
154 0.15
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.12
183 0.14
184 0.16
185 0.22
186 0.25
187 0.27
188 0.33
189 0.35
190 0.37
191 0.38
192 0.36
193 0.31
194 0.28
195 0.26
196 0.25
197 0.26
198 0.24
199 0.24
200 0.26
201 0.26
202 0.25
203 0.27
204 0.25
205 0.26
206 0.31
207 0.33
208 0.36
209 0.42
210 0.46
211 0.49
212 0.57
213 0.57
214 0.54
215 0.51
216 0.48
217 0.42
218 0.37
219 0.31
220 0.21
221 0.15
222 0.11
223 0.09
224 0.06
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.12
241 0.15
242 0.19
243 0.22
244 0.27
245 0.36
246 0.42
247 0.49
248 0.53
249 0.59
250 0.63
251 0.63
252 0.62
253 0.57
254 0.56
255 0.49
256 0.41
257 0.32
258 0.24
259 0.24
260 0.24
261 0.2
262 0.19
263 0.17
264 0.17
265 0.16
266 0.16
267 0.16
268 0.13
269 0.16
270 0.17
271 0.2
272 0.21
273 0.21
274 0.25
275 0.27
276 0.33
277 0.37
278 0.4
279 0.43
280 0.43
281 0.45
282 0.44
283 0.46
284 0.42
285 0.4
286 0.37
287 0.33
288 0.34
289 0.32
290 0.29
291 0.25
292 0.25
293 0.26
294 0.27
295 0.3
296 0.36
297 0.4
298 0.49
299 0.57
300 0.62
301 0.65
302 0.69
303 0.68
304 0.71
305 0.78
306 0.79
307 0.78
308 0.8
309 0.79
310 0.82
311 0.87
312 0.86
313 0.86
314 0.86
315 0.85
316 0.8
317 0.79
318 0.78
319 0.78
320 0.79
321 0.79
322 0.77
323 0.79
324 0.78
325 0.73
326 0.66
327 0.61
328 0.57
329 0.54
330 0.47
331 0.41
332 0.38
333 0.35